Archives de catégorie : épidémiologie

Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le variant indien

Après le B.1.1.7 anglais, le B.1.351 sud-africain, le P.1 brésilien, c’est au tour d’un autre variant du SARS-CoV-2, cette fois identifié en Inde, de faire les gros titres de la presse internationale. Depuis quelques semaines, l’Inde connaît en effet une flambée épidémique. Dès lors le rapprochement a été vite fait avec l’émergence de ce nouveau …

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Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1

Au Brésil, l’épidémie de Covid-19 est aujourd’hui dominée par plusieurs lignées virales SARS-CoV-2 qui ont toutes en commun de posséder la mutation E484K dans la protéine S (spike ou spicule), qui permet au virus de se fixer sur les cellules qu’ils infectent. Cette mutation est problématique dans la mesure où elle peut contribuer à un …

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Publié dans ACE2, activité neutralisante, Amazonas, analyse phylogénétique, anticorps, anticorps monoclonaux, anticorps neutralisants, B.1.1.7, B.1.351, brésil, contagiosité, coronavirus, COVID-19, D614G, domaine NTD, domaine RBD, domaine RBM, E484K, écepteur ACE2, échappement immunitaire, épidémiologie, Immunologie, Infectiologie, K417N/T, létalité, Manaus, mutations, N.10, N.9, N501Y, neutralisation, P.2, pathogénicité, pouvoir neutralisant, protéine S, protéine spike, RBD, RBM, SARS-CoV-2, séquençage génomique, spicule, transmissibilité, vaccin, vaccination, variant anglais, variant brésilien, variant britannique, Variant Of Concern, variant P.1, variant sud-africain, variants d’intérêt, Variants Of Interest, variants préoccupants, Virologie, virus, VOC, VOI | Commentaires fermés sur Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1

Covid-19 : retour sur les premiers cas de variant sud-africain en France et les premières chaînes de contamination

Une enquête épidémiologique détaille l’origine des premiers cas notifiés en France d’infection par le variant dit sud-africain du SARS-Cov-2*. Également dénommé B.1.351, ce dernier comporte plusieurs mutations dans le gène codant la protéine S (spicule ou spike en anglais), notamment les mutations N501Y et E484K, respectivement associées à une plus grande transmissibilité et à un …

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Covid-19 : transmission du coronavirus par voie aéroportée dans une église en Australie

L’histoire remonte à juillet 2020 et se déroule en Australie. Elle est relatée dans un article daté du 5 avril 2021 dans la revue en ligne Emerging Infectious Diseases. Tout commence le 18 juillet 2020 lorsque le service de santé publique de la ville de Sydney apprend l’existence d’un cas d’infection par le SARS-CoV-2 chez …

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Covid-19 : malgré la quarantaine, des passagers d’un vol international à l’origine de multiples chaînes de contamination

L’histoire se déroule en Nouvelle-Zélande, pays qui pratique une stratégie d’isolement et de mise en quatorzaine à ses frontières dans le but d’éliminer le coronavirus SARS-CoV-2. Le 18 septembre 2020, un cas de Covid-19 est identifié. Le patient est un des passagers d’un vol international en provenance d’Inde. À sa descente d’avion, cet homme (G) …

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Covid-19 : infection nosocomiale dans un hôpital israélien malgré le port du masque et la distanciation physique

Des médecins israéliens rapportent la survenue dans un hôpital pédiatrique d’une flambée épidémique de Covid-19 après qu’un enfant soit venu consulter, accompagné de sa mère. Et ce malgré le respect des mesures de protection habituelles : port du masque chirurgical et distanciation physique. Ces cas d’infection intra-hospitalière ont été rapportés le 27 janvier 2021 dans …

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Covid-19 : probables réinfections chez des résidents d’une maison de retraite

C’est l’histoire de résidents d’un centre de soins infirmiers spécialisés pour personnes âgées dans le Kentucky (États-Unis). En juillet 2020, cet établissement informe les autorités sanitaires locales d’un cas de Covid-19. Des tests RT-PCR sont effectués afin de détecter d’autres cas possibles parmi les résidents et les employés. Le cas index est un membre du …

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New York : le coronavirus circulait plus d’un mois avant l’identification du premier cas de Covid-19

Des chercheurs américains rapportent que le SARS-CoV-2 était présent dans la ville de New York six à huit semaines avant l’identification du premier cas de Covid-19. Telle est la conclusion d’une étude postée sur le site de prépublication medXriv le 11 février 2021. On rappelle que le premier cas d’infection par le SARS-CoV-2 à New …

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Manaus, Brésil : de nouveaux variants du SARS-CoV-2 se jouent-ils de l’immunité collective ?

Que se passe-t-il à Manaus dans l’État d’Amazonas ? En octobre 2020, cet état du nord-ouest du Brésil avait été durement touché par l’épidémie de Covid-19. Publiée en octobre 2020 dans la revue Science, une étude conduite auprès des donneurs de sang indiquait que plus des trois quarts (76 %) des habitants de la plus …

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Covid-19 : le défi des nouveaux variants

Depuis quelques jours, les données concernant les variants du coronavirus SARS-CoV-2, qu’ils soient britanniques, sud-africain, brésilien, voire possiblement américain, se succèdent à un rythme soutenu. Ces informations sont publiées sur des sites de prépublication en attendant d’être évaluées par les pairs et faire l’objet d’une publication dans une revue scientifique. D’autres résultats sont postés en …

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Royaume-Uni : un variant du coronavirus SARS-CoV-2 porteur de nombreuses mutations

Le gouvernement britannique a annoncé que des chercheurs ont identifié un nouveau variant du coronavirus SARS-CoV-2. Celui-ci renferme un nombre de mutations plus important que la plupart des autres variants, raison pour laquelle il est pris « particulièrement au sérieux », a indiqué Chris Whittie, le Chief medical officer for England. « Le groupe consultatif sur les …

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SARS-CoV-2 : que sait-on de la dynamique de la charge virale, des durées d’excrétion et de contagiosité du virus ?

L’évolution dans le temps de la quantité du virus SARS-CoV-2 dans un organisme humain infecté et de sa présence dans divers fluides biologiques influent sur la transmission du virus responsable de la maladie Covid-19. Pour décrire ces paramètres essentiels pour estimer la durée du pouvoir infectieux du virus, et par là même sa contagiosité, les …

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Un rassemblement de motards dans le Dakota du Sud à l’origine de dizaines de cas de Covid-19 dans l’État voisin du Minnesota

C’est l’histoire d’un très important rassemblement de motards qui s’est tenu durant une semaine en août 2020 dans la petite ville de Sturgis dans le Dakota du Sud, dans l’indifférence face à la pandémie de Covid-19. Cette manifestation, qui s’est déroulée en extérieur et en intérieur, a réuni environ 460 000 personnes venues des quatre coins …

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Covid-19 : un mariage et sept enterrements

C’est l’histoire d’un mariage qui a mal tourné, non parce qu’il s’est terminé par un divorce, mais parce qu’il a entraîné un grand nombre de cas secondaires et même tertiaires de Covid-19. Nous sommes le 7 août 2020 dans une petite localité de l’état du Maine aux États-Unis qui compte 4 500 habitants et aucun …

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Visons, furets, chats : les animaux infectés par le SARS-CoV-2 représentent-ils un risque pour l’être humain ?

