Systémique médicale
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Archives de catégorie : Revue systématique Méta Analyse
COVID-19 : bientôt 2 000 revues systématiques enregistrées sur Prospero… sans compter les revues confidentielles
Les protocoles des revues systématiques doivent être enregistrés avant de faire le travail. Enregistrer un protocole est un gage de qualité qui oblige les chercheurs à bien réfléchir au projet et prévient les embellissements en cours de travail. Le registre des revues systématiques, basé à York en Angleterre, s’appelle PROSPERO. Ce registre a créé un espace dédié au COVID-19… A… Continuer la lecture →
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COVID-19 : les projets sérieux sur les traitements arrivent… convaincre les médias de ne plus servir la soupe aux complotistes
Je ne suis pas toutes les initiatives sur les essais des traitements de la COVID-19, mais je suis impressionné par d’excellents projets qui ont été correctement financés (toujours insuffisamment très probablement). Ils devraient nous faire oublier ces querelles apportées par des chercheurs peu respectueux des bonnes méthodes scientifiques, dont certains ont toujours accès aux médias. J’en retiens trois : Tout… Continuer la lecture →
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COVID-19 : L’Assemblée nationale cautionne probablement les publications scientifiques du député Joachim Son-Forget
Après l’histoire de la députée Martine Wonner qui semble ignorer l’existence des revues prédatrices, deux publications ont comme affiliation « Assemblée nationale » pour le dernier auteur. C’est prestigieux, BRAVO. Je suppose que l’Assemblée nationale dispose d’une procédure pour relire certains manuscrits scientifiques avant publication. Il doit en être de même pour la faculté de médecine de Lille. Il est surprenant qu’aucun… Continuer la lecture →
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COVID-19 : une merda-analyse sur la chloroquine dans le bulletin paroissial NMNI, avec une taupe parisienne
Nombreux sont ceux qui ont noté le 6 juin 2020 la publication d’une méta-analyse dans le bulletin paroissial NMNI. NMNI est l’une de ces revues qualifiées de ‘Salon des articles refusés’ : tout ce qui est écrit est publié quelque part ! Le titre de la méta-analyse : « Clinical efficacy of chloroquine derivatives in COVID-19 infection: Comparative meta-analyse between the… Continuer la lecture →
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Les lignes directrices pour écrire des articles ne sont pas des outils pour évaluer la qualité des articles
Le titre de ce billet est simple, mais trop de chercheurs n’ont pas totalement compris les objectifs des lignes directrices disponibles sur le site EQUATOR. Les plus connues sont CONSORT? STARD, STROBE, etc… L’article publié dans le numéro 2 (juin) de la revue Health Science Reports explique ce qui devrait être considéré comme évident. Les auteurs viennent du centre anglais… Continuer la lecture →
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SANRA : un outil simple pour évaluer les revues narratives de la littérature
La première mise en évidence de la piètre qualité des revues de la littérature a été l’article de C Mulrow publié par les Annals of Internal Medicine : The medical review article : state of the science. Cet article de 1987 est toujours d’actualité et mérite d’être lu. Elle montrait que les méthodes pour faire une revue de la littérature… Continuer la lecture →
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A-t-on besoin de ces revues générales qui augmentent les facteurs d’impact et évitent aux chercheurs de citer les données originales ?
Excellent article dans Journal of Informetrics fin 2018, mais difficile à lire car il contient trop de données sur 16 pages. Le travail bibliométrique semble bien fait à partir de la base Web of Science. Le titre « Overcitation and overrepresentation of review papers in the most cited papers », par des chercheurs espagnols. Il est connu que les reviews (review papers,… Continuer la lecture →
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Faut-il limiter les articles des revues systématiques et méta-analyses à la langue anglaise ? Question pertinente… réponse surprenante
Les Annals of Internal Medicine ont publié une excellente recherche (septembre 2018) sur l’association entre les estimations des effets du traitement et les caractéristiques de publication. L’étude méta-épidémiologique a été réalisée par des chercheurs français et allemands (hôpitaux universitaires et centres Cochrane), financés par Cochrane France. Il faut surtout féliciter Agnès Dechartres, Pitié-Salpétrière, qui est premier auteur de cet article…. Continuer la lecture →
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Les Annals of Internal Medicine ont publié une excellente recherche (septembre 2018) sur l’association entre les estimations des effets du traitement et les caractéristiques de publication. L’étude méta-épidémiologique a été réalisée par des chercheurs… Continuer la lecture →
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Les Annals of Internal Medicine ont publié une excellente recherche (septembre 2018) sur l’association entre les estimations des effets du traitement et les caractéristiques de publication. L’étude méta-épidémiologique a été réalisée par des chercheurs français et allemands (hôpitaux universitaires et centres Cochrane), financés par Cochrane France. Il faut surtout féliciter Agnès Dechartres, Sorbonne Université, qui est premier auteur de cet… Continuer la lecture →
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Journalologie, metawars, et une recette de rigueur en enregistrant les protocoles : la science mise à l’épreuve dans la revue Science
Le numéro du 21 septembre 2018 de la revue Science contient une série d’article sur la ‘Metaresearch’, c’est à dire ces équipes qui font de la recherche sur la recherche… pour mieux comprendre ce qui se passe. Chapitres en accès libre ! Voici les chapitres : Research on research : une courte introduction sur le développement d’équipes qui cherchent à… Continuer la lecture →
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Journalologie, metawars, et une recette de rigueur en enregistrant les protocoles : la science mise à l’épreuve dans la revue Science
Le numéro du 21 septembre 2018 de la revue Science contient une série d’article sur la ‘Metaresearch’, c’est à dire ces équipes qui font de la recherche sur la recherche… pour mieux comprendre ce qui se passe. Chapitres en accès libre ! Voici les cha… Continuer la lecture →
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Tempête chez Cochrane : une revue systématique sur le vaccin HPV serait mal faite, et conflits de la gouvernance..
Ce qui semble acquis, c’est que les revues systématiques de la collaboration Cochrane sont meilleures que celles qui n’ont pas respecté la méthodologie Cochrane. Chez Cochrane, les conflits d’intérêts sont mieux gérés qu’ailleurs. La plupart des chercheurs travaillant pour Cochrane sont honnêtes. Malgré cette appréciation, toutes les revues Cochrane ne sont peut-être pas toutes de bonne qualité.. difficile à évaluer…. Continuer la lecture →
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Tempête chez Cochrane : une revue systématique sur le vaccin HPV serait mal faite, et conflits de la gouvernance..
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PRISMA Scoping review est utile car ces synthèses de littérature se développent
Ce sont les Annals qui le 4 septembre 2018 ont publié les lignes directrices PRISMA adaptées pour les Scoping Review. En mars 2016, nous avons présenté un article qui souhaitait que des recommandations pour écrire des scoping review soient préparées, c’est fait avec PRISMA-ScR. Mais avant d’écrire, il faut des recommandations pour faire ces scoping reviews, ou études de portée… Continuer la lecture →
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PRISMA Scoping review est utile car ces synthèses de littérature se développent
Ce sont les Annals qui le 4 septembre 2018 ont publié les lignes directrices PRISMA adaptées pour les Scoping Review. En mars 2016, nous avons présenté un article qui souhaitait que des recommandations pour écrire des scoping review soient préparées, c… Continuer la lecture →
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68 compétences utiles pour pratiquer l’Evidence-Based-Practice ! Certains n’ont pas compris !
