Systémique médicale
Boules de Fourrure
Archives de catégorie : Mauvais articles
Statistiques dans les articles : mauvaises, de pire en pier avec le temps, nous le savons tous et rien ne change
On peut se demander à quoi servent les alertes fréquentes sur la très mauvaise qualité des analyses statistiques des articles scientifiques. Beaucoup de billets de ce blog attestent de la mauvaise qualité des statistiques. Cet article de PlOS One du 1 octobre 2020 est signé par Stephen Goodman (Stanford, METRICS), très connu pour ses alertes sur la mauvaise qualité des… Continuer la lecture
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Le directeur de l’IHU Méditerranée a effectivement cosigné plus de 3 000 articles et études. Ce qui ne veut pas dire qu’il les a «écrits».
J’ai été très étonné quand j’ai vu des Parlementaires naïfs gober sans commentaires les dires du druide de Marseille. Il se vante d’avoir signé au moins 3 500 articles scientifiques (sans compter des éditos, rubriques dans des magazines divers). Eh oui, le public est admiratif car il ne sait pas que c’est un comportement autoritaire vis à vis de jeunes… Continuer la lecture
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CIVOD-91 : L’ODDRE N’A PAS D’IPMROTNCAE pour le Pr D LAROUT de l’UHI de SMERAILLE
Beaucoup trop a été dit sur l’hydroxychloroquine, tout cela entretenu par des réseaux sociaux. Les preuves sont nombreuses de son absence d’efficacité et par exemple les articles de Futura Santé sont factuels et documentés, mais il en existe d’autres. L’article de Julien Hernandez du 3 août 2020 « Chloroquine : fin de partie » est intéressant et mérite diffusion au public averti…. Continuer la lecture
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COVID-19 : la plupart des études cliniques en cours apporteront de faibles niveaux de preuve
C’est une lettre publiée dans JAMA Internal Medicine le 27 juillet 2020 (Characteristics and Strength of Evidence of COVID-19 Studies Registered on ClinicalTrials.gov). Ces auteurs américains ont cherché les études enregistrées dans le registre ClinicalTrials.gov et recherché les niveaux de preuve attendus, avec une méthode ‘2011 Oxford Centre for Evidence-Based Medicine’ (OCEBM). « We identified 1551 studies registered from March 1,… Continuer la lecture
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COVID-19 : les revues d’auto-promotion est une bonne appelation pour les bulletins paroissiaux raoultiens
Voici le résumé de ce preprint déposé le 15 juillet 2020 sur une plateforme de ISO (MetaArXiv) : Pendant la pandémie COVID-19, la ruée vers les jugements scientifiques et politiques sur les mérites de l’hydroxychloroquine a été alimentée par des articles douteux qui ont pu être publiés parce que les auteurs n’étaient pas indépendants des pratiques des revues dans lesquelles… Continuer la lecture
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COVID-19 : conseils pour choisir une revue pour l’article AZI/HCQ co-signé par Mme la députée Martine Wonner
Chère Madame, en tant que députée et pour montrer l’exemple aux chercheurs, vous devez retirer l’article publié dans la revue prédatrice Asian Journal of Medicine and Health. Si vous ou vos co-auteurs doutent qu’il s’agit d’une revue prédatrice, je suis à votre disposition pour en discuter. J’espère que LA revue ne vous demandera pas trop d’argent pour la rétractation. Grâce… Continuer la lecture
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COVID-19 : les ‘hot paper’ n’honorent pas les revues, dont le NEJM qui est un bras armé de l’industrie
Le Parisien a publié des données scandaleuses sur l’efficacité de la chloroquine (sondage IFOP) et le NEJM (New England Journal of Medicine) voudrait nous faire croire que le remdevisir guérit la COVID-19…. Doit-on s’attendre à voir pire lors de cette pandémie d’articles scientifiques ? L’article du 10 avril 2020 « Compassionate use of remdesivir for patients with severe COVID-19 » est ce… Continuer la lecture
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COVID-19 : la Chine contrôlerait les articles scientifiques avant publication (la France devrait réfléchir)
