Archives de catégorie : Virologie

Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1

Au Brésil, l’épidémie de Covid-19 est aujourd’hui dominée par plusieurs lignées virales SARS-CoV-2 qui ont toutes en commun de posséder la mutation E484K dans la protéine S (spike ou spicule), qui permet au virus de se fixer sur les cellules qu’ils infectent. Cette mutation est problématique dans la mesure où elle peut contribuer à un …

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Publié dans ACE2, activité neutralisante, Amazonas, analyse phylogénétique, anticorps, anticorps monoclonaux, anticorps neutralisants, B.1.1.7, B.1.351, brésil, contagiosité, coronavirus, COVID-19, D614G, domaine NTD, domaine RBD, domaine RBM, E484K, écepteur ACE2, échappement immunitaire, épidémiologie, Immunologie, Infectiologie, K417N/T, létalité, Manaus, mutations, N.10, N.9, N501Y, neutralisation, P.2, pathogénicité, pouvoir neutralisant, protéine S, protéine spike, RBD, RBM, SARS-CoV-2, séquençage génomique, spicule, transmissibilité, vaccin, vaccination, variant anglais, variant brésilien, variant britannique, Variant Of Concern, variant P.1, variant sud-africain, variants d’intérêt, Variants Of Interest, variants préoccupants, Virologie, virus, VOC, VOI | Commentaires fermés sur Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1

Covid-19 : retour sur les premiers cas de variant sud-africain en France et les premières chaînes de contamination

Une enquête épidémiologique détaille l’origine des premiers cas notifiés en France d’infection par le variant dit sud-africain du SARS-Cov-2*. Également dénommé B.1.351, ce dernier comporte plusieurs mutations dans le gène codant la protéine S (spicule ou spike en anglais), notamment les mutations N501Y et E484K, respectivement associées à une plus grande transmissibilité et à un …

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Covid-19 : transmission du coronavirus par voie aéroportée dans une église en Australie

L’histoire remonte à juillet 2020 et se déroule en Australie. Elle est relatée dans un article daté du 5 avril 2021 dans la revue en ligne Emerging Infectious Diseases. Tout commence le 18 juillet 2020 lorsque le service de santé publique de la ville de Sydney apprend l’existence d’un cas d’infection par le SARS-CoV-2 chez …

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Covid-19 : malgré la quarantaine, des passagers d’un vol international à l’origine de multiples chaînes de contamination

L’histoire se déroule en Nouvelle-Zélande, pays qui pratique une stratégie d’isolement et de mise en quatorzaine à ses frontières dans le but d’éliminer le coronavirus SARS-CoV-2. Le 18 septembre 2020, un cas de Covid-19 est identifié. Le patient est un des passagers d’un vol international en provenance d’Inde. À sa descente d’avion, cet homme (G) …

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Infecté il y a cinq ans, un survivant d’Ebola serait à l’origine d’une nouvelle épidémie en Guinée

Un survivant de l’épidémie d’Ebola de grande ampleur ayant sévi en Afrique de l’Ouest en 2013-2016 serait à l’origine de la flambée épidémique qui frappe actuellement la Guinée. Telle est la surprenante conclusion de trois rapports indépendants publiés le 12 mars 2021 sur le site virological.org. La nouvelle épidémie d’Ebola en Guinée n’aurait donc pas …

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Publié dans Afrique de l’Ouest, Ebola, épidémie, filovirus, génome, Guinée, Infectiologie, latence virale, Libéria, persistance virale, quiescence virale, République démocratique du Congo, séquençage génétique, Sierra Leone, sperme, survivant d’Ebola, taux de mutation, testicule, transmission sexuelle, Virologie, virus, virus à ARN | Commentaires fermés sur Infecté il y a cinq ans, un survivant d’Ebola serait à l’origine d’une nouvelle épidémie en Guinée

Infecté il y a cinq ans, un survivant d’Ebola serait à l’origine d’une nouvelle épidémie en Guinée

Un survivant de l’épidémie d’Ebola de grande ampleur ayant sévi en Afrique de l’Ouest en 2013-2016 serait à l’origine de la flambée épidémique qui frappe actuellement la Guinée. Telle est la surprenante conclusion de trois rapports indépendants publiés le 12 mars 2021 sur le site virological.org. La nouvelle épidémie d’Ebola en Guinée n’aurait donc pas …

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Surdité brusque et SARS-CoV-2 : une infection peut en cacher une autre

