Archives de catégorie : Grand public

Loi pour une République numérique : vos recherches sur fonds publics doivent être publiées en accès libre

La loi pour une République numérique a été publiée au Journal Officiel la semaine dernière (8 octobre 2016). Sur le site du gouvernement, c’est un cocorico : libérer l’innovation en faisant circuler les informations et les savoirs, pour armer la France face aux enjeux globaux de l’économie de la donnée ; créer un cadre de confiance clair, garant des droits… Continuer la lecture

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Prix Nobel à Bob Dylan : déjà prévu dans le BMJ de Noël 2015 par des suédois !

Science, le 13 octobre 2016, a rendu hommage à Bob Dylan par un court article intitulé « Bob Dylan, the songwriter scientists love to quote, just won a Nobel Prize ».Le prix Nobel de littérature lui a été attribué par l’Académie de Suède avec un communiqué court « for having created new poetic expressions within the great American song tradition », et une interview… Continuer la lecture

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Le grand public lit vos articles : ayez toutes les autorisations avant de publier les données d’un joueur de cornemuse

Les praticiens sont très naïfs et, lors des formations, je dois toujours insister sur les autorisations avant de publier des diagnostics ou des iconographies de patient. Trop d’iconographies, trop de cas cliniques sont publiés sans les autorisations des patients. L’excuse naïve, qui consiste à dire que le patient n’est pas reconnaissable, n’est pas acceptable. Un cas anglais, après d’autres américains,… Continuer la lecture

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Malscience ! De la fraude dans les labos : Bon livre de vulgarisation qui devrait inquiéter les chercheurs !

Ce livre est bienvenu, et il énonce clairement des pratiques que parfois nos institutions préfèrent ne pas voir. D’ailleurs le chapitre 14 a pour titre « L’omerta française ? ». Il n’y a pas de langue de bois Même pour des experts avertis, il y a des informations nouvelles. Par exemple, je ne savais pas que le Pr GE Séralini (l’hoomme aux… Continuer la lecture

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Une vision pour la communication scientifique du 21ème siècle : 12 principes.. transparence, collaborer, ouvrir les données,…

Ce rapport publié en juin 2016 propose les 12 principes que vous avez sur l’image. Il a été préparé par un réseau autrichien pour la recherche ouverte. Il est court (11 pages). Un principe de départ : la situation actuelle n’est pas satisfaisante… Il y a 2 pages bien faites sur les 19 déficits du système, groupés en 1) accès… Continuer la lecture

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Une revue scientifique écrite pour les enfants, et reviewée par des enfants : Frontiers for Young Minds

J’ai été heureux de découvrir une revue qui m’a intéressé. Dans le groupe Frontiers, une revue sans but lucratif, ni APC (Article Processing Charge) pour les auteurs est destinée aux enfants. Cette revue Frontiers for Young Minds, créée en 2014, est accessible gratuitement. Elle est supportée par deux fondations : Jacobs Foundation et avec Frontiers, le groupe CellPress participe à… Continuer la lecture

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La famille dans les attributions des qualifications d’auteurs ! La France serait plus vertueuse que d’autres pays !!!

Beau travail (9 août 2016) dans PNAS avec une équipe de chercheurs multinationale ‘USA, UK, Italie, Espagne). Le premier auteur Mattia Prosperi a posté une vidéo sur YouTube pour se présenter et expliquer ses méthodes de travail : amusant car vidéo de 2 minutes bien faite. L’article a pour titre « Kin of authorship in five decades of health science literature »… Continuer la lecture

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Capitaine Haddock : 249 problèmes de santé (dont 193 traumatismes) dans les 15 aventures de Tintin

Bon article dans La Presse Médicale (22 juillet 2016) sur les ennuis de santé du capitaine Haddock. La conclusion du résumé : « Les traumatismes, notamment crâniens, sont les principales causes de problèmes de santé chez Tintin et Haddock mais ils sont moins sévères chez ce dernier qui passe progressivement d’un statut de capitaine de marine, alcoolique avéré, à celui de… Continuer la lecture

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La crise de la publication scientifique vue par le rédacteur du Lancet : quantité prime sur qualité

Richard Horton, rédacteur en chef du Lancet qui appartient à Elsevier, se permet de donner son opinion sur l’avenir de la publication scientifique. Je le rejoins souvent car j’ai des diapos avec le titre : « A-t-on encore besoin des revues scientifiques ? » Son éditorial du 23 juillet 2016 est intitulé « Offline: The crisis of scientific publishing ». Entre les lignes, il… Continuer la lecture

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Intégrité scientifique, rapport Corvol : il faut que la France bouge !

