Archives de catégorie : Gaspillage

Journalologie, metawars, et une recette de rigueur en enregistrant les protocoles : la science mise à l’épreuve dans la revue Science

Le numéro du 21 septembre 2018 de la revue Science contient une série d’article sur la ‘Metaresearch’, c’est à dire ces équipes qui font de la recherche sur la recherche… pour mieux comprendre ce qui se passe. Chapitres en accès libre ! Voici les chapitres : Research on research : une courte introduction sur le développement d’équipes qui cherchent à… Continuer la lecture

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Les prix Cochrane-REWARD pour récompenser ceux qui luttent contre le gaspillage en recherche

Le gaspillage en recherche est un sport qui se porte bien… Nous avons présenté les initiatives de groupes d’experts, pour diminuer les gaspillages, et en particulier le mouvement REWARD, avec son site, ses événements, les 5 articles fondateurs du Lancet en 2014, etc… REWARD alliance s’est associé à la Collaboration Cochrane pour décerner des prix de £ 2500 aux initiatives… Continuer la lecture

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La qualité de la littérature n’augmente pas d’après Richard Lehman, qui a fait une rubrique hebdomadaire pendant 20 ans

Une interview de Richard Lehman dans un blog du BMJ contient un commentaires désabusé, mais probablement exact : La plupart des articles ne traitent pas encore de questions cliniques, et la qualité de la littérature ne s’est pas vraiment améliorée malgré tous les indicateurs, les alarmes et les alertes qui ont été ajoutés, en partie grâce aux exigences des revues…. Continuer la lecture

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INQUIRE pour diminuer le gaspillage de la recherche : des suggestions pour les universitaires et les institutions

Depuis janvier 2014, nous avons évoqué plusieurs fois les initiatives REWARD, surtout poussés par des articles du Lancet. Il s’agit de décrire puis de lutter contre le gaspillage de la recherche. Plusieurs articles ont fait le point sur les propositions. Dans PLOS Medicine, en juin 2018, un article intitulé « Academic response to improving value and reducing waste: A comprehensive framework… Continuer la lecture

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Publier des études négatives, OUI… mais ne plus mettre en oeuvre des pratiques semble très difficile..

C’est un excellent éditorial de JAMA Pediatrics (23 juillet 2018) pour accompagner trois études négatives publiées dans le même numéro. L’éditorial présente les 3 études, et surtout pose la question de la « desimplementation » des pratiques. Publier les études négatives ou stériles devient plus commun.. mais ces publications des 3 essais randomisés contrôlés devraient permettre de changer des pratiques de sur… Continuer la lecture

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Industries versus milieux académiques : qui fait le mieux pour la publication des résultats des essais cliniques ?

Lors du congrès ESOF à Toulouse(juillet 2018), dans une session sur la disponibilité des résultats des essais cliniques, Sile Lane, de Sense about Science a présenté une diapositive que j’ai reprise et que je vous propose de bien lire, car il n’y a pas besoin de la commenter !!!! Ce sont surtout des données nord-américaines, et les détails sont dans… Continuer la lecture

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Peer review des projets de recherche : un gros travail mal évalué dont on ne sait pas s’il est meilleur que la chance

Cet article a été publié par des chercheurs anglais dans PLOS ONE en mai 2018 avec pour titre : « Peer review of health research funding proposals: a systematic map and systematic review of innovations for effectiveness and efficiency ». Il apporte des propositions pour faciliter l’évaluation des projets de recherche, sans répondre aux questions de fond sur les conflits d’intérêts permanents,… Continuer la lecture

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Après quelques années, RIAT démarre : il faut publier les essais invisibles et abandonnés

C’est en 2013, que le concept de RIAT (Restoring Invisible and Abandoned Trials) a été décrit dans le BMJ. Trop d’essais ne sont jamais publiés alors que les résultats sont utiles pour notre communauté. RIAT était un appel à la communauté des chercheurs pour publier ces essais, car il faut du temps, de l’argent, des autorisations, etc.. et des volontaires… Continuer la lecture

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La communauté scientifique française est très en retard pour l’évaluation des chercheurs… encore basée sur le plus mauvais indicateur, le dieu JIF

