Archives de catégorie : RT-PCR

Covid-19 : premier cas documenté de transmission du SARS-CoV-2 du chat à l’homme

C’est l’histoire d’une vétérinaire thaïlandaise de 32 ans qui se présente le 15 août 2021 à l’hôpital universitaire de Songkhla, ville située au sud du pays. Elle présente depuis deux jours de la fièvre, un écoulement nasal clair et une toux productive. Elle déclare aux médecins qu’elle et deux de ses collègues ont examiné un …

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Publié dans Animal, arbre phylogénique, chat, contact-tracing, coronavirus, enquête épidémiologique, épidémiologie, félin, médecine vétérinaire, prélèvement nasopharyngé, prélèvement rectal, RT-PCR, SARS-CoV-2, séquençage génomique, Vétérinaire, Virologie | Commentaires fermés sur Covid-19 : premier cas documenté de transmission du SARS-CoV-2 du chat à l’homme

Dans le sillage d’Omicron, les singularités de BA.2

L’ascension du variant Omicron (B.1.1.529) a été fulgurante dans de nombreux pays. Initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud en novembre 2021, ce nouveau variant du SARS-CoV-2 est aujourd’hui présent dans au moins 67 pays. Ce variant préoccupant est composé de trois sous-lignages désignés BA.1 (majoritaire), BA.2 et BA.3 (très peu détecté). Un …

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Publié dans ACE2, anticorps, anticorps neutralisants, biologie, Biologie humaine, bronche, cellule, charge virale, coronavirus, COVID-19, délétion, Delta, domaine de liaison au récepteur, dynamique virale, échappement immunitaire, épidémiologie, épithélium nasal, évasion immunitaire, fusion membranaire, Immunologie, modèle animal, mutation, Omicron, pathogénicité, PCR, poumon, protéine spike, pseudovirus, RBD, récepteur ACE2, réplication virale, RT-PCR, SARS-CoV-2, séquence génomique, spike, TMPRSS2, transmissibilité, Vaccinologie, variant, variants, Virologie, virus | Commentaires fermés sur Dans le sillage d’Omicron, les singularités de BA.2

Omicron : une biologie et une dynamique virale différentes de celles observées chez les précédents variants

Dans ce billet de blog, je vous invite, à travers les données issues d’articles publiés ces dernières semaines, à comprendre les moyens utilisés par la recherche pour explorer les propriétés biologiques et virologiques d’Omicron. Celles-ci révèlent en quoi ce nouveau variant du SARS-CoV-2 est atypique. L’objectif des chercheurs est de comprendre comment les multiples mutations …

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Publié dans ACE2, anticorps, anticorps neutralisants, Biologie humaine, biologie structurale, bronche, cathepsine, cellule, charge virale, conformation, coronavirus, cryo-EM, cryomicroscopie électronique, délétion, Delta, domaine amino-terminal, domaine de liaison au récepteur, durée d'excrétion, dynamique virale, échappement immunitaire, ectodomaine, effet épistatique, épistasie, épithélium nasal, épitopes, évasion immunitaire, excrétion virale, fusion membranaire, IFITM, Immunologie, mutation, Omicron, particules virales, PCR, peptide de fusion, poumon, protéine spike, protomère, pseudovirus, RBD, récepteur ACE2, réplication, réplication virale, RT-PCR, SARS-CoV-2, séquence génomique, sites antigéniques, sous-unité S1, sous-unité S2, spike, TMPRSS2, transmissibilité, trimère, variant, variants, Virologie, virus, voie endosomale | Commentaires fermés sur Omicron : une biologie et une dynamique virale différentes de celles observées chez les précédents variants

Quand la vaccination vient à bout d’une infection Covid-19 persistante chez un patient immunodéprimé