C’est l’histoire d’un homme de 29 ans, sans antécédent médical, qui se présente dans le service d’ORL du CHU de Dijon pour une surdité brusque bilatérale apparue depuis dix jours. Il n’existe pas d’autre signe à l’examen clinique. La femme du patient présente une anosmie et une agueusie. Cette perte d’odorat et du goût incite …

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Covid-19 : infection nosocomiale dans un hôpital israélien malgré le port du masque et la distanciation physique

Des médecins israéliens rapportent la survenue dans un hôpital pédiatrique d’une flambée épidémique de Covid-19 après qu’un enfant soit venu consulter, accompagné de sa mère. Et ce malgré le respect des mesures de protection habituelles : port du masque chirurgical et distanciation physique. Ces cas d’infection intra-hospitalière ont été rapportés le 27 janvier 2021 dans …

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Transplantation pulmonaire : un cas tragique de transmission du SARS-CoV-2 d’une donneuse à une receveuse

Des chirurgiens et médecins américains rapportent, dans un article publié en ligne le 10 février 2021 dans l’American Journal of Transplantation, un cas documenté de transmission du SARS-CoV-2 entre donneuse et receveuse dans le cadre d’une greffe bi-pulmonaire. La donneuse avait pourtant été testé négative pour le coronavirus au test RT-PCR réalisé sur prélèvement nasopharyngé. …

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New York : le coronavirus circulait plus d’un mois avant l’identification du premier cas de Covid-19

Des chercheurs américains rapportent que le SARS-CoV-2 était présent dans la ville de New York six à huit semaines avant l’identification du premier cas de Covid-19. Telle est la conclusion d’une étude postée sur le site de prépublication medXriv le 11 février 2021. On rappelle que le premier cas d’infection par le SARS-CoV-2 à New …

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Covid-19 : des personnels de santé israéliens contaminés par le coronavirus après la première dose de vaccin

Des médecins israéliens rapportent des cas de contamination par le coronavirus SARS-CoV-2 parmi le personnel du plus grand hôpital du pays après administration de la première dose de vaccin anti-Covid-19. Publié le 1er février 2021 dans la revue en ligne Emerging Infectious Diseases, ce rapport concerne vingt-deux cas de contamination post-vaccinale. Ceux-ci sont survenus lors …

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Pneumonie Covid-19 : une inflammation qui tourne en boucle

Le coronavirus SARS-CoV-2 peut provoquer une réaction inflammatoire pouvant aboutir, dans sa forme la plus grave, à un syndrome de détresse respiratoire aiguë. Une minorité de patients Covid-19 développent une pneumonie nécessitant le recours à la ventilation mécanique. La mortalité de ces patients est élevée (20 % à 40 %). Les déterminants de cette gravité …

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Covid-19 : quand le SARS-CoV-2 se déleste de petits fragments de son matériel génétique pour échapper aux anticorps

Avec l’apparition de nouveaux variants SARS-CoV-2, on sait désormais que ce coronavirus, dont le génome était considéré jusqu’à présent relativement stable, peut muter. Cette variabilité génétique repose sur l’apparition de mutations consistant en la substitution d’un nucléotide par un autre, autrement dit d’une « lettre » par une autre dans l’ARN viral. Comme pour tout …

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Manaus, Brésil : de nouveaux variants du SARS-CoV-2 se jouent-ils de l’immunité collective ?

Que se passe-t-il à Manaus dans l’État d’Amazonas ? En octobre 2020, cet état du nord-ouest du Brésil avait été durement touché par l’épidémie de Covid-19. Publiée en octobre 2020 dans la revue Science, une étude conduite auprès des donneurs de sang indiquait que plus des trois quarts (76 %) des habitants de la plus …

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Interview with Virologist Christian Drosten: »I Am Quite Apprehensive about What Might Otherwise Happen in Spring and Summer » – DER SPIEGEL

DER SPIEGEL: Professor Drosten, the pandemic has entered a decisive phase. The beginning of the vaccination campaign has meant light at the end of the tunnel, but now, more contagious virus variants have appeared. How dangerous is the situation in Germ… Continuer la lecture

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Covid-19 : vaccins et nouveaux variants, quel impact ?