C’est incroyable, car nous avons encore besoin de rapports pour exposer ce qui était déjà exprimé dans les années 1970s…. Incroyable, car dans la communauté biomédicale, le dieu JIF (Journal Impact Factor) règne, et le pire c’est SIGAPS pour allouer de l’argent en fonction de la notoriété des revues et surtout pas de la qualité des articles et recherches… C’est… Continuer la lecture

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« Self-explanatory illustrations » : faites des tableaux et figures lisibles

Expliquer aux chercheurs que les illustrations des articles scientifiques doivent être claires, précises et compréhensibles prend du temps. Tous les jours, il m’arrive de voir des illustrations que je ne comprends pas… et je n’évoque pas des sujets complexes. Une illustration, que ce soit un tableau ou une figure, doit être comprise sans avoir à se reporter au texte de… Continuer la lecture

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Academia has become POP world

Le Monde POP (Publish or Perish) a transformé les publications, objets d’une économie de marché. Un article est une monnaie d’échange pour une promotion, une attribution de ressources, etc… Ce livre « Publish or Perish », écrit par Imad A Moosa, professeur de finance de Melbourne, Australie, est la meilleure analyse de ce phénomène ? Le sous-titre ‘Perceived benefits versus unintended consequences »… Continuer la lecture

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Les fake news prennent l’ascenseur, les vérités l’escalier ! Félicitations au COMETS

Le comité d’éthique du Cnrs (COMETS) a publié un bon avis (2018-37, 12/04/18) intitulé « Quelles nouvelles responsabilités pour les chercheurs à l’heure des débats sur la post-vérité ? » Faut-il dire « informations fallacieuses » ou « infox « ? Il faut lire ce rapport 2 ou 3 fois pour bien intégrer nos responsabilités car nous devons nous engager pour La marche des… Continuer la lecture

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Améliorer la reproductibilité de la recherche scientifique : 13 articles dans PNAS !

En mars 2018, un numéro spécial des PNAS a publié 13 articles suite à un colloque sur la reproductibilité en recherche. Il s’agit d’un colloque de la National Academy of Sciences aux USA, et ce qui est bien, c’est que les vidéos des présentations sont sur YouTube. Elles sont faciles à écouter, et j’ai testé : bons enregistrements. Parmi les… Continuer la lecture

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89 % des études animales citées dans des brochures investigateurs pour les essais chez l’homme ne sont jamais publiées !

Si vous pensez que la recherche clinique a des problèmes, regardez la recherche animale ! Cet article de PLOS Biology (5 avril 2018), intitulé « Preclinical efficacy studies in investigator brochures: Do they enable risk–benefit assessment? » ne nous étonne pas… mais devrait nous inquiéter. La plupart des essais cliniques chez l’homme seraient basés sur des recherches animales insuffisantes (non publiés, omission… Continuer la lecture

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Le salami existe toujours… avec un cas de 33 articles pour une étude dasn une revue indéxée (Iran !)

La rédaction de la revue est bien sûr complice ! Cette histoire est racontée en détail sur Discover (relayé de Neuroskeptic) et concerne « Trends of Mental Health Status in Iranian Population Aged 15 and above between 1999 and 2015 ». Ci-dessus l’un des articles ! La recherche sur PubMed donne accès aux 33 articles… tous publiés le même jour. Regardez les… Continuer la lecture

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L’excellence de la Recherche exige l’Intégrité : bonnes contributions des experts étrangers ; bel exemple de langue de bois d’experts français

Je vous ai annoncé le colloque organisé par Ph Ravaud et son équipe (Hôtel-Dieu, Paris) avec le soutien d’Aviesan en décembre 2017, Maison de la Chimie, Paris. Ce fût une bonne réunion avec une salle pleine. La plupart des diapos des orateurs sont en ligne ; elles ont été déposées sur des archives ouvertes OSF (Univ Virginia, Charlottesville, USA). La… Continuer la lecture

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Les critères de jugement sont trop souvent différents entre protocoles et publications ! Ce devrait être une étape préalable aux méthodes de lecture critique

Article dans BMC Medical Research Methodology en janvier 2018 et intitulé « A systematic review of comparisons between protocols or registrations and full reports in primary biomedical research ». Bonne recherche d’auteurs canadiens. J’en ai marre de tous ces étudiants que l’on forme à l’analyse de la littérature, ou LCA (Lecture Critique d’Articles) sans les prévenir sur la qualité effroyables de certains… Continuer la lecture

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La recherche animale doit s’améliorer : la recherche préclinique se trompe encore, et des malades sont inclus dans des essais !