Au Danemark, des visons d’élevage ont été infectés par le SARS-CoV-2, le coronavirus responsable de la Covid-19. Le risque de propagation du SARS-CoV-2 dans ces fermes, de même que la crainte d’une extension des contaminations humaines à partir de ces animaux, a incité le gouvernement danois à décider de l’abattage immédiat de tous les visons …

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Covid-19 : cinquante-neuf personnes infectées en Irlande par le coronavirus après un vol intercontinental

L’histoire remonte à l’été dernier. Une flambée épidémique de Covid-19 est survenue dans les jours qui ont suivi l’arrivée en Irlande de passagers d’un vol international d’une durée de plus de sept heures. Douze passagers ont été contaminés par un passager infecté. Une fois contaminés, ces passagers ont transmis le virus à 46 personnes. Sur …

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Covid-19 : ce que l’on sait sur les enfants et adolescents et ce qu’il reste à apprendre

Depuis le début de l’épidémie de Covid-19, les données attestent que les enfants développent rarement une forme sévère de Covid-19. En effet, les enfants infectés présentent le plus souvent des symptômes légers [1]. Le fait que l’infection aiguë par le SARS-CoV-2 est le plus souvent bénigne chez les enfants a participé à l’idée largement répandue …

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Contrôle de l’épidémie de Covid-19 : les leçons de la Nouvelle-Zélande

En l’absence de vaccin et de traitement médicamenteux efficace contre le virus SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19, les pays les plus touchés par la pandémie actuelle ont mis en place des mesures dites « non pharmaceutiques » pour lutter contre la diffusion du nouveau coronavirus. Évaluer l’impact des stratégies développées dans différents pays pour faire …

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Grippe : à quoi s’attendre dans le contexte de la pandémie Covid-19 ?

Comme chaque année en hiver, les virus de la grippe (également appelés virus influenza) circulent. Sauf qu’un autre virus respiratoire, le SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19, sévit et sévira également durant la période hivernale 2020-21. Dès lors, une question se pose : à quoi ressemblera en France et en Europe la saison grippale dans les …

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Covid-19 : cluster en Floride après un match de hockey sur glace

C’est l’histoire d’une rencontre amicale de hockey sur glace qui s’est soldée par la survenue de cas groupés (« cluster ») au sein des deux équipes. Elle est relatée dans un article publié le 16 octobre 2020 dans le bulletin épidémiologique hebdomadaire des Centres de contrôle et de prévention des maladies (CDC, Atlanta, Géorgie, États-Unis). …

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Covid-19 : cas groupés dans une crèche en Pologne

Des épidémiologistes polonais rapportent la survenue de nombreux cas groupés d’infection au SARS-CoV-2 au sein d’une crèche. Ces résultats, publiés le 9 octobre 2020 dans la revue en ligne Emerging Infectious Diseases, semblent indiquer que des enfants d’un ou deux ans pourraient transmettre le coronavirus. Cette crèche a réouvert le 18 mai 2020 après la …

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Covid-19 : une adolescente à l’origine de la transmission du virus à onze membres de sa famille

C’est l’histoire d’une adolescente américaine de 13 ans qui s’est révélée être à l’origine d’une chaîne de transmission intrafamiliale du coronavirus SARS-CoV-2. Au total, onze membres de sa famille ont été cas secondaires, confirmés ou probables, sur une période de trois semaines. Son histoire est relatée dans le dernier numéro du bulletin épidémiologique hebdomadaire des …

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Masque ou voile mortuaire

Chaque année, dans le monde, 6 millions d’enfants meurent avant l’âge de 5 ans, dont la moitié de malnutrition, l’autre moitié se répartissant entre pneumonies, diarrhées, paludisme, tuberculose et sida pour l’essentiel. Chez les adultes, les accidents du travail et maladies professionnelles en tuent environ 2 millions. Les suicides et homicides en tuent environ 1,5 …

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Diffusion du coronavirus SARS-CoV-2 : ce que nous apprennent les clusters de Hongkong

Publiée le 17 septembre 2020 dans la revue Nature Medicine, une étude internationale à laquelle ont participé des épidémiologistes hongkongais, australiens et français, est riche d’enseignements pour mieux comprendre les modes de diffusion du coronavirus SARS-CoV-2 via les cas groupés (« clusters ») et les « super-infecteurs » (également appelés  « super-propagateurs » ou « …

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Diffusion du coronavirus SARS-CoV-2 : ce que nous apprennent les clusters de Hongkong

