Archives de catégorie : Recommandations

L’éthique des recherches animales bafouée dans certaines publications : propositions des NIH

Le blog Science Intergity Digest (E Bik) présente des exemples de ce qu’il ne faut pas faire aux animaux, à partir de publications. Le billet du 7 mai est consacré aux grandes tumeurs des souris. C’est un billet très détaillé avec des liste… Continuer la lecture

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Leçons de la pandémie : la Science Ouverte aurait pu assurer des pratiques rigoureuses, fiables et transparentes… Aurions-nous loupé le coche ?

Félicitons les auteurs, de plusieurs nationalités mais surtout français, pour un article publié dans BMC Medical Research Methodology le 5 juin 2021. Cette ‘déclaration pour des changements’ a été préparée avec rigueur. La traçabilité totale des donnée… Continuer la lecture

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Conflits d’intérêts trop fréquents lors de la rédaction des recommandations européennes en médecine cardiovasculaire

Il faudra bien un jour arrêter de mettre parmi les rédacteurs des recommandations de pratique clinique des experts sans lien avec les industries de santé. La plupart des cliniciens avec des liens industriels ne sont pas capables d’avoir des posit… Continuer la lecture

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Recommandations CLUE : les relations entre Universités et Revues scientifiques ne sont pas ‘fluides’

J’avais présenté le preprint de 2017 et les discussions autour de ces recommandations commencées en 2013, puis continuées 2016… quelques retards suite à diverses péripéties, et discussions animées en 2017.. auxquelles j’ai contribué. … Continuer la lecture

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Comment améliorer les publications médicales ? Pas évident

European Heart Journal a publié en février 2021 un article pour suggérer comment améliorer les publications. Il y a beaucoup de bonnes réflexions, y compris payer les relecteurs, bien que ce soit un peu illusoire (combien d’argent ? pour quelle q… Continuer la lecture

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10 règles simples pour bien choisir et citer vos références. C’est le bordel des citations (2) !

La qualité des références est vraiment mauvaise, et rares sont les reviewers qui téléchargent les références lorsqu’ils évaluent un article (je ne le fais pas !). Dans l’excellente série de PLOS Computational Biology intitulée « Ten simple … Continuer la lecture

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Comment présenter la race et l’ethnie dans les articles scientifiques ? Les américains avancent sur ce point

Il s’agit d’un éditorial du JAMA le 22 février 2021 signé par Annette Flanagin, et deux collègues managing editor des revues JAMA et JAMA Network, avec Howard Bauchner, rédacteur en chef du JAMA. C’est un appel à commentaires, avant a… Continuer la lecture

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PRISMA 2020 : toilettage utile de cette ligne directrice de 2009 pour écrire des revues systématiques

Journal of Clinical Epidemiology a publié en février 2021 les méthodes ayant permis une mise à jour de la ligne directrice PRISMA pour écrire des revues systématiques. PRISMA 2009 pour ‘Preferred Reporting Items for Systematic reviews and Meta-An… Continuer la lecture

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Une initiative bienvenue mais difficile : The Inclusion and Diversity Statement

C’est un éditorial de la vice-présidente éditoriale de Cell Press (7 janvier 2021) qui nous explique la mise en place d’une nouvelle déclaration demandée aux auteurs d’articles publiés par les revues de Cell Press. Les auteurs doivent… Continuer la lecture

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COVID-19 : était-il possible d’éviter les rétractations du LancetGate et du NEJM ?

La réponse serait oui pour 4 experts des publications (2 canadiens, un danois, un anglais) dans un article de Clinical Epidemiology de décembre 2020. Mais restons critiques ! Leurs arguments sont intéressants et montrent que les lignes directrices ne s… Continuer la lecture

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Les lignes directrices pour écrire des articles ne sont pas des outils pour évaluer la qualité des articles

Le titre de ce billet est simple, mais trop de chercheurs n’ont pas totalement compris les objectifs des lignes directrices disponibles sur le site EQUATOR. Les plus connues sont CONSORT? STARD, STROBE, etc… L’article publié dans le numéro 2 (juin) de la revue Health Science Reports explique ce qui devrait être considéré comme évident. Les auteurs viennent du centre anglais… Continuer la lecture

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COVID-19 : la bonne règle d’Ingelfinger est obsolète ! Il fut un temps où les revues scientifiques ne considéraient pas les manuscrits dont les données avaient été communiquées au public

Je reprends quelques éléments d’un billet que j’ai publié sur Univadis le 4 mai 2020 sous le titre « COVID-19 : Des données non validées par des revues scientifiques sont diffusées par les médias ». Avec les réseaux sociaux, les préprints, et l’accélération liée volume de publications COVID-19, la diffusion des preuves scientifiques a changé : est-ce un progrès ? Je vous… Continuer la lecture