C’est une bonne nouvelle que la publication sur le site du secrétariat d’Etat de l’enseignement supérieur et de la recherche du rapport Corvol remis le 29 juin 2016 : « Bilan et propositions de mise en oeuvre de la charte nationale d’intégrité scientifique ». Le précédent rapport de JP Alix n’avait pas eu de publicité forte des la part du gouvernement. Bonne… Continuer la lecture

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Des jeux pervers : gagner 80 € pour citer (‘ancrer’) silencieusement des sites internet commerciaux

Environ 2 ou 3 fois par an, je reçois une sollicitation pour citer un autre site (en général commercial). Le premier email est soft : « seriez-vous intéressé par un échange d’informations…… ? ». En général, j’ignore ces sollicitations car je sens venir le truc. Ce sont des collaborations avec des sites du domaine de la science en général, en accord avec… Continuer la lecture

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La revue ‘Harvard Theological Review’ ne veut pas rétracter un article sur la femme de Jésus

Les questions religieuses animent régulièrement des revues. Il y a pas mal d’exemples. Le blog RetractionWacth relate (21 juin 2016) une histoire banale de conflits entre experts. Un papyrus évoquerait la femme de Jésus selon un prof de Harvard. Cet article de 2014 serait une fraude en ne reposant sur rien du tout d’après d’autres experts. La revue ‘Harvard Theological… Continuer la lecture

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La recherche fast-food : enquête dans le magazine Marianne

Les pages 58 à 65 de Marianne (n° 998 du 27 mai au 2 juin 2016) ont un article intitulé Les ravages de la science « fast-food », avec quelques dessins humoristiques. Cet article fait suite à la démarche de 7 prix Nobel français qui se sont insurgés à l’annonce de coupes budgétaires. De ce fait Marianne a enquêté sur… Continuer la lecture

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Difficile de publier tous les essais cliniques terminés aux USA : moins de 30 % dans les 2 ans après la fin de l’essai

Très agréable quand il s’agit de lire un bon article dans une bonne revue, mais il faut une heure ! Dans BMJ (janvier 2016) des chercheurs connus de Yale aux USA ont analysé 4 347 essais interventionnels de 51 centres universitaires américains. Les protocoles de ces essais ont été enregistrés dans clinicaltrials.gov (où les chercheurs doivent déposer les principaux résultats)… Continuer la lecture

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Ecrire en science pour le grand public : un exercice particulier que des scientifiques ne connaissent pas

Le dernier numéro de 2015 de Medical Writing, la revue de EMWA (European Medical Writers Association) a pour thème « Writing for lay audience ». Onze articles, y compris l’éditorial, sont consacrés à ce sujet, et lire ce numéro nous faire prendre conscience des techniques spécifiques à cet exercice. L’éditorial de Phil Leventhal présente bien les articles du numéro. Ce numéro contient… Continuer la lecture

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Trop de complices : Médiapart revient sur un ‘cas chimiquement pur d’omerta médicale’. Du rififi en médecine interne !

