Archives de catégorie : délétion

Dans le sillage d’Omicron, les singularités de BA.2

L’ascension du variant Omicron (B.1.1.529) a été fulgurante dans de nombreux pays. Initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud en novembre 2021, ce nouveau variant du SARS-CoV-2 est aujourd’hui présent dans au moins 67 pays. Ce variant préoccupant est composé de trois sous-lignages désignés BA.1 (majoritaire), BA.2 et BA.3 (très peu détecté). Un …

Continuer la lecture

Publié dans ACE2, anticorps, anticorps neutralisants, biologie, Biologie humaine, bronche, cellule, charge virale, coronavirus, COVID-19, délétion, Delta, domaine de liaison au récepteur, dynamique virale, échappement immunitaire, épidémiologie, épithélium nasal, évasion immunitaire, fusion membranaire, Immunologie, modèle animal, mutation, Omicron, pathogénicité, PCR, poumon, protéine spike, pseudovirus, RBD, récepteur ACE2, réplication virale, RT-PCR, SARS-CoV-2, séquence génomique, spike, TMPRSS2, transmissibilité, Vaccinologie, variant, variants, Virologie, virus | Commentaires fermés sur Dans le sillage d’Omicron, les singularités de BA.2

Omicron : une biologie et une dynamique virale différentes de celles observées chez les précédents variants

Dans ce billet de blog, je vous invite, à travers les données issues d’articles publiés ces dernières semaines, à comprendre les moyens utilisés par la recherche pour explorer les propriétés biologiques et virologiques d’Omicron. Celles-ci révèlent en quoi ce nouveau variant du SARS-CoV-2 est atypique. L’objectif des chercheurs est de comprendre comment les multiples mutations …

Continuer la lecture

Publié dans ACE2, anticorps, anticorps neutralisants, Biologie humaine, biologie structurale, bronche, cathepsine, cellule, charge virale, conformation, coronavirus, cryo-EM, cryomicroscopie électronique, délétion, Delta, domaine amino-terminal, domaine de liaison au récepteur, durée d'excrétion, dynamique virale, échappement immunitaire, ectodomaine, effet épistatique, épistasie, épithélium nasal, épitopes, évasion immunitaire, excrétion virale, fusion membranaire, IFITM, Immunologie, mutation, Omicron, particules virales, PCR, peptide de fusion, poumon, protéine spike, protomère, pseudovirus, RBD, récepteur ACE2, réplication, réplication virale, RT-PCR, SARS-CoV-2, séquence génomique, sites antigéniques, sous-unité S1, sous-unité S2, spike, TMPRSS2, transmissibilité, trimère, variant, variants, Virologie, virus, voie endosomale | Commentaires fermés sur Omicron : une biologie et une dynamique virale différentes de celles observées chez les précédents variants

Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le nouveau variant Omicron (B.1.1.529)

Après le variant Delta (ex-variant B.1.1.7 dit britannique), le variant Beta (ex-variant sud-africain B.1.351), le variant Gamma (ex-variant P.1 dit brésilien), c’est donc au tour d’un autre variant du SARS-CoV-2, dénommé Omicron (ou variant B.1.1.519), de faire les gros titres de la presse internationale et d’occuper le devant de la scène sur les chaînes d’info …

Continuer la lecture

Publié dans Afrique australe, afrique du sud, analyse phylogénétique, B.1.1.529, Botswana, cas clinique, constellation de mutations, coronavirus, COVID-19, délétion, Divers, domaine amino-terminal, domaine de liaison au récepteur, domaine N-terminal, échappement immunitaire, épidémiologie, épitopes, évolution intra-hôte, évolution virale accélérée, gestes barrières, immunodéprimés, Immunologie, immunosuppression, infection prolongée par le SARS-CoV-2, insertion, MESURES BARRIERES, mesures non pharmaceutiques, NTD, Omicron, pateints immunodéprimés, PCR, profil mutationnel, protéine S, protéine spike, pseudovirus, RBD, SARS-CoV-2, séquençage génomique, spicule, variant, Variant Of Concern, variant préoccupant, vih, Virologie, virus du sida, VOC | Commentaires fermés sur Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le nouveau variant Omicron (B.1.1.529)

Covid-19 : Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon… l’émergence sans fin des variants

Il ne se passe plus un jour sans que l’on entende parler du variant Delta, identifié pour la première fois en Inde. Il est pourtant loin d’être la seule lignée virale à inquiéter les épidémiologistes, médecins et autorités sanitaires nationales et internationales. À ce jour, dans le monde, on dénombre une petite vingtaine de variants …

Continuer la lecture de « Covid-19 : Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon… l’émergence sans fin des variants »

Continuer la lecture

Publié dans Afrique, alpha, bêta, coronavirus, COVID-19, délétion, Delta, épidémiologie, Epsilon, fitness, gamma, insertion, Iota, Kappa, Lambd, mutations, nouveaux variants, NTD, Ouganda, protéine spike, RDB, SARS-CoV-2, séquençage génomique, susbtitution, Theta, vaccin, vaccination, variant, Variant Of Concern, Variant Of Interest, variant under monitoring, variants, variants préoccupants, Virologie, VOC, VOI, VUM | Commentaires fermés sur Covid-19 : Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon… l’émergence sans fin des variants

Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le variant indien

Après le B.1.1.7 anglais, le B.1.351 sud-africain, le P.1 brésilien, c’est au tour d’un autre variant du SARS-CoV-2, cette fois identifié en Inde, de faire les gros titres de la presse internationale. Depuis quelques semaines, l’Inde connaît en effet une flambée épidémique. Dès lors le rapprochement a été vite fait avec l’émergence de ce nouveau …

Continuer la lecture de « Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le variant indien »

Continuer la lecture

Publié dans B.1.1.7, B.1.351, coronavirus, COVID-19, délétion, échappement immunitaire, épidémiologie, Gènétique, génomique, inde, Infectiologie, mutation, P.1, protéine S, protéine spike, royaume uni, SARS-CoV-2, séquençage génomique, spicule, transmissibilité, variant à suivre, variant anglais, variant B.1.1.617, variant brésilien, variant britannique, variant indien, Variant Of Concern, Variant Of Interest, variant préoccupant, variant under investigation, Virologie, virus, VOC, VOI, VUI | Commentaires fermés sur Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le variant indien

Covid-19 : quand le SARS-CoV-2 se déleste de petits fragments de son matériel génétique pour échapper aux anticorps

Avec l’apparition de nