Archives de catégorie : Omicron

Covid-19 : comment Omicron a-t-il évolué depuis son émergence il y a un an ?

Il y a un an, le 26 novembre 2021, l’Organisation mondiale de la santé désignait le variant B.1.1.529 comme variant préoccupant, sous l’appellation Omicron. Par quels mécanismes moléculaires ce lignage du SARS-CoV-2 a-t-il depuis évolué ? Quelles trajectoires évolutives a-t-il suivies pour générer de nombreux sous-lignages, eux-mêmes à l’origine de multiples sous-variants ? Et quelle …

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Publié dans ACE2, anticorps neutralisants, BA.1, BA.2, BA.2.75, BA.2.75.2, BA.4, BA.5, breakpoint, co-infection, convergence évolutive, coronavirus, COVID-19, délétions, Delta, dérive antigénique, distance antigénique, domaine NTD, évolution convergente, Génétique - Biologie moléculaire, immunodéprimé, infection chronique, infection persistante, lignages, mécanisme évolutif, mutations, mutations antigéniques, mutations RBD, NTD, Omicron, point de cassure, protéine spike, RBD, récepteur cellulaire ACE2, recombinaison génétique, SARS-CoV-2, sous-lignages, sous-lignages d’Omicron, sous-variants, surveillance génomique, trajectoire évolutive, variant préoccupant, Virologie, virus recombinant, XBB | Commentaires fermés sur Covid-19 : comment Omicron a-t-il évolué depuis son émergence il y a un an ?

Covid-19 : quand le séquençage du génome entier du virus guide le traitement en cas d’infection persistante

Chez de rares patients immunodéprimés, l’infection par le SARS-CoV-2 peut entraîner une infection chronique pendant plusieurs semaines ou plusieurs mois. On dispose de peu de données sur la prise en charge thérapeutique de ces patients, qui pourraient bénéficier d’associations de médicaments ou de traitements pendant une durée plus longue. Il importe alors de savoir s’il …

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Publié dans coronavirus, COVID-19, génome viral, Infectiologie, infection chronique, infection persistante, infection prolongée, infection prolongée par le SARS-CoV-2, mutations, Omicron, patients immunodéprimés, réinfection, SARS-CoV-2, séquençage génomique, séquence de génome entier, sous-lignages, sous-variants, traitement antiviral, variants, Virologie, WGS | Commentaires fermés sur Covid-19 : quand le séquençage du génome entier du virus guide le traitement en cas d’infection persistante

Covid-19 : le sous-variant BQ.1.1 d’Omicron progresse en France

L’évolution continue du variant Omicron, apparu fin 2021, a entraîné l’émergence de nouveaux sous-variants. Ces nouveaux venus n’en finissent pas d’éroder l’immunité acquise par la vaccination et/ou l’infection naturelle et de présenter des propriétés biologiques différentes, notamment du fait de leur capacité d’échappement immunitaire et de changements fonctionnels de leur protéine spike. Comme BA.4.6 et …

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Publié dans anticorps neutralisants, BA.4.6, BA.5, BF.7, BQ.1, BQ.1.1, breakthrough Infection, coronavirus, COVID-19, échappement immunitaire, épidémiologie, Immunologie, mutations, Omicron, protéine spike, RBD, SARS-CoV-2, sous-lignage, sous-lignages d’Omicron, sous-variant, sous-variants, test de neutralisation, vaccination, Virologie | Commentaires fermés sur Covid-19 : le sous-variant BQ.1.1 d’Omicron progresse en France

Covid-19 : le variant Omicron aurait émergé chez la souris, selon une étude

Le variant Omicron apparaît mieux équipé pour reconnaître le récepteur cellulaire ACE2 de la souris que celui de l’homme, rapportent des chercheurs américains dans une étude publiée le 18 octobre 2022 dans les Comptes rendus de l’Académie américaine des sciences (PNAS). On rappelle que le coronavirus SARS-CoV-2 se fixe par l’intermédiaire de la région RBD …

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Covid-19 : des rats domestiques contaminés par leur propriétaire infecté par le SARS-CoV-2

Deux rats domestiques ont été contaminés par le variant Omicron du SARS-CoV-2 à partir d’une personne infectée, rapportent des chercheurs français dans un article paru le 13 octobre 2022 sur le site de prépublication bioRxiv. L’un des rongeurs a développé des symptômes sévères. Ces résultats sont présentés par Xavier Montagutelli, Bérénice Decaudin et Étienne Simon-Laurière …