Nous avons évoqué plusieurs fois les protections diverses qui ont empêché les investigations à la Pitié-Salpétrière. L’article du NEJM devrait être rétracté car les données sources ne sont pas accessibles ! Des experts pensent que la non communication des données sources devrait devenir une cause de rétractation !! Il n’est jamais trop tard pour corriger la science… Il s’agit d’un… Continuer la lecture

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Communiqués de presse : les essais randomisés publiés dans les revues prestigieuses donnent moins souvent lieu à un communiqué que les études observationnelles

Ce sont des chercheurs d’Auckland (New Zealand) qui ont voulu savoir si les essais randomisés contrôllés (ECRs) étaient plus influents que les études observationnelles pour guider la pratique clinique, en se basant sur la couverture médiatique. Leur travail a été publié dans PLOS ONE de fin 2015. Les études observationnelles sont plus fréquentes que les ECRs et peuvent proposer des… Continuer la lecture

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Les résultats de 71 % de 489 études observationnelles enregistrées dans clinicaltrials.gov étaient disponibles 30 mois après la fin de l’étude

C’est une belle étude de l’équipe d’épidémiologie clinique de l’Hôtel Dieu de Paris publiée en janvier 2016 dans BMC Medicine (facteur d’impact 7,4) : « Public availability of results of observational studies evaluating an intervention registered at ClinicalTrials.gov ». Les auteurs ont inclus des études observationnelles avec des résultats de tolérance ayant été terminées entreoctobre 2007 et décembre 2011. L’étude est bien… Continuer la lecture

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Les AFMU meilleures que le magazine Lancet : exceptionnels articles sur les attentats du 13 novembre 2015 à Paris

Excellent dossier (février 2016) de 12 articles dont 1 éditorial, 10 articles spéciaux, et une lettre à la rédaction sur les attaques terroristes du 13 novembre dans les AFMU (Annales Françaises de Médecine d’Urgence). J’ai beaucoup appris en lisant ces articles, et je vous suggère de tous les lire, d’autant plus qu’ils ont été publiés en accès libre (un grand… Continuer la lecture

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Greffes de trachée artificielle recouverte de cellules souche : fraude ou pas au Karolinska Institute ?

Une affaire pas claire concerne un chirurgien du Karolinska Institute, Stockholm, Suède, depuis assez longtemps.. Le Monde daté du 16 février 2016 titre « L’institut Karolinska éclaboussé par une affaire de fraude » mais les informations sont contradictoires, et pour l’instant rien n’est établi très formellement. Des suspicions fortes et une réouverture des investigations relancent cette histoire. Depuis juillet 2015, RetractionWatch a… Continuer la lecture

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Bataclan 13/11/2015, Lancet 24/11 (100 000 auteurs), NEJM 2/12 (une auteure), à qui les SIGAPS !

Félicitons très sincèrement tous les professionnels qui se sont mobilisés lors des attentats terroristes du 13 novembre 2015 à Paris, avec une pensée pour les victimes. Tout ce qui a été fait est exeptonnel, que ce soient les personnels de santé et tous les autres corps de métier : chapeau. Tous les médias ont consacré leurs ‘unes’ à ces événements,… Continuer la lecture

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Les résultats de 2/3 des essais des nouveaux médicaments (FDA) de 2012 ont été publics : insuffisant !

Belle étude (BMJ Open, novembre 2015) montrant que les régulations ne sont pas suivies ! Nous savons que la publication des résultats des essais cliniques est obligatoire, que ce soient d’après les recommandations de l’OMS, de la FDA et des autres agences d’enregistrement de médicaments. D’ailleurs, aux USA, une pénalité de 10 000 $ par jour de retard pourrait être… Continuer la lecture

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Les taux de bonne réalisation et de publication des recherches faites dans les établissements de santé devraient être un des critères de la certification

La plupart des recherches ne seraient pas publiées.. mais nous manquons de critères objectifs pour être certains que cette opinion est exacte. Des données existent, mais ne semblent pas être rendues publiques… Les établissements hospitaliers pourraient publier le taux de réalisation des recherches financées par divers sponsors (dont le PHRC, programme hospitalier de recherche clinique). Par taux de réalisation, il… Continuer la lecture

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Les leçons de l’affaire Séralini / OGM : comment publier des recherches sans conclusion (voire fausses) ?

