Archives de catégorie : séquençage génomique

Covid-19 : ces variants préoccupants anglais, sud-africain et brésilien qui circulent en Europe

Réalisée entre juin 2020 et février 2021 sous l’égide du Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC, Stockholm, Suède), une étude a analysé les données des cas Covid-19 liés à des « variants préoccupants » (Variants Of Concern ou VOC), en l’occurrence aux variants anglais B.1.1.7, sud-africain B.1.351 et brésilien P.1. Il  …

Continuer la lecture de « Covid-19 : ces variants préoccupants anglais, sud-africain et brésilien qui circulent en Europe »

Continuer la lecture

Publié dans B.1.1.7, B.1.351, épidémiologie, Europe, hospitalisation, mutation E484K, non-VOC, P.1, pays européens, réanimation, séquençage génomique, variant, variant anglais, variant anglais B.1.1.7, variant brésilien P.1, variant sud-africain, variant sud-africain B.1.351, variants, variants of concern, Virologie, VOC | Commentaires fermés sur Covid-19 : ces variants préoccupants anglais, sud-africain et brésilien qui circulent en Europe

Covid-19 : transmission par aérosols ou comment le coronavirus a contaminé des passagers d’un mini-bus

C’est l’histoire de deux chauffeurs de bus américains qui ont transmis le SARS-CoV-2 à plusieurs passagers, alors que ces derniers portaient un masque et respectaient la distanciation physique. Ces deux cas sont rapportés par des médecins et des chercheurs de la faculté de médecine Case Western Reserve de Cleveland (Ohio, États-Unis) dans un article publié …

Continuer la lecture de « Covid-19 : transmission par aérosols ou comment le coronavirus a contaminé des passagers d’un mini-bus »

Continuer la lecture

Publié dans aération, aérosols, bus, chauffeur, contact-tracing, contamination, coronavirus, COVID-19, DISTANCIATION PHYSIQUE, Divers, épidémiologie, espace clos, masque, mini-bus, passagers, SARS-CoV-2, séquençage génomique, transmission, transmission aérienne, transmission aéroportée, van, véhicule, ventilation, Virologie | Commentaires fermés sur Covid-19 : transmission par aérosols ou comment le coronavirus a contaminé des passagers d’un mini-bus

Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le variant indien

Après le B.1.1.7 anglais, le B.1.351 sud-africain, le P.1 brésilien, c’est au tour d’un autre variant du SARS-CoV-2, cette fois identifié en Inde, de faire les gros titres de la presse internationale. Depuis quelques semaines, l’Inde connaît en effet une flambée épidémique. Dès lors le rapprochement a été vite fait avec l’émergence de ce nouveau …

Continuer la lecture de « Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le variant indien »

Continuer la lecture

Publié dans B.1.1.7, B.1.351, coronavirus, COVID-19, délétion, échappement immunitaire, épidémiologie, Gènétique, génomique, inde, Infectiologie, mutation, P.1, protéine S, protéine spike, royaume uni, SARS-CoV-2, séquençage génomique, spicule, transmissibilité, variant à suivre, variant anglais, variant B.1.1.617, variant brésilien, variant britannique, variant indien, Variant Of Concern, Variant Of Interest, variant préoccupant, variant under investigation, Virologie, virus, VOC, VOI, VUI | Commentaires fermés sur Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le variant indien

Covid-19 : quid de la production de variants chez un individu infecté et de leur transmission ?

Durant la pandémie de Covid-19, le séquençage du génome viral est utilisé pour suivre la diffusion de nouveaux variants porteurs de mutations spécifiques. On le sait, de nouvelles mutations, ou associations de mutations, peuvent conférer un avantage sélectif au virus, qui peut devenir plus transmissible ou échapper au système immunitaire. Il a ainsi été montré …

Continuer la lecture de « Covid-19 : quid de la production de variants chez un individu infecté et de leur transmission ? »

Continuer la lecture

Publié dans cluster, coronavirus, COVID-19, diversité intra-hôte, diversité intra-patient, évolution intra-patient, foyer épidémique, Gènétique, génome viral, goulot d'étranglement, mutations, protéine S, protéine spike, SARS-CoV-2, sélection purificatrice, séquençage génomique, spicule, transmission, variant dominant, variant minoritaire, Variant Of Concern, variants, variants préoccupants, Virologie, virus, VOC | Commentaires fermés sur Covid-19 : quid de la production de variants chez un individu infecté et de leur transmission ?

Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1

Au Brésil, l’épidémie de Covid-19 est aujourd’hui dominée par plusieurs lignées virales SARS-CoV-2 qui ont toutes en commun de posséder la mutation E484K dans la protéine S (spike ou spicule), qui permet au virus de se fixer sur les cellules qu’ils infectent. Cette mutation est problématique dans la mesure où elle peut contribuer à un …

Continuer la lecture de « Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1 »

Continuer la lecture

Publié dans ACE2, activité neutralisante, Amazonas, analyse phylogénétique, anticorps, anticorps monoclonaux, anticorps neutralisants, B.1.1.7, B.1.351, brésil, contagiosité, coronavirus, COVID-19, D614G, domaine NTD, domaine RBD, domaine RBM, E484K, écepteur ACE2, échappement immunitaire, épidémiologie, Immunologie, Infectiologie, K417N/T, létalité, Manaus, mutations, N.10, N.9, N501Y, neutralisation, P.2, pathogénicité, pouvoir neutralisant, protéine S, protéine spike, RBD, RBM, SARS-CoV-2, séquençage génomique, spicule, transmissibilité, vaccin, vaccination, variant anglais, variant brésilien, variant britannique, Variant Of Concern, variant P.1, variant sud-africain, variants d’intérêt, Variants Of Interest, variants préoccupants, Virologie, virus, VOC, VOI | Commentaires fermés sur Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1

New York : le coronavirus circulait plus d’un mois avant l’identification du premier cas de Covid-19

Des chercheurs américains rapportent que le SARS-CoV-2 était présent dans la ville de New York six à huit semaines avant l’identification du premier cas de Covid-19. Telle est la conclusion d’une étude postée sur le site de prépublication medXriv le 11 février 2021. On rappelle que le premier cas d’infection par le SARS-CoV-2 à New …

Continuer la lecture de « New York : le coronavirus circulait plus d’un mois avant l’identification du premier cas de Covid-19 »

Continuer la lecture

Publié dans analyse phylogénétique, ARN viral, Biologie moléculaire, coronavirus, COVID-19, épidémiologie, Etats-Unis, Gènétique, génome, Infectiologie, lignage, new york, PCR, poolage, pooling, RT-PCR, Santé publique, SARS-CoV-2, séquençage, séquençage génomique, séquence génétique, sérologie, tests groupés, Virologie, virus | Commentaires fermés sur New York : le coronavirus circulait plus d’un mois avant l’identification du premier cas de Covid-19