Le numéro du 11 janvier 2018 du BMJ contient 4 articles sur la recherche animale. Très longue histoire qui mérite de lire tous les articles. Il s’agit d’un domaine compliqué, le développement d’un vaccin pour la tuberculose. Un éditorial de F Godlee, basé sur les autres articles du numéro : ‘Nous avons besoin d’une meilleure recherche animale, mieux décrite’ ;… Continuer la lecture

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SIGAPS : 950 millions d’euros alloués de façon variable selon les établissements, avec de petits arrangements discrets….

La France est l’un des rares pays qui alloue directement de l’argent en fonction des publications… c’est plutôt rare. En général l’argent est alloué pour des projets de recherche (à ceux qui publient..). La cour des comptes, soucieuse de l’utilisation de l’argent public, a publié le 18 janvier 2018 un rapport de 246 pages (avec annexes) intitulé : « Le rôle… Continuer la lecture

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Les critères de jugement sont trop souvent différents entre protocoles et publications ! Ce devrait être une étape préalable aux méthodes de lecture critique

Article dans BMC Medical Research Methodology en janvier 2018 et intitulé « A systematic review of comparisons between protocols or registrations and full reports in primary biomedical research ». Bonne recherche d’auteurs canadiens. J’en ai marre de tous ces étudiants que l’on forme à l’analyse de la littérature, ou LCA (Lecture Critique d’Articles) sans les prévenir sur la qualité effroyables de certains… Continuer la lecture

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Pourquoi vous ne devriez pas croire ce que vous lisez dans les revues biomédicales : F Godlee, rédactrice du BMJ

C’est le tire d’une bonne conférence (novembre 2017) à la Liverpool School of Tropical Medicine, faite par Fiona Godlee, rédactrice en chef du BMJ ; vous pouvez ré-écoutez la vidéo en regardant les bonnes diapos. Il vous faut une heure tranquille, ce que j’ai fait un dimanche matin, pour avoir uns liste de cas de malveillances ou fraudes en médecine,… Continuer la lecture

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Comment éviter une menace importante : les revues illégitimes ou prédatrices

Une interview de deux chercheurs du centre de jounalologie de Ottawa dirigé par David Moher a été publiée par Scholarly Kitchen pour commenter deux bons articles de cette équipe (5 décembre 2017). Voici ces 2 articles : En septembre 2017, dans Nature, D Moher et al ont publié un article avec un titre de magazine : « Stop this waste of… Continuer la lecture

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Des valeurs de P embellies dans les revues prestigieuses : phénomène connu qui ne gêne personne

Bon article en juillet 2017 dans Journal of Clinical Epidemiology intitulé : »The distribution of P-values in medical research articles suggested selective reporting associated with statistical significance ». Il existe des données importantes sur le bricolage évident des statistiques dans les articles scientifiques, et ceci est une caractéristique transdisciplinaire, des sciences sociales, aux sciences de la vie et aux sciences dures !… Continuer la lecture

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L’aveuglement de notre communauté sur les mauvaises pratiques des chercheurs : du pain béni pour la presse grand public au Québec, en Suisse et en France

Simultanément, des médias grand public dénoncent les pratiques des chercheurs en septembre / octobre 2017… Inquiétant ? Oui, car cela montre clairement que la communauté scientifique n’est pas capable de diffuser le concept de conduire des recherches responsables. Les responsables laissent (voire incitent) des chercheurs honnêtes adopter des pratiques préjudiciables à la recherche. S’ils ne font rien, remercions les journalistes,… Continuer la lecture

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L’affaire Séralini versus Monsanto continue : tous menteurs dans une affaire qui nuit à la science… sans faits établis sur de bonnes méthodes, les croyances s’opposent

