Archives de catégorie : variant

Covid-19 : le variant Omicron aurait émergé chez la souris, selon une étude

Le variant Omicron apparaît mieux équipé pour reconnaître le récepteur cellulaire ACE2 de la souris que celui de l’homme, rapportent des chercheurs américains dans une étude publiée le 18 octobre 2022 dans les Comptes rendus de l’Académie américaine des sciences (PNAS). On rappelle que le coronavirus SARS-CoV-2 se fixe par l’intermédiaire de la région RBD …

Continuer la lecture

Publié dans Animal, animal de compagnie, coronavirus, COVID-19, médecine vétérinaire, nouveaux variants, Omicron, one health, protéine spike, rat, RBD, RBM, récepteur ACE2, receptor binding domain, receptor binding motif, réservoir animal, rongeur, rongeurs, rongeurs domestiques, SARS-CoV-2, souris, variant, Virologie | Commentaires fermés sur Covid-19 : le variant Omicron aurait émergé chez la souris, selon une étude

Covid-19 : des rats domestiques contaminés par leur propriétaire infecté par le SARS-CoV-2

Deux rats domestiques ont été contaminés par le variant Omicron du SARS-CoV-2 à partir d’une personne infectée, rapportent des chercheurs français dans un article paru le 13 octobre 2022 sur le site de prépublication bioRxiv. L’un des rongeurs a développé des symptômes sévères. Ces résultats sont présentés par Xavier Montagutelli, Bérénice Decaudin et Étienne Simon-Laurière …

Continuer la lecture

Publié dans Animal, animal de compagnie, coronavirus, COVID-19, eaux usées, lignages cryptiques, médecine vétérinaire, nouveaux variants, Omicron, one health, rat, rat domestique, réservoir secondaire, rongeur, rongeurs domestiques, SARS-CoV-2, souris, spectre d’hôte, variant, Virologie, zoologie | Commentaires fermés sur Covid-19 : des rats domestiques contaminés par leur propriétaire infecté par le SARS-CoV-2

BA.2.75.2, le nouveau sous-variant d’Omicron qui inquiète les scientifiques

L’évolution continue du variant Omicron du SARS-CoV-2 continue de produire de nouveaux sous-variants porteurs de mutations additionnelles. Un de ces sous-variants émergents, dénommé BA.2.75, s’est rapidement diffusé dans certaines parties du monde, mais sans encore surpasser BA.5, le variant actuellement dominant. BA.2.75, dont la fréquence augmente en Inde, a été détecté en juillet 2022 dans …

Continuer la lecture

Publié dans anticorps, anticorps neutralisants, BA.2.75, BA.2.75.2, BA.4, BA.5, convergence évolutive, coronavirus, COVID-19, échappement immunitaire, évasion immunitaire, évolution convergente, neutralisation, Omicron, SARS-CoV-2, sous-variants, Vaccinologie, variant, variants, Virologie | Commentaires fermés sur BA.2.75.2, le nouveau sous-variant d’Omicron qui inquiète les scientifiques

Pros : Prescrire, mars 2022 : médicaments utiles et inutiles

Chaque mois, la revue indépendante Prescrire passe en revue les médicaments nouvellement commercialisés, ainsi que les nouvelles indications de médicaments déjà sur le marché. Elle en discute les mérites et démérites, par comparaison avec les autres traitements disponibles. Voici les médicaments qu’elle a examinés dans son numéro de mars 2022. POUR LES PROS :L’article qui … Lire la suite Continuer la lecture

Publié dans adrénaline, alirocumab, allergie, Amlodipine, Anti cholestérol, Anticorps monoclonal, Aprexevo, Arachides, Bénéfices, bénéfices/risques, Casirivimab, cholestérol, Covid, COVID-19, Dapaglifozine, de plaquettes, dépression, Désensibilisation, Diabète, Eskétamine, Filgotinib, Forxiga, fostamatinib, hémorragies, HTA, hypertension artérielle, Imdévimab, Immunodépresseur, information, insuffisance rénale chronique, Irbésartan, IRC, Jyseleca, Lagevrio°, médicament, médicaments, Méthodes, Méthotrexate, Monupiravir, Palforzia, Pensées suicidaires, plaquettes, polyarthrite rhumatoïde, Praluent, Prescrire, Protéines d'arachides, Risque suicidaire, risques, Ronapreve°, saignements, Spravato, suicide, Tavlesse, tentative de suicide, thrombopenie, Thrombopénie immunitaire chronique, traitement, Transfusio, variant | Commentaires fermés sur Pros : Prescrire, mars 2022 : médicaments utiles et inutiles

Infection par Omicron : quelle réponse contre d’autres variants chez les vaccinés et non-vaccinés ?

Une étude sud-africaine a évalué, chez des individus vaccinés et non vaccinés, la capacité des anticorps produits après une infection par le variant Omicron à combattre d’autres variants du SARS-CoV-2. Les résultats ont été publiés le 22 mars 2022 dans la revue Cell Host and Microbe. Conduite par Simon Richardson, Penny Moore et leurs collègues …

Continuer la lecture

Publié dans ADCC, ADCP, alpha, anticorps neutralisants, BA.1, bêta, breakthrough Infection, breakthrough Infections, coronavirus, COVID-19, cytotoxicité cellulaire, D614G, Delta, gamma, immunité, immunité neutralisante, immunité neutralisante croisée, Immunologie, infection post-vaccinale, non-vaccinés, Omicron, phagocytose dépendante des anticorps, rappel, SARS-CoV-2, troisième dose, vaccination, vaccinés, Vaccinologie, variant, Virologie | Commentaires fermés sur Infection par Omicron : quelle réponse contre d’autres variants chez les vaccinés et non-vaccinés ?

Dans le sillage d’Omicron, les singularités de BA.2

L’ascension du variant Omicron (B.1.1.529) a été fulgurante dans de nombreux pays. Initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud en novembre 2021, ce nouveau variant du SARS-CoV-2 est aujourd’hui présent dans au moins 67 pays. Ce variant préoccupant est composé de trois sous-lignages désignés BA.1 (majoritaire), BA.2 et BA.3 (très peu détecté). Un …

Continuer la lecture

Publié dans ACE2, anticorps, anticorps neutralisants, biologie, Biologie humaine, bronche, cellule, charge virale, coronavirus, COVID-19, délétion, Delta, domaine de liaison au récepteur, dynamique virale, échappement immunitaire, épidémiologie, épithélium nasal, évasion immunitaire, fusion membranaire, Immunologie, modèle animal, mutation, Omicron, pathogénicité, PCR, poumon, protéine spike, pseudovirus, RBD, récepteur ACE2, réplication virale, RT-PCR, SARS-CoV-2, séquence génomique, spike, TMPRSS2, transmissibilité, Vaccinologie, variant, variants, Virologie, virus | Commentaires fermés sur Dans le sillage d’Omicron, les singularités de BA.2

Omicron : une biologie et une dynamique virale différentes de celles observées chez les précédents variants

Dans ce billet de blog, je vous invite, à travers les données issues d’articles publiés ces dernières semaines, à comprendre les moyens utilisés par la recherche pour explorer les propriétés biologiques et virologiques d’Omicron. Celles-ci révèlent en quoi ce nouveau variant du SARS-CoV-2 est atypique. L’objectif des chercheurs est de comprendre comment les multiples mutations …

Continuer la lecture

Publié dans ACE2, anticorps, anticorps neutralisants, Biologie humaine, biologie structurale, bronche, cathepsine, cellule, charge virale, conformation, coronavirus, cryo-EM, cryomicroscopie électronique, délétion, Delta, domaine amino-terminal, domaine de liaison au récepteur, durée d'excrétion, dynamique virale, échappement immunitaire, ectodomaine, effet épistatique, épistasie, épithélium nasal, épitopes, évasion immunitaire, excrétion virale, fusion membranaire, IFITM, Immunologie, mutation, Omicron, particules virales, PCR, peptide de fusion, poumon, protéine spike, protomère, pseudovirus, RBD, récepteur ACE2, réplication, réplication virale, RT-PCR, SARS-CoV-2, séquence génomique, sites antigéniques, sous-unité S1, sous-unité S2, spike, TMPRSS2, transmissibilité, trimère, variant, variants, Virologie, virus, voie endosomale | Commentaires fermés sur Omicron : une biologie et une dynamique virale différentes de celles observées chez les précédents variants

Les 10 billets les plus lus de 2021 sur le blog « Réalités biomédicales »

Depuis la création de ce blog il y a huit ans, mon désir est toujours le même : vous surprendre, toujours avec sérieux et bonne humeur en vous racontant des histoires médicales extraordinaires. Vous êtes toujours de plus en plus nombreux à lire ce blog, le seul à vous raconter des cas cliniques insolites, déroutants, …

Continuer la lecture

Publié dans Anatomopathologie, Cardiologie, cas clinique, cerveau, chirurgie, coronavirus, COVID-19, Gastroentérologie, Imagerie médicale - Radiologie, Immunologie, Infectiologie, médecine sexuelle, Neurologie, proctologie, SARS-CoV-2, sexologie, Urologie, Vaccinologie, variant, variant Delta, variant Omicron, Virologie | Commentaires fermés sur Les 10 billets les plus lus de 2021 sur le blog « Réalités biomédicales »

Variant Omicron : un risque d’échappement immunitaire

Le moins qu’on puisse dire est que le nouveau variant Omicron initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud inquiète les spécialistes. Une étude, publiée sous forme de preprint sur le site medRxiv, rapporte un risque accru de réinfection associé à ce nouveau variant du SARS-CoV-2. En d’autres termes, Omicron présente une capacité accrue …

Continuer la lecture

Publié dans ACE2, afrique du sud, alpha, anticorps, bêta, breakthrough Infections, coronavirus, COVID-19, Delta, domaine de liaison au récepteur, échappement immunitaire, épidémiologie, immunité naturelle, immunité vaccinale, infections post-vaccinales, nouveau variant, NTD, Omicron, RBD, récepteur ACE2, réinfection, SARS-CoV-2, taux de reproduction effectif, transmissibilité, vaccin, vaccination, vague, variant, Virologie | Commentaires fermés sur Variant Omicron : un risque d’échappement immunitaire

Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le nouveau variant Omicron (B.1.1.529)

Après le variant Delta (ex-variant B.1.1.7 dit britannique), le variant Beta (ex-variant sud-africain B.1.351), le variant Gamma (ex-variant P.1 dit brésilien), c’est donc au tour d’un autre variant du SARS-CoV-2, dénommé Omicron (ou variant B.1.1.519), de faire les gros titres de la presse internationale et d’occuper le devant de la scène sur les chaînes d’info …

Continuer la lecture

Publié dans Afrique australe, afrique du sud, analyse phylogénétique, B.1.1.529, Botswana, cas clinique, constellation de mutations, coronavirus, COVID-19, délétion, Divers, domaine amino-terminal, domaine de liaison au récepteur, domaine N-terminal, échappement immunitaire, épidémiologie, épitopes, évolution intra-hôte, évolution virale accélérée, gestes barrières, immunodéprimés, Immunologie, immunosuppression, infection prolongée par le SARS-CoV-2, insertion, MESURES BARRIERES, mesures non pharmaceutiques, NTD, Omicron, pateints immunodéprimés, PCR, profil mutationnel, protéine S, protéine spike, pseudovirus, RBD, SARS-CoV-2, séquençage génomique, spicule, variant, Variant Of Concern, variant préoccupant, vih, Virologie, virus du sida, VOC | Commentaires fermés sur Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le nouveau variant Omicron (B.1.1.529)

