Systémique médicale
Boules de Fourrure
Archives de catégorie : Rédaction des revues
Actualisation des recommandations ICMJE avec des paragraphes sur l’intelligence artificielle
L’ICMJE (International Committee of Medical Journal Editors), ancien groupe Vancouver, actualise chaque année ses : Recommandations pour la conduite, la présentation, la rédaction et la publication des travaux de recherche soumis à des revues méd… Continuer la lecture
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ChatGPT va changer rapidement les publications scientifiques
J’observe ce qui se passe et ChatGPT est une actualité donnant lieu à des publications dans toutes les revues scientifiques. La prestigieuse revue Radiology a publié un commentaire de deux pages d’un jeune radio-pédiatre (février 2023). Il … Continuer la lecture
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New Ground : publication à suivre ? Initiative originale pour vulgariser des articles importants et informer les chercheurs
New Ground ou ‘Journal for Advances in Science‘ est un nouveau modèle de publication, assez original, probablement utile. C’est un billet du 15 mars 2023 de Scholarly Kitchen qui me l’a fait découvrir. C’est un modèle créé… Continuer la lecture
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Dans certains pays, dont la France, les professionnels de santé non médecins publient peu
Parmi les formations à la rédaction que je dispense, j’ai régulièrement des groupes de professionnels de santé dits ‘paramédicaux’. Ce sont surtout des infirmiers, plutôt des IPA (Infirmiers de pratiques avancées) et des masseurs-kiné… Continuer la lecture
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Intelligence artificielle et médecine : la pravda des chercheurs a une fille
Voici le premier article dans le New England Journal of Medicine (NEJM) sur Intelligence artificielle et médecine (avril 2023). Il est écrit par CJ Haugh et J Drazen. Il y a un éditorial ‘Artificial intelligence in medicine‘. Cet édito acco… Continuer la lecture
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Les instructions aux auteurs des revues de neurosciences et physiologie n’incitent pas suffisamment aux pratiques responsables pour rapporter des résultats
Dans PLOS One le 30 mars 2023, des chercheurs australiens ont analysé les instructions aux auteurs des revues de neuroscience : Encouraging responsible reporting practices in the Instructions to Authors of neuroscience and physiology journals: There is… Continuer la lecture
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Citer une revue systématique dans les articles des essais randomisés : oui, mais les bonnes sont très rares
Cela fait longtemps que des instructions aux auteurs de revues incitent à lier essais cliniques randomisés (ECR) et revues systématiques (RS). Une bonne pratique serait ce citer une RS dans l’introduction d’un article sur un ECR. Dans la di… Continuer la lecture
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Les méga-revues : un danger pour la science ? dégradation de la qualité du peer-review ?
Une opinion de JPA Ioannidis dans le JAMA, 20 mars 2023, nous apporte des informations sur ce modèle de publication qui met en péril certaines revues légitimes anciennes. Plus de 2 000 articles originaux ou revues de la littérature par an Est considéré… Continuer la lecture
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Les nouvelles politiques du groupe JAMA impulsées par Kirsten Bibbins-Domingo
La nouvelle rédactrice en chef du JAMA et du JAMA Network semble changer un peu la maison. Des d’éditoriaux concernent la politique éditoriale du groupe depuis sa nommination, été 2022. Dépôt des manuscrits acceptés sur des archives ouvertes Cet … Continuer la lecture
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La complexité de faire fonctionner une revue scientifique… et l’insatisfaction des chercheurs
Que penser d’une discussion sur la liste de EASE (European Association of Science Editors) ? La voici : Dear collegues, I have a conflicting situation with my manuscript jourmey which I would like to share and hear your feedback. Me and my colegu… Continuer la lecture
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Peer Review Congress 9 : toutes les vidéos en ligne… une ressource incroyable
J’ai largement commenté des présentations du PRC9 en septembre 2022. Viennent d’être mises en ligne, en accès libre, toutes les vidéos des présentations ainsi que des pdf de posters. Très bien fait et agréable de revoir certaines présentati… Continuer la lecture
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Pour se faire un bon CV, rien de tel qu’être membre d’un comité de rédaction
Article de Nature du 16 janvier 2023 dont le titre est repris ci-contre (article de 15 pages en accès libre). J’ai traduit le résumé en français : Parmi les rédacteurs en chef, 8 % sont des femmes Les rédacteurs scientifiques façonnent le contenu… Continuer la lecture
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ChatGBT : performant non sourcé… co-auteur d’articles scientifiques (auteurs cadeaux ou fantômes ?)
