Archives de catégorie : mutations

Covid-19 : Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon… l’émergence sans fin des variants

Il ne se passe plus un jour sans que l’on entende parler du variant Delta, identifié pour la première fois en Inde. Il est pourtant loin d’être la seule lignée virale à inquiéter les épidémiologistes, médecins et autorités sanitaires nationales et internationales. À ce jour, dans le monde, on dénombre une petite vingtaine de variants …

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Publié dans Afrique, alpha, bêta, coronavirus, COVID-19, délétion, Delta, épidémiologie, Epsilon, fitness, gamma, insertion, Iota, Kappa, Lambd, mutations, nouveaux variants, NTD, Ouganda, protéine spike, RDB, SARS-CoV-2, séquençage génomique, susbtitution, Theta, vaccin, vaccination, variant, Variant Of Concern, Variant Of Interest, variant under monitoring, variants, variants préoccupants, Virologie, VOC, VOI, VUM | Commentaires fermés sur Covid-19 : Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon… l’émergence sans fin des variants

Covid-19 : nouvelles données sur le variant Delta, dit « indien », en progression dans de nombreux pays

Identifié initialement en Inde, le variant Delta est désormais majoritaire au Royaume-Uni, où il représente environ 90 % des cas d’infection par le virus SARS-CoV-2. En date du 14 juin 2021, selon la base de données génomiques Gisaid, 61 autres pays étaient touchés par ce variant, anciennement dénommé variant indien (ou encore B.1.617.2, mais aussi …

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Publié dans anticorps de sujets convalescents, anticorps monoclonaux, B.1.617.2, coronavirus, COVID-19, E484K, E484Q, EFFICACITE VACCINALE, épidémiologie, Gisaid, L425R, mutations, REACT-1, SARS-CoV-2, séquençage génomique, test PCR de criblage, Vaccinologie, VACCINS, variant, variant Alpha, variant Beta, variant brésilie, variant Delta, variant Gamma, variant indien, variant sud-africain, variants, variants of concern, variants préoccupants, Virologie, VOC, VOC-21APR-02 | Commentaires fermés sur Covid-19 : nouvelles données sur le variant Delta, dit « indien », en progression dans de nombreux pays

Covid-19 : infection par le SARS-CoV-2 durant sept mois chez une patiente porteuse du VIH

L’histoire se déroule en Afrique du Sud et concerne une femme de 36 ans admise dans un hôpital de Durban en septembre 2020 pour un mal de gorge, de la toux et une gêne respiratoire. Ce cas clinique a été rapporté le 4 juin 2021 sur le site de prépublication medRxiv par l’équipe d’Axel Sigal …

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Covid-19 : comment le variant indien a débarqué au Brésil

L’histoire commence le 27 mars 2021. Le navire « MV Shanddong SA Zhi » quitte la Malaisie pour un long voyage qui doit l’amener à São Luís (État du Maranhão) au Brésil. Signalons au passage que São Luis est la seule capitale d’État du Brésil qui n’ait pas été fondée par les Portugais et dont …

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Publié dans Amérique du Sud, B.1.617.2, brésil, coronavirus, COVID-19, épidémiologie, inde, Infectiologie, lignage B.1.617.2, mutations, nouveaux variants, protéine S, protéine spike, SARS-CoV-2, spicule, variant Delta, variants, variants of concern, variants préoccupants, variats préoccupants, varient indien, Virologie, VOC | Commentaires fermés sur Covid-19 : comment le variant indien a débarqué au Brésil

Covid-19 : moindre sensibilité du variant indien B.1.167.2 aux vaccins et aux anticorps monoclonaux

Une étude française montre que le variant indien B.1.167.2 présente de façon significative une moindre sensibilité aux anticorps neutralisants développés par des patients Covid-19 convalescents ou produits après vaccination. L’originalité de cette étude, parue le 27 mai 2021 sur le site de prépublication bioRxiv, tient notamment au fait que les chercheurs n’ont pas utilisé de …

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Covid-19 : quid de la production de variants chez un individu infecté et de leur transmission ?

Durant la pandémie de Covid-19, le séquençage du génome viral est utilisé pour suivre la diffusion de nouveaux variants porteurs de mutations spécifiques. On le sait, de nouvelles mutations, ou associations de mutations, peuvent conférer un avantage sélectif au virus, qui peut devenir plus transmissible ou échapper au système immunitaire. Il a ainsi été montré …

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Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1

Au Brésil, l’épidémie de Covid-19 est aujourd’hui dominée par plusieurs lignées virales SARS-CoV-2 qui ont toutes en commun de posséder la mutation E484K dans la protéine S (spike ou spicule), qui permet au virus de se fixer sur les cellules qu’ils infectent. Cette mutation est problématique dans la mesure où elle peut contribuer à un …

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Publié dans ACE2, activité neutralisante, Amazonas, analyse phylogénétique, anticorps, anticorps monoclonaux, anticorps neutralisants, B.1.1.7, B.1.351, brésil, contagiosité, coronavirus, COVID-19, D614G, domaine NTD, domaine RBD, domaine RBM, E484K, écepteur ACE2, échappement immunitaire, épidémiologie, Immunologie, Infectiologie, K417N/T, létalité, Manaus, mutations, N.10, N.9, N501Y, neutralisation, P.2, pathogénicité, pouvoir neutralisant, protéine S, protéine spike, RBD, RBM, SARS-CoV-2, séquençage génomique, spicule, transmissibilité, vaccin, vaccination, variant anglais, variant brésilien, variant britannique, Variant Of Concern, variant P.1, variant sud-africain, variants d’intérêt, Variants Of Interest, variants préoccupants, Virologie, virus, VOC, VOI | Commentaires fermés sur Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1