Des chercheurs sud-africains rapportent 19 janvier 2021 sur le site de prépublication bioXriv des résultats indiquant que les mutations présentes dans le variant sud-africain 501Y.V2 lui confèrent la possibilité d’échapper à l’activité neutralisante des anticorps produits lors d’une infection naturelle, voire post-vaccination. Rappel : la protéine S (spike, spicule) de surface du coronavirus SARS-CoV-2 se …

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Publié dans 501.V3, 501Y.V.2, 501Y.V1, activité neutralisante, afrique du sud, anticorps monoclonaux, anticorps polyclonaux, B.1.1.7, B1.1.28, brésil, coronavirus, délétion, domaine N-terminal, E484K, émergence de nouveaux variants, Gènétique, immunité, Immunologie, Infectiologie, K417N/T, mutations, N501Y, nouveau variant, nouveaux variants, NTD, plasma, protéine S, protéine spike, pseudovirus, RBD, receptor binding domain, royaume uni, SARS-CoV-2, sérum, système immunitaire, Vaccinologie, variant anglais, variant brésilien, variant britannique, Virologie, VOC 202012/01 | Commentaires fermés sur Covid-19 : vaccins et nouveaux variants, quel impact ?

Covid-19 : le défi des nouveaux variants

Depuis quelques jours, les données concernant les variants du coronavirus SARS-CoV-2, qu’ils soient britanniques, sud-africain, brésilien, voire possiblement américain, se succèdent à un rythme soutenu. Ces informations sont publiées sur des sites de prépublication en attendant d’être évaluées par les pairs et faire l’objet d’une publication dans une revue scientifique. D’autres résultats sont postés en …

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Publié dans 501Y.V2, afrique du sud, Amazonas, Angleterre, B.1.1.7, brésil, circulation virale, coronavirus, COVID-19, Danemark, E484K, émergence de nouveaux variants, épidémiologie, État d’Amazonas, Etats-Unis, gestes barrirères, Illinois, Infectiologie, K417N, K417T, lignage B.1.1.28, lignage B.1.1.33, lignage B.1.1.7, lignage B.1.351, Manaus, MESURES BARRIERES, mutations, N501Y, nouveaux variants, Ohio, protéine spike, RBD, résultats RT-PCR discordants, royaume uni, RT-PCR, SARS-CoV-2, SGTF, spicule, vaccin, vaccins à ARN messager, vaccins anti-Covid-19, variant américain, variant anglais, variant brésilien, variant britannique, Variant Of Concern, variant P.1, variant sud-africain, variants, Virologie, VOC, VOC 202012/01, VUI 202101/01 | Commentaires fermés sur Covid-19 : le défi des nouveaux variants

Inventaire de mutations d’une région cruciale du SARS-CoV-2 influant sur la réponse en anticorps

Une équipe de chercheurs américains a établi une cartographie de toutes les mutations entraînant un changement d’acide aminé dans une petite région de la protéine spike de l’enveloppe du SARS-CoV-2. Baptisée RBD (domaine de fixation au récepteur, receptor binding domain), cette zone est celle qui permet au coronavirus de s’arrimer au récepteur ACE2 présent sur …

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Le SARS-CoV-2 continue de se répliquer jusqu’à 35 heures après le décès

Des médecins légistes allemands ont détecté la réplication du coronavirus SARS-CoV-2 dans la gorge de patients décédés de la Covid-19 plus de trente cinq heures après leur mort. L’équipe d’Axel Heinemann de l’université de Hambourg a évalué la stabilité du SARS-CoV-2 et son pouvoir infectieux en période post-mortem. Cette étude a pu être réalisée dans …

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« Réalités Biomédicales » : les 10 billets les plus lus de 2020

Vous êtes toujours de plus en plus nombreux à lire ce blog, le seul à vous raconter, depuis maintenant sept ans, des histoires médicales extraordinaires. Mon désir est toujours le même : vous surprendre, toujours avec sérieux et bonne humeur, en vous relatant des cas cliniques insolites, déroutants, hallucinants, exceptionnels, incroyables, inimaginables, inoubliables, récemment publiés …

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Royaume-Uni : un variant du coronavirus SARS-CoV-2 porteur de nombreuses mutations

Le gouvernement britannique a annoncé que des chercheurs ont identifié un nouveau variant du coronavirus SARS-CoV-2. Celui-ci renferme un nombre de mutations plus important que la plupart des autres variants, raison pour laquelle il est pris « particulièrement au sérieux », a indiqué Chris Whittie, le Chief medical officer for England. « Le groupe consultatif sur les …

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Les traitements anti Covid qui existent déjà sont-ils les grands oubliés de la politique sanitaire ? | Atlantico.fr

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L’aventure scientifique des vaccins à ARN messager