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Covid-19 le mardi sept avril 2019 à 17 heures

Quelques nouveautés par rapport aux épisodes précédents : ICI, notamment.Le site stop-postillon pour confectionner soi-même des masques et pour savoir comment et où les porter : LABon, c’est du copinage… mais c’est bien fait, ça donne des idées et, s… Continuer la lecture

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Le facteur TOP devrait remplacer le facteur d’impact, mais ce n’est pas gagné.. aux revues de le mettre en oeuvre

Le mouvement initié à Charlottesville par les équipes de Brian Nosek a décrit les recommandations TOP décrites depuis plus de 5 ans. TOP pour Transparency Openess Promotion est basé sur 8 critères décrits dans des revues dont Science en juin 2015. Ce sont les critères recomandés par Chris Chambers dans le dernier chapitre de son ouvrage sur les 7 péchés… Continuer la lecture

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Actualisation des recos de Vancouver… ‘relations et activités’ remplace ‘conflits d’intérêts’, et d’autres idées nouvelles

En décembre, l’ICMJE ou International Committee of Medical Journal Editors met à jour le document intitulé “Recommendations for the Conduct, Reporting, Editing, and Publication of Scholarly Work in Medical Journals”. Encore appelé recommandations de Vancouver. Les changements ont été publiés début janvier 2020 (www.icmje.org). Le nombre de changements est limité, mais significatif. La version originale a sa traduction en français… Continuer la lecture

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Guide LERU pour développer une culture de l’intégrité de la recherche dans les Universités

LERU (League of European Research Universities) est un réseau de 23 universités en Europe, dont 3 universités françaises. Ce réseau a publié en janvier 2020 un très bon Advice paper intitulé « Towards a Research Integrity Culture at Universities: From Recommendations to Implementation ». Nous disposons de beaucoup de guides, documents, recommandations… sur le développement de l’intégrité de la recherche. Je trouve… Continuer la lecture

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GRPD et revues scientifiques : compliqué à mettre en oeuvre….

J’ai participé à une réunion à Bruxelles au sein de l’ERC (European Research Council). Il y avait des personnels de cette agence, de la commission européenne (DG RTD), et une quinzaine de rédacteurs de revues. GRPD, c’est le truc sur la protection des données, et les revues sont très concernées : quelles données archiver et comment ? Organisé par EASE… Continuer la lecture

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Le podcast pourrait-il remplacer les résumés des articles ?

Nous avons montré hier des exemples de résumés graphiques qui remplacent ou complètent les résumés classiques. D’autres revues, par exemple Chemosphere, demandent aux auteurs trois éléments : Highlights, Graphical Abstract, et résumé classique. Voici une capture d’écran (Chemosphere 237 (2019) 124536) : Mais la question n’est-elle pas : à l’heure des outils électroniques, a-t-on encore besoin de résumés ? Ne… Continuer la lecture

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Quel est l’avenir des ‘résumés graphiques’ ? Vont-ils remplacer nos vieux résumés ?

Dans certaines disciplines, les revues ont adopté les ‘graphical abstracts’, avec des instructions spécifiques. Par exemple le Journal of Allergy and Clinical Immunology a des instructions pour ces abstracts. Voici leur définition « Un résumé graphique (GA) a pour but d’offrir un résumé visuel de l’approche expérimentale et des principales conclusions de l’article. Le résumé graphique idéal devrait pouvoir être autonome… Continuer la lecture

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Courte synthèse sur la rédaction d’un article IMRaD : le minimum pour vos étudiants, et I AM pour répondre aux revues

Même le minimum, c’est déjà difficile : si vous connaissez IMRaD, adoptez I AM. La synthèse en 9 pages faite par des chercheurs de Nouvelle Zélande, Suède et Thaïlande est utile.. La collaboration améliore toujours les articles. Je ne connais pas cette revue de chez SAGE : The International Journal of Lower Extremity Wounds qui a mis en ligne cet… Continuer la lecture

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Quatre croyances erronées qui font obstacle à des recherches plus fiables

C’est le titre d’un excellent article dans eLife de 11 pages (début août 2019) signé par 3 chercheurs, M Yarborough (Sacramento, Californie), R Nadon (MacGill, Montréal), et DG Carlin, chercheur indépendant basé à Marseille ! Cet article part de constats alarmants et anciens (Altman en 1994 sur le scandale de la mauvaise recherche dans le BMJ, et un livre que… Continuer la lecture

