Systémique médicale
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Archives de catégorie : Virologie
BA.2.75.2, le nouveau sous-variant d’Omicron qui inquiète les scientifiques
L’évolution continue du variant Omicron du SARS-CoV-2 continue de produire de nouveaux sous-variants porteurs de mutations additionnelles. Un de ces sous-variants émergents, dénommé BA.2.75, s’est rapidement diffusé dans certaines parties du monde, mais sans encore surpasser BA.5, le variant actuellement dominant. BA.2.75, dont la fréquence augmente en Inde, a été détecté en juillet 2022 dans …
Publié dans anticorps, anticorps neutralisants, BA.2.75, BA.2.75.2, BA.4, BA.5, convergence évolutive, coronavirus, COVID-19, échappement immunitaire, évasion immunitaire, évolution convergente, neutralisation, Omicron, SARS-CoV-2, sous-variants, Vaccinologie, variant, variants, Virologie
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Quand un vaccin contre la variole ne protège pas du monkeypox
Des médecins américains rapportent le cas d’un homme de 34 ans qui a contracté le monkeypox (variole du singe) bien que vacciné contre la variole huit ans auparavant. Il avait reçu le vaccin ACAM2000, vaccin antivariolique vivant atténué de « deuxième génération » produit sur culture cellulaire. Celui-ci contient le virus de la vaccine, virus …
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Publié dans ACAM2000, animal de compagnie, anticorps, anticorps neutralisants, breakthrough Infections, immunogénicité, Imvamune, Imvane, Infectiologie, infection post-vaccinale, Jynneos, monkeypox, MPXV, MVA-BN, neutralisation, vaccin, vaccin antivariolique, vaccination, VARIOLE, variole du singe, Virologie
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Un patient contracte simultanément le monkeypox, la Covid-19 et la syphilis, tandis qu’un autre présente une co-infection par monkeypox, SARS-CoV-2 et VIH
Deux études indépendantes, espagnole et italienne, rapportent, chez un homme ayant des relations avec des hommes, une co-infection par le virus monkeypox (variole du singe) et d’autres agents infectieux. L’équipe espagnole a publié le 23 août 2022, sous forme de preprint sur le site Research Square, le cas d’un individu de 56 ans ayant des …
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Des chercheurs italiens isolent le virus monkeypox dans le sperme d’un patient présentant une excrétion virale prolongée
Des chercheurs italiens rapportent, dans un article publié le 2 août 2022 sur le site web de la revue Lancet Infectious Diseases, avoir isolé le virus monkeypox dans le sperme d’un patient et avoir observé, pendant une durée prolongée, la présence de ce virus infectieux capable de se répliquer. Le patient en question est un …
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Des études montrent que la pandémie de Covid-19 a commencé sur un marché de Wuhan et que deux lignées virales ont été transmises à l’homme
Deux études, publiées en ligne le 26 juillet 2022 dans la revue Science, rapportent que le marché aux animaux vivants Huanan à Wuhan, en Chine, a été l’épicentre de l’émergence de la pandémie de Covid-19 et que celle-ci s’est manifestée par la transmission de l’animal à l’homme d’au moins deux lignages viraux distincts. On le …
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Un cas inexpliqué de monkeypox chez un enfant
C’est l’histoire d’un petit néerlandais de 10 ans, sans antécédent médical particulier, qui a été adressé début juin 2022 aux urgences de l’Emma Kinderziekenhuis, un hôpital pédiatrique à Amsterdam. Ce cas a été rapporté le 18 juillet 2022 dans la revue en ligne Eurosurveillance. Tout a commencé trois semaines auparavant, lorsque ce jeune garçon s’est …
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Identification d’anticorps neutralisants à large spectre, actifs sur tous les coronavirus humains
Deux équipes indépendantes rapportent, dans le numéro daté du 12 juillet 2022 de la revue Science, avoir identifié des anticorps neutralisants à large spectre, actifs contre une vaste gamme de coronavirus. Ces anticorps humains ont la particularité de cibler une autre région de la protéine spike que celle contre laquelle sont dirigés les anticorps induits …