Imaginez que les articles de l’IHU de Marseille aient besoin d’un accord d’une agence de l’état, voire du ministère de la santé avant d’être publiés sur YouTube ou dans une revue de complaisance ? Le respect des règles d’éthique et d’intégrité serait un préalable à toute publication ! Tout serait plus facile et nous éviterait des débats inutiles basés sur… Continuer la lecture
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COVID 19 : les biais de convenance sociale cachent des déviances au niveau de la diffusion des recherches
Nous lisons tout sur le Coronavirus, et c’est très difficile de sélectionner les informations validées, d’autant plus qu’elles sont rares. Restons prudents et ne passons pas notre temps à dire que rien n’est bien fait… surtout gardons confiance en nos décideurs.Ils ne cachent rien.. arrêtons les fausses polémiques. Je suis confiné dans les Alpes, à 1800 mètres… avec la neige… Continuer la lecture
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Il faut défendre le Pharmachien, site humoristique canadien sur la pseudoscience
Je vous suggère de diffuser auprès du public et de vos collègues les commentaires du site canadien, le Parmachien. Il est animé par un pharmacien de Montréal et ce site diffuse des informations pour montrer comment la fausse science est propagée. Je vous laisse évaluer et apprécier les illustrations. Animé par Olivier Bernard, Montréal, qui a écrit des livres, et… Continuer la lecture
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Le bras armé de l’industrie : le business du New England Journal of Medicine participe au bio-creep (effet de glissade)
Je ne suis pas seul à penser que les essais cliniques publiés par le NEJM participent à des stratégies malsaines. Dans le numéro du 7 février 2019, il y a deux essais de non-infériorité avec un antibiotique de la classe des tétracyclines. Les conclusions sont : Essai dans les infections de la peau : « Omadacycline was noninferior to linezolid for… Continuer la lecture
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Au moins 400 articles devraient être rétractés (Chine) car les recherches ont été faites avec des organes prélevés à des prisonniers exécutés
C’est une histoire connue, mais dont le volume n’a jamais été évalué : en Chine, des prisonniers sont exécutés, et leurs organes prélevés pour des transplantations.. Tout ceci est absolument condamné par les principes éthiques de la recherche. Mais ces transplantations donnent lieu à publication d’articles scientifiques… Nous avons déjà cité un cas (564 transplants) mais cette fois-ci ce sont… Continuer la lecture
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Pour augmenter l’impact de vos publications, écrivez mieux ! Est-ce vrai ?
C’est le message d’un article moyen de la prestigieuse revue PNAS (8 janvier 2019), avec pour titre : How we can boost the impact of publications? Try better writing. La qualité méthodologique du travail ne permet pas d’être convaincu par cet article… des facteurs de confusion peuvent exister. Donc prudence. Auteurs australiens. Déjà 1268 tweets le 29 janvier pour un… Continuer la lecture
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L’amateurisme est encore trop fréquent au sein des revues scientifiques, d’après R Smith
Sur l’un des blogs du BMJ, Richard Smith, ancien rédacteur en chef du BMJ a donné son opinion le 31 décembre 2018 sur les revues scientifiques. Il a rappelé que c’est en 1995, que son prédécesseur au BMJ, Stephen Lock avec formalisé les mauvaises pratiques, notamment à propos du cas de Malcom Pearce, gynécologue, qui avait publié une étude fraudée… Continuer la lecture
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La démission du comité de rédaction de Nutrients va faciliter la publication d’articles médiocres… évitons MDPI
J’ai fait un billet le 20 juin 2018 sur MDPI, une ancienne maison d’édition qui a profité de l’Open Access pour améliorer ses revenus. MDPI a été considéré comme produisant des revues prédatrices, mais certaines des revues de cette maison d’édition semblent de bonne qualité. Pour certains MDPI n’est pas une maison d’édition prédatrice. Dix rédacteurs séniors de la revue… Continuer la lecture
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Si vous obtenez de l’argent pour faire une recherche dans le domaine de la nutrition, c’est que vous connaissez bien les membres du jury ….