Covid-19 : Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon… l’émergence sans fin des variants

Il ne se passe plus un jour sans que l’on entende parler du variant Delta, identifié pour la première fois en Inde. Il est pourtant loin d’être la seule lignée virale à inquiéter les épidémiologistes, médecins et autorités sanitaires nationales et internationales. À ce jour, dans le monde, on dénombre une petite vingtaine de variants …

Continuer la lecture de « Covid-19 : Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon… l’émergence sans fin des variants »

Continuer la lecture

Publié dans Afrique, alpha, bêta, coronavirus, COVID-19, délétion, Delta, épidémiologie, Epsilon, fitness, gamma, insertion, Iota, Kappa, Lambd, mutations, nouveaux variants, NTD, Ouganda, protéine spike, RDB, SARS-CoV-2, séquençage génomique, susbtitution, Theta, vaccin, vaccination, variant, Variant Of Concern, Variant Of Interest, variant under monitoring, variants, variants préoccupants, Virologie, VOC, VOI, VUM | Commentaires fermés sur Covid-19 : Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon… l’émergence sans fin des variants

Des lions infectés par le variant Delta dans un zoo en Inde

Des vétérinaires et virologistes indiens rapportent plusieurs cas d’infection naturelle par le variant Delta du SARS-CoV-2 chez des lions d’Asie (Panthera leo persica, encore appelé lion persan). Leurs travaux sont parus le 2 juillet 2021 sur le site de prépublication bioRxiv. Le séquençage génomique du virus détecté chez ces félins maintenus en captivité dans un …

Continuer la lecture de « Des lions infectés par le variant Delta dans un zoo en Inde »

Continuer la lecture

Publié dans Animal, animal de compagnie, animal domestique, animaux, B.1.167.2, barrière d'espèce, chat, chien, coronavirus, COVID-19, épidémiologie, faune sauvage, félin, félins, Furet, inde, lion, médecine vétérinaire, mustélidés, one health, parc zoologique, Santé publique, SARS-CoV-2, singes, spillback, spillover, tigre, une seule santé, variant, variant Delta, variant indien, Virologie, vison, visons d'élevage, zoo | Commentaires fermés sur Des lions infectés par le variant Delta dans un zoo en Inde

Syndrome de Cotard et Covid-19 : lorsqu’une patiente affirme qu’elle est morte et que son cerveau se décompose

L’histoire concerne une femme turque de 41 ans, institutrice en école primaire, hospitalisée pour une perte d’odorat (anosmie), des douleurs musculaires et  un mal de gorge. Le test RT-PCR réalisé sur prélèvement nasopharyngé est positif pour le variant anglais B.1.1.7, aujourd’hui dénommé Alpha. Les symptômes s’améliorent progressivement. Après dix jours, le test PCR revient négatif, mais …

Continuer la lecture de « Syndrome de Cotard et Covid-19 : lorsqu’une patiente affirme qu’elle est morte et que son cerveau se décompose »

Continuer la lecture

Publié dans antipsychotique, B.1.1.7, coronavirus, COVID-19, délire de négation, électroconvulsivothérapie, épisode psychotique, mort, neuroleptique, Neurologie, neuropsychiatrie, Neuropsychologie, olanzapine, psychiatrie, SARS-CoV-2, sismothérapie, syndrome de Cotard, variant, variant Alpha, variant anglais | Commentaires fermés sur Syndrome de Cotard et Covid-19 : lorsqu’une patiente affirme qu’elle est morte et que son cerveau se décompose

Covid-19 : nouvelles données sur le variant Delta, dit « indien », en progression dans de nombreux pays