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Monkeypox : certains symptômes des premiers patients londoniens diffèrent de ceux observés lors des épidémies antérieures
Selon une étude conduite auprès de malades londoniens ayant présenté une infection par le virus monkeypox en mai dernier, certains symptômes cliniques diffèrent, par leur localisation et/ou leur fréquence, de ceux rapportés lors des épidémies antérieures survenues en Afrique. Publiée en ligne dans la revue Lancet Infectious Diseases, cette étude observationnelle rétrospective concerne des patients …
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Risque de transmission du monkeypox à l’hôpital : de l’importance de la décontamination des surfaces
Une étude allemande souligne à quel point il est important pour le personnel hospitalier de suivre les recommandations des mesures de protection contre le monkeypox. Cette mise en garde intervient alors que l’Organisation mondiale de la santé a indiqué vendredi 1er juillet que l’Europe compte plus de 4 500 cas de « variole du singe …
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Covid-19 : premier cas documenté de transmission du SARS-CoV-2 du chat à l’homme
C’est l’histoire d’une vétérinaire thaïlandaise de 32 ans qui se présente le 15 août 2021 à l’hôpital universitaire de Songkhla, ville située au sud du pays. Elle présente depuis deux jours de la fièvre, un écoulement nasal clair et une toux productive. Elle déclare aux médecins qu’elle et deux de ses collègues ont examiné un …
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Les variants BA.4 et BA.5 d’Omicron ont une grande capacité à échapper aux anticorps induits par la vaccination et l’infection
Les sous-variants BA.4 et BA.5 d’Omicron sont capables d’échapper de façon notable aux anticorps produits après vaccination ou après infection naturelle, selon une étude publiée le 22 juin 2022 dans The New England Journal of Medicine (NEJM). Il en est de même pour un autre sous-variant d’Omicron, BA.2.12.1, qui représente actuellement la souche de SARS-CoV-2 …
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Le renforcement immunitaire par Omicron dépend de l’exposition antérieure au SARS-CoV-2
Une vaste étude britannique montre que la capacité d’une infection par Omicron à renforcer le système immunitaire contre le SARS-CoV-2 dépend de la souche ou du variant qui nous a déjà infecté et qu’elle n’équivaut pas, loin s’en faut, à une dose de vaccin. Dans quelle mesure une infection par Omicron stimule-t-elle l’immunité via les …
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Variole du singe : il est urgent de changer le nom du virus et de la maladie
L’Organisation mondiale de la santé (OMS) a déclaré mardi 14 juin réfléchir à « changer le nom du virus de la variole du singe ». « Nous ferons des annonces sur les nouveaux noms dès que possible », a promis son directeur général, Tedros Adhanom Ghebreyesus, lors d’une conférence de presse. Cela devient en effet urgent, car tous les …
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Covid-19 : l’ombre des variants BA.4 et BA.5 plane sur l’été
La communauté scientifique internationale est pleinement mobilisée pour évaluer les propriétés biologiques et virologiques de BA.4 et BA.5, les deux nouveaux sous-lignages d’Omicron, identifiés pour la première fois en Afrique du Sud et qui sont devenus en mai les variants prédominants dans ce pays. Ils y ont provoqué une nouvelle vague de contaminations mais de …
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Monkeypox : ce qu’on sait des premiers cas survenus en France, aux États-Unis, au Royaume-Uni, au Portugal, en Italie et en Australie
Des cas de monkeypox (maladie improprement dénommée variole du singe) ont été récemment identifiés dans neuf États de l’Union européenne : l’Autriche, la Belgique, la France, l’Allemagne, l’Italie, le Portugal, l’Espagne, la Grèce, Suède, les Pays-Bas. Des cas ont été également été notifiés au Royaume-Uni, en Belgique, Canada, Finlande, Irlande, Malte, Mexique, Pays-Bas, République Tchèque, …
Publié dans Dermatologie, épidémiologie, Virologie
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Variole du singe : une étude décrit les caractéristiques de cas survenus au Royaume-Uni entre 2018 et 2021
