Archives de catégorie : Virologie

Covid-19 : infection par le SARS-CoV-2 durant sept mois chez une patiente porteuse du VIH

L’histoire se déroule en Afrique du Sud et concerne une femme de 36 ans admise dans un hôpital de Durban en septembre 2020 pour un mal de gorge, de la toux et une gêne respiratoire. Ce cas clinique a été rapporté le 4 juin 2021 sur le site de prépublication medRxiv par l’équipe d’Axel Sigal …

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Publié dans antirétroviraux, charge virale plasmatique, coronavirus, déficit immunitaire, délétions, évolution intra-hôte, évolution intra-patient, immunodépression, immunodéprimé, immunosuppression, Infectiologie, infection à VIH, mutations, NTD, patients immunodéprimés, personnes vulnérables, protéine S, protéine spike, RBD, SARS-CoV-2, séquençage génomique, sida, spicule, traitement antirétroviral, traitement immunosuppresseur, trithérapie, vaccination, vih, Virologie | Commentaires fermés sur Covid-19 : infection par le SARS-CoV-2 durant sept mois chez une patiente porteuse du VIH

Covid-19 : comment le variant indien a débarqué au Brésil

L’histoire commence le 27 mars 2021. Le navire « MV Shanddong SA Zhi » quitte la Malaisie pour un long voyage qui doit l’amener à São Luís (État du Maranhão) au Brésil. Signalons au passage que São Luis est la seule capitale d’État du Brésil qui n’ait pas été fondée par les Portugais et dont …

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Publié dans Amérique du Sud, B.1.617.2, brésil, coronavirus, COVID-19, épidémiologie, inde, Infectiologie, lignage B.1.617.2, mutations, nouveaux variants, protéine S, protéine spike, SARS-CoV-2, spicule, variant Delta, variants, variants of concern, variants préoccupants, variats préoccupants, varient indien, Virologie, VOC | Commentaires fermés sur Covid-19 : comment le variant indien a débarqué au Brésil

Covid-19 : moindre sensibilité du variant indien B.1.167.2 aux vaccins et aux anticorps monoclonaux

Une étude française montre que le variant indien B.1.167.2 présente de façon significative une moindre sensibilité aux anticorps neutralisants développés par des patients Covid-19 convalescents ou produits après vaccination. L’originalité de cette étude, parue le 27 mai 2021 sur le site de prépublication bioRxiv, tient notamment au fait que les chercheurs n’ont pas utilisé de …

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Publié dans Angleterre, anticorps monoclonaux, AstraZeneca, B.1.167.1, B.1.167.2, B.1.167.3, clusters, coronavirus, épidémiologie, foyers de contamination, inde, Infectiologie, mutations, NTD, Pfizer, protéine S, protéine spike, RBD, royaume uni, SARS-CoV-2, séroneutralisation, spicule, vaccin, Vaccinologie, variant, variant indien, variants indiens, variants préoccupants, Virologie, VOC | Commentaires fermés sur Covid-19 : moindre sensibilité du variant indien B.1.167.2 aux vaccins et aux anticorps monoclonaux

Malaisie : un nouveau coronavirus, issu d’une recombinaison entre un virus canin et félin, isolé chez un patient hospitalisé pour pneumonie

Un nouveau coronavirus, issu d’une recombinaison entre deux coronavirus, l’un canin, l’autre félin, a été identifié chez un enfant présentant une pneumonie. Ce virus a été entièrement séquencé par une équipe de chercheurs américains, éthiopiens, chinois, malaisiens et singapouriens. Leurs résultats ont été publiés en ligne le 20 mai 2021 dans la revue Clinical Infectious …

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La piste d’un vaccin universel anti-coronavirus

Plusieurs études récemment publiées indiquent que le développement d’un vaccin capable de reconnaître des cibles communes à plusieurs familles de coronavirus animaux et humains serait un objectif atteignable sur le plan scientifique. En d’autres termes, créer un vaccin universel anti-coronavirus semble donc possible. Les coronavirus responsables du SARS (syndrome respiratoire aigu sévère), du MERS (syndrome …