Tout est regrettable dans cette histoire compliquée à propos d’un premier article qui n’aurait pas dû être publié, qui n’aurait pas dû être rétracté sur des arguments faibles, qui n’aurait pas dû être republié avec d’autres complices, etc…. Mais jamais personne n’arrivera à s’entendre pour faire une très bonne étude collaborative qui pourrait apporter des arguments de réponse : il… Continuer la lecture

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Newsletter de juillet 2017 envoyée le 1 août avec le titre « Péché de corruption : combien se font une carrière sur des méconduites ? »

En juillet 2017, 20 billets sur le blog de la rédaction médicale. Plutôt que résumer le mois de juillet, j’ai choisi de reprendre un billet à lire en ce week-en de mi-août un apéritif en vacances……. J’ai analysé les 8 chapitres d’un excellent ouvrage (mai 2017) de Chris Chambers, professeur de neurosciences cognitives à Cardiff : The 7 deadly sins… Continuer la lecture

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Les jeunes chercheurs sont malmenés dans de la mauvaise science : pétition anglaise Bullied Into Bad Science

The Bullied Into Bad Science campaign is an initiative by early career researchers (ECRs) for early career researchers who aim for a fairer, more open and ethical research and publication environment. Vous pouvez signer, comme je l’ai fait. Il s’agit d’une pétition proposée par de jeunes chercheurs (ECRs pour Early Career Researchers) de Cambridge en Angleterre. Ils sont préoccupés par… Continuer la lecture

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Significosis, Neophilia, Theorrhea, Arigorum, Disjunctivitis : 5 maladies de la recherche d’après Leadership Quarterly

Voici un extrait de l’abstract : However, five serious “diseases” stifle the production of useful research. These diseases include: significosis, an inordinate focus on statistically significant results; neophilia, an excessive appreciation for novelty; theorrhea, a mania for new theory; arigorium, a deficiency of rigor in theoretical and empirical work; and finally, disjunctivitis, a proclivity to produce large quantities of redundant,… Continuer la lecture

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Les revues de Sciences Sociales dysfonctionnent : « Le pénis conceptuel en tant que construction sociale »

Les revues de Sciences Sociales sont aussi mauvaises que les revues biomédicales… mais je suis convaincu qu’elles surfent facilement sur le plagiat, et d’autres pratiques bizarres. Deux observations pour en témoigner : 1 ) Un article de type ‘canular’ (hoax) a encore piégé une revue. Le titre de cet article The Conceptual penis as a social construct publié dans une… Continuer la lecture

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Les chercheurs italiens utilisent des pratiques préjudiciables en recherche dans plus de 50 % des articles (comme les américains)

Il s’agit d’une étude faite en Italie en utilisant le même questionnaire que celui qui a été utilisé aux USA. L’article est dans PLOS ONE, en mars 2017, avec pour titre : « Questionable research practices among italian research psychologists » Pour les italiens, il y avait 277 réponses…. et pour les US 2000 psychologues. Les résultats donnent le vertige…il s’agit de… Continuer la lecture

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La recherche sur la recherche dysfonctionne parfois : quel est le meilleur jour de la semaine pour soumettre un article ?

Ce n’est pas le premier article de ce type que je consulte par hasard (août 2016).. J’ai jeté les autres, et je ne m’en rappelle plus… Des ressources ont été dépensées pour répondre à une question stupide avec une méthode mal décrite. Nous sommes dans l’excellence des carrières universitaires : ils ont publié un article ! Ils auront une carrière… Continuer la lecture

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Au secours, Wakefield revient ! Trump, Rivasi, Montagnier sont dangereux pour la santé publique

Nous avons évoqué plusieurs fois l’affaire Wakefield qui a causé des morts de rougeole au Royaume-Uni. J’ai résumé cette affaire dans un article de La Presse Médicale en 2012. The BMJ a décrit cette fraude en 3 articles, et ceci a été à l’origine d’un certain froid avec The Lancet. C’est un journaliste, Brian Deer, qui a fait réagir la… Continuer la lecture