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Je maintiens : rien ne prouve que manger bio réduit le cancer… évitons les conflits militants et comprenons la méthode scientifique

Mon billet du 30 octobre 2018 était probablement militant en reprenant un billet de blog québécois sur cette bonne publiée dans JAMA Internal Medicine et intitulée « Association of Frequency of Organic Food Consumption With Cancer Risk Findings From the NutriNet-Santé Prospective Cohort Study ». Qu’en penser avec un peu de recul ? Le Bulletin du Cancer a publié en janvier 2019… Continuer la lecture

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Je maintiens : rien ne prouve que manger bio réduit le cancer… évitons les conflits militants et comprenons la méthode scientifique

Mon billet du 30 octobre 2018 était probablement militant en reprenant un billet de blog québécois sur cette bonne publiée dans JAMA Internal Medicine et intitulée « Association of Frequency of Organic Food Consumption With Cancer Risk Findings From the NutriNet-Santé Prospective Cohort Study ». Qu’en penser avec un peu de recul ? Le Bulletin du Cancer a publié en janvier 2019… Continuer la lecture

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SANRA : un outil simple pour évaluer les revues narratives de la littérature

La première mise en évidence de la piètre qualité des revues de la littérature a été l’article de C Mulrow publié par les Annals of Internal Medicine : The medical review article : state of the science. Cet article de 1987 est toujours d’actualité et mérite d’être lu. Elle montrait que les méthodes pour faire une revue de la littérature… Continuer la lecture

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Pratiques éditoriales de 38 revues d’addictologie : pas encore suffisantes pour assurer l’intégrité de la recherche

Cette étude simple est intéressante et montre que les procédures des revues de spécialités sont laxistes. Il s’agit d’un article publié dans Addiction (mars 2019) et intitulé « Use of Publication Procedures to Improve Research Integrity by Addiction Journals », avec un seul auteur (épidémiologie, statistiques, au Texas) et publié par Addiction, la meilleure revue du domaine de l’addictologie. Les instructions aux… Continuer la lecture

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Pratiques éditoriales de 38 revues d’addictologie : pas encore suffisantes pour assurer l’intégrité de la recherche

Cette étude simple est intéressante et montre que les procédures des revues de spécialités sont laxistes. Il s’agit d’un article publié dans Addiction (mars 2019) et intitulé « Use of Publication Procedures to Improve Research Integrity by Addiction Journals », avec un seul auteur (épidémiologie, statistiques, au Texas) et publié par Addiction, la meilleure revue du domaine de l’addictologie. Les instructions aux… Continuer la lecture

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10 règles simples pour éviter les conflits entre collègues

La plupart des interactions et communications entre collègues sont cordiales et se passent très bien. Dans quelques cas existent des conflits qui peuvent pourrir tout un laboratoire / département /service… Il s’agit de vues différentes, d’interprétations divergentes, voire d’un mauvais jour. Des conflits peuvent durer des années ! Dans la série « 10 simple rules » de PLOS computational biology (18 janvier… Continuer la lecture

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Vous n’écrivez pas un article scientifique pour des lecteurs : écrivez pour les reviewers et le rédacteur en chef

Dans le livre sur la publication pour les revues de psychologie analysé le 14 février 2019, le chapitre « Writing for your referees », par RS Sternberg, est bien fait. Il reprend un message que je répète toujours lors des formations : pour qui écrivez-vous ? La plupart des chercheurs répondent pour des collègues, pour d’autres chercheurs qui connaissent mal… Continuer la lecture

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La soumission des articles par des tiers n’est pas acceptée par certaines revues

La soumission d’un article à une revue est un process qui prend du temps quand l’auteur ne connaît pas bien le système. De nombreuses informations sont demandées (adresses email, conflits d’intérêts, ORCID, etc..), le formattage des images nécessite de respecter un poids maximum, la transformation en pdf de votre document word doit être faite correctement, et encore d’autres demandes diverses… Continuer la lecture

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60 Académies européennes en faveur du libre accès en attirant l’attention sur les dangers : enfin des positions raisonnables et non militantes

ALLEA (the European Federation of Academies of Sciences and Humanities, was founded in 1994 and currently brings together almost 60 Academies in more than 40 countries from the Council of Europe region) a publié en décembre 2018 une réponse au plan S. C’est une déclaration de 8 pages, bien faite en insistant sur un Open Access raisonnable et accompagné… ce… Continuer la lecture

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Actualisation des recommandations du groupe de Vancouver en décembre 2018 : version française en ligne