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Publié dans adjuvant, anticorps neutralisants, anticorps neutralisants à large spectre, ARN messager, Betacoronavirus, chauves-souris, coronavirus, COVID-19, domaine de liaison au récepteur, domaine RBD, ferritine, immunité cross-neutralisante, Immunologie, Infectiologie, macaques, nanoparticules, nanoparticules de ferritine, nanoparticules lipidiques, nanoparticules mosaïques, nouveaux variants, pandémie, protéine S, protéine spike, pseudovirus, RBD, receptor binding domain, recherche animale, SARS-CoV-1, SARS-CoV-2, singe, souris, vaccin à ARN messager, vaccin pan-coronavirus, vaccin universel anti-coronavirus, vaccination, Vaccinologie, Virologie | Commentaires fermés sur La piste d’un vaccin universel anti-coronavirus

Covid-19 : ces variants préoccupants anglais, sud-africain et brésilien qui circulent en Europe

Réalisée entre juin 2020 et février 2021 sous l’égide du Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC, Stockholm, Suède), une étude a analysé les données des cas Covid-19 liés à des « variants préoccupants » (Variants Of Concern ou VOC), en l’occurrence aux variants anglais B.1.1.7, sud-africain B.1.351 et brésilien P.1. Il  …

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Covid-19 : que sait-on du variant new-yorkais ?

Identifié pour la première fois dans la ville de New York en novembre 2020, le variant B.1.526 a vu sa prévalence augmenter fortement depuis le début de l’année. La proportion de ce nouveau lignage viral est ainsi passée de 3 % à la mi-janvier 2021 à 34 % fin février. Au 5 avril 2021, l’analyse …

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Covid-19 : infections post-vaccinales dues à des variants

C’est l’histoire de deux femmes qui ont contracté la Covid-19, respectivement 19 et 36 jours, après avoir reçu leur deuxième dose d’un vaccin à ARN messager. Le cas de ces patientes a été rapporté le 21 avril 2021 par des médecins et chercheurs américains dans un article en ligne du New England Journal of Medicine. …

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Covid-19 : transmission par aérosols ou comment le coronavirus a contaminé des passagers d’un mini-bus

C’est l’histoire de deux chauffeurs de bus américains qui ont transmis le SARS-CoV-2 à plusieurs passagers, alors que ces derniers portaient un masque et respectaient la distanciation physique. Ces deux cas sont rapportés par des médecins et des chercheurs de la faculté de médecine Case Western Reserve de Cleveland (Ohio, États-Unis) dans un article publié …

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Une seule dose de vaccin stimule l’immunité contre certains variants du SARS-CoV-2 chez des personnes ayant déjà été infectées

Que se passe-t-il sur le plan immunitaire chez un individu qui reçoit une première dose de vaccin alors qu’il avait antérieurement contracté la Covid-19 ? Telle est la question à laquelle des immunologistes britanniques ont cherché à répondre. Il importe en effet de savoir en quoi la vaccination anti-Covid-19 peut influer sur la réponse immunitaire …

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Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le variant indien

Après le B.1.1.7 anglais, le B.1.351 sud-africain, le P.1 brésilien, c’est au tour d’un autre variant du SARS-CoV-2, cette fois identifié en Inde, de faire les gros titres de la presse internationale. Depuis quelques semaines, l’Inde connaît en effet une flambée épidémique. Dès lors le rapprochement a été vite fait avec l’émergence de ce nouveau …

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Covid-19 : quid de la production de variants chez un individu infecté et de leur transmission ?

Durant la pandémie de Covid-19, le séquençage du génome viral est utilisé pour suivre la diffusion de nouveaux variants porteurs de mutations spécifiques. On le sait, de nouvelles mutations, ou associations de mutations, peuvent conférer un avantage sélectif au virus, qui peut devenir plus transmissible ou échapper au système immunitaire. Il a ainsi été montré …

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Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1

Au Brésil, l’épidémie de Covid-19 est aujourd’hui dominée par plusieurs lignées virales SARS-CoV-2 qui ont toutes en commun de posséder la mutation E484K dans la protéine S (spike ou spicule), qui permet au virus de se fixer sur les cellules qu’ils infectent. Cette mutation est problématique dans la mesure où elle peut contribuer à un …

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Covid-19 : retour sur les premiers cas de variant sud-africain en France et les premières chaînes de contamination

Une enquête épidémiologique détaille l’origine des premiers cas notifiés en France d’infection par le variant dit sud-africain du SARS-Cov-2*. Également dénommé B.1.351, ce dernier comporte plusieurs mutations dans le gène codant la protéine S (spicule ou spike en anglais), notamment les mutations N501Y et E484K, respectivement associées à une plus grande transmissibilité et à un …

