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Archives de catégorie : épidémiologie
Covid-19 : première description d’une importante diffusion communautaire du variant Delta au Brésil
Alors que le Brésil commence à récupérer d’une seconde vague de Covid-19, les premiers cas d’infection par le variant Delta, hautement transmissible, sont en train d’émerger. Le premier cas d’infection par ce variant préoccupant date du 26 avril 2021. Depuis, plusieurs cas isolés ou d’importation ont été signalés dans cinq États du Brésil. Une équipe …
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Covid-19 : une étude chinoise souligne l’ampleur de la charge virale à la phase précoce de l’infection par le variant Delta
Une vaste étude décrit la première chaîne de transmission du variant Delta du SARS-CoV-2 en Chine. Celle-ci date du 21 mai 2021. Au total, 167 infections ont été détectées à Guangzhou (province de Guangdong) puis rattachées au cas index à partir de données épidémiologiques ou génétiques. Les chercheurs chinois révèlent que les charges virales associées …
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États-Unis : flambée épidémique due au variant Delta dans un gymnase
L’histoire s’est déroulée sur une période de deux semaines dans une ville de l’Oklahoma (État du Midwest des États-Unis). Elle est relatée dans le bulletin épidémiologique hebdomadaire des Centres américains de contrôle et de prévention des maladies (CDC) daté du 9 juillet 2021. Tout commence par l’identification, le 15 avril 2021, d’un cas d’infection par …
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Covid-19 : Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon… l’émergence sans fin des variants
Il ne se passe plus un jour sans que l’on entende parler du variant Delta, identifié pour la première fois en Inde. Il est pourtant loin d’être la seule lignée virale à inquiéter les épidémiologistes, médecins et autorités sanitaires nationales et internationales. À ce jour, dans le monde, on dénombre une petite vingtaine de variants …
Publié dans Afrique, alpha, bêta, coronavirus, COVID-19, délétion, Delta, épidémiologie, Epsilon, fitness, gamma, insertion, Iota, Kappa, Lambd, mutations, nouveaux variants, NTD, Ouganda, protéine spike, RDB, SARS-CoV-2, séquençage génomique, susbtitution, Theta, vaccin, vaccination, variant, Variant Of Concern, Variant Of Interest, variant under monitoring, variants, variants préoccupants, Virologie, VOC, VOI, VUM
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Covid-19 : nouvelles données sur le variant Delta, dit « indien », en progression dans de nombreux pays
Identifié initialement en Inde, le variant Delta est désormais majoritaire au Royaume-Uni, où il représente environ 90 % des cas d’infection par le virus SARS-CoV-2. En date du 14 juin 2021, selon la base de données génomiques Gisaid, 61 autres pays étaient touchés par ce variant, anciennement dénommé variant indien (ou encore B.1.617.2, mais aussi …
Publié dans anticorps de sujets convalescents, anticorps monoclonaux, B.1.617.2, coronavirus, COVID-19, E484K, E484Q, EFFICACITE VACCINALE, épidémiologie, Gisaid, L425R, mutations, REACT-1, SARS-CoV-2, séquençage génomique, test PCR de criblage, Vaccinologie, VACCINS, variant, variant Alpha, variant Beta, variant brésilie, variant Delta, variant Gamma, variant indien, variant sud-africain, variants, variants of concern, variants préoccupants, Virologie, VOC, VOC-21APR-02
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Covid-19 : comment le variant indien a débarqué au Brésil
L’histoire commence le 27 mars 2021. Le navire « MV Shanddong SA Zhi » quitte la Malaisie pour un long voyage qui doit l’amener à São Luís (État du Maranhão) au Brésil. Signalons au passage que São Luis est la seule capitale d’État du Brésil qui n’ait pas été fondée par les Portugais et dont …
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Publié dans Amérique du Sud, B.1.617.2, brésil, coronavirus, COVID-19, épidémiologie, inde, Infectiologie, lignage B.1.617.2, mutations, nouveaux variants, protéine S, protéine spike, SARS-CoV-2, spicule, variant Delta, variants, variants of concern, variants préoccupants, variats préoccupants, varient indien, Virologie, VOC
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Covid-19 : moindre sensibilité du variant indien B.1.167.2 aux vaccins et aux anticorps monoclonaux
Une étude française montre que le variant indien B.1.167.2 présente de façon significative une moindre sensibilité aux anticorps neutralisants développés par des patients Covid-19 convalescents ou produits après vaccination. L’originalité de cette étude, parue le 27 mai 2021 sur le site de prépublication bioRxiv, tient notamment au fait que les chercheurs n’ont pas utilisé de …
Publié dans Angleterre, anticorps monoclonaux, AstraZeneca, B.1.167.1, B.1.167.2, B.1.167.3, clusters, coronavirus, épidémiologie, foyers de contamination, inde, Infectiologie, mutations, NTD, Pfizer, protéine S, protéine spike, RBD, royaume uni, SARS-CoV-2, séroneutralisation, spicule, vaccin, Vaccinologie, variant, variant indien, variants indiens, variants préoccupants, Virologie, VOC
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Covid-19 : ces variants préoccupants anglais, sud-africain et brésilien qui circulent en Europe
Réalisée entre juin 2020 et février 2021 sous l’égide du Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC, Stockholm, Suède), une étude a analysé les données des cas Covid-19 liés à des « variants préoccupants » (Variants Of Concern ou VOC), en l’occurrence aux variants anglais B.1.1.7, sud-africain B.1.351 et brésilien P.1. Il …
Publié dans B.1.1.7, B.1.351, épidémiologie, Europe, hospitalisation, mutation E484K, non-VOC, P.1, pays européens, réanimation, séquençage génomique, variant, variant anglais, variant anglais B.1.1.7, variant brésilien P.1, variant sud-africain, variant sud-africain B.1.351, variants, variants of concern, Virologie, VOC
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Covid-19 : que sait-on du variant new-yorkais ?
Identifié pour la première fois dans la ville de New York en novembre 2020, le variant B.1.526 a vu sa prévalence augmenter fortement depuis le début de l’année. La proportion de ce nouveau lignage viral est ainsi passée de 3 % à la mi-janvier 2021 à 34 % fin février. Au 5 avril 2021, l’analyse …
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Publié dans B.1.351, B.1.526, breakthrough Infection, coronavirus, COVID-19, épidémiologie, infection post-vaccinale, P.1, réinfection, Santé publique, SARS-CoV-2, variant, variant brésilien, variant new-yorkais, variant sud-africain, variants, variants d’intérêt, variants préoccupants, Virologie, VOC, VOI
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Covid-19 : infections post-vaccinales dues à des variants
C’est l’histoire de deux femmes qui ont contracté la Covid-19, respectivement 19 et 36 jours, après avoir reçu leur deuxième dose d’un vaccin à ARN messager. Le cas de ces patientes a été rapporté le 21 avril 2021 par des médecins et chercheurs américains dans un article en ligne du New England Journal of Medicine. …
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Covid-19 : transmission par aérosols ou comment le coronavirus a contaminé des passagers d’un mini-bus
C’est l’histoire de deux chauffeurs de bus américains qui ont transmis le SARS-CoV-2 à plusieurs passagers, alors que ces derniers portaient un masque et respectaient la distanciation physique. Ces deux cas sont rapportés par des médecins et des chercheurs de la faculté de médecine Case Western Reserve de Cleveland (Ohio, États-Unis) dans un article publié …
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Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le variant indien
Après le B.1.1.7 anglais, le B.1.351 sud-africain, le P.1 brésilien, c’est au tour d’un autre variant du SARS-CoV-2, cette fois identifié en Inde, de faire les gros titres de la presse internationale. Depuis quelques semaines, l’Inde connaît en effet une flambée épidémique. Dès lors le rapprochement a été vite fait avec l’émergence de ce nouveau …
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Publié dans B.1.1.7, B.1.351, coronavirus, COVID-19, délétion, échappement immunitaire, épidémiologie, Gènétique, génomique, inde, Infectiologie, mutation, P.1, protéine S, protéine spike, royaume uni, SARS-CoV-2, séquençage génomique, spicule, transmissibilité, variant à suivre, variant anglais, variant B.1.1.617, variant brésilien, variant britannique, variant indien, Variant Of Concern, Variant Of Interest, variant préoccupant, variant under investigation, Virologie, virus, VOC, VOI, VUI
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Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1
Au Brésil, l’épidémie de Covid-19 est aujourd’hui dominée par plusieurs lignées virales SARS-CoV-2 qui ont toutes en commun de posséder la mutation E484K dans la protéine S (spike ou spicule), qui permet au virus de se fixer sur les cellules qu’ils infectent. Cette mutation est problématique dans la mesure où elle peut contribuer à un …
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Covid-19 : retour sur les premiers cas de variant sud-africain en France et les premières chaînes de contamination
Une enquête épidémiologique détaille l’origine des premiers cas notifiés en France d’infection par le variant dit sud-africain du SARS-Cov-2*. Également dénommé B.1.351, ce dernier comporte plusieurs mutations dans le gène codant la protéine S (spicule ou spike en anglais), notamment les mutations N501Y et E484K, respectivement associées à une plus grande transmissibilité et à un …
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Covid-19 : malgré la quarantaine, des passagers d’un vol international à l’origine de multiples chaînes de contamination
L’histoire se déroule en Nouvelle-Zélande, pays qui pratique une stratégie d’isolement et de mise en quatorzaine à ses frontières dans le but d’éliminer le coronavirus SARS-CoV-2. Le 18 septembre 2020, un cas de Covid-19 est identifié. Le patient est un des passagers d’un vol international en provenance d’Inde. À sa descente d’avion, cet homme (G) …
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Covid-19 : probables réinfections chez des résidents d’une maison de retraite
C’est l’histoire de résidents d’un centre de soins infirmiers spécialisés pour personnes âgées dans le Kentucky (États-Unis). En juillet 2020, cet établissement informe les autorités sanitaires locales d’un cas de Covid-19. Des tests RT-PCR sont effectués afin de détecter d’autres cas possibles parmi les résidents et les employés. Le cas index est un membre du …
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New York : le coronavirus circulait plus d’un mois avant l’identification du premier cas de Covid-19
Des chercheurs américains rapportent que le SARS-CoV-2 était présent dans la ville de New York six à huit semaines avant l’identification du premier cas de Covid-19. Telle est la conclusion d’une étude postée sur le site de prépublication medXriv le 11 février 2021. On rappelle que le premier cas d’infection par le SARS-CoV-2 à New …
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Manaus, Brésil : de nouveaux variants du SARS-CoV-2 se jouent-ils de l’immunité collective ?
Que se passe-t-il à Manaus dans l’État d’Amazonas ? En octobre 2020, cet état du nord-ouest du Brésil avait été durement touché par l’épidémie de Covid-19. Publiée en octobre 2020 dans la revue Science, une étude conduite auprès des donneurs de sang indiquait que plus des trois quarts (76 %) des habitants de la plus …
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Royaume-Uni : un variant du coronavirus SARS-CoV-2 porteur de nombreuses mutations
Le gouvernement britannique a annoncé que des chercheurs ont identifié un nouveau variant du coronavirus SARS-CoV-2. Celui-ci renferme un nombre de mutations plus important que la plupart des autres variants, raison pour laquelle il est pris « particulièrement au sérieux », a indiqué Chris Whittie, le Chief medical officer for England. « Le groupe consultatif sur les …
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Covid-19 : cinquante-neuf personnes infectées en Irlande par le coronavirus après un vol intercontinental
L’histoire remonte à l’été dernier. Une flambée épidémique de Covid-19 est survenue dans les jours qui ont suivi l’arrivée en Irlande de passagers d’un vol international d’une durée de plus de sept heures. Douze passagers ont été contaminés par un passager infecté. Une fois contaminés, ces passagers ont transmis le virus à 46 personnes. Sur …
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Covid-19 : ce que l’on sait sur les enfants et adolescents et ce qu’il reste à apprendre
Depuis le début de l’épidémie de Covid-19, les données attestent que les enfants développent rarement une forme sévère de Covid-19. En effet, les enfants infectés présentent le plus souvent des symptômes légers [1]. Le fait que l’infection aiguë par le SARS-CoV-2 est le plus souvent bénigne chez les enfants a participé à l’idée largement répandue …
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Contrôle de l’épidémie de Covid-19 : les leçons de la Nouvelle-Zélande
En l’absence de vaccin et de traitement médicamenteux efficace contre le virus SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19, les pays les plus touchés par la pandémie actuelle ont mis en place des mesures dites « non pharmaceutiques » pour lutter contre la diffusion du nouveau coronavirus. Évaluer l’impact des stratégies développées dans différents pays pour faire …
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Grippe : à quoi s’attendre dans le contexte de la pandémie Covid-19 ?
Comme chaque année en hiver, les virus de la grippe (également appelés virus influenza) circulent. Sauf qu’un autre virus respiratoire, le SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19, sévit et sévira également durant la période hivernale 2020-21. Dès lors, une question se pose : à quoi ressemblera en France et en Europe la saison grippale dans les …
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Covid-19 : cluster en Floride après un match de hockey sur glace
C’est l’histoire d’une rencontre amicale de hockey sur glace qui s’est soldée par la survenue de cas groupés (« cluster ») au sein des deux équipes. Elle est relatée dans un article publié le 16 octobre 2020 dans le bulletin épidémiologique hebdomadaire des Centres de contrôle et de prévention des maladies (CDC, Atlanta, Géorgie, États-Unis). …
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Covid-19 : cas groupés dans une crèche en Pologne
Des épidémiologistes polonais rapportent la survenue de nombreux cas groupés d’infection au SARS-CoV-2 au sein d’une crèche. Ces résultats, publiés le 9 octobre 2020 dans la revue en ligne Emerging Infectious Diseases, semblent indiquer que des enfants d’un ou deux ans pourraient transmettre le coronavirus. Cette crèche a réouvert le 18 mai 2020 après la …
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Covid-19 : une adolescente à l’origine de la transmission du virus à onze membres de sa famille
C’est l’histoire d’une adolescente américaine de 13 ans qui s’est révélée être à l’origine d’une chaîne de transmission intrafamiliale du coronavirus SARS-CoV-2. Au total, onze membres de sa famille ont été cas secondaires, confirmés ou probables, sur une période de trois semaines. Son histoire est relatée dans le dernier numéro du bulletin épidémiologique hebdomadaire des …
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Masque ou voile mortuaire
Chaque année, dans le monde, 6 millions d’enfants meurent avant l’âge de 5 ans, dont la moitié de malnutrition, l’autre moitié se répartissant entre pneumonies, diarrhées, paludisme, tuberculose et sida pour l’essentiel. Chez les adultes, les accidents du travail et maladies professionnelles en tuent environ 2 millions. Les suicides et homicides en tuent environ 1,5 …