Systémique médicale
Boules de Fourrure
Archives de catégorie : Écrire
ChatGPT va changer rapidement les publications scientifiques
J’observe ce qui se passe et ChatGPT est une actualité donnant lieu à des publications dans toutes les revues scientifiques. La prestigieuse revue Radiology a publié un commentaire de deux pages d’un jeune radio-pédiatre (février 2023). Il … Continuer la lecture
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Vous avez peut-être publié des articles sans le savoir ! Cherchez
Ce billet de RetractionWatch en avril 2023 est surprenant. Une chercheuse, Anca Turcu de University of Central Florida’s School of Politics, Security, and International Affairs, a découvert qu’elle était auteur d’un article avec son nom. L&… Continuer la lecture
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Les instructions aux auteurs des revues de neurosciences et physiologie n’incitent pas suffisamment aux pratiques responsables pour rapporter des résultats
Dans PLOS One le 30 mars 2023, des chercheurs australiens ont analysé les instructions aux auteurs des revues de neuroscience : Encouraging responsible reporting practices in the Instructions to Authors of neuroscience and physiology journals: There is… Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 16 Tu vendras ton travail
Trop de thèse sont un transfert d’os d’une tombe dans une autre. Elles plaisent à un vieux jury qui se congratule, mais ne se demande pas si la thèse aura une vie après la soutenance. Une recherche dont les résultats ne sont pas diffusés es… Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 15 Ton jury, tu épateras
Ce dernier rite de passage doit être bien préparé. La forme (habillement, respect du temps, empathie, clarté) a de l’importance. Une thèse mal présentée met le jury de mauvaise humeur. Un rite de passage codifié par la faculté, et rapide… L… Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 14 Abondance de références, tu éviteras
Attention, trop de références sont un étalage de confitures alors que quelques références bien choisies sont très utiles. Ne retiens que des références avec des données probantes pour convaincre, donc essentiellement des articles originaux. 25 à 30 % d… Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 13 Ta carte postale : titre et résumé
Trop de titres de thèse sont peu informatifs et pas très attirants. Il y a trois types de titres : informatifs, indicatifs, interrogatifs. Il faut choisir entres ces trois possibilités… pas toujours facile. Titre actif avec verbe et résultat pour… Continuer la lecture
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ChatGBT : performant non sourcé… co-auteur d’articles scientifiques (auteurs cadeaux ou fantômes ?)
Depuis novembre 2022, c’est l’excitation autour d’un outil d’intelligence artificielle (IA) qui répond à nos questions et propose des textes cohérents, voire plaisants, etc… Tous les domaines de l’éducation, de la science sont concernés, et ce n’est qu… Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 11 Précis, clair, bref tu seras
Le style scientifique n’est pas le style littéraire. Nous avons appris à bien écrire, dans l’esprit des grands auteurs de la littérature. Urgence, il faut tout oublier en science : Le meilleur style est l’absence de style Comprends co… Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 10 Instructions te guideront
Avant de commencer ta thèse, tu dois consulter les instructions de ta faculté, des instructions pour bien écrire et d’autres recommandations Chaque faculté publie sur son site des instructions pour la thèse. Il faut les consulter. Elles sont détaillées… Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 9 Une discussion sans palabres
La discussion commence très naturellement par répondre à ta question de recherche. Pour cela, tu résumes brièvement le(s) résultat(s) principal(aux) en mettant en valeur les aspects nouveaux et importants. La thèse, comme l’article original d’une revue… Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 8 Tes résultats, tu simplifieras
Le plan IMRaD de ta thèse, ce sont 4 questions : Pourquoi j’ai fait ce travail (introduction, module 5) ? Comment j’ai fait ce travail (méthodes, module 6) ? Qu’est ce que j’ai observé (résultats, ce module) ? Qu’est-ce qu… Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 7 Ethique, tu n’oublieras pas
Ta recherche doit respecter tous les principes d’une recherche responsable, c’est-à-dire respecter les directives, bonnes pratiques et règles d’éthique qui s’appliquent à la recherche. Tu dois être intègre, en étant totalement honnête, sans cacher des … Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 6 Qualité, donne tes méthodes
