Archives de catégorie : Delta

Covid-19 : caractérisation du variant XD, issu d’une recombinaison entre Delta et Omicron

Une étude dirigée par des chercheurs de l’Institut Pasteur de Paris rapporte les premières données épidémiologiques, virologiques et biologiques concernant le variant XD du SARS-CoV-2, issu de la recombinaison entre les variants Delta et Omicron. Ces travaux, supervisés par Étienne Simon-Lorière, responsable du groupe ‘Génomique évolutive des virus à ARN’ à l’Institut Pasteur, ont été …

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Publié dans anticorps, anticorps monoclonaux, anticorps neutralisants, AY.4, BA.1, BA.2, biologiqe moléculaire, breakpoints, coronavirus, COVID-19, Delta, échappement immunitaire, Gènétique, Génétique - Biologie moléculaire, génome viral, Immunologie, neutralisation, Omicron, points de cassure, protéine spike, RBD, recombinaison génétique, SARS-CoV-2, sous-lignage, spike, template switching, vaccin, vaccination, variant XD, variants, Virologie, virus recombinant | Commentaires fermés sur Covid-19 : caractérisation du variant XD, issu d’une recombinaison entre Delta et Omicron

Infection par Omicron : quelle réponse contre d’autres variants chez les vaccinés et non-vaccinés ?

Une étude sud-africaine a évalué, chez des individus vaccinés et non vaccinés, la capacité des anticorps produits après une infection par le variant Omicron à combattre d’autres variants du SARS-CoV-2. Les résultats ont été publiés le 22 mars 2022 dans la revue Cell Host and Microbe. Conduite par Simon Richardson, Penny Moore et leurs collègues …

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Publié dans ADCC, ADCP, alpha, anticorps neutralisants, BA.1, bêta, breakthrough Infection, breakthrough Infections, coronavirus, COVID-19, cytotoxicité cellulaire, D614G, Delta, gamma, immunité, immunité neutralisante, immunité neutralisante croisée, Immunologie, infection post-vaccinale, non-vaccinés, Omicron, phagocytose dépendante des anticorps, rappel, SARS-CoV-2, troisième dose, vaccination, vaccinés, Vaccinologie, variant, Virologie | Commentaires fermés sur Infection par Omicron : quelle réponse contre d’autres variants chez les vaccinés et non-vaccinés ?

Dans le sillage d’Omicron, les singularités de BA.2

L’ascension du variant Omicron (B.1.1.529) a été fulgurante dans de nombreux pays. Initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud en novembre 2021, ce nouveau variant du SARS-CoV-2 est aujourd’hui présent dans au moins 67 pays. Ce variant préoccupant est composé de trois sous-lignages désignés BA.1 (majoritaire), BA.2 et BA.3 (très peu détecté). Un …

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Omicron : une biologie et une dynamique virale différentes de celles observées chez les précédents variants

Dans ce billet de blog, je vous invite, à travers les données issues d’articles publiés ces dernières semaines, à comprendre les moyens utilisés par la recherche pour explorer les propriétés biologiques et virologiques d’Omicron. Celles-ci révèlent en quoi ce nouveau variant du SARS-CoV-2 est atypique. L’objectif des chercheurs est de comprendre comment les multiples mutations …

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Publié dans ACE2, anticorps, anticorps neutralisants, Biologie humaine, biologie structurale, bronche, cathepsine, cellule, charge virale, conformation, coronavirus, cryo-EM, cryomicroscopie électronique, délétion, Delta, domaine amino-terminal, domaine de liaison au récepteur, durée d'excrétion, dynamique virale, échappement immunitaire, ectodomaine, effet épistatique, épistasie, épithélium nasal, épitopes, évasion immunitaire, excrétion virale, fusion membranaire, IFITM, Immunologie, mutation, Omicron, particules virales, PCR, peptide de fusion, poumon, protéine spike, protomère, pseudovirus, RBD, récepteur ACE2, réplication, réplication virale, RT-PCR, SARS-CoV-2, séquence génomique, sites antigéniques, sous-unité S1, sous-unité S2, spike, TMPRSS2, transmissibilité, trimère, variant, variants, Virologie, virus, voie endosomale | Commentaires fermés sur Omicron : une biologie et une dynamique virale différentes de celles observées chez les précédents variants