Publiée le 24 mai 2022 dans la revue The Lancet Infectious Diseases, une étude rapporte les caractéristiques cliniques, des données de cinétique virale et la réponse à des traitements antiviraux expérimentaux, provenant de sept patients infectés par le virus de la variole du singe (monkeypox, en anglais). Ces sept patients, cinq jeunes adultes et un …
Publié dans Dermatologie, Infectiologie, Virologie
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Omicron : ce que l’on sait des sous-variants BA.4 et BA.5
Initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud en novembre 2021, Omicron, nouveau variant préoccupant du SARS-CoV-2, est représenté par trois sous-lignages : BA.1, BA.2 et BA.3. Deux nouveaux sous-lignages d’Omicron, BA.4 et BA.5, classés variants d’intérêt par l’Organisation mondiale de la santé (OMS), ont depuis été détectés en Afrique du Sud. Selon les …
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Covid-19 : caractérisation du variant XD, issu d’une recombinaison entre Delta et Omicron
Une étude dirigée par des chercheurs de l’Institut Pasteur de Paris rapporte les premières données épidémiologiques, virologiques et biologiques concernant le variant XD du SARS-CoV-2, issu de la recombinaison entre les variants Delta et Omicron. Ces travaux, supervisés par Étienne Simon-Lorière, responsable du groupe ‘Génomique évolutive des virus à ARN’ à l’Institut Pasteur, ont été …
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Infection par Omicron : quelle réponse contre d’autres variants chez les vaccinés et non-vaccinés ?
Une étude sud-africaine a évalué, chez des individus vaccinés et non vaccinés, la capacité des anticorps produits après une infection par le variant Omicron à combattre d’autres variants du SARS-CoV-2. Les résultats ont été publiés le 22 mars 2022 dans la revue Cell Host and Microbe. Conduite par Simon Richardson, Penny Moore et leurs collègues …
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Quid de la réponse en anticorps neutralisants après infection par le variant Omicron chez les personnes vaccinées ?
Une étude américaine a évalué la réponse en anticorps neutralisants faisant suite à une infection par le variant Delta ou Omicron chez des individus ayant reçu deux doses de vaccin, avec ou sans rappel. Ces résultats ont été publiés en ligne dans la revue Cell le 18 mars 2022. On rappelle qu’une infection survenant chez …
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Dans le sillage d’Omicron, les singularités de BA.2
L’ascension du variant Omicron (B.1.1.529) a été fulgurante dans de nombreux pays. Initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud en novembre 2021, ce nouveau variant du SARS-CoV-2 est aujourd’hui présent dans au moins 67 pays. Ce variant préoccupant est composé de trois sous-lignages désignés BA.1 (majoritaire), BA.2 et BA.3 (très peu détecté). Un …
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Publié dans ACE2, anticorps, anticorps neutralisants, biologie, Biologie humaine, bronche, cellule, charge virale, coronavirus, COVID-19, délétion, Delta, domaine de liaison au récepteur, dynamique virale, échappement immunitaire, épidémiologie, épithélium nasal, évasion immunitaire, fusion membranaire, Immunologie, modèle animal, mutation, Omicron, pathogénicité, PCR, poumon, protéine spike, pseudovirus, RBD, récepteur ACE2, réplication virale, RT-PCR, SARS-CoV-2, séquence génomique, spike, TMPRSS2, transmissibilité, Vaccinologie, variant, variants, Virologie, virus
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Omicron : une biologie et une dynamique virale différentes de celles observées chez les précédents variants
Dans ce billet de blog, je vous invite, à travers les données issues d’articles publiés ces dernières semaines, à comprendre les moyens utilisés par la recherche pour explorer les propriétés biologiques et virologiques d’Omicron. Celles-ci révèlent en quoi ce nouveau variant du SARS-CoV-2 est atypique. L’objectif des chercheurs est de comprendre comment les multiples mutations …
Publié dans ACE2, anticorps, anticorps neutralisants, Biologie humaine, biologie structurale, bronche, cathepsine, cellule, charge virale, conformation, coronavirus, cryo-EM, cryomicroscopie électronique, délétion, Delta, domaine amino-terminal, domaine de liaison au récepteur, durée d'excrétion, dynamique virale, échappement immunitaire, ectodomaine, effet épistatique, épistasie, épithélium nasal, épitopes, évasion immunitaire, excrétion virale, fusion membranaire, IFITM, Immunologie, mutation, Omicron, particules virales, PCR, peptide de fusion, poumon, protéine spike, protomère, pseudovirus, RBD, récepteur ACE2, réplication, réplication virale, RT-PCR, SARS-CoV-2, séquence génomique, sites antigéniques, sous-unité S1, sous-unité S2, spike, TMPRSS2, transmissibilité, trimère, variant, variants, Virologie, virus, voie endosomale
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Des lapins de compagnie naturellement infectés par le SARS-CoV-2 en France
Des chercheurs vétérinaires français ont, pour la première fois, mis en évidence une infection naturelle par le SARS-CoV-2 chez des lapins de compagnie. Cette étude, dirigée par des chercheurs de l’université de Montpellier, a été publiée le 27 janvier 2022 dans la revue Veterinary Sciences. Elle visait à déterminer la séroprévalence de l’infection par le …
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Hong Kong : transmission du SARS-CoV-2 de hamsters de compagnie à l’homme, suivie d’une diffusion interhumaine
Tout commence, à Hong Kong, le 11 janvier 2022. Une employée de 23 ans travaillant dans une animalerie, qui vend des hamsters, des lapins et des chinchillas, présente un mal de gorge et de la toux. Elle est doublement vaccinée contre la Covid-19, la deuxième dose lui ayant été administrée le 16 septembre 2021. Elle …
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En Inde, un léopard contaminé par le SARS-CoV-2. Des pumas et des lions infectés dans un zoo en Afrique du Sud
Un léopard vivant en liberté a été contaminé par le SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19, indiquent des chercheurs de l’Institut indien de recherche vétérinaire à Bareli (Uttar Pradesh, État de l’Inde du Nord) dans un preprint publié le 12 janvier 2022 sur le site bioRxiv. En 2021, trois cas d’infection naturelle par le SARS-CoV-2 chez des …
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Comment le SARS-CoV-2 peut évoluer en variant préoccupant chez un individu immunodéprimé
C’est l’histoire d’une femme sud-africaine d’une trentaine d’années, atteinte du sida. Elle est admise en septembre 2020 dans un hôpital de Durban pour des symptômes qui ont débuté douze jours auparavant. Cette patiente présente une gêne respiratoire, un mal de gorge, de la toux. Le test RT-PCR pour le SARS-CoV-2 effectué sur le prélèvement nasopharyngé …
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Covid-19 : ce que l’on sait de la sévérité de l’infection à Omicron
Quel impact le variant Omicron a-t-il sur le taux des admissions et des hospitalisations ? Ce nouveau variant, initialement identifié au Botswana et en Afrique du Sud en novembre 2021, est-il aussi dangereux que le précédent variant Delta ? Plusieurs études, en provenance d’Afrique du Sud et du Royaume-Uni, ont été publiées. L’occasion de faire …
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Les 10 billets les plus lus de 2021 sur le blog « Réalités biomédicales »
Depuis la création de ce blog il y a huit ans, mon désir est toujours le même : vous surprendre, toujours avec sérieux et bonne humeur en vous racontant des histoires médicales extraordinaires. Vous êtes toujours de plus en plus nombreux à lire ce blog, le seul à vous raconter des cas cliniques insolites, déroutants, …
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États-Unis : le SARS-CoV-2, détecté chez une proportion importante de cerfs en liberté, est capable de se diffuser entre cervidés
Le SARS-CoV-2 a été détecté, entre janvier et mars 2021, chez plus d’un tiers des cerfs vivant en liberté dans le nord-est de l’Ohio (État du Midwest des États-Unis), rapporte une étude mise en ligne le 23 décembre 2021 sur le site de la revue Nature. L’espèce de cervidé en question est appelé « cerf …
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Covid-19 : le SARS-CoV-2 peut persister dans le corps pendant des mois et se disséminer précocement dans le cerveau