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Covid-19 : transmission du coronavirus par voie aéroportée dans une église en Australie

L’histoire remonte à juillet 2020 et se déroule en Australie. Elle est relatée dans un article daté du 5 avril 2021 dans la revue en ligne Emerging Infectious Diseases. Tout commence le 18 juillet 2020 lorsque le service de santé publique de la ville de Sydney apprend l’existence d’un cas d’infection par le SARS-CoV-2 chez …

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Covid-19 : malgré la quarantaine, des passagers d’un vol international à l’origine de multiples chaînes de contamination

L’histoire se déroule en Nouvelle-Zélande, pays qui pratique une stratégie d’isolement et de mise en quatorzaine à ses frontières dans le but d’éliminer le coronavirus SARS-CoV-2. Le 18 septembre 2020, un cas de Covid-19 est identifié. Le patient est un des passagers d’un vol international en provenance d’Inde. À sa descente d’avion, cet homme (G) …

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Infecté il y a cinq ans, un survivant d’Ebola serait à l’origine d’une nouvelle épidémie en Guinée

Un survivant de l’épidémie d’Ebola de grande ampleur ayant sévi en Afrique de l’Ouest en 2013-2016 serait à l’origine de la flambée épidémique qui frappe actuellement la Guinée. Telle est la surprenante conclusion de trois rapports indépendants publiés le 12 mars 2021 sur le site virological.org. La nouvelle épidémie d’Ebola en Guinée n’aurait donc pas …

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Publié dans Afrique de l’Ouest, Ebola, épidémie, filovirus, génome, Guinée, Infectiologie, latence virale, Libéria, persistance virale, quiescence virale, République démocratique du Congo, séquençage génétique, Sierra Leone, sperme, survivant d’Ebola, taux de mutation, testicule, transmission sexuelle, Virologie, virus, virus à ARN | Commentaires fermés sur Infecté il y a cinq ans, un survivant d’Ebola serait à l’origine d’une nouvelle épidémie en Guinée

Infecté il y a cinq ans, un survivant d’Ebola serait à l’origine d’une nouvelle épidémie en Guinée

Un survivant de l’épidémie d’Ebola de grande ampleur ayant sévi en Afrique de l’Ouest en 2013-2016 serait à l’origine de la flambée épidémique qui frappe actuellement la Guinée. Telle est la surprenante conclusion de trois rapports indépendants publiés le 12 mars 2021 sur le site virological.org. La nouvelle épidémie d’Ebola en Guinée n’aurait donc pas …

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Surdité brusque et SARS-CoV-2 : une infection peut en cacher une autre

C’est l’histoire d’un homme de 29 ans, sans antécédent médical, qui se présente dans le service d’ORL du CHU de Dijon pour une surdité brusque bilatérale apparue depuis dix jours. Il n’existe pas d’autre signe à l’examen clinique. La femme du patient présente une anosmie et une agueusie. Cette perte d’odorat et du goût incite …

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Covid-19 : infection nosocomiale dans un hôpital israélien malgré le port du masque et la distanciation physique

Des médecins israéliens rapportent la survenue dans un hôpital pédiatrique d’une flambée épidémique de Covid-19 après qu’un enfant soit venu consulter, accompagné de sa mère. Et ce malgré le respect des mesures de protection habituelles : port du masque chirurgical et distanciation physique. Ces cas d’infection intra-hospitalière ont été rapportés le 27 janvier 2021 dans …

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Transplantation pulmonaire : un cas tragique de transmission du SARS-CoV-2 d’une donneuse à une receveuse

Des chirurgiens et médecins américains rapportent, dans un article publié en ligne le 10 février 2021 dans l’American Journal of Transplantation, un cas documenté de transmission du SARS-CoV-2 entre donneuse et receveuse dans le cadre d’une greffe bi-pulmonaire. La donneuse avait pourtant été testé négative pour le coronavirus au test RT-PCR réalisé sur prélèvement nasopharyngé. …

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New York : le coronavirus circulait plus d’un mois avant l’identification du premier cas de Covid-19

Des chercheurs américains rapportent que le SARS-CoV-2 était présent dans la ville de New York six à huit semaines avant l’identification du premier cas de Covid-19. Telle est la conclusion d’une étude postée sur le site de prépublication medXriv le 11 février 2021. On rappelle que le premier cas d’infection par le SARS-CoV-2 à New …