Covid-19 : quand le SARS-CoV-2 se déleste de petits fragments de son matériel génétique pour échapper aux anticorps

Avec l’apparition de nouveaux variants SARS-CoV-2, on sait désormais que ce coronavirus, dont le génome était considéré jusqu’à présent relativement stable, peut muter. Cette variabilité génétique repose sur l’apparition de mutations consistant en la substitution d’un nucléotide par un autre, autrement dit d’une « lettre » par une autre dans l’ARN viral. Comme pour tout …

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Covid-19 : vaccins et nouveaux variants, quel impact ?

Des chercheurs sud-africains rapportent 19 janvier 2021 sur le site de prépublication bioXriv des résultats indiquant que les mutations présentes dans le variant sud-africain 501Y.V2 lui confèrent la possibilité d’échapper à l’activité neutralisante des anticorps produits lors d’une infection naturelle, voire post-vaccination. Rappel : la protéine S (spike, spicule) de surface du coronavirus SARS-CoV-2 se …

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Publié dans 501.V3, 501Y.V.2, 501Y.V1, activité neutralisante, afrique du sud, anticorps monoclonaux, anticorps polyclonaux, B.1.1.7, B1.1.28, brésil, coronavirus, délétion, domaine N-terminal, E484K, émergence de nouveaux variants, Gènétique, immunité, Immunologie, Infectiologie, K417N/T, mutations, N501Y, nouveau variant, nouveaux variants, NTD, plasma, protéine S, protéine spike, pseudovirus, RBD, receptor binding domain, royaume uni, SARS-CoV-2, sérum, système immunitaire, Vaccinologie, variant anglais, variant brésilien, variant britannique, Virologie, VOC 202012/01 | Commentaires fermés sur Covid-19 : vaccins et nouveaux variants, quel impact ?

Covid-19 : le défi des nouveaux variants

Depuis quelques jours, les données concernant les variants du coronavirus SARS-CoV-2, qu’ils soient britanniques, sud-africain, brésilien, voire possiblement américain, se succèdent à un rythme soutenu. Ces informations sont publiées sur des sites de prépublication en attendant d’être évaluées par les pairs et faire l’objet d’une publication dans une revue scientifique. D’autres résultats sont postés en …

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Inventaire de mutations d’une région cruciale du SARS-CoV-2 influant sur la réponse en anticorps

Une équipe de chercheurs américains a établi une cartographie de toutes les mutations entraînant un changement d’acide aminé dans une petite région de la protéine spike de l’enveloppe du SARS-CoV-2. Baptisée RBD (domaine de fixation au récepteur, receptor binding domain), cette zone est celle qui permet au coronavirus de s’arrimer au récepteur ACE2 présent sur …

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Royaume-Uni : un variant du coronavirus SARS-CoV-2 porteur de nombreuses mutations

Le gouvernement britannique a annoncé que des chercheurs ont identifié un nouveau variant du coronavirus SARS-CoV-2. Celui-ci renferme un nombre de mutations plus important que la plupart des autres variants, raison pour laquelle il est pris « particulièrement au sérieux », a indiqué Chris Whittie, le Chief medical officer for England. « Le groupe consultatif sur les …

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Les chauves-souris chinoises, réservoirs de coronavirus émergents


Alors que l’épidémie de pneumonie due au nouveau coronavirus 2019-nCoV se propage à travers le monde, des chercheurs chinois avaient ces derniers mois, à plusieurs reprises, alerté la communauté scientifique internationale sur le risque de voir prochainement émerger une infection humaine par un coronavirus provenant de chauves-souris en Chine. Il faut dire que dans ce …

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L’histoire multimillénaire d’un cancer contagieux 



C’est l’histoire d’un cancer hors normes, celui d’une tumeur qui se transmet chez le chien à la façon d’une maladie transmissible au cours du coït. Son nom : tumeur vénérienne transmissible canine (CTVT, pour canine transmissible ventral tumour, en anglais). 
Egalement connu sous le nom de sarcome de Stocker en médecine vétérinaire, ce cancer constitue …

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N’épousez pas de vieux messieurs

À leur naissance, les femmes ont un stock limité d’ovocytes dont certains subiront une maturation aboutissant à la libération régulière d’ovules entre la puberté et la ménopause. Chez les hommes, inversement, les cellules germinales souches disponibles à la naissance ne … Continuer la lecture Continuer la lecture

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La résilience appliquée à la génomique

J’ai fait un peu de génomique dans une autre vie professionnelle. Je m’intéressais à une maladie génétique de transmission autosomique dominante, la polykystose rénale autosomique dominante. La première mutation que j’ai identifié comme jeune thésard était un magnifique polymorphisme, prédit … Continuer la lecture Continuer la lecture

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Cancer du sein métastatique : AURORA, l’aube de progrès dans les traitements.

Le cancer du sein métastatique reste encore le parent pauvre de la sénologie. Afin de mieux appréhender les divers aspects de la maladie, une grande étude paneuropéenne va débuter. Nom de code : AURORA. Depuis quelques années, les traitements destinés aux cancers du sein à un stade précoce et localisés ont permis de faire des …

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