Publiée le 17 septembre 2020 dans la revue Nature Medicine, une étude internationale à laquelle ont participé des épidémiologistes hongkongais, australiens et français, est riche d’enseignements pour mieux comprendre les modes de diffusion du coronavirus SARS-CoV-2 via les cas groupés (« clusters ») et les « super-infecteurs » (également appelés  « super-propagateurs » ou « …

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Covid-19 : quand de jeunes enfants ramènent le coronavirus à la maison

Une enquête épidémiologique américaine, décrivant la dynamique de transmission du coronavirus SARS-CoV-2 lors de trois flambées épidémiques survenues dans l’État de l’Utah, montrent que les jeunes enfants infectés par le coronavirus au sein de crèches et garderies peuvent transmettre le virus à la maison aux membres de la famille. Utilisant les données de traçage des …

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Didier Raoult : pourquoi une majorité de Français lui fait-elle plus confiance qu’au gouvernement ?

Bonjour 17/09/2020. Le spectacle médiatique n’en finit plus, sa conclusion reste incertaine. Après des mois de mises en scène télévisées, de sombres coulisses politiques, de caricatures, d’ego chauffés à blanc, d’accusations croisées et d’invraisemblables polémiques médicamenteuses les chiffres sont là : un Français sur deux a une « image positive » du Pr Didier Raoult, microbiologiste à la […] Continuer la lecture

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Covid, 250 euros: face à la grève du dépistage, le gouvernement va-t-il envoyer la police ?

Bonjour 16/09/2020. L’affaire restait médiatiquement régionale. Elle prend soudain une ampleur nationale et risque de diffuser – plaçant brutalementle pouvoir exécutif devant ses responsabilités. Reprenons ce que nous en dit l’AFP ? La grève dans les vingt laboratoires d’analyse biologiques Biofusion du Tarn-et-Garonne, Haute-Garonne et Lot a été reconduite ce mercredi 16 septembre. Les salariés grévistes […] Continuer la lecture

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Covid politique : les propos au vitriol d’un rapporteur de la commission d’enquête du Sénat

Bonjour 15/09/2020. Le ton, la température, montent dans les médias. Le pouvoir exécutif, le passé et le présent, est la cible de mille et une nouvelles flèches. Dernier (et passionnant) exemple en date l’entretien accordé au Monde  (Chloé Hecketsweiler et Solenn de Royer) par le Dr Bernard Jomier, sénateur de Paris (apparenté Parti socialiste) – corapporteur de […] Continuer la lecture

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A l’image de l’Allemagne, un mouvement antimasque pourrait-t-il émerger en France ?

Bonjour 13/09/2020. C’est une nouvelle salve, sévère et argumentée, contre la stratégie gouvernementale de lutte contre l’épidémie. Elle est signée, dans le Journal du Dimanche, par le Dr William Dab, ancien Directeur général de la santé – interrogé par Anne-Laure Barret. Nous y reviendrons. Pour l’heure, cette question : Le port du masque à l’extérieur est […] Continuer la lecture

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COVID-19 : selon une étude, la fréquentation des restaurants et bars est une situation à risque d’infection

Des épidémiologistes américains ont cherché à déterminer chez des individus présentant des symptômes évocateurs de Covid-19, et qui pour cette raison avaient passé un test de dépistage du coronavirus dans un centre médical, quelles avaient été les activités auxquelles ils avaient participé au cours des deux dernières semaines précédant le début des symptômes. Réalisée entre …

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Réquisitoire dérangeant pour le gouvernement «Ne plus être gouvernés par la peur»

Bonjour 12/09/20020. C’est un document d’importance, une tribune collective publiée par Le Parisien et signée par trente-cinq scientifiques, universitaires et professionnels de santé 1 critiquent avec une certaine virulence la politique et la communication gouvernementales. Selon eux, elles relèvent davantage d’un affichage d’une « posture protectrice » que d’une stratégie sanitaire précise. Un document dont […] Continuer la lecture

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Castex: dégradation de la situation, quatorzaine divisée par deux. Tout reste à expliquer