Nous avons commenté une conférence de JPA Ioannidis du 14 juin 2018 expliquant que dans le domaine de la nutrition, il n’existait pas de données établissant des liens de causalité entre des comportements et des risques…. Son point de vue a été publié le 23 août 2018 dans le JAMA, et cet article contient toutes les bonnes références sur cette… Continuer la lecture
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Toujours les controverses autour du PACE trial publié par The Lancet : un appel pour le rétracter est commenté par le BMJ
The Lancet est silencieux depuis longtemps, alors que les controverses sont nombreuses autour de cet essai qui n’a pas été reproduit. J’ai évoqué cette non reproductibilité en juin 2018 : l’essai PACE, publié en 2011, a évalué 641 patients ayant un syndrome de fatigue chronique. Les critères de jugement ont été changé en cours d’essai. Il n’a pas été reproduit…. Continuer la lecture
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« Self-explanatory illustrations » : faites des tableaux et figures lisibles
Expliquer aux chercheurs que les illustrations des articles scientifiques doivent être claires, précises et compréhensibles prend du temps. Tous les jours, il m’arrive de voir des illustrations que je ne comprends pas… et je n’évoque pas des sujets complexes. Une illustration, que ce soit un tableau ou une figure, doit être comprise sans avoir à se reporter au texte de… Continuer la lecture
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Le salami existe toujours… avec un cas de 33 articles pour une étude dasn une revue indéxée (Iran !)
La rédaction de la revue est bien sûr complice ! Cette histoire est racontée en détail sur Discover (relayé de Neuroskeptic) et concerne « Trends of Mental Health Status in Iranian Population Aged 15 and above between 1999 and 2015 ». Ci-dessus l’un des articles ! La recherche sur PubMed donne accès aux 33 articles… tous publiés le même jour. Regardez les… Continuer la lecture
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Pourquoi vous ne devriez pas croire ce que vous lisez dans les revues biomédicales : F Godlee, rédactrice du BMJ
C’est le tire d’une bonne conférence (novembre 2017) à la Liverpool School of Tropical Medicine, faite par Fiona Godlee, rédactrice en chef du BMJ ; vous pouvez ré-écoutez la vidéo en regardant les bonnes diapos. Il vous faut une heure tranquille, ce que j’ai fait un dimanche matin, pour avoir uns liste de cas de malveillances ou fraudes en médecine,… Continuer la lecture
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La Revue Prescrire a raison : les guides de la Haute autorité de santé ont une très très grande marge d’amélioration….
Dans son numéro de janvier 2018 (page 71), La Revue Prescrire donne des informations sur son activité d’évaluation des guides élaborés par la Haute autorité de santé. Leur évaluation est plutôt bien faite, et ils ont des données objectives pour confirmer ce qui semble assez évident quand on discute avec ceux qui savent utiliser et évaluer la littérature (ils sont… Continuer la lecture
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« Prise en charge défectueuse d’une lésionnelles » : droit de réponse de l’avocat qui conseille le rédacteur en chef ayant accepté un article d’une auteure proche
Le 2 octobre 2017 sur ce blog, j’ai publié un billet commentant un article de la revue Déontologie, Droit & Soin ayant pour titre « Prise en charge défectueuse d’une lésionnelles ». Je me suis permis de penser qu’il s’agissait d’un article de complaisance, et je vous laisse juger. L’auteure est Mme Khady Badiane Devers. Un bon commentaire avait été justement ajouté… Continuer la lecture
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Les revues de Sciences Sociales dysfonctionnent : « Le pénis conceptuel en tant que construction sociale »
Les revues de Sciences Sociales sont aussi mauvaises que les revues biomédicales… mais je suis convaincu qu’elles surfent facilement sur le plagiat, et d’autres pratiques bizarres. Deux observations pour en témoigner : 1 ) Un article de type ‘canular’ (hoax) a encore piégé une revue. Le titre de cet article The Conceptual penis as a social construct publié dans une… Continuer la lecture
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La recherche sur la recherche dysfonctionne parfois : quel est le meilleur jour de la semaine pour soumettre un article ?