Cette histoire (plutôt triste) a donné lieu à une évaluation, avec recul, par un sociologue des NIH aux USA. David Resnik a publié un long article le 25 avril 2015 dans J Agri Environ Ethics. Analyse bien faite et intéressante. La publication, la rétractation puis la republication de l’article « Long term toxicity of a Roundup herbicide and Roundup-tolerant genetically… Continuer la lecture

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Le chocolat fait perdre du poids : article publié mais il s’agissait d’une pêche au P significatif… et l’éthique des journalistes concernés est très discutable

La lecture complète de cette histoire illustre le fonctionnement de notre système : faire le buzz est bien plus important que vérifier les données scientifiques. Johannes Bohannon est un récidiviste car il avait déjà piégé des revues prédatrices qui avaient publié des articles totalement inventés. Heureusement qu’il existe de bons journalistes sachant ce qu’est l’investigation et ses règles… seraient-ils minoritaires… Continuer la lecture

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Parler de sexe et vous publierez plus facilement : que ce soient des magazines grand public ou des revues biomédicales prestigieuses… la recette marche

Je pensais ne pas évoquer ce sujet mais le buzz dans les magazines people et revues biomédicales est majeur… d’autant plus que c’est la revue Science qui a publié un article dont les données étaient probablement inventées. L’article était alléchant dès son titre… Les faits : Un article a été publié dans Science en décembre 2014, et le titre était… Continuer la lecture

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Tintin : plus de traumatismes que de pathologies du voyageur ! Déception pour les médecins des voyages ?

Tintin a donné lieu à quelques analyses scientifiques et ses déboires de santé ont été nombreux. Félicitons Eric Caumes et les co-auteurs pour l’article intitulé « Les problèmes de santé de Tintin : plus de traumatismes que de pathologies du voyageur », et publié dans La Presse Médicale en mai 2015. C’est le premier article original analysant complètement tous les problèmes de… Continuer la lecture

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Le déni de la pollution des publications… très inquiétant, mais nous sommes passifs

Voici le premier paragraphe d’un article paru dans les « Mayo Clinic Proceedings » le 3 avril 2015 (paywall), et c’est bien dit : « The world is facing a huge threat from pollution. The scientific community seems unable or unwilling to do anything about the problem and appears to be in a state of denial. The pollution crisis I’m describing is not… Continuer la lecture

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Les programmes scientifiques français de TV ne reflètent pas l’évolution du savoir : la sélection des experts serait biaisée

Dans mon billet du 18 février 2015, j’ai analysé un article sur la (mauvaise) qualité des programmes TV américains dans le domaine de la santé. Je concluais en regrettant l’absence de données françaises… erreur, erreur car un excellent article a été publié en février 2015 par une équipe de Bordeaux dans ‘Public Understanding of Science’, une bonne revue du groupe… Continuer la lecture

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L’histoire de la fraude sur les cellules STAP bien analysée : se lit comme un roman policier !

Nous avons commenté les 2 articles de Nature (fin janvier 2014) finalement retirés de la littérature en juillet pour fraude, avec le suicide d’un des co-auteurs (Y Sasai). Félicitons Cheryl Lancaster, Department of Philosophy, Durham University, UK, pour avoir expliqué en détail cette histoire de fraude. Elle travaille sur l’histoire des cellules souches (elle a un PhD dans ce domaine),… Continuer la lecture

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Règle de l’embargo bafouée par nos ministres et trop de scientifiques : Ebola permet tout !

En science, il existe un principe qui consiste à présenter les innovations et toutes nouveautés aux pairs (par le processus du peer review des revues scientifiques) et aux institutions (agences du médicament pour décider de la mise sur le marché) avant de les diffuser dans le public. Eh bien Ebola permet n’importe quoi. Je vous suggère de lire le billet… Continuer la lecture

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Servier : je suis CHARLIE ? Le Médiator pourrait faire pschitt…. ou la fabrique d’un scandale de sécurité sanitaire….

Assez surprenant de découvrir dans Libération du 20 janvier 2015 un article intitulé « Mediator : Servier prescrit le retrait d’une étude médicale ». Cette information a été reprise sur des sites comme Medscape par exemple. Surprenant car ce sont des avocats qui ont écrit à 2 sociétés savantes, Société Française de Cardiologie et Collège National des Cardiologues Français, pour leur demander… Continuer la lecture

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Les scientifiques sont persuadés qu’ils savent écrire des articles ! Erreur !