Bon article paru dans JAMA Network Open le 22 juin 2018 avec le titre « Core Competencies in Evidence-Based Practice for Health ProfessionalsConsensus Statement Based on a Systematic Review and Delphi Survey ». Déjà 16 000 téléchargements en moins d’un mois ! Evidence-best-pratice (EBP) est préférable à Evidence-Based-medicine. Il s’agit d’un énorme travail et les méthodes ont été bien décrites (image à… Continuer la lecture →
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Lyme : les ‘oies dorées’ de la HAS, aux ordres du politique, préfèrent les croyances plutôt que l’expertise scientifique !
J’ai été étonné de voir le nombre d’articles de presse et de réseaux sociaux évoquant un rapport de la Haute Autorité de santé (HAS) sur la maladie de Lyme (Quotidien du Médecin, JIM, et la communiqué AFIS qui précise que 12 organisations n’ont pas voulu signer le rapport, etc… à lire…). Quand les « experts » se battent dans un… Continuer la lecture →
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10 types de revues systématiques : comment choisir ?
La qualité des revues systématiques est variable. La méthodologie de la collaboration Cochrane, basée sur les essais randomisés, est la meilleure. Il y a les revues systématiques Cochrane et les autres de qualité moyenne voire mauvaise ! Cet article de BMC Medical Research Methodology, début 2018, mérite attention car il donne de bons conseils. L’objectif est de bien définir 10… Continuer la lecture →
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10 types de revues systématiques : comment choisir ?
La qualité des revues systématiques est variable. La méthodologie de la collaboration Cochrane, basée sur les essais randomisés, est la meilleure. Il y a les revues systématiques Cochrane et les autres ! Cet article de BMC Medical Research Methodology, début 2018, mérite attention car il donne de bons conseils. L’objectif est de bien définir 10 types de revues systématiques, avec… Continuer la lecture →
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Les critères de jugement sont trop souvent différents entre protocoles et publications ! Ce devrait être une étape préalable aux méthodes de lecture critique
Article dans BMC Medical Research Methodology en janvier 2018 et intitulé « A systematic review of comparisons between protocols or registrations and full reports in primary biomedical research ». Bonne recherche d’auteurs canadiens. J’en ai marre de tous ces étudiants que l’on forme à l’analyse de la littérature, ou LCA (Lecture Critique d’Articles) sans les prévenir sur la qualité effroyables de certains… Continuer la lecture →
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Les critères de jugement sont trop souvent différents entre protocoles et publications ! Ce devrait être une étape préalable aux méthodes de lecture critique
Article dans BMC Medical Research Methodology en janvier 2018 et intitulé « A systematic review of comparisons between protocols or registrations and full reports in primary biomedical research ». Bonne recherche d’auteurs canadiens. J’en ai marre de tous ces étudiants que l’on forme à l’analyse de la littérature, ou LCA (Lecture Critique d’Articles) sans les prévenir sur la qualité effroyables de certains… Continuer la lecture →
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Revues systématiques ou narratives ? Politiques des 5 revues médicales prestigieuses
Les revues systématiques et narratives sont-elles en compétition entre les revues prestigieuses ? Ne soumettez pas une revue systématique au NEJM qui n’en publie jamais.. N’imaginez pas non plus que les revues systématiques soient toujours de meilleure qualité que les revues narratives : il existe de très mauvaises revues systématiques, comme de très mauvaises revues narratives. Un article de BMC… Continuer la lecture →
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Revues systématiques ou narratives ? Politiques des 5 revues médicales prestigieuses
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Du nouveau chez MiRoR : une interview de JPA Ioannidis et du matériel pédagogique excellent
Nous avons présenté en février 2017 le projet MiRoR (Methods in Research on Research) qui a plusieurs facettes. En novembre 2017 la nouvelle newsletter nous apporte des informations utiles : une interview du pape de la recherche sur la recherche, JPA Ioannidis de Stanford ; la vidéo est facile à écouter, avec un bon anglais, et il y a une… Continuer la lecture →
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Trois instituts de recherche anglais et la fondation B&M Gates rejoignent la plateforme de l’industrie pharma pour partager les résultats d’essais cliniques
C’est dans le NEJM que 4 financeurs de recherche, dont la recherche clinique, annoncent des avancées dans le partage des données des essais cliniques : Bravo. Le titre de cet article du 16 novembre 2017 : « Data Sharing from Clinical Trials — A Research Funder’s Perspective ». Les 4 signataires sont des représentants de : The Wellcome Trust, the Medical Research… Continuer la lecture →
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Comment définir Open Peer Review ? Une revue pas systématique de 122 définitions !
