Archives de catégorie : sous-variants

COVID-19 : dans le maquis des variants et sous-variants d’Omicron

Dans ce billet de blog, je souhaite vous faire lire un fil rédigé sur Twitter par T. Ryan Gregory, professeur en biologie de l’évolution à l’université de Guelph (Ontario, Canada). Ryan m’a donné son accord pour la traduction et l’adaptation de sa série de tweets publiés le 10 janvier 2022. À sa lecture, j’ai non …

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Publié dans Aeterna, Argus, BA.1, BA.2, BA.5, Basilic, Basilisk, BF.7, BQ.1, BQ.1.1, Centaure, Centaurus, Cerberus, Cetus, CH1.1, Chiron, coronavirus, COVID-19, Dictys, Evolution, Génétique - Biologie moléculaire, Gryphon, Hippogryph, Hydra, Kraken, Mimas, Minotaure, Omicron, Orthrus, Python, SARS-CoV-2, sous-lignages, sous-variants, Sphinx, Triton, Typhon, variants, Virologie, XBB.1.5 | Commentaires fermés sur COVID-19 : dans le maquis des variants et sous-variants d’Omicron

Covid-19 : comment Omicron a-t-il évolué depuis son émergence il y a un an ?

Il y a un an, le 26 novembre 2021, l’Organisation mondiale de la santé désignait le variant B.1.1.529 comme variant préoccupant, sous l’appellation Omicron. Par quels mécanismes moléculaires ce lignage du SARS-CoV-2 a-t-il depuis évolué ? Quelles trajectoires évolutives a-t-il suivies pour générer de nombreux sous-lignages, eux-mêmes à l’origine de multiples sous-variants ? Et quelle …

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Publié dans ACE2, anticorps neutralisants, BA.1, BA.2, BA.2.75, BA.2.75.2, BA.4, BA.5, breakpoint, co-infection, convergence évolutive, coronavirus, COVID-19, délétions, Delta, dérive antigénique, distance antigénique, domaine NTD, évolution convergente, Génétique - Biologie moléculaire, immunodéprimé, infection chronique, infection persistante, lignages, mécanisme évolutif, mutations, mutations antigéniques, mutations RBD, NTD, Omicron, point de cassure, protéine spike, RBD, récepteur cellulaire ACE2, recombinaison génétique, SARS-CoV-2, sous-lignages, sous-lignages d’Omicron, sous-variants, surveillance génomique, trajectoire évolutive, variant préoccupant, Virologie, virus recombinant, XBB | Commentaires fermés sur Covid-19 : comment Omicron a-t-il évolué depuis son émergence il y a un an ?

Covid-19 : quand le séquençage du génome entier du virus guide le traitement en cas d’infection persistante

Chez de rares patients immunodéprimés, l’infection par le SARS-CoV-2 peut entraîner une infection chronique pendant plusieurs semaines ou plusieurs mois. On dispose de peu de données sur la prise en charge thérapeutique de ces patients, qui pourraient bénéficier d’associations de médicaments ou de traitements pendant une durée plus longue. Il importe alors de savoir s’il …

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Publié dans coronavirus, COVID-19, génome viral, Infectiologie, infection chronique, infection persistante, infection prolongée, infection prolongée par le SARS-CoV-2, mutations, Omicron, patients immunodéprimés, réinfection, SARS-CoV-2, séquençage génomique, séquence de génome entier, sous-lignages, sous-variants, traitement antiviral, variants, Virologie, WGS | Commentaires fermés sur Covid-19 : quand le séquençage du génome entier du virus guide le traitement en cas d’infection persistante

Covid-19 : le sous-variant BQ.1.1 d’Omicron progresse en France

L’évolution continue du variant Omicron, apparu fin 2021, a entraîné l’émergence de nouveaux sous-variants. Ces nouveaux venus n’en finissent pas d’éroder l’immunité acquise par la vaccination et/ou l’infection naturelle et de présenter des propriétés biologiques différentes, notamment du fait de leur capacité d’échappement immunitaire et de changements fonctionnels de leur protéine spike. Comme BA.4.6 et …

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