Identifié initialement en Inde, le variant Delta est désormais majoritaire au Royaume-Uni, où il représente environ 90 % des cas d’infection par le virus SARS-CoV-2. En date du 14 juin 2021, selon la base de données génomiques Gisaid, 61 autres pays étaient touchés par ce variant, anciennement dénommé variant indien (ou encore B.1.617.2, mais aussi …

Continuer la lecture de « Covid-19 : nouvelles données sur le variant Delta, dit « indien », en progression dans de nombreux pays »

Continuer la lecture

Publié dans anticorps de sujets convalescents, anticorps monoclonaux, B.1.617.2, coronavirus, COVID-19, E484K, E484Q, EFFICACITE VACCINALE, épidémiologie, Gisaid, L425R, mutations, REACT-1, SARS-CoV-2, séquençage génomique, test PCR de criblage, Vaccinologie, VACCINS, variant, variant Alpha, variant Beta, variant brésilie, variant Delta, variant Gamma, variant indien, variant sud-africain, variants, variants of concern, variants préoccupants, Virologie, VOC, VOC-21APR-02 | Commentaires fermés sur Covid-19 : nouvelles données sur le variant Delta, dit « indien », en progression dans de nombreux pays

Covid-19 : moindre sensibilité du variant indien B.1.167.2 aux vaccins et aux anticorps monoclonaux

Une étude française montre que le variant indien B.1.167.2 présente de façon significative une moindre sensibilité aux anticorps neutralisants développés par des patients Covid-19 convalescents ou produits après vaccination. L’originalité de cette étude, parue le 27 mai 2021 sur le site de prépublication bioRxiv, tient notamment au fait que les chercheurs n’ont pas utilisé de …

Continuer la lecture de « Covid-19 : moindre sensibilité du variant indien B.1.167.2 aux vaccins et aux anticorps monoclonaux »

Continuer la lecture

Publié dans Angleterre, anticorps monoclonaux, AstraZeneca, B.1.167.1, B.1.167.2, B.1.167.3, clusters, coronavirus, épidémiologie, foyers de contamination, inde, Infectiologie, mutations, NTD, Pfizer, protéine S, protéine spike, RBD, royaume uni, SARS-CoV-2, séroneutralisation, spicule, vaccin, Vaccinologie, variant, variant indien, variants indiens, variants préoccupants, Virologie, VOC | Commentaires fermés sur Covid-19 : moindre sensibilité du variant indien B.1.167.2 aux vaccins et aux anticorps monoclonaux

Covid-19 : ces variants préoccupants anglais, sud-africain et brésilien qui circulent en Europe

Réalisée entre juin 2020 et février 2021 sous l’égide du Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC, Stockholm, Suède), une étude a analysé les données des cas Covid-19 liés à des « variants préoccupants » (Variants Of Concern ou VOC), en l’occurrence aux variants anglais B.1.1.7, sud-africain B.1.351 et brésilien P.1. Il  …

Continuer la lecture de « Covid-19 : ces variants préoccupants anglais, sud-africain et brésilien qui circulent en Europe »

Continuer la lecture

Publié dans B.1.1.7, B.1.351, épidémiologie, Europe, hospitalisation, mutation E484K, non-VOC, P.1, pays européens, réanimation, séquençage génomique, variant, variant anglais, variant anglais B.1.1.7, variant brésilien P.1, variant sud-africain, variant sud-africain B.1.351, variants, variants of concern, Virologie, VOC | Commentaires fermés sur Covid-19 : ces variants préoccupants anglais, sud-africain et brésilien qui circulent en Europe

Covid-19 : que sait-on du variant new-yorkais ?