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Covid-19 : des personnels de santé israéliens contaminés par le coronavirus après la première dose de vaccin

Des médecins israéliens rapportent des cas de contamination par le coronavirus SARS-CoV-2 parmi le personnel du plus grand hôpital du pays après administration de la première dose de vaccin anti-Covid-19. Publié le 1er février 2021 dans la revue en ligne Emerging Infectious Diseases, ce rapport concerne vingt-deux cas de contamination post-vaccinale. Ceux-ci sont survenus lors …

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Pneumonie Covid-19 : une inflammation qui tourne en boucle

Le coronavirus SARS-CoV-2 peut provoquer une réaction inflammatoire pouvant aboutir, dans sa forme la plus grave, à un syndrome de détresse respiratoire aiguë. Une minorité de patients Covid-19 développent une pneumonie nécessitant le recours à la ventilation mécanique. La mortalité de ces patients est élevée (20 % à 40 %). Les déterminants de cette gravité …

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Covid-19 : quand le SARS-CoV-2 se déleste de petits fragments de son matériel génétique pour échapper aux anticorps

Avec l’apparition de nouveaux variants SARS-CoV-2, on sait désormais que ce coronavirus, dont le génome était considéré jusqu’à présent relativement stable, peut muter. Cette variabilité génétique repose sur l’apparition de mutations consistant en la substitution d’un nucléotide par un autre, autrement dit d’une « lettre » par une autre dans l’ARN viral. Comme pour tout …

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Manaus, Brésil : de nouveaux variants du SARS-CoV-2 se jouent-ils de l’immunité collective ?

Que se passe-t-il à Manaus dans l’État d’Amazonas ? En octobre 2020, cet état du nord-ouest du Brésil avait été durement touché par l’épidémie de Covid-19. Publiée en octobre 2020 dans la revue Science, une étude conduite auprès des donneurs de sang indiquait que plus des trois quarts (76 %) des habitants de la plus …

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Interview with Virologist Christian Drosten: »I Am Quite Apprehensive about What Might Otherwise Happen in Spring and Summer » – DER SPIEGEL

DER SPIEGEL: Professor Drosten, the pandemic has entered a decisive phase. The beginning of the vaccination campaign has meant light at the end of the tunnel, but now, more contagious virus variants have appeared. How dangerous is the situation in Germ… Continuer la lecture

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Covid-19 : vaccins et nouveaux variants, quel impact ?

Des chercheurs sud-africains rapportent 19 janvier 2021 sur le site de prépublication bioXriv des résultats indiquant que les mutations présentes dans le variant sud-africain 501Y.V2 lui confèrent la possibilité d’échapper à l’activité neutralisante des anticorps produits lors d’une infection naturelle, voire post-vaccination. Rappel : la protéine S (spike, spicule) de surface du coronavirus SARS-CoV-2 se …

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Publié dans 501.V3, 501Y.V.2, 501Y.V1, activité neutralisante, afrique du sud, anticorps monoclonaux, anticorps polyclonaux, B.1.1.7, B1.1.28, brésil, coronavirus, délétion, domaine N-terminal, E484K, émergence de nouveaux variants, Gènétique, immunité, Immunologie, Infectiologie, K417N/T, mutations, N501Y, nouveau variant, nouveaux variants, NTD, plasma, protéine S, protéine spike, pseudovirus, RBD, receptor binding domain, royaume uni, SARS-CoV-2, sérum, système immunitaire, Vaccinologie, variant anglais, variant brésilien, variant britannique, Virologie, VOC 202012/01 | Commentaires fermés sur Covid-19 : vaccins et nouveaux variants, quel impact ?

Covid-19 : le défi des nouveaux variants

Depuis quelques jours, les données concernant les variants du coronavirus SARS-CoV-2, qu’ils soient britanniques, sud-africain, brésilien, voire possiblement américain, se succèdent à un rythme soutenu. Ces informations sont publiées sur des sites de prépublication en attendant d’être évaluées par les pairs et faire l’objet d’une publication dans une revue scientifique. D’autres résultats sont postés en …

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Inventaire de mutations d’une région cruciale du SARS-CoV-2 influant sur la réponse en anticorps

Une équipe de chercheurs américains a établi une cartographie de toutes les mutations entraînant un changement d’acide aminé dans une petite région de la protéine spike de l’enveloppe du SARS-CoV-2. Baptisée RBD (domaine de fixation au récepteur, receptor binding domain), cette zone est celle qui permet au coronavirus de s’arrimer au récepteur ACE2 présent sur …