Comme chaque année, le groupe de Vancouver actualise les « Recommandations pour la conduite, la présentation, la rédaction et la publication des travaux de recherche soumis à des revues médicales ». La nouvelle version est en ligne sur le site de l’ICMJE, ainsi que la traduction française que j’actualise avec le groupe de Vancouver. Il y a des petits détails qui ont… Continuer la lecture

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Les oies dorées de la HAS ne connaissent pas les bonnes pratiques de publication : disparition des recos ‘Dyslipidémies’ ! Les Archives des Maladies du Coeur devraient rétracter leur article

Assez inhabituel de la part de la HAS, mais BRAVO : les recommandations sur les dyslipidémies ont été abrogées selon un communiqué de presse du 22 novembre 2018. Cette décision a été poussée par un recours devant le Conseil d’État de l’association Formindep. Des conflits d’intérêts n’ont pas été gérés correctement. La HAS n’a semble-t-il pas pris la peine de… Continuer la lecture

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Des règles simples pour écrire un article ‘multi-auteurs’… ou comment assainir des situations souvent conflictuelles

Chaque fois que je discute avec des chercheurs, la question du travail en équipe et surtout de la collaboration pour écrire est un sujet chaud; voire très chaud. La pratique la plus fréquente et celle du premier auteur qui envoie un manuscrit (sans l’ordre des auteurs) à ses co-auteurs, avec une demande vague : qu’en pensez-vous ? Les ennuis commencent… Continuer la lecture

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La recherche dite ‘hélicoptère’ ne peut pas durer.. mais comment faire ?

C’est un rapport américain, des National Academies of Sciences, Engineering, Medicine, qui m’a fait découvrir cette problématique. Pour moi, la recherche ‘hélicoptère’ se limitait à ces médecins allant en Afrique prendre des données pour les publier dans de bonnes revues sans les noms des travailleurs de terrain, etc… Eh bien, c’est plus large d’après ce rapport de 335 pages, dont… Continuer la lecture

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La recherche dite ‘hélicoptère’ ne peut pas durer.. mais comment faire ?

C’est un rapport américain, des National Academies of Sciences, Engineering, Medicine, qui m’a fait découvrir cette problématique. Pour moi, la recherche ‘hélicoptère’ se limitait à ces médecins allant en Afrique prendre des données pour les publier dans de bonnes revues sans les noms des travailleurs de terrain, etc… Eh bien, c’est plus large d’après ce rapport de 335 pages, dont… Continuer la lecture

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Contrôle d’un arrêt de travail par un employeur : contre visite patronale

Un employeur peut recourir à ce dispositif de contre visite patronale, c’est à dire faire réaliser une visite médicale pour s’assurer que l’arrêt de travail d’un de ses salarié est médicalement justifié, en faisant appel à une s… Continuer la lecture

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Preprints : des recommandations en discussion chez COPE. Bonne idée, mais est-ce que les revues scientifiques françaises acceptent les preprints ?

Je n’ai pas la réponse à cette question et vos avis seraient utiles. J’ai déjà vu un article en français ayant eu un preprint en français…. mais la rédaction ne semble pas au courant…. Je pense que les comités de rédaction de nos revues françaises … Continuer la lecture

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Preprints : des recommandations en discussion chez COPE. Bonne idée, mais est-ce que les revues scientifiques françaises acceptent les preprints ?

Je n’ai pas la réponse à cette question et vos avis seraient utiles. J’ai déjà vu un article en français ayant eu un preprint en français…. mais la rédaction ne semble pas au courant…. Je pense que les comités de rédaction de nos revues françaises doivent se poser la question et définir une politique affichée dans les recommandations aux auteurs…. Continuer la lecture

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Certains pays européens sont sous-performants dans la recherche sur le cancer par rapport à leur PIB et doivent faire davantage pour faire face au fardeau croissant du cancer.

Une équipe de chercheurs britanniques (Londres) a effectué une analyse bibliométrique des documents de recherche européens sur le cancer dans le Web of Science de 2002 à 2013 dans le but de quantifier l’activité de recherche. C’est un article de septembre 2018 dans European Journal of Cancer. Parmi eux figuraient les 28 États membres de l’Union européenne (UE), ainsi que… Continuer la lecture

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Certains pays européens sont sous-performants dans la recherche sur le cancer par rapport à leur PIB et doivent faire davantage pour faire face au fardeau croissant du cancer.

Une équipe de chercheurs britanniques (Londres) a effectué une analyse bibliométrique des documents de recherche européens sur le cancer dans le Web of Science de 2002 à 2013 dans le but de quantifier l’activité de recherche. C’est un article de septem… Continuer la lecture

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