Les jargons dans le domaine de l’Open sont nombreux, et parmi eux Open Peer Review. Nous avons des interprétations probablement diverses, et cette revue systématique postée en avril 2017 sur F1000Research apporte des réflexions utiles. Le titre : « What is open peer review? A systematic review ». En fait, ce n’est pas une revue systématique… titre trompeur. Depuis avril, 4 reviewers… Continuer la lecture →
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Deux sociétés savantes demandent de rétracter une revue Cochrane dont les conclusions ne leur plaisent pas (cas des antiviraux de l’hépatite C)
Le 6 juin 2017, une revue systématique Cochrane intitulée « Direct-acting antivirals for chronic hepatitis C » a créé une surprise, et n’a pas plus à de nombreux experts. Le travail semble bien fait, et ils ont inclu 138 essais randomisés (25 232 participants). La conclusion n’a pas plu dans un environnement pharmaceutique poussant au traitement de tous les porteurs du virus… Continuer la lecture →
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Mieux décrire les interventions dans les revues systématiques.. 8 recommandations majeures
Bravo au groupe de travail réuni en juin 2016, dont les recommandations ont été publiées dans le BMJ (20 juillet 2017) en accès ouvert, dans la rubrique Research Methods and Reporting. Il s’agit de recommandations pour améliorer les revues systématiques. Nous avons vu tous les biais des revues systématiques, dont l’épidémie est inutile, trompeuse, voire dangereuse ! Diffusons ces recommandations… Continuer la lecture →
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60 % des essais non publiés (79 % des malades inclus) dans le domaine de la prévention de la douleur post-opératoire (prégabaline), et pas d’efficacité !
Article très bien fait publié dans Pain (en accès libre), avec un titre informatif contenant le résultat et un verbe conjugué (tout ce que j’aime) : « Perioperative pregabalin administration does not prevent chronic postoperative pain: systematic review with a meta-analysis of randomized trials ». Félicitations pour Valeria Martinez, hôpital Raymond Poincaré. Une vidéo résume le travail… à voir. Si le résultat… Continuer la lecture →
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Les journalistes couvrent de façon préférentielle les résultats initiaux, bien qu’ils soient souvent contredits par des méta-analyses et informent rarement le public lorsqu’ils ne sont pas confirmés.
C’est un travail de l’équipe de Bordeaux qui a été remarqué lors du congrès mondial sur l’intégrité de la recherche : bonne communication orale de Estelle Dumas-Mallet dans un anglais parfait, salle comble sans le moindre trac. La première question a ensuite été posée par Brian Nosek, chercheur responsable du Center for Open Science à Charlottesville, USA. Bravo à l’équipe… Continuer la lecture →
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25 % des méta-analyses sont faites sur les données individuelles des patients !!!