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Le SARS-CoV-2 continue de se répliquer jusqu’à 35 heures après le décès

Des médecins légistes allemands ont détecté la réplication du coronavirus SARS-CoV-2 dans la gorge de patients décédés de la Covid-19 plus de trente cinq heures après leur mort. L’équipe d’Axel Heinemann de l’université de Hambourg a évalué la stabilité du SARS-CoV-2 et son pouvoir infectieux en période post-mortem. Cette étude a pu être réalisée dans …

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« Réalités Biomédicales » : les 10 billets les plus lus de 2020

Vous êtes toujours de plus en plus nombreux à lire ce blog, le seul à vous raconter, depuis maintenant sept ans, des histoires médicales extraordinaires. Mon désir est toujours le même : vous surprendre, toujours avec sérieux et bonne humeur, en vous relatant des cas cliniques insolites, déroutants, hallucinants, exceptionnels, incroyables, inimaginables, inoubliables, récemment publiés …

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Royaume-Uni : un variant du coronavirus SARS-CoV-2 porteur de nombreuses mutations

Le gouvernement britannique a annoncé que des chercheurs ont identifié un nouveau variant du coronavirus SARS-CoV-2. Celui-ci renferme un nombre de mutations plus important que la plupart des autres variants, raison pour laquelle il est pris « particulièrement au sérieux », a indiqué Chris Whittie, le Chief medical officer for England. « Le groupe consultatif sur les …

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Les traitements anti Covid qui existent déjà sont-ils les grands oubliés de la politique sanitaire ? | Atlantico.fr

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L’aventure scientifique des vaccins à ARN messager

C’est l’histoire d’un concept scientifique qui a débouché, en un temps record, sur le développement et la production à grande échelle de préparations vaccinales qui seront pour la première fois administrées chez l’homme dans un contexte très particulier, celui d’une maladie infectieuse pandémique. Des millions de doses des vaccins élaborés par Pfizer/BioNTech d’une part, Moderna …

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Covid-19 : persistance du SARS-CoV-2 dans l’intestin trois mois après le début des symptômes

Le SARS-CoV-2 peut persister dans l’intestin jusqu’à trois mois après l’infection virale. Telle est l’intrigante observation rapportée dans un article posté le 5 novembre 2020 sur le site de prépublication bioRxiv par une équipe américaine au terme d’une étude dont l’objectif premier était d’analyser la réponse en anticorps dirigés contre le SARS-CoV-2 dans le cadre …

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Covid-19 et perte d’odorat : du nouveau sur la persistance du SARS-CoV-2 et son potentiel neuroinvasif

Le SARS-CoV-2 peut persister au sein de l’épithélium olfactif, non seulement pendant plusieurs semaines à la suite de la Covid-19, mais également pendant des mois après la disparition des symptômes, indique une étude française postée le 18 novembre 2020 sur le site de prépublication bioRxiv. Les données de ces travaux semblent également indiquer que le …

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SARS-CoV-2 : que sait-on de la dynamique de la charge virale, des durées d’excrétion et de contagiosité du virus ?

L’évolution dans le temps de la quantité du virus SARS-CoV-2 dans un organisme humain infecté et de sa présence dans divers fluides biologiques influent sur la transmission du virus responsable de la maladie Covid-19. Pour décrire ces paramètres essentiels pour estimer la durée du pouvoir infectieux du virus, et par là même sa contagiosité, les …

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Covid-19 : combien de particules virales un être humain infecté par le SARS-CoV-2 renferme-t-il ?

Des chercheurs israéliens ont estimé le nombre total de particules virales (ou virions) présentes chez une personne infectée par le SARS-CoV-2 durant le pic de l’infection. Ils ont également évalué la masse de la totalité de ces virions dans le corps humain et même, pandémie oblige, à l’échelle de la planète. Le moins que l’on …

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Covid-19 : ce que l’on sait sur les enfants et adolescents et ce qu’il reste à apprendre

Depuis le début de l’épidémie de Covid-19, les données attestent que les enfants développent rarement une forme sévère de Covid-19. En effet, les enfants infectés présentent le plus souvent des symptômes légers [1]. Le fait que l’infection aiguë par le SARS-CoV-2 est le plus souvent bénigne chez les enfants a participé à l’idée largement répandue …

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