Bonjour 11/09/2020. Que se passe-t-il au sommet de l’Etat ? Le Premier ministre a tenu une courte allocution, aujourd’hui, à 17 heures pour rendre compte du conseil de défense qui s’est tenu plus tôt dans la matinée. Résumons. Jean Castex a annoncé une « dégradation manifeste » de la situation épidémiologique. Et le chef du gouvernement, une nouvelle fois, […] Continuer la lecture

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Covid : la cacophonie, le bon sens et l’appel à la vigilance de SOS Médecins France

Bonjour 11/09/2020. Interrogation montante. Dramatiser à l’excès ou prendre le risque de sous-estimer la réalité chiffrée et ses conséquences ? Dans les médias on n’en finit plus d’aborder l’équation du « sanitaire » qui serait opposée à l’ « économique ». Le tout, le plus souvent, dans la cacophonie, les invectives, l’inaudible. Et l’on observe dans le même temps les premiers […] Continuer la lecture

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Covid. Le Conseil scientifique fait de la politique. Emmanuel Macron lui répond

Bonjour 0/09/2020. Une étape a été franchie par le Conseil scientifique et nul ne sait jusqu’où cette institution pourra aller. Rendu public par le gouvernement le 9 septembre son dernier avis, daté du 3 septembre, dresse « un constat d’échec » à propos de la stratégie d’isolement destinée à lutter contre l’épidémie de Covid-19. Ses membres (chargés […] Continuer la lecture

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Un médecin peut-il sans danger se déclarer «farouchement opposé» au port du masque ?

Bonjour 09/09/2020 Quelques lignes pour une affaire hors norme rapportée notamment par Le Progrès, l’AFP et Le Quotidien du Médecin ( Martin Dumas Primbault). « Sur la porte de son cabinet, un écriteau va à l’encontre des recommandations des autorités sanitaires. Le Dr Patrick Bellier est farouchement opposé au port du masque, au point d’interdire à ses patients de […] Continuer la lecture

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«Cas contact», Jean Castex, Premier ministre, «va immédiatement subir un test»

Bonjour 08/09/2020 . Avant toute chose, donner l’exemple à la France. Le Premier ministre Jean Castex «va immédiatement subir un test». Et ce parce qu’il n’a pu résister à un passage sur le Tour de France . Et parce qu’il il compte désormais parmi les «cas contacts» du directeur de la course, Christian Prudhomme, qui vient […] Continuer la lecture

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Pourquoi va-t-on réduire la «quatorzaine» alors que la progression virale est «exponentielle» ?

Bonjour 08/09/2020 Une fois de plus, la nécessité absolue d’une pédagogie destinée au plus grand nombre – un exercice que l’exécutif peine à mettre en place. Le gouvernement va très vraisemblablement réduire la période d’isolement des malades du Covid-19 et des cas contacts, jugeant que la durée actuelle de 14 jours est «trop longue». Mais […] Continuer la lecture

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Covid et libertés. Que penser de celles et ceux qui manifestent contre le port du masque ?

Bonjour 06/09/2020. C’est là aussi, là encore, un symptôme à décrypter. Echos de l’AFP mandés d’Australie. Ignorant les avertissements officiels et la réglementation de santé publique, plusieurs centaines de personnes se sont rassemblées à Melbourne pour protester contre les restrictions destinées à endiguer la pandémie. Les forces de l’ordre ont arrêté près de vingt  personnes […] Continuer la lecture

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Covid-Ibiza  : les stars du PSG contaminées réquisitionnées par le ministre de la santé ?

Bonjour 04/09/2020. L’Equipe va devoir ouvrir une rubrique virologique. Pour l’heure ses lecteurs découvrent le caractère universel des modes de contaminations, la nécessité ubiquitaire de se protéger. Le spectacle sportif est, aussi, surtout, à ce prix. « Marquinhos, qui a ressenti des symptômes depuis deux jours, a été testé positif au Covid-19 ce jeudi 3 septembre […] Continuer la lecture

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