C’est un énorme travail pour une revue systématique publiée par des chercheurs de Liverpool dans Thebmj en mars 2017 avec le titre ‘Exploring changes over time and characteristics associated with data retrieval across individual participant data meta-analysis : systématic review’. Beaucoup de données, et des tableaux clairs et informatifs ! Cette revue systématique était destinée à savoir si les méta-analyses… Continuer la lecture →
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Un mine d’or qui mérite d’être mieux connue : The James Lind Library
Cette bibliothèque a été créée en 2003, en reprenant des ressources existantes, et c’est Iain Chalmers qui a été l’initiateur, et toujours un des animateurs actifs. Le sous titre de la James Lind Library (JLL) est : « Illustrating the development of fair tests of treatments in health care » explique l’objectif. Je connais cette expérience britannique depuis le début, et je… Continuer la lecture →
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Les méthodologies et analyses de données de mauvaise qualité encouragent des résultats faux-positifs ou la sélection naturelle de la mauvaise science
C’est le constat fait par deux chercheurs et publié dans la revue ‘Royal society open science’ (21 septembre 2016) sous le titre ‘The natural selection of bad science’. En citation de cet article, il y a un tweet « J’ai participé à un grand nombre de comités de recherche, je ne me souviens pas de quelqu’un regardant les articles des… Continuer la lecture →
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Trop de revues systématiques et de méta-analyses d’après JPA Ioannidis : une épidémie inutile, trompeuse voire dangereuse
C’est un article fleuve de 30 pages paru dans The Milbank Quaterly en septembre 2106, avec le titre « The mass production of redundant, misleading, and conflicted systematic reviews and meta-analysis » a un seul auteur. Cet auteur est prolifique, et c’est un bon chercheur : JPA Ioannidis, de Stanford, USA. Une interview de JPA Ioannidis dans Retraction Watch vous permet de… Continuer la lecture →
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Les mauvaises pratiques, parfois identifiées, ne sont pas dénoncées par les auteurs des revues systématiques
Les auteurs de revues systématiques (RS), seraient-ils complices des chercheurs qui ont de mauvaises pratiques ? Cette question mérite réflexion quand les auteurs de RS ne dénoncent pas les manipulations mises en évidence. Faire une RS met les auteurs dans une position privilégiée pour découvrir des pratiques de recherche parfois inacceptables. Les doubles publications sont le plus souvent identifiées. Les… Continuer la lecture →
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L’épidémiologie des revues systématiques montre que trop souvent leur qualité est mauvaise !
Très bon article de l’équipe de David Moher, Canada, sur les revues systématiques dans PLOS Medicine en mai 2016 : « Epidemiology and Reporting Characteristics of Systematic Reviews of Biomedical Research: A Cross-Sectional Study ». Bonne idée : ils ont analysé un échantillon de 300 des 682 revues systématiques ajoutées dans MEDLINE pendant le mois de février 2014. Environ 8000 nouvelles revues… Continuer la lecture →
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La collaboration Cochrane mérite d’être mieux connue : bonne image sur le fonctionnement
Je suis régulièrement étonné par l’insuffisance de formation sur les méthodes de synthèse de l’information. Lors de formation, même de jeunes médecins ayant fini la fac depuis moins de 5 ans n’ont AUCUNE idée de ce qu’est la collaboration Cochrane. Ils ont entendu le nom, mais très rares sont ceux qui peuvent dire qui était Archie Cochrane. Médecin écossais très… Continuer la lecture →
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Pas beaucoup de données probantes montrant que l’on peut prévenir les mauvaises conduites des chercheurs et promouvoir l’intégrité
Une excellente revue systématique (accès libre) vient d’être publiée avec le titre « Interventions to prevent misconduct and promote intergrity in research and publication (review) ». Dans le cadre de la collaboration Cochrane, en général, les méthodes des revues systématiques sont bonnes : c’est le cas pour cette revue. La description des méthodes de travail est bien faite, avec la… Continuer la lecture →
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Des recommandations pour écrire des ‘scoping reviews’ seraient très utiles !
Bonne analyse d’un groupe d’épidémiologistes canadiens qui ont évalué 494 ‘scoping reviews’ publiées entre 1999 et 2014. Il s’agit d’un article de recherche début 2016 dans BMC Medical Research Methodology. Les scoping reviews augmentent dans la littérature et les méthodes ne sont pas standardisées. Ce ne sont pas des revues systématiques, en ce sens que les ‘scoping reviews’ génèrent des… Continuer la lecture →
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