Une étude américaine, reposant sur des autopsies de patients décédés de la Covid-19, a consisté à traquer la présence du coronavirus dans de très nombreux organes et tissus du corps humain. Les résultats montrent que le SARS-CoV-2 peut provoquer une infection disséminée et persister dans l’organisme pendant des mois. Le virus peut notamment largement diffuser …
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Variant Omicron : un risque d’échappement immunitaire
Le moins qu’on puisse dire est que le nouveau variant Omicron initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud inquiète les spécialistes. Une étude, publiée sous forme de preprint sur le site medRxiv, rapporte un risque accru de réinfection associé à ce nouveau variant du SARS-CoV-2. En d’autres termes, Omicron présente une capacité accrue …
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Un Covid long peut également survenir chez des personnes vaccinées atteintes de Covid-19
On le sait, une infection par le SARS-CoV-2 peut entraîner des troubles prolongés, ce que l’on appelle la Covid-longue. Le terme « Covid-long » a, tout d’abord, été utilisé par les patients puis repris dans la littérature médicale anglo-saxonne (long Covid) pour qualifier ces symptômes séquellaires post-Covid. Mais qu’en est-il lorsque la Covid-19 se déclare chez une …
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Un second cas de patiente guérie d’une infection par le VIH sans intervention médicale
C’est l’histoire d’une femme qui, après avoir été infectée par le virus du sida, serait la seconde personne au monde à avoir complètement et naturellement éliminé toute trace du VIH de son organisme. Le système immunitaire de cette patiente a-t-il réussi à développer une immunité stérilisante, capable de totalement et définitivement éradiquer le VIH ? …
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États-Unis : diffusion massive du SARS-CoV-2 parmi les cerfs, potentiels réservoirs du coronavirus
Une étude américaine rapporte que plus de 80 % des cerfs, testés entre décembre 2020 et janvier 2021 dans plusieurs régions de l’État d’Iowa, sont positifs au SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19. Le cervidé en question est appelé « cerf de Virginie » (Odocoileus virginianus). Cette espèce est sensible à l’infection par le SARS-CoV-2. Il a été …
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Quand la vaccination vient à bout d’une infection Covid-19 persistante chez un patient immunodéprimé
C’est l’histoire d’un homme de 37 ans atteint du syndrome de Wiskott-Aldrich, un déficit immunitaire héréditaire associée à une anomalie présente sur le chromosome X. L’incidence de cette pathologie est estimée entre 1 à 5 enfants atteints pour un million de naissances. Elle est caractérisée par l’association de trois symptômes. Cette triade comporte un eczéma, …
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Des coronavirus de chauves-souris très proches du SARS-CoV-2 identifiés au Laos
Des chercheurs de l’Institut Pasteur rapportent avoir identifié, au nord du Laos, des coronavirus de chauves-souris dont il apparaît qu’ils représentent à ce jour les ancêtres les plus proches du SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19. Cette étude est un élément possiblement très important dans la quête du réservoir naturel de l’agent viral responsable de la …
Publié dans ACE2, BANAL, BANAL-236, Betacoronavirus, chauve-souris en fer à cheval, chauves-souris, coronavirus, échantillons fécaux, écouvillonnage rectal, fèces, formation karstique, génome viral, grottes, identité génétique, Laos, Mekong, origine, pangolin, parenté génétique, prélèvements anaux, prélèvements rectaux, protéine S, protéine spike, province de Vientiane, pseudovirus, R. affinis, R. malayanus, R. marshalli, R. pusillus, R. shameli, RaTG13, RBD, récepteur ACE2, récepteur cellulaire, récepteur humain ACE2, receptor binding domain, recombinaisons génétiques, reliefs karstiques, Rhinolophus, Rhinolophus affinis, sarbecovirus, similitude génétque, site de clivage de la furine, souches virales, spicule, Virologie, virus émergent, Yunnan, zoologie
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