Identifié pour la première fois dans la ville de New York en novembre 2020, le variant B.1.526 a vu sa prévalence augmenter fortement depuis le début de l’année. La proportion de ce nouveau lignage viral est ainsi passée de 3 % à la mi-janvier 2021 à 34 % fin février. Au 5 avril 2021, l’analyse …

Continuer la lecture de « Covid-19 : que sait-on du variant new-yorkais ? »

Continuer la lecture

Publié dans B.1.351, B.1.526, breakthrough Infection, coronavirus, COVID-19, épidémiologie, infection post-vaccinale, P.1, réinfection, Santé publique, SARS-CoV-2, variant, variant brésilien, variant new-yorkais, variant sud-africain, variants, variants d’intérêt, variants préoccupants, Virologie, VOC, VOI | Commentaires fermés sur Covid-19 : que sait-on du variant new-yorkais ?

Covid-19 : retour sur les premiers cas de variant sud-africain en France et les premières chaînes de contamination

Une enquête épidémiologique détaille l’origine des premiers cas notifiés en France d’infection par le variant dit sud-africain du SARS-Cov-2*. Également dénommé B.1.351, ce dernier comporte plusieurs mutations dans le gène codant la protéine S (spicule ou spike en anglais), notamment les mutations N501Y et E484K, respectivement associées à une plus grande transmissibilité et à un …

Continuer la lecture de « Covid-19 : retour sur les premiers cas de variant sud-africain en France et les premières chaînes de contamination »

Continuer la lecture

Publié dans afrique du sud, agrégats de cas, B.1.351, cas d'importation, cas importés, chaînes de contamination, cluster, cluster familial, coronavirus, COVID-19, enquête épidémiologique, épidémiologie, foyer épidémique, foyers d’infection, foyers familiaux, Infectiologie, Mozambique, SARS-CoV-2, transmission, variant, variant sud-africain, Virologie, virus | Commentaires fermés sur Covid-19 : retour sur les premiers cas de variant sud-africain en France et les premières chaînes de contamination

Royaume-Uni : un variant du coronavirus SARS-CoV-2 porteur de nombreuses mutations

Le gouvernement britannique a annoncé que des chercheurs ont identifié un nouveau variant du coronavirus SARS-CoV-2. Celui-ci renferme un nombre de mutations plus important que la plupart des autres variants, raison pour laquelle il est pris « particulièrement au sérieux », a indiqué Chris Whittie, le Chief medical officer for England. « Le groupe consultatif sur les …

Continuer la lecture de « Royaume-Uni : un variant du coronavirus SARS-CoV-2 porteur de nombreuses mutations »

Continuer la lecture

Publié dans ARN, coronavirus, COVID-19, délétion, délétions, épidémiologie, génome, génome viral, immunosuppresion, lignage, mutation, mutations, nouveau variant, nouvelle variante, PCR, SARS-CoV-2, séquence génétique, vaccin, Vaccinologie, VACCINS, variant, Virologie, virus, VUI-202012/01 | Commentaires fermés sur Royaume-Uni : un variant du coronavirus SARS-CoV-2 porteur de nombreuses mutations

Coronavirus SARS-CoV-2 : quelle importance revêt la mutation génétique D614G ?

C’est l’histoire d’une mutation génétique qui a déjà beaucoup fait parler d’elle sur les réseaux sociaux et certains sites Internet depuis quelques temps. Surtout depuis le 30 avril dernier, date à laquelle un article posté sur le site de prépublication bioRxiv et émanant d’un laboratoire de recherche très connu a rapporté la présence d’une mutation …

Continuer la lecture de « Coronavirus SARS-CoV-2 : quelle importance revêt la mutation génétique D614G ? »

Continuer la lecture

Publié dans Biologie moléculaire, charge virale, clade, coronavirus, COVID-19, D14, dérive génétique, enveloppe virale, épidémiologie, épidémiologie moléculaire, G614, mutation D614G, pandémie, protéine S, protéine spike, Pseudo-particules virales, pseudovirions, sélection naturelle, spicule, variant, Virologie, virus | Commentaires fermés sur Coronavirus SARS-CoV-2 : quelle importance revêt la mutation génétique D614G ?