Ce n’est pas le premier article de ce type que je consulte par hasard (août 2016).. J’ai jeté les autres, et je ne m’en rappelle plus… Des ressources ont été dépensées pour répondre à une question stupide avec une méthode mal décrite. Nous sommes dans l’excellence des carrières universitaires : ils ont publié un article ! Ils auront une carrière… Continuer la lecture
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BMJ de Noël : des chercheurs néo-zélandais reçoivent 2,1 spams par jour leur proposant d’écrire un article ou de venir à un congrès
Dans le numéro du BMJ de Noël 2016, une bonne étude sur les spams que nous recevons tous pour écrire des articles « We read spam a lot: prospective cohort study of unsolicited and unwanted academic invitations ». L’article est bien fait et humoristique aussi. Ce sont cinq universitaires d’Auckland (endocrinologie, rhumato, biotstat, santé de la femme) ayant de 10 à 24… Continuer la lecture
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Revue systématique sur des médicaments : utilisez les rapports cliniques plutôt que les publications incomplètes
Un article de quelques pages ne peut pas contenir toutes les informations d’un rapport d’étude clinique qui fait parfois 1000 pages… C’est un problème ignoré par ceux qui font des revues systématiques, voire des méta-analyses à partir de publication. L’article de l’équipe du centre Cochrane nordique, pour 7 essais sur l’orlistat, a comparé les publications avec les protocoles et les… Continuer la lecture
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La citation des articles rétractés pose problème : faut-il supprimer les articles rétractés plutôt que de les garder en archives ?
Félicitons Guillaume Cabanac, Université de Toulouse, pour être l’un des co-rédacteurs, des « Proceedings of the Joint Workshop on Bibliometric-enhanced Information Retrieval and Natural Language Processing for Digital Libraries(BIRNDL) co-located with the Joint Conference on Digital Libraries 2016 (JCDL 2016), Newark, NJ, USA, June 23, 2016. » La table des matières est intéressante, avec des contributions que je ne peux pas toutes… Continuer la lecture
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La presse scientifique trouble s’installe à Paris ! Takayama Publishing Group, avec des pseudos régles d’éthique
C’est Jeffrey Beall qui m’a fait découvrir ce groupe de presse basé en France, même si le nom vous paraît plutôt japonisant. Le billet de J Beall est bien documenté, avec de nombreux commentaires à lire. Rien à ajouter : en bref, des ‘experts’ français organisent des congrès et ils viennent de lancer 7 revues. Ces revues gratuites en Open… Continuer la lecture
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La recherche fast-food : enquête dans le magazine Marianne
Les pages 58 à 65 de Marianne (n° 998 du 27 mai au 2 juin 2016) ont un article intitulé Les ravages de la science « fast-food », avec quelques dessins humoristiques. Cet article fait suite à la démarche de 7 prix Nobel français qui se sont insurgés à l’annonce de coupes budgétaires. De ce fait Marianne a enquêté sur… Continuer la lecture
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La médiocrité de Rue89 qui reprend un mauvais billet de blog sans en évaluer la qualité
Nous avons évoqué le mauvais journalisme scientifique de Rue89, contrairement aux autres médias qui contrôlent la qualité des messages. En 2013, Rue89 avait publié un pamphlet ‘gratuit’ sans argumenter intitulé « Publications académiques : le règne de l’absurde » et les commentaires des ignorants ne font pas avancer la question. Eh bien, le 17 mai 2016, même médiocrité de Rue89 qui publie… Continuer la lecture
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Un français piégé par des auteurs pour une méga revue qui utilise des rédacteurs académiques : Scientific World Journal
C’est RetractionWatch qui nous raconte en détail le 4 mai une histoire qui devient commune, à savoir des usurpations d’identité. Nous connaissons des cas de reviewers suggérés avec des adresses emails fabriquées pour transférer directement les emails à l’auteurs de l’article. Cette fois-ci un français, Xavier Delorme, maître assistant à l’école des mines de St Etienne s’est aperçu que son… Continuer la lecture
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La qualité de la science diminue, en particulier sous la pression pour publier : il faudrait moins publier !
