Systémique médicale
Boules de Fourrure
Archives de catégorie : Rédaction des revues
ChatGBT : performant non sourcé… co-auteur d’articles scientifiques (auteurs cadeaux ou fantômes ?)
Depuis novembre 2022, c’est l’excitation autour d’un outil d’intelligence artificielle (IA) qui répond à nos questions et propose des textes cohérents, voire plaisants, etc… Tous les domaines de l’éducation, de la science sont concernés, et ce n’est qu… Continuer la lecture
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Encore une démission d’un rédacteur en chef à propos des questions sur la diversité
Nous avons observé la démission de H Bauchner, rédacteur en chef du JAMA, suite à un podcast malencontreux sur le racisme. Un rédacteur en chef : je suis la victime Cette fois-ci, c’est le rédacteur en chef, Klaus Fiedler, de la revue Perspective… Continuer la lecture
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La moitié des preprints COVID-19 sur medRxiv ont été publiés dans des revues à comité de lecture
C’est une courte lettre très simple publiée sur JAMA Open Network en le 8 décembre 2022. Le titre Evaluation of Publication of COVID-19–Related Articles Initially Presented as Preprints, et le résultat principal est : Dans cette étude, nous avons… Continuer la lecture
Publié dans COVID-19, prépublication, Rédaction des revues
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Editorial commun de plus de 300 revues ‘COP27 : Une action urgente pour l’Afrique et le monde’
Suite à la conférence sur le changement climatique, ce sont plus de 300 revues scientifiques qui ont publié le même éditorial. La liste des revues est ici. Toutes les revues prestigieuses des groupe JAMA, Lancet et BMJ ont publié cet éditorial. Voici, … Continuer la lecture
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The Lancet rend hommage à Louis Pasteur
Le numéro 10369 du 17 décembre 2022 du Lancet contient plusieurs articles sur les apports de Louis Pasteur à la science. L’éditorial ‘Pasteur’s legacy in 21st century‘ nous précise qu’il est né le 27 décembre 1822 et list… Continuer la lecture
Publié dans Public-Médias, Rédaction des revues
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Toutes les revues devraient avoir un JOC (Journal Oversight Committee)
Nous avons évoqué le 21 novembre 2022, les relations entre le rédacteur en chef du JAMA et le propriétaire du JAMA. C’est une situation qui est celle de toutes les revues scientifiques (voire tous les organes de presse ?). Le rédacteur en chef d&… Continuer la lecture
Publié dans Rédaction des revues, Sociétés savantes
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Une histoire de sexe : les revues scientifiques peuvent être politiquement engagées
Je raconte très rarement mon témoignage du licenciement très brutal de George Lundberg, rédacteur en chef du JAMA en janvier 1999. J’ai été témoin de cette histoire car j’étais membre du JAMA Editorial Board, et nous avons été convoqués en … Continuer la lecture
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eLife change de modèle en 2023 : les reviewed preprints seront en ligne avant la VOR
C’est une information du 20 octobre 2022 qui provient de eLife, revue en open access supportée par Howard Hughes Medical Institute, the Max Planck Society and Wellcome. eLife vient de fêter ses 10 ans en octobre 2022, et republie les 10 articles … Continuer la lecture
Publié dans évaluation, Peer review, Rédaction des revues
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EDI, DIE, IDEA, IDEAS : de nouvelles exigences des revues concernant l’équité, la diversité et l’inclusion
Le mouvement se structure et les termes évoluent. Tout semble avoir commencé par les équilibres femmes-hommes dans les revues : disparités parmi les auteurs, les relecteurs, les comités de rédaction…. En bref, le système des mâles blancs aux têtes gri… Continuer la lecture
Publié dans Intégrité scientifique, Race, Rédaction des revues, Sexe et genre
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La complicité des Sociétés savantes qui aiment les revues de faible qualité
Le marché des revues scientifiques a toujours observé des transferts de revues entre les éditeurs. Si dans le passé, ces transferts étaient entre les grands éditeurs (Springer, Elsevier, Wiley, SAGE, Taylor & Francis, etc….), il semblent que … Continuer la lecture
Publié dans Peer review, Prédateurs, Rédaction des revues
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Peer-Review Congress J3 : partage de données, commentaires après publication
Plaisir de voir une présentation française de l’équipe de Rennes (Locher, Naudet). C’est Maximilian Siebert qui a présenté ‘Data Sharing and Reanalysis for Main Studies Assessed by the European Medicines Agency’. Il a eu beaucou… Continuer la lecture
Publié dans Peer review, Rédaction des revues, Reproductibilité
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Peer-review congress J1 : session ‘Equity, Diversity and Inclusion’.. et des EDI editors dans les revues ?