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BA.2.75.2, le nouveau sous-variant d’Omicron qui inquiète les scientifiques

L’évolution continue du variant Omicron du SARS-CoV-2 continue de produire de nouveaux sous-variants porteurs de mutations additionnelles. Un de ces sous-variants émergents, dénommé BA.2.75, s’est rapidement diffusé dans certaines parties du monde, mais sans encore surpasser BA.5, le variant actuellement dominant. BA.2.75, dont la fréquence augmente en Inde, a été détecté en juillet 2022 dans …

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Identification d’anticorps neutralisants à large spectre, actifs sur tous les coronavirus humains

Deux équipes indépendantes rapportent, dans le numéro daté du 12 juillet 2022 de la revue Science, avoir identifié des anticorps neutralisants à large spectre, actifs contre une vaste gamme de coronavirus.  Ces anticorps humains ont la particularité de cibler une autre région de la protéine spike que celle contre laquelle sont dirigés les anticorps induits …

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Les variants BA.4 et BA.5 d’Omicron ont une grande capacité à échapper aux anticorps induits par la vaccination et l’infection

Les sous-variants BA.4 et BA.5 d’Omicron sont capables d’échapper de façon notable aux anticorps produits après vaccination ou après infection naturelle, selon une étude publiée le 22 juin 2022 dans The New England Journal of Medicine (NEJM). Il en est de même pour un autre sous-variant d’Omicron, BA.2.12.1, qui représente actuellement la souche de SARS-CoV-2 …

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Le renforcement immunitaire par Omicron dépend de l’exposition antérieure au SARS-CoV-2

Une vaste étude britannique montre que la capacité d’une infection par Omicron à renforcer le système immunitaire contre le SARS-CoV-2 dépend de la souche ou du variant qui nous a déjà infecté et qu’elle n’équivaut pas, loin s’en faut, à une dose de vaccin. Dans quelle mesure une infection par Omicron stimule-t-elle l’immunité via les …

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Covid-19 : l’ombre des variants BA.4 et BA.5 plane sur l’été

La communauté scientifique internationale est pleinement mobilisée pour évaluer les  propriétés biologiques et virologiques de BA.4 et BA.5, les deux nouveaux sous-lignages d’Omicron, identifiés pour la première fois en Afrique du Sud et qui sont devenus en mai les variants prédominants dans ce pays. Ils y ont provoqué une nouvelle vague de contaminations mais de …

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Omicron : ce que l’on sait des sous-variants BA.4 et BA.5

Initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud en novembre 2021, Omicron, nouveau variant préoccupant du SARS-CoV-2, est représenté par trois sous-lignages : BA.1, BA.2 et BA.3. Deux nouveaux sous-lignages d’Omicron, BA.4 et BA.5, classés variants d’intérêt par l’Organisation mondiale de la santé (OMS), ont depuis été détectés en Afrique du Sud. Selon les …

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Covid-19 : caractérisation du variant XD, issu d’une recombinaison entre Delta et Omicron

Une étude dirigée par des chercheurs de l’Institut Pasteur de Paris rapporte les premières données épidémiologiques, virologiques et biologiques concernant le variant XD du SARS-CoV-2, issu de la recombinaison entre les variants Delta et Omicron. Ces travaux, supervisés par Étienne Simon-Lorière, responsable du groupe ‘Génomique évolutive des virus à ARN’ à l’Institut Pasteur, ont été …

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Infection par Omicron : quelle réponse contre d’autres variants chez les vaccinés et non-vaccinés ?