La bonne nouvelle : nous avons une information régulière sur les dérives de la science, et cette information existe dans tous les médias. Nous avons vu que la presse grand public, Le Monde par exemple (mai 2015), a alerté sur les faussaires des labos. Eh bien, le 11 mai 2016, c’est encore une tribune dans la prestigieuse revue Nature. Daniel… Continuer la lecture
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Articles avec des titres trompeurs ? Oui, assez souvent… j’ai été abusé par « Review time in peer review »
Trop souvent, nous allons chercher des articles dont le titre est attirant, et la revue considérée comme de qualité. Je tombe sur un article de Scientometrics (vieille revue intéressante avec un facteur d’impact de 2,2) : « Review time in peer review: quantitative analysis and modelling of editorial workflows ». Article de 16 pages en accès libre, par 3 auteurs de Pologne… Continuer la lecture
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Un poster pour votre labo : Repérer la Mauvaise Science… facile, mais que faire ensuite ?
Vous pouvez télécharger le pdf, ou commander des posters…. ne nécessite pas de commentaires, sauf qu’il faudrait une version française (existe déjà en espagnol, portugais, russe ) Continuer la lecture
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Que penser de Penelope ? C’est un site pour identifier les erreurs dans les manuscrits…. bonne idée, mais utile ?
Je suis réservé sur PENELOPE, et j’aimerais en voir plus. L’idée semble bonne, mais qui va payer pour cela ? Peut-être des revues pour faciliter un travail initial de respect des instructions aux auteurs ? Le site n’est pas très clair sur la stratégie économique et le volume d’activité. Penelope est un site qui examine un manuscrit que vous pouvez… Continuer la lecture
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Des articles bidouillés mais des chercheurs honnêtes : tous responsables, mais pas coupables…… je ne comprends pas
Les articles scientifiques sont bidouillés pour 50 % d’entre eux (au moins), mais je reste persuadé qu’il n’y a pas 50 % de chercheurs malhonnêtes ! Avec K Slim, nous avons exprimé nos opinions dans un éditorial du Journal de Chirurgie Viscérale (article en français et en anglais). Le titre : « Institutions et revues biomédicales : des articles de… Continuer la lecture
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Synhtèse sur le gaspillage de la recherche en 26 diapos, avec les références : excellent exposé pour vos équipes !
Parmi les speakers de la Conférence Mondiale sur l’Intégrité Scientifique (juin 2015), en plenary session, E Wager a présenté la problématique éthique du gaspillage de la recherche. Ses diapositives ont été mises en ligne sur le site Equator-Network, et elles sont intéressantes surtout par les références à quelques articles princeps. Que contient cet exposé : Le rappel de la série… Continuer la lecture
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Plus de 50 % des études précliniques ne sont pas reproductibles, et 28 milliards de dollars sont gaspillés annuellement aux USA
La non reproductibilité des études fondamentales et des études animales est un problème important avec des coûts majeurs et des conséquences sur les malades qui espèrent des traitements. Cet article du 9 juin 2015 dans PLOS Biology fait très peur : « The economics of reproducibility in preclinical research ». Il récapitule d’abord les données de non reproductibilité d’expérimentations précliniques documentées sur… Continuer la lecture
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