Présentation de Ana-Catarina Pinho-Gomes (The George Institute for Global Health, Imperial College London, London), sur la proportion de femmes parmi les reviewers (et rédateurs) de revues médicales… Vous imaginez les observations…. avec … Continuer la lecture
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Bulletin de l’Académie de Médecine : bravo pour 4 articles sur les revues scientifiques
Il est heureux de voir que des revues françaises défendent la diffusion des savoirs, en particulier dans notre langue. BRAVO, mais les relecteurs auraient pu être plus attentifs. Il y a un éditorial et trois ‘research articles’. L’éditorial… Continuer la lecture
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L’ANSM va informer les revues sur les pratiques de l’IHU… bonne décision, mais les revues ne feront rien
Un excellent article de Victor Garcia en accès libre dans l’Express (13 juin 2022) vous résume les nouvelles décisions de l’Agence du Médicament (ANSM) pour essayer d’améliorer les pratiques de l’IHU de Marseille : l’IHU e… Continuer la lecture
Publié dans Afrique, Ethique, Fraude-Plagiat, Intégrité scientifique, Méconduites, Méthodologies, Public-Médias, Rédaction des revues
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Chaque revue devrait avoir son comité d’éthique : structure très simple pour traiter les méconduites
Depuis 2018, avec le rédacteur en chef et d’autres collègues orthopédistes, je participe au comité d’éthique de la Revue de Chirurgie Orthopédique et Traumatologique (OTSR). Nous avons co-signé un éditorial pour attirer l’attention su… Continuer la lecture
Publié dans Intégrité scientifique, Rédaction des revues
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La littérature chinoise explique comment les organes de prisonniers sont obtenus pour transplantation
J’ai évoqué un problème connu en Chine, avec la prise d’organes de prisonniers pour les transplantations. Les revues scientifiques ne devraient pas accepter des publications non éthiques. Les équipes chinoises ont une expérience des transpl… Continuer la lecture
Publié dans chine, Rédaction des revues
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Un marseillais sans éthique ni intégrité : il publie dans sa revue un hommage à l’IHU de Marseille
Avertissement : La plupart de mes collègues marseillais sont de bons professionnels, mais… Je voudrais simplement attirer l’attention sur un dysfonctionnement du système des publications à propos d’un article très bizarre dans la revu… Continuer la lecture
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Groupe JAMA : revue de l’année 2021 pour chacune des 12 revues, sauf le JAMA
Chaque année, sous un format assez standard, toutes les revues du groupe JAMA publient des données sur les fonctionnements des revues l’année précédente. C’est instructif et cela permet de comparer les revues entre elles et de voir quelles … Continuer la lecture
Publié dans Rédaction des revues
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Environ 50 % des articles de recherche de Nature sont publiés avec les avis des relecteurs en ligne
Depuis quelques années le groupe Nature s’engage pour la transparence du peer-review et tout progresse. Nous ne sommes pas encore au peer-review totalement ouvert avec les noms des relecteurs, mais les données publiés dans un éditorial du 1 mars … Continuer la lecture
Publié dans évaluation, Peer review, Rédaction des revues
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Comment faire rétracter un article qualifié d’irresponsable ? Le cas Macchiarini devrait nous aider pour les articles falsifiés de l’IHU de Marseille
La lecture du BMJ du 2 mars 2022 nous confirme qu’il est parfois très difficile de faire rétracter des articles par des revues. Une lettre appelle à rétracter un article du Lancet de 2008 concernant les greffes de trachée de Maccharini et al : Ti… Continuer la lecture
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Auteurs, relecteurs et rédacteurs devraient déclarer leur race ou ethnie à des fins de recherche
C’est un mouvement nord-américain qui devrait nous concerner, et cet article de Nature de 5 pages est détaillé (24 février 2022, accès libre). Ce sont plus de 50 éditeurs représentant plus de 15 000 revues scientifiques qui se préparent à demande… Continuer la lecture