C’est l’histoire d’un concept scientifique qui a débouché, en un temps record, sur le développement et la production à grande échelle de préparations vaccinales qui seront pour la première fois administrées chez l’homme dans un contexte très particulier, celui d’une maladie infectieuse pandémique. Des millions de doses des vaccins élaborés par Pfizer/BioNTech d’une part, Moderna …

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Covid-19 : persistance du SARS-CoV-2 dans l’intestin trois mois après le début des symptômes

Le SARS-CoV-2 peut persister dans l’intestin jusqu’à trois mois après l’infection virale. Telle est l’intrigante observation rapportée dans un article posté le 5 novembre 2020 sur le site de prépublication bioRxiv par une équipe américaine au terme d’une étude dont l’objectif premier était d’analyser la réponse en anticorps dirigés contre le SARS-CoV-2 dans le cadre …

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Covid-19 et perte d’odorat : du nouveau sur la persistance du SARS-CoV-2 et son potentiel neuroinvasif

Le SARS-CoV-2 peut persister au sein de l’épithélium olfactif, non seulement pendant plusieurs semaines à la suite de la Covid-19, mais également pendant des mois après la disparition des symptômes, indique une étude française postée le 18 novembre 2020 sur le site de prépublication bioRxiv. Les données de ces travaux semblent également indiquer que le …

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SARS-CoV-2 : que sait-on de la dynamique de la charge virale, des durées d’excrétion et de contagiosité du virus ?

L’évolution dans le temps de la quantité du virus SARS-CoV-2 dans un organisme humain infecté et de sa présence dans divers fluides biologiques influent sur la transmission du virus responsable de la maladie Covid-19. Pour décrire ces paramètres essentiels pour estimer la durée du pouvoir infectieux du virus, et par là même sa contagiosité, les …

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Covid-19 : combien de particules virales un être humain infecté par le SARS-CoV-2 renferme-t-il ?

Des chercheurs israéliens ont estimé le nombre total de particules virales (ou virions) présentes chez une personne infectée par le SARS-CoV-2 durant le pic de l’infection. Ils ont également évalué la masse de la totalité de ces virions dans le corps humain et même, pandémie oblige, à l’échelle de la planète. Le moins que l’on …

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Covid-19 : ce que l’on sait sur les enfants et adolescents et ce qu’il reste à apprendre

Depuis le début de l’épidémie de Covid-19, les données attestent que les enfants développent rarement une forme sévère de Covid-19. En effet, les enfants infectés présentent le plus souvent des symptômes légers [1]. Le fait que l’infection aiguë par le SARS-CoV-2 est le plus souvent bénigne chez les enfants a participé à l’idée largement répandue …

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Covid-19 : nouvelles données sur la persistance des anticorps anti-SARS-CoV-2

Deux études indépendantes, canadienne et américaine, indiquent que les anticorps spécifiquement dirigés contre le SARS-CoV-2 persistent au moins trois mois chez des patients Covid-19 après le début des symptômes. Les résultats de ces travaux ont été publiés le 8 octobre 2020 dans la revue Science Immunology. On sait que les anticorps jouent un rôle important …

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Présence d’une protéine du coronavirus dans l’œil d’une patiente Covid-19 convalescente

Une protéine du SARS-CoV-2 a été détectée dans les tissus oculaires d’une patiente sexagénaire infectée trois mois plus tôt par le coronavirus, rapportent des ophtalmologistes chinois dans un article publié en ligne le 8 octobre 2020 dans la revue JAMA Ophtalmology.   C’est l’histoire d’une femme de 64 ans qui a présenté une toux sèche …

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Covid. Pourquoi Emmanuel Macron serait-il tout particulièrement mécontent d’Olivier Véran ?

Bonjour 17/09/2020. Les vents tourneraient-ils au coeur de l’exécutif ? « Quand Emmanuel Macron n’est pas satisfait, il le fait savoir. Ce jour-là, c’est le ministre de la Santé, Olivier Véran, qui en a fait les frais. Vendredi 11 septembre, lors du Conseil de défense consacré à l’évolution de la situation sanitaire, le président de la République […] Continuer la lecture

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Didier Raoult : pourquoi une majorité de Français lui fait-elle plus confiance qu’au gouvernement ?

Bonjour 17/09/2020. Le spectacle médiatique n’en finit plus, sa conclusion reste incertaine. Après des mois de mises en scène télévisées, de sombres coulisses politiques, de caricatures, d’ego chauffés à blanc, d’accusations croisées et d’invraisemblables polémiques médicamenteuses les chiffres sont là : un Français sur deux a une « image positive » du Pr Didier Raoult, microbiologiste à la […] Continuer la lecture

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Covid reconnue maladie professionnelle ? Le gouvernement accusé de trahir la parole donnée

Bonjour 6/09/2020. C’est une nouvelle étape dans une affaire qui apparaîtra à beaucoup comme un scandale – si le non-respect de la parole donnée par l’exécutif en est un. Nous parlons ici des conditions dans lesquelles la Covid-19 pourra/pourrait, en France, être ou non reconnu comme une maladie professionnelle. Rappel. Nous étions le 23 mars […] Continuer la lecture

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Covid, 250 euros: face à la grève du dépistage, le gouvernement va-t-il envoyer la police ?

Bonjour 16/09/2020. L’affaire restait médiatiquement régionale. Elle prend soudain une ampleur nationale et risque de diffuser – plaçant brutalementle pouvoir exécutif devant ses responsabilités. Reprenons ce que nous en dit l’AFP ? La grève dans les vingt laboratoires d’analyse biologiques Biofusion du Tarn-et-Garonne, Haute-Garonne et Lot a été reconduite ce mercredi 16 septembre. Les salariés grévistes […] Continuer la lecture

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Covid politique : les propos au vitriol d’un rapporteur de la commission d’enquête du Sénat

Bonjour 15/09/2020. Le ton, la température, montent dans les médias. Le pouvoir exécutif, le passé et le présent, est la cible de mille et une nouvelles flèches. Dernier (et passionnant) exemple en date l’entretien accordé au Monde  (Chloé Hecketsweiler et Solenn de Royer) par le Dr Bernard Jomier, sénateur de Paris (apparenté Parti socialiste) – corapporteur de […] Continuer la lecture

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Chloroquine : le Pr Pialoux soupçonne le Pr Raoult de ne pas avoir respecté les règles éthiques

Bonjour 14/09/2020. C’est un entretien à bien des égards édifiant. Il est accordé au Monde (Sandrine Cabut) par le Pr Gilles Pialoux « Le Covid-19 peut entraîner un broyage social, avec des glissements entre causalité et responsabilité ». Le chef du service de maladies infectieuses et tropicales de l’hôpital Tenon depuis 2004 y est interrogé à propos […] Continuer la lecture

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A l’image de l’Allemagne, un mouvement antimasque pourrait-t-il émerger en France ?

Bonjour 13/09/2020. C’est une nouvelle salve, sévère et argumentée, contre la stratégie gouvernementale de lutte contre l’épidémie. Elle est signée, dans le Journal du Dimanche, par le Dr William Dab, ancien Directeur général de la santé – interrogé par Anne-Laure Barret. Nous y reviendrons. Pour l’heure, cette question : Le port du masque à l’extérieur est […] Continuer la lecture

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Castex: dégradation de la situation, quatorzaine divisée par deux. Tout reste à expliquer

Bonjour 11/09/2020. Que se passe-t-il au sommet de l’Etat ? Le Premier ministre a tenu une courte allocution, aujourd’hui, à 17 heures pour rendre compte du conseil de défense qui s’est tenu plus tôt dans la matinée. Résumons. Jean Castex a annoncé une « dégradation manifeste » de la situation épidémiologique. Et le chef du gouvernement, une nouvelle fois, […] Continuer la lecture

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Covid : la cacophonie, le bon sens et l’appel à la vigilance de SOS Médecins France

Bonjour 11/09/2020. Interrogation montante. Dramatiser à l’excès ou prendre le risque de sous-estimer la réalité chiffrée et ses conséquences ? Dans les médias on n’en finit plus d’aborder l’équation du « sanitaire » qui serait opposée à l’ « économique ». Le tout, le plus souvent, dans la cacophonie, les invectives, l’inaudible. Et l’on observe dans le même temps les premiers […] Continuer la lecture

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Covid. Le Conseil scientifique fait de la politique. Emmanuel Macron lui répond

Bonjour 0/09/2020. Une étape a été franchie par le Conseil scientifique et nul ne sait jusqu’où cette institution pourra aller. Rendu public par le gouvernement le 9 septembre son dernier avis, daté du 3 septembre, dresse « un constat d’échec » à propos de la stratégie d’isolement destinée à lutter contre l’épidémie de Covid-19. Ses membres (chargés […] Continuer la lecture

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