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La procrastination : un thème évoqué lors de toutes les formations à la rédaction… facile à surmonter

La procrastination (du latin pro, qui signifie « en avant » et crastinus qui signifie « du lendemain ») est une tendance à remettre systématiquement au lendemain des actions (qu’elles soient limitées à un domaine précis de la vie quotidienne ou non). je viens de copier cela de wikipedia.org C’est l’un des premiers thèmes cités lorsque je demande dans une… Continuer la lecture

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BMJ de Noël : des chercheurs néo-zélandais reçoivent 2,1 spams par jour leur proposant d’écrire un article ou de venir à un congrès

Dans le numéro du BMJ de Noël 2016, une bonne étude sur les spams que nous recevons tous pour écrire des articles « We read spam a lot: prospective cohort study of unsolicited and unwanted academic invitations ». L’article est bien fait et humoristique aussi. Ce sont cinq universitaires d’Auckland (endocrinologie, rhumato, biotstat, santé de la femme) ayant de 10 à 24… Continuer la lecture

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Publications des essais cliniques : les recherches académiques ne font pas mieux que les industries de santé

La mise en ligne de données sur les publications des essais cliniques grâce à Ben Goldacre, fondateur de AllTrials, est une excellente nouvelle. Le mouvement AllTrials est supporté par de nombreuses revues biomédicales (BMJ, PLOS) et d’autres organisations comme la collaboration Cochrane. Une ambition : All trials registered, all trials reported. Voir ci-dessous la pétition signée par plus de 80… Continuer la lecture

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Trop de revues systématiques et de méta-analyses d’après JPA Ioannidis : une épidémie inutile, trompeuse voire dangereuse

C’est un article fleuve de 30 pages paru dans The Milbank Quaterly en septembre 2106, avec le titre « The mass production of redundant, misleading, and conflicted systematic reviews and meta-analysis » a un seul auteur. Cet auteur est prolifique, et c’est un bon chercheur : JPA Ioannidis, de Stanford, USA. Une interview de JPA Ioannidis dans Retraction Watch vous permet de… Continuer la lecture

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Des lignes directrices pour écrire des articles épidémiologiques en nutrition : bienvenues car trop d’inepties publiées dans ce domaine

Il s’agit d’une extension des lignes directrices STROBE (Strengthening the Reporting of Observational Studies in Epidemiology) dédiée aux études épidémiologiques dans le domaine de la nutrition. Indispensable, car c’est un domaine très complexe et des études sont publiées pour vous raconter que manger ou boire des aliments vous cause le cancer. Les pseudo-scientistes écolos s’en servent pour affoler le public…….. Continuer la lecture

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PubPeer en session plénière du congrès EASE de Strasbourg : des cartels de truands doivent exister

Nous avons évoqué le congrès de European Association of Science Editors à Strasbourg (10 au 12 juin 2016), et le 12 juin nous avons écouté Boris Barbour, l’un des fondateurs de PubPeer, invité pour une session plénière. Plusieurs billets nous ont permis d’évoquer PubPeer sur notre blog. PubPeer permet de mettre des commentaires anonymes sur des articles. Et surtout :… Continuer la lecture

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La qualité de la science diminue, en particulier sous la pression pour publier : il faudrait moins publier !

La bonne nouvelle : nous avons une information régulière sur les dérives de la science, et cette information existe dans tous les médias. Nous avons vu que la presse grand public, Le Monde par exemple (mai 2015), a alerté sur les faussaires des labos. Eh bien, le 11 mai 2016, c’est encore une tribune dans la prestigieuse revue Nature. Daniel… Continuer la lecture

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Difficile de publier tous les essais cliniques terminés aux USA : moins de 30 % dans les 2 ans après la fin de l’essai

Très agréable quand il s’agit de lire un bon article dans une bonne revue, mais il faut une heure ! Dans BMJ (janvier 2016) des chercheurs connus de Yale aux USA ont analysé 4 347 essais interventionnels de 51 centres universitaires américains. Les protocoles de ces essais ont été enregistrés dans clinicaltrials.gov (où les chercheurs doivent déposer les principaux résultats)… Continuer la lecture

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