Publié dans Rédaction des revues, Sexe et genre
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Les manuscrits déposées en preprints sont peu modifiés par le peer-review quand ils sont publiés.. La lecture par les pairs est utile
Voici le titre d’une tribune du 2 février 2022 dans THE qui a attiré mon attention sur deux articles de PLOS Biology : Les preprints sont « largement inchangés » par l’évaluation par les pairs, même pendant la pandémie Covid. Deux études di… Continuer la lecture
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Actualisation des recommandations ICMJE fin 2021 : les preprints
En 2020, l’ICMJE (International Committee of Medical Journal Editors) n’avait pas actualisé ses recommandations pour écrire des articles. Fin 2021, ils ont apporté des modifications. Outre quelques actualisations de liens, quelques précisio… Continuer la lecture
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Les 13 articles importants de la Pravda des chercheurs… quel travail éditorial sans oublier les chinois !
Le New England Journal of Medicine offre gracieusement en fin d’année un pdf téléchargeable d’accès libre (sous réserve de créer un compte avec votre adresse mail). Ce document de 53 pages, en décembre 2021, est d’une bonne qualité éd… Continuer la lecture
Publié dans Rédaction des revues
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Pandémie : hausse des publications et baisse de 18 % des articles non-Covid
C’est avec joie que j’ai découvert un bon article d’une équipe française dirigée par Alexandre Loupy (Paris Translational Research Epidemiology and Biostatistics Department, Université de Paris, Hôpital Necker). Félicitons le premier auteur, Marc Rayna… Continuer la lecture
Publié dans COVID-19, Rédaction des revues
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URGENCE : les revues devraient adopter le modèle RRs avec les IPA (In-Principle Acceptance)
Nous avons évoqué plusieurs fois ce modèle de publication adopté par environ 300 revues, mais boudé par le domaine médical qui serait celui qui en a le plus besoin. Je m’explique : Le modèle de publication RRs (Registered Reports) change la sélection d… Continuer la lecture
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Dysfonctionnement des revues scientifiques pendant la pandémie à SARS-CoV-2
Je remercie la Société Française de Santé Publique pour son aimable invitation lors de son congrès d’octobre 2021 à Poitiers. Deux interventions m’ont été proposées : quels sont les enjeux des publications en général ? Quels étaient les enjeux liées à … Continuer la lecture
Publié dans COVID-19, Rédaction des revues
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Le partage des données d’essais cliniques doit être encouragé… il n’est pas assez rapide en médecine
Il existe beaucoup d’initiatives pour encourager le partage des données des essais, mais force est de constater que ce n’est pas suffisant. Sur ce thème, j’avais rapporté en juillet 2021 les opinions d’un responsable du groupe P… Continuer la lecture
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Manuscrits soumis à 2329 revues : la première vague de la pandémie a créé des avantages potentiellement cumulatifs pour les hommes
Cet article de PLOS ONE (octobre 2021) est un énorme travail, parfois difficile à comprendre, proposé par 6 auteurs européens, et grâce à la participation de Elsevier. Le titre : Gender gap in journal submissions and peer review during the first wave o… Continuer la lecture
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Les Registered Reports de Nature Human Behavior ont bien démarré
Lors de la conférence MetaScience 2021, j’ai suivi une session formidable sur les Registered Reports (RRs). La vidéo de 1 h 30 est en accès libre avec 4 speakers : bien sûr le maître des RRs, Chris Chambers, puis Anne Scheel, Courtney Soderberg e… Continuer la lecture
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Plus de 200 revues ont publié simultanément le même éditorial : urgence pour diminuer la température