Depuis novembre 2022, c’est l’excitation autour d’un outil d’intelligence artificielle (IA) qui répond à nos questions et propose des textes cohérents, voire plaisants, etc… Tous les domaines de l’éducation, de la science sont concernés, et ce n’est qu… Continuer la lecture
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Encore une démission d’un rédacteur en chef à propos des questions sur la diversité
Nous avons observé la démission de H Bauchner, rédacteur en chef du JAMA, suite à un podcast malencontreux sur le racisme. Un rédacteur en chef : je suis la victime Cette fois-ci, c’est le rédacteur en chef, Klaus Fiedler, de la revue Perspective… Continuer la lecture
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La moitié des preprints COVID-19 sur medRxiv ont été publiés dans des revues à comité de lecture
C’est une courte lettre très simple publiée sur JAMA Open Network en le 8 décembre 2022. Le titre Evaluation of Publication of COVID-19–Related Articles Initially Presented as Preprints, et le résultat principal est : Dans cette étude, nous avons… Continuer la lecture
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Editorial commun de plus de 300 revues ‘COP27 : Une action urgente pour l’Afrique et le monde’
Suite à la conférence sur le changement climatique, ce sont plus de 300 revues scientifiques qui ont publié le même éditorial. La liste des revues est ici. Toutes les revues prestigieuses des groupe JAMA, Lancet et BMJ ont publié cet éditorial. Voici, … Continuer la lecture
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The Lancet rend hommage à Louis Pasteur
Le numéro 10369 du 17 décembre 2022 du Lancet contient plusieurs articles sur les apports de Louis Pasteur à la science. L’éditorial ‘Pasteur’s legacy in 21st century‘ nous précise qu’il est né le 27 décembre 1822 et list… Continuer la lecture
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Toutes les revues devraient avoir un JOC (Journal Oversight Committee)
Nous avons évoqué le 21 novembre 2022, les relations entre le rédacteur en chef du JAMA et le propriétaire du JAMA. C’est une situation qui est celle de toutes les revues scientifiques (voire tous les organes de presse ?). Le rédacteur en chef d&… Continuer la lecture
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Une histoire de sexe : les revues scientifiques peuvent être politiquement engagées
Je raconte très rarement mon témoignage du licenciement très brutal de George Lundberg, rédacteur en chef du JAMA en janvier 1999. J’ai été témoin de cette histoire car j’étais membre du JAMA Editorial Board, et nous avons été convoqués en … Continuer la lecture
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eLife change de modèle en 2023 : les reviewed preprints seront en ligne avant la VOR
C’est une information du 20 octobre 2022 qui provient de eLife, revue en open access supportée par Howard Hughes Medical Institute, the Max Planck Society and Wellcome. eLife vient de fêter ses 10 ans en octobre 2022, et republie les 10 articles … Continuer la lecture
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EDI, DIE, IDEA, IDEAS : de nouvelles exigences des revues concernant l’équité, la diversité et l’inclusion
Le mouvement se structure et les termes évoluent. Tout semble avoir commencé par les équilibres femmes-hommes dans les revues : disparités parmi les auteurs, les relecteurs, les comités de rédaction…. En bref, le système des mâles blancs aux têtes gri… Continuer la lecture
Publié dans Intégrité scientifique, Race, Rédaction des revues, Sexe et genre
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La complicité des Sociétés savantes qui aiment les revues de faible qualité
Le marché des revues scientifiques a toujours observé des transferts de revues entre les éditeurs. Si dans le passé, ces transferts étaient entre les grands éditeurs (Springer, Elsevier, Wiley, SAGE, Taylor & Francis, etc….), il semblent que … Continuer la lecture
Publié dans Peer review, Prédateurs, Rédaction des revues
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Peer-Review Congress J3 : partage de données, commentaires après publication
Plaisir de voir une présentation française de l’équipe de Rennes (Locher, Naudet). C’est Maximilian Siebert qui a présenté ‘Data Sharing and Reanalysis for Main Studies Assessed by the European Medicines Agency’. Il a eu beaucou… Continuer la lecture
Publié dans Peer review, Rédaction des revues, Reproductibilité
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Peer-review congress J1 : session ‘Equity, Diversity and Inclusion’.. et des EDI editors dans les revues ?
Présentation de Ana-Catarina Pinho-Gomes (The George Institute for Global Health, Imperial College London, London), sur la proportion de femmes parmi les reviewers (et rédateurs) de revues médicales… Vous imaginez les observations…. avec … Continuer la lecture
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Bulletin de l’Académie de Médecine : bravo pour 4 articles sur les revues scientifiques
Il est heureux de voir que des revues françaises défendent la diffusion des savoirs, en particulier dans notre langue. BRAVO, mais les relecteurs auraient pu être plus attentifs. Il y a un éditorial et trois ‘research articles’. L’éditorial… Continuer la lecture
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L’ANSM va informer les revues sur les pratiques de l’IHU… bonne décision, mais les revues ne feront rien
Un excellent article de Victor Garcia en accès libre dans l’Express (13 juin 2022) vous résume les nouvelles décisions de l’Agence du Médicament (ANSM) pour essayer d’améliorer les pratiques de l’IHU de Marseille : l’IHU e… Continuer la lecture
Publié dans Afrique, Ethique, Fraude-Plagiat, Intégrité scientifique, Méconduites, Méthodologies, Public-Médias, Rédaction des revues
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Chaque revue devrait avoir son comité d’éthique : structure très simple pour traiter les méconduites
Depuis 2018, avec le rédacteur en chef et d’autres collègues orthopédistes, je participe au comité d’éthique de la Revue de Chirurgie Orthopédique et Traumatologique (OTSR). Nous avons co-signé un éditorial pour attirer l’attention su… Continuer la lecture
Publié dans Intégrité scientifique, Rédaction des revues
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La littérature chinoise explique comment les organes de prisonniers sont obtenus pour transplantation
J’ai évoqué un problème connu en Chine, avec la prise d’organes de prisonniers pour les transplantations. Les revues scientifiques ne devraient pas accepter des publications non éthiques. Les équipes chinoises ont une expérience des transpl… Continuer la lecture
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Un marseillais sans éthique ni intégrité : il publie dans sa revue un hommage à l’IHU de Marseille
Avertissement : La plupart de mes collègues marseillais sont de bons professionnels, mais… Je voudrais simplement attirer l’attention sur un dysfonctionnement du système des publications à propos d’un article très bizarre dans la revu… Continuer la lecture
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Groupe JAMA : revue de l’année 2021 pour chacune des 12 revues, sauf le JAMA
Chaque année, sous un format assez standard, toutes les revues du groupe JAMA publient des données sur les fonctionnements des revues l’année précédente. C’est instructif et cela permet de comparer les revues entre elles et de voir quelles … Continuer la lecture
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Environ 50 % des articles de recherche de Nature sont publiés avec les avis des relecteurs en ligne
Depuis quelques années le groupe Nature s’engage pour la transparence du peer-review et tout progresse. Nous ne sommes pas encore au peer-review totalement ouvert avec les noms des relecteurs, mais les données publiés dans un éditorial du 1 mars … Continuer la lecture
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Comment faire rétracter un article qualifié d’irresponsable ? Le cas Macchiarini devrait nous aider pour les articles falsifiés de l’IHU de Marseille
La lecture du BMJ du 2 mars 2022 nous confirme qu’il est parfois très difficile de faire rétracter des articles par des revues. Une lettre appelle à rétracter un article du Lancet de 2008 concernant les greffes de trachée de Maccharini et al : Ti… Continuer la lecture
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Auteurs, relecteurs et rédacteurs devraient déclarer leur race ou ethnie à des fins de recherche
C’est un mouvement nord-américain qui devrait nous concerner, et cet article de Nature de 5 pages est détaillé (24 février 2022, accès libre). Ce sont plus de 50 éditeurs représentant plus de 15 000 revues scientifiques qui se préparent à demande… Continuer la lecture
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Les manuscrits déposées en preprints sont peu modifiés par le peer-review quand ils sont publiés.. La lecture par les pairs est utile
Voici le titre d’une tribune du 2 février 2022 dans THE qui a attiré mon attention sur deux articles de PLOS Biology : Les preprints sont « largement inchangés » par l’évaluation par les pairs, même pendant la pandémie Covid. Deux études di… Continuer la lecture
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Actualisation des recommandations ICMJE fin 2021 : les preprints
En 2020, l’ICMJE (International Committee of Medical Journal Editors) n’avait pas actualisé ses recommandations pour écrire des articles. Fin 2021, ils ont apporté des modifications. Outre quelques actualisations de liens, quelques précisio… Continuer la lecture
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Les 13 articles importants de la Pravda des chercheurs… quel travail éditorial sans oublier les chinois !
Le New England Journal of Medicine offre gracieusement en fin d’année un pdf téléchargeable d’accès libre (sous réserve de créer un compte avec votre adresse mail). Ce document de 53 pages, en décembre 2021, est d’une bonne qualité éd… Continuer la lecture
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Pandémie : hausse des publications et baisse de 18 % des articles non-Covid
C’est avec joie que j’ai découvert un bon article d’une équipe française dirigée par Alexandre Loupy (Paris Translational Research Epidemiology and Biostatistics Department, Université de Paris, Hôpital Necker). Félicitons le premier auteur, Marc Rayna… Continuer la lecture
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URGENCE : les revues devraient adopter le modèle RRs avec les IPA (In-Principle Acceptance)
Nous avons évoqué plusieurs fois ce modèle de publication adopté par environ 300 revues, mais boudé par le domaine médical qui serait celui qui en a le plus besoin. Je m’explique : Le modèle de publication RRs (Registered Reports) change la sélection d… Continuer la lecture
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Dysfonctionnement des revues scientifiques pendant la pandémie à SARS-CoV-2
Je remercie la Société Française de Santé Publique pour son aimable invitation lors de son congrès d’octobre 2021 à Poitiers. Deux interventions m’ont été proposées : quels sont les enjeux des publications en général ? Quels étaient les enjeux liées à … Continuer la lecture
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Le partage des données d’essais cliniques doit être encouragé… il n’est pas assez rapide en médecine
Il existe beaucoup d’initiatives pour encourager le partage des données des essais, mais force est de constater que ce n’est pas suffisant. Sur ce thème, j’avais rapporté en juillet 2021 les opinions d’un responsable du groupe P… Continuer la lecture
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