Une étude sud-africaine a évalué, chez des individus vaccinés et non vaccinés, la capacité des anticorps produits après une infection par le variant Omicron à combattre d’autres variants du SARS-CoV-2. Les résultats ont été publiés le 22 mars 2022 dans la revue Cell Host and Microbe. Conduite par Simon Richardson, Penny Moore et leurs collègues …

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Bilan (partiel) de la semaine entre le lundi 14 mars et le samedi 19 mars 2022

Chien-Chi Chang Magnum Photos Les semaines se suivent et se ressemblent.Les critères de substitution restent des critères de substitution dans les essais cliniques, en oncologie comme ailleurs,Bel article dans le JAMA (ICI) sur le fait que prendr… Continuer la lecture

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Dans le sillage d’Omicron, les singularités de BA.2

L’ascension du variant Omicron (B.1.1.529) a été fulgurante dans de nombreux pays. Initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud en novembre 2021, ce nouveau variant du SARS-CoV-2 est aujourd’hui présent dans au moins 67 pays. Ce variant préoccupant est composé de trois sous-lignages désignés BA.1 (majoritaire), BA.2 et BA.3 (très peu détecté). Un …

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Omicron : une biologie et une dynamique virale différentes de celles observées chez les précédents variants

Dans ce billet de blog, je vous invite, à travers les données issues d’articles publiés ces dernières semaines, à comprendre les moyens utilisés par la recherche pour explorer les propriétés biologiques et virologiques d’Omicron. Celles-ci révèlent en quoi ce nouveau variant du SARS-CoV-2 est atypique. L’objectif des chercheurs est de comprendre comment les multiples mutations …

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En Inde, un léopard contaminé par le SARS-CoV-2. Des pumas et des lions infectés dans un zoo en Afrique du Sud

Un léopard vivant en liberté a été contaminé par le SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19, indiquent des chercheurs de l’Institut indien de recherche vétérinaire à Bareli (Uttar Pradesh, État de l’Inde du Nord) dans un preprint publié le 12 janvier 2022 sur le site bioRxiv. En 2021, trois cas d’infection naturelle par le SARS-CoV-2 chez des …

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Comment le SARS-CoV-2 peut évoluer en variant préoccupant chez un individu immunodéprimé

C’est l’histoire d’une femme sud-africaine d’une trentaine d’années, atteinte du sida. Elle est admise en septembre 2020 dans un hôpital de Durban pour des symptômes qui ont débuté douze jours auparavant. Cette patiente présente une gêne respiratoire, un mal de gorge, de la toux. Le test RT-PCR pour le SARS-CoV-2 effectué sur le prélèvement nasopharyngé …

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Covid-19 : 50 personnels de santé alertent Olivier Véran et réclament le report de la rentrée scolaire | Le JDD

TRIBUNE. Covid-19: 50 personnels de santé alertent Olivier Véran et réclament le report de la rentrée scolaire 20h00 , le 25 décembre 2021 , modifié à 12h50 , le 26 décembre 2021 Dans une lettre ouverte, des professionnels de santé interpellent Olivier… Continuer la lecture

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Covid-19 : ce que l’on sait de la sévérité de l’infection à Omicron

Quel impact le variant Omicron a-t-il sur le taux des admissions et des hospitalisations ? Ce nouveau variant, initialement identifié au Botswana et en Afrique du Sud en novembre 2021, est-il aussi dangereux que le précédent variant Delta ? Plusieurs études, en provenance d’Afrique du Sud et du Royaume-Uni, ont été publiées. L’occasion de faire …

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Variant Omicron : ce que l’on sait de l’activité neutralisante des anticorps, du risque de réinfection et de l’efficacité des vaccins

Initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud, le variant Omicron (B.1.1.529) est le cinquième variant préoccupant depuis le début de la pandémie Covid-19 due au SARS-CoV-2*. C’est également celui qui inquiète le plus les virologistes, immunologistes et épidémiologistes. En effet, plusieurs études in vitro indiquent que les nombreuses mutations présentes dans la protéine …

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Variant Omicron : un risque d’échappement immunitaire

Le moins qu’on puisse dire est que le nouveau variant Omicron initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud inquiète les spécialistes. Une étude, publiée sous forme de preprint sur le site medRxiv, rapporte un risque accru de réinfection associé à ce nouveau variant du SARS-CoV-2. En d’autres termes, Omicron présente une capacité accrue …

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Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le nouveau variant Omicron (B.1.1.529)

Après le variant Delta (ex-variant B.1.1.7 dit britannique), le variant Beta (ex-variant sud-africain B.1.351), le variant Gamma (ex-variant P.1 dit brésilien), c’est donc au tour d’un autre variant du SARS-CoV-2, dénommé Omicron (ou variant B.1.1.519), de faire les gros titres de la presse internationale et d’occuper le devant de la scène sur les chaînes d’info …

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