Dans un journal grand public américain, The Atlantic, j’ai été surpris de lire 4 pages sur les méthodes rédactionnelles des scientifiques (merci JY Nau pour l’info). Surpris car je n’imagine pas un tel article en France où tout le monde sait écrire. Cet article décrit des cours de rédaction, notamment à New York University, pour des chercheurs, le plus souvent… Continuer la lecture

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Une recherche ‘vraie’ publiée dans TheBMJ a montré que les communiqués de presse en santé sont embellis, et accuse les universitaires !

Ce n’est pas la première fois que l’on évoque les communiqués de presse des chercheurs du domaine de la santé pour dire qu’ils sont assez optimistes. Cette étude publiée dans TheBMJ du 10 décembre 2014 est bonne par sa méthodologie. Cet article contient une note qui nous permet d’accéder aux données sources du travail ! TheBMJ fait partie des revues… Continuer la lecture

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Projet d’une revue biomédicale partagée avec les patients : Research Engagement and Involvement

Après l’intérêt des institutions, il était normal que des revues soient créées pour accepter les recherches dans lesquelles les patients ont un engagement fort. C’est le pari de BMC qui lance cette revue bientôt, car les soumissions sont acceptées. Les objectifs « Research Involvement and Engagement is an interdisciplinary, health and social care journal focussing on patient and wider involvement and… Continuer la lecture

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Titre racoleur et menteur de Rue89 pour attaquer maladroitement la ministre de l’enseignement supérieur et de la recherche !

Dans un article mis en ligne le 10 novembre, deux (mauvais ?) journalistes attaquent à tort le Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche (MESR)et le groupe Elsevier avec un titre racoleur « La France préfère payer (deux fois) pour les articles de ses chercheurs ». Je ne connais pas ces journalistes, s’ils sont bons, ils ont écrit un mauvais article… Continuer la lecture

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Des magazines sollicitent des experts avec des courriels adaptés et bien écrits.. sans dire qu’il faudra payer au moins 3000 $

Vous recevez régulièrement des spam de revues prédatrices, et souvent il est facile de voir que c’est une arnaque. Moins souvent, ces emails viennent de magazines scientifiques. Mais certaines officines deviennent de plus en plus professionnelles. Voici un exemple d’un courriel anonymisé et reproduit intégralement ci-dessous, et j’ai eu du mal à me faire une idée : Cette demande est… Continuer la lecture

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Interdisons les communiqués de presse sur les études animales, car ils sont vraiment trompeurs

Cet éditorial (Evid Based Med, June 2014) attire notre attention sur la mauvaise qualité des communiqués de presse dans le domaine scientifique. Quelques idées sont intéressantes : on ne devrait pas accepter de communiqués de presse sur les études cliniques ayant utilisé un critère de substitution comme critère de jugement principal, et on ne devrait pas faire de communiqués de… Continuer la lecture

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Guerre violente : Science et Cell contre Nature à propos des articles rétractés sur les cellules STAP, avec publications des avis des relecteurs des articles STAP

Nous avons rapporté cette histoire : 2 articles fin janvier 2014 dans la revue Nature sur une nouvelle technique, dite STAP, pour produire des cellules souches. Réactions immédiates de la communauté scientifique et enquête interne dans le prestigieux RIKEN du Japon. Fin mars, les manipulations sont avérées, puis les 2 articles sont rétractés par Nature le 2 juillet. Nature s’est… Continuer la lecture

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La Recherche de septembre 2014 : l’open access en science sera la règle dans peu de temps

Je remercie le magazine La Recherche, et surtout Nicolas Chevassus-au-Louis, pour l’interview qu’ils ont publié dans le numéro de septembre 2014. Le titre de mon interview en page 76 : « L’accès libre à la science va devenir la règle ». C’est mon opinion, et je la défends. Je peux avoir des contradicteurs, et tant mieux. Malheureusement, le magazine La Recherche n’est… Continuer la lecture

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