Les revues scientifiques soutiennent les mouvements pour le climat en publiant un éditorial commun en septembre 2021. Ce sont 233 revues prestigieuses, avec en tête NEJM, BMJ et revues du groupe, Lancet et revues du groupe, le Bulletin de l’OMS,&… Continuer la lecture
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Plutôt que citer des articles rétractés, citez la notice de rétractation d’après PNAS
Les instructions aux auteurs de PNAS ont évolué en ajoutant une phrase : ‘S’il est nécessaire de faire référence à un article rétracté, expliquez pourquoi et citez l’avis de rétractation plutôt que la publication originale.‘ Tou… Continuer la lecture
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MDAR : améliorer transparence et reproductibilité dans les sciences de la vie
Il s’agit d’une initiative majeure pour mieux structurer les articles de recherche dans les sciences de la vie. Un éditorial de Nature en avril 2021 a présenté l’initiative MDAR pour Materials, Design, Analysis, Reporting. Toutes les … Continuer la lecture
Publié dans Ligne directrice, Recommandations, Rédaction des revues, Reproductibilité, transparence
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Départ de Fiona Godlee, rédactrice en chef du BMJ et activiste pour l’intégrité de la recherche
C’est une news du 19 juillet 2021 dans le BMJ qui nous apprends le départ en fin d’année 2021 de Fiona Godlee, rédactrice en chef depuis 16 ans. Avec le JAMA, c’est la deuxième revue des ‘big five’ ou ‘V5’ de l… Continuer la lecture
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La neurologie en tête dans les revues médicales générales (NEJM, Lancet, JAMA, BMJ, PLOS Med)
Cet article du JAMA Network Open (16 avril 2021) a analysé sur 10 ans les articles de spécialités médicales publiés par les revues médicales générales, et la neurologie était en tête. Les 5 revues de médecine générale présentant les facteurs d’im… Continuer la lecture
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Problématique de l’équité au sein des revues… faut-il suivre les propositions du réseau JAMA ?
En réaction aux critiques de racisme exprimées par le changement du rédacteur en chef du JAMA, toutes les revues du groupe JAMA ont publié le 3 juin 2021 le même éditorial intitulé Equity and the JAMA Network. Les rédacteurs des revues JAMA se disent t… Continuer la lecture
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Racisme au JAMA ? Le rédacteur en chef a été remercié : injuste, mais il assume ses reponsabilités
Harold Bauchner, rédacteur en chef du JAMA depuis 2011, a été remercié le 1 juin 2021. Nous avons présenté la situation en mars 2021, situation qui a donné lieu à des articles, dont un dans le New York Times, et une pétition signée par 9000 personnes d… Continuer la lecture
Publié dans Rédaction des revues
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Une industrie pharmaceutique attaque une revue américaine (Anesthesiology) : est-ce réaliste ?
Est-ce que publier des résultats défavorables à un médicament est possible sans prendre de risque ? Le billet du 16 avril 2021 de RetractionWatch décrit la plainte (aux USA) de Pacira Biosciences contre la revue Anesthesiology. La plainte est dirigée c… Continuer la lecture
Publié dans Rédaction des revues, revue systématique
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Revues d’auto-promotion : publication dans une excellente revue, BMJ EBM
J’ai aimé le preprint que j’ai commenté en août 2020 sur les revues d’auto-promotion. Ce concept caractérise des auteurs et rédacteurs qui savent abuser du système des publications. Il y a de bons bricoleurs dans ce domaine : les cher… Continuer la lecture
Publié dans Méconduites, Rédaction des revues
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Le rédacteur en chef du JAMA placé en congé administratif après les commentaires de son adjoint sur le racisme
Cette information circulait sur des sites professionnels, mais c’est un article du New York Times qui, le 25 mars 2021, revient sur cette affaire. Le rédacteur en chef depuis 2011 a été mis en ‘congé administratif’ pendant les investi… Continuer la lecture
Publié dans Rédaction des revues
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