La deuxième question du plan IMRaD est : Comment j’ai fait ce travail ? Ce sont les méthodes de ta thèse ou de ton article. Tu dois décrire avec précision comment tu as travaillé, sans omettre tous les détails, mêmes les plus évidents. Ton lecteu… Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 5 Introduction en 3 parties… Connu, Inconnu, Question
Le plan IMRaD de ta thèse doit répondre à 4 questions : Pourquoi j’ai fait ce travail (Introduction) ? Comment j’ai fait ce travail (Méthodes) ? Qu’est-ce que j’ai observé (Résultats) ? Qu’est-ce que j’en pense (Discussion) ? L’introduction est d… Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 4 PICOT ton ami
Ce module de guide du thésard t’aidera pour préparer une question de recherche. Apprend à poser la question de recherche ; évaluer l’écart entre la littérature et les pratiques : le mieux serait d’avoir une revue systématique (voir module 1… Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 3 Kits, Quitte à s’outiller
Pour réussir ta thèse, l’environnement professionnel et familial compte : tu auras parfois besoin de soutiens pour rester motivé. Ta formation aux méthodes de recherche et les conditions matérielles de ton travail doivent être prises en compte. Ce modu… Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 2 Je plane, tu planning
Pourquoi faire une thèse ? Par plaisir, pas seulement. Il faut questionner ses collègues pour apprendre de leurs succès et épreuves. Savoir choisir un sujet, un directeur de thèse sont importants. Il faut préparer un rétroplanning (sur 12 mois par exem… Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 1 Rechercher tu apprendras
Dans ce module 1 du guide du thésard, les principes d’une thèse d’exercice sont présentés. Ce rite de passage se fait dans la souffrance. Les mauvais souvenirs sont vite oubliés. La thèse de médecine et l’article de recherche suivent la mêm… Continuer la lecture
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Guide du thésard en médecine : présentation des 16 modules
J’ai préparé 16 vidéos de 4 minutes en moyenne pour aider les internes en médecine lorsqu’ils doivent préparer leur thèse. Chaque vidéo sera mise en ligne avec un billet sur ce blog pour la présenter. Avec chaque vidéo, un document pdf de 4… Continuer la lecture
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Ta thèse, l’imaginer, l’écrire, la diffuser : Module 12 Systématique sera ta revue
La revue systématique est une recherche qui se développe. Faire une revue systématique (RS) demande du temps, de la rigueur et une collaboration avec des collèges. Bien faite (ce qui est rare), la RS est une recherche qui permet d’analyser la littératu… Continuer la lecture
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Mise à jour des recommandations ICMJE : introduction de race et ethnie et suppression du terme paternité dans la version française
Habituellement, les recommandations pour la conduite, la présentation, la rédaction et la publication des travaux de recherche soumis à des revues médicales de l’ICMJE (International Committee of Medical Journal Editors) sont actualisées en décem… Continuer la lecture
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Quand les encadrants s’emparent du travail des jeunes chercheurs : à lire d’urgence
Attention : ne pas généraliser sans plus d’infirmations, mais le problème existe ! Je n’avais pas encore eu le temps de lire ce livre mais quand je l’ai ouvert, je ne l’ai plus quitté, comme un polar !! Bien écrit, c’est l… Continuer la lecture
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L’écriture en recherche qualitative nécessite un apprentissage
Je suis toujours frappé par les politiques différentes des revues selon les disciplines. C’est normal, mais c’est souvent un grand écart entre des articles de biologie fondamentale, de physique, de médecine et de sciences humaines et social… Continuer la lecture
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Un truc étrange : pourquoi nous avons des centaines de systèmes de références alors que 3 ou 5 seraient bien suffisants
Depuis environ 40 ans, c’est un questionnement qui revient périodiquement, et rien ne se passe. Lorsque nous soumettons un manuscrit, il faut se plier à des exigences nombreuses pour mettre les références en forme. Les habitudes varient entre les disci… Continuer la lecture
Les posters de congrès dans de grands halls vont disparaître : dans 10 ans ou moins ?
Nous avons tous été admiratifs devant des posters de congrès encyclopédiques : même en 15 minutes, les principaux messages ne sont pas compris. En discutant lors de formation sur les abstracts et posters, les participants suivent des hypothèses que je … Continuer la lecture
Actualisation des recommandations ICMJE fin 2021 : les preprints
En 2020, l’ICMJE (International Committee of Medical Journal Editors) n’avait pas actualisé ses recommandations pour écrire des articles. Fin 2021, ils ont apporté des modifications. Outre quelques actualisations de liens, quelques précisio… Continuer la lecture
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La nature sexuée de la paternité des articles : les femmes ont l’impression de recevoir moins de crédit que ce qu’elles méritent
Une recherche a été conduite par des experts connus américains et canadiens le 1 septembre 2021 dans Science Advances (revue du groupe AAAS dont le leader est Science). Voici la traduction du résumé qui reflète bien l’article, sans reprendre de d… Continuer la lecture
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Après DORA, Leiden manifesto, Hong Kong principles, une bonne avancée pour améliorer un CV
Bonne réflexion publiée dans Nature le 29 octobre 2021, par des experts de la Swiss National Science Foundation (Bern), et du Centre for Science and Technology Studies, Leiden University. Cette initiative complète d’autres mouvements pour arrêter… Continuer la lecture
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Hommages à J Farfor, JP Benhamou, M Huguier, les précurseurs de la bonne rédaction médicale en France
Félicitons Alexandre Pariente pour son article de janvier 2021 intitulé Première publication dans GCB, ou de l’influence de James Farfor et de Jean-Pierre Benhamou sur un rédacteur médical débutant dans les années 70. Article publié dans Hépato-Gastro … Continuer la lecture
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Dix règles simples pour structurer un article de recherche
Les formats des articles de recherche varient selon les disciplines scientifiques. Si la recherche médicale utilise essentiellement le format IMRaD (Introduction, Méthodes, Résultats, Discussion), d’autres formats existent : Méthodes à la fin, mé… Continuer la lecture
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Duplication des acronymes d’essais cliniques : trompeur ou pas ?
Que penser de l’utilisation des acronymes pour désigner des études cliniques, voire des maladies. Dans le domaine médical, l’acronyme est fréquent, pas toujours clair, mais parfois très utile. J’ai évoqué un article humoristique du BM… Continuer la lecture
‘Un canari dans la mine de charbon’…. éviter d’étaler votre culture dans les titres des articles
L’ingéniosité des auteurs pour trouver des titres peu évocateurs du travail, voire destinés à perdre le lecteur potentiel est surprenante. Je suis souvent confronté à des auteurs qui trouvent de formulations théâtrales, musicales, artistiques ou encore… Continuer la lecture
Les méthodologies et analyses de données de mauvaise qualité encouragent des résultats faux-positifs ou la sélection naturelle de la mauvaise science
C’est le constat fait par deux chercheurs et publié dans la revue ‘Royal society open science’ (21 septembre 2016) sous le titre ‘The natural selection of bad science’. En citation de cet article, il y a un tweet « J’ai participé à un grand nombre de c… Continuer la lecture
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10 règles simples pour bien choisir et citer vos références. C’est le bordel des citations (2) !
La qualité des références est vraiment mauvaise, et rares sont les reviewers qui téléchargent les références lorsqu’ils évaluent un article (je ne le fais pas !). Dans l’excellente série de PLOS Computational Biology intitulée « Ten simple … Continuer la lecture
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Citez, citez au maximum… quelle honte de voir cette pratique encore recommandée
J’ai l’habitude de dire : ‘L’abondance de références dans un article est un excellent indicateur de l’absence d’esprit critique des auteurs‘. Il s’agit d’un article dans Materials Today: Proceedings… Continuer la lecture
Faire un bon titre pour votre article : indicatif ou informatif ?
Trop de titres d’articles originaux sont mal faits et font probablement perdre de l’audience aux auteurs. Il y a pas mal de conseils pour écrire un titre, et j’ai repris les conseils de PLOS. Ils proposent cinq conseils à suivre et d… Continuer la lecture
Doug Altman, un statisticien anglais qui nous a alerté sur la très mauvaise qualité des recherches
Cet article de 21 pages dans Biometrical Journal début février 2021 est à garder car il reprend une communication en mémoire de Doug Altman (décédé en juin 2018). La carrière de Doug a été exceptionnelle car il a été visionnaire, et l’un des bios… Continuer la lecture
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Bien faire des illustrations pour les articles de recherche clinique : pas si facile ?
Lors des formations à la rédaction, expliquer comment bien préparer des illustrations, tableaux ou figures, est difficile. Les auteurs croient savoir faire. C’est faux car de bonnes illustrations améliorent la lisibilité des articles, ne sont pas… Continuer la lecture
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La discussion de votre manuscrit est facile à écrire
C’est étonnant de constater que beaucoup d’auteurs d’articles originaux ne savent pas comment écrire la discussion. Certains procrastinent ! Cette partie est simple, elle demande de la réflexion, et doit être écrite sans attendre la f… Continuer la lecture