Archives de catégorie : séquençage génomique

Covid-19 : première description d’une importante diffusion communautaire du variant Delta au Brésil

Alors que le Brésil commence à récupérer d’une seconde vague de Covid-19, les premiers cas d’infection par le variant Delta, hautement transmissible, sont en train d’émerger. Le premier cas d’infection par ce variant préoccupant date du 26 avril 2021. Depuis, plusieurs cas isolés ou d’importation ont été signalés dans cinq États du Brésil. Une équipe …

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Covid-19 : Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon… l’émergence sans fin des variants

Il ne se passe plus un jour sans que l’on entende parler du variant Delta, identifié pour la première fois en Inde. Il est pourtant loin d’être la seule lignée virale à inquiéter les épidémiologistes, médecins et autorités sanitaires nationales et internationales. À ce jour, dans le monde, on dénombre une petite vingtaine de variants …

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Covid-19 : nouvelles données sur le variant Delta, dit « indien », en progression dans de nombreux pays

Identifié initialement en Inde, le variant Delta est désormais majoritaire au Royaume-Uni, où il représente environ 90 % des cas d’infection par le virus SARS-CoV-2. En date du 14 juin 2021, selon la base de données génomiques Gisaid, 61 autres pays étaient touchés par ce variant, anciennement dénommé variant indien (ou encore B.1.617.2, mais aussi …

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Publié dans anticorps de sujets convalescents, anticorps monoclonaux, B.1.617.2, coronavirus, COVID-19, E484K, E484Q, EFFICACITE VACCINALE, épidémiologie, Gisaid, L425R, mutations, REACT-1, SARS-CoV-2, séquençage génomique, test PCR de criblage, Vaccinologie, VACCINS, variant, variant Alpha, variant Beta, variant brésilie, variant Delta, variant Gamma, variant indien, variant sud-africain, variants, variants of concern, variants préoccupants, Virologie, VOC, VOC-21APR-02 | Commentaires fermés sur Covid-19 : nouvelles données sur le variant Delta, dit « indien », en progression dans de nombreux pays

Covid-19 : infection par le SARS-CoV-2 durant sept mois chez une patiente porteuse du VIH

L’histoire se déroule en Afrique du Sud et concerne une femme de 36 ans admise dans un hôpital de Durban en septembre 2020 pour un mal de gorge, de la toux et une gêne respiratoire. Ce cas clinique a été rapporté le 4 juin 2021 sur le site de prépublication medRxiv par l’équipe d’Axel Sigal …

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Diagnostiquer et traiter une maladie génétique rare en moins de 48 heures chrono

C’est l’histoire d’un nourrisson de cinq semaines admis à l’hôpital car cela fait deux heures qu’il n’arrête pas de pleurer. Il est inconsolable et irritable. L’examen clinique révèle une déviation anormale des yeux vers le bas lors des pleurs qui sont, par ailleurs, atypiques. Le nourrisson présente une encéphalopathie infantile. On estime qu’il existe environ …

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Covid-19 : ces variants préoccupants anglais, sud-africain et brésilien qui circulent en Europe

Réalisée entre juin 2020 et février 2021 sous l’égide du Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC, Stockholm, Suède), une étude a analysé les données des cas Covid-19 liés à des « variants préoccupants » (Variants Of Concern ou VOC), en l’occurrence aux variants anglais B.1.1.7, sud-africain B.1.351 et brésilien P.1. Il  …

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Covid-19 : transmission par aérosols ou comment le coronavirus a contaminé des passagers d’un mini-bus

C’est l’histoire de deux chauffeurs de bus américains qui ont transmis le SARS-CoV-2 à plusieurs passagers, alors que ces derniers portaient un masque et respectaient la distanciation physique. Ces deux cas sont rapportés par des médecins et des chercheurs de la faculté de médecine Case Western Reserve de Cleveland (Ohio, États-Unis) dans un article publié …

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Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le variant indien

Après le B.1.1.7 anglais, le B.1.351 sud-africain, le P.1 brésilien, c’est au tour d’un autre variant du SARS-CoV-2, cette fois identifié en Inde, de faire les gros titres de la presse internationale. Depuis quelques semaines, l’Inde connaît en effet une flambée épidémique. Dès lors le rapprochement a été vite fait avec l’émergence de ce nouveau …

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Covid-19 : quid de la production de variants chez un individu infecté et de leur transmission ?

Durant la pandémie de Covid-19, le séquençage du génome viral est utilisé pour suivre la diffusion de nouveaux variants porteurs de mutations spécifiques. On le sait, de nouvelles mutations, ou associations de mutations, peuvent conférer un avantage sélectif au virus, qui peut devenir plus transmissible ou échapper au système immunitaire. Il a ainsi été montré …

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Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1

Au Brésil, l’épidémie de Covid-19 est aujourd’hui dominée par plusieurs lignées virales SARS-CoV-2 qui ont toutes en commun de posséder la mutation E484K dans la protéine S (spike ou spicule), qui permet au virus de se fixer sur les cellules qu’ils infectent. Cette mutation est problématique dans la mesure où elle peut contribuer à un …

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New York : le coronavirus circulait plus d’un mois avant l’identification du premier cas de Covid-19

Des chercheurs américains rapportent que le SARS-CoV-2 était présent dans la ville de New York six à huit semaines avant l’identification du premier cas de Covid-19. Telle est la conclusion d’une étude postée sur le site de prépublication medXriv le 11 février 2021. On rappelle que le premier cas d’infection par le SARS-CoV-2 à New …

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