C’est l’histoire d’un homme de 37 ans atteint du syndrome de Wiskott-Aldrich, un déficit immunitaire héréditaire associée à une anomalie présente sur le chromosome X. L’incidence de cette pathologie est estimée entre 1 à 5 enfants atteints pour un million de naissances. Elle est caractérisée par l’association de trois symptômes. Cette triade comporte un eczéma, …

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Taïwan : cluster dans un hôpital associé à un événement super-contaminateur

C’est l’histoire d’un foyer de transmission de Covid-19 associé à la propagation du virus SARS-CoV-2 à la faveur d’un événement de super-contamination survenu dans un grand hôpital de Taïwan. Elle est relatée dans un article paru le 21 juillet 2021 dans le Journal of Microbiology, Immunology and Infection. Il est très rare de trouver dans …

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Covid-19 : rares infections post-vaccinales chez les soignants du plus grand hôpital israélien

Malgré la grande efficacité du vaccin Pfizer à ARN messager contre la Covid-19, des infections post-vaccinales ont été récemment rapportées dans la littérature médicale internationale, notamment parmi le personnel de santé. Des épidémiologistes et immunologistes israéliens ont cherché à caractériser ces infections parmi les employés du Sheba Medical Center (Ramat Gan), le plus important établissement …

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Surdité brusque et SARS-CoV-2 : une infection peut en cacher une autre

C’est l’histoire d’un homme de 29 ans, sans antécédent médical, qui se présente dans le service d’ORL du CHU de Dijon pour une surdité brusque bilatérale apparue depuis dix jours. Il n’existe pas d’autre signe à l’examen clinique. La femme du patient présente une anosmie et une agueusie. Cette perte d’odorat et du goût incite …

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Covid-19 : probables réinfections chez des résidents d’une maison de retraite

C’est l’histoire de résidents d’un centre de soins infirmiers spécialisés pour personnes âgées dans le Kentucky (États-Unis). En juillet 2020, cet établissement informe les autorités sanitaires locales d’un cas de Covid-19. Des tests RT-PCR sont effectués afin de détecter d’autres cas possibles parmi les résidents et les employés. Le cas index est un membre du …

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Transplantation pulmonaire : un cas tragique de transmission du SARS-CoV-2 d’une donneuse à une receveuse

Des chirurgiens et médecins américains rapportent, dans un article publié en ligne le 10 février 2021 dans l’American Journal of Transplantation, un cas documenté de transmission du SARS-CoV-2 entre donneuse et receveuse dans le cadre d’une greffe bi-pulmonaire. La donneuse avait pourtant été testé négative pour le coronavirus au test RT-PCR réalisé sur prélèvement nasopharyngé. …

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New York : le coronavirus circulait plus d’un mois avant l’identification du premier cas de Covid-19

Des chercheurs américains rapportent que le SARS-CoV-2 était présent dans la ville de New York six à huit semaines avant l’identification du premier cas de Covid-19. Telle est la conclusion d’une étude postée sur le site de prépublication medXriv le 11 février 2021. On rappelle que le premier cas d’infection par le SARS-CoV-2 à New …

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Covid-19 : le défi des nouveaux variants

Depuis quelques jours, les données concernant les variants du coronavirus SARS-CoV-2, qu’ils soient britanniques, sud-africain, brésilien, voire possiblement américain, se succèdent à un rythme soutenu. Ces informations sont publiées sur des sites de prépublication en attendant d’être évaluées par les pairs et faire l’objet d’une publication dans une revue scientifique. D’autres résultats sont postés en …

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Covid-19 : interrogations sur l’excrétion du virus et la réponse en anticorps

Des chercheurs allemands ont mené une analyse virologique détaillée auprès de neuf patients atteints de Covid-19 afin d’évaluer la réplication du SARS-CoV-2, la persistance et l’excrétion du virus, ainsi que la réponse du système immunitaire en anticorps. Autant de données particulièrement attendues par la communauté scientifique pour mieux comprendre la dynamique temporelle de ce nouveau …

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