Hong Kong : transmission du SARS-CoV-2 de hamsters de compagnie à l’homme, suivie d’une diffusion interhumaine

Tout commence, à Hong Kong, le 11 janvier 2022. Une employée de 23 ans travaillant dans une animalerie, qui vend des hamsters, des lapins et des chinchillas,  présente un mal de gorge et de la toux. Elle est doublement vaccinée contre la Covid-19, la deuxième dose lui ayant été administrée le 16 septembre 2021. Elle …

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En Inde, un léopard contaminé par le SARS-CoV-2. Des pumas et des lions infectés dans un zoo en Afrique du Sud

Un léopard vivant en liberté a été contaminé par le SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19, indiquent des chercheurs de l’Institut indien de recherche vétérinaire à Bareli (Uttar Pradesh, État de l’Inde du Nord) dans un preprint publié le 12 janvier 2022 sur le site bioRxiv. En 2021, trois cas d’infection naturelle par le SARS-CoV-2 chez des …

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Comment le SARS-CoV-2 peut évoluer en variant préoccupant chez un individu immunodéprimé

C’est l’histoire d’une femme sud-africaine d’une trentaine d’années, atteinte du sida. Elle est admise en septembre 2020 dans un hôpital de Durban pour des symptômes qui ont débuté douze jours auparavant. Cette patiente présente une gêne respiratoire, un mal de gorge, de la toux. Le test RT-PCR pour le SARS-CoV-2 effectué sur le prélèvement nasopharyngé …

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Covid-19 : ce que l’on sait de la sévérité de l’infection à Omicron

Quel impact le variant Omicron a-t-il sur le taux des admissions et des hospitalisations ? Ce nouveau variant, initialement identifié au Botswana et en Afrique du Sud en novembre 2021, est-il aussi dangereux que le précédent variant Delta ? Plusieurs études, en provenance d’Afrique du Sud et du Royaume-Uni, ont été publiées. L’occasion de faire …

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Variant Omicron : ce que l’on sait de l’activité neutralisante des anticorps, du risque de réinfection et de l’efficacité des vaccins

Initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud, le variant Omicron (B.1.1.529) est le cinquième variant préoccupant depuis le début de la pandémie Covid-19 due au SARS-CoV-2*. C’est également celui qui inquiète le plus les virologistes, immunologistes et épidémiologistes. En effet, plusieurs études in vitro indiquent que les nombreuses mutations présentes dans la protéine …

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Variant Omicron : un risque d’échappement immunitaire

Le moins qu’on puisse dire est que le nouveau variant Omicron initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud inquiète les spécialistes. Une étude, publiée sous forme de preprint sur le site medRxiv, rapporte un risque accru de réinfection associé à ce nouveau variant du SARS-CoV-2. En d’autres termes, Omicron présente une capacité accrue …

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Covid-19 : un enseignant non vacciné à l’origine d’une flambée épidémique au variant Delta dans une école primaire américaine

L’histoire se déroule aux États-Unis dans une école primaire. Elle commence lorsqu’un enseignant apprend qu’il est positif pour le SARS-CoV-2, le coronavirus responsable de la Covid-19. Nous sommes le 23 mai 2021. Deux jours plus tôt, cette personne, non vaccinée, a présenté des symptômes mais a continué à travailler le demain et le surlendemain avant …

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Covid-19 : Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon… l’émergence sans fin des variants

Il ne se passe plus un jour sans que l’on entende parler du variant Delta, identifié pour la première fois en Inde. Il est pourtant loin d’être la seule lignée virale à inquiéter les épidémiologistes, médecins et autorités sanitaires nationales et internationales. À ce jour, dans le monde, on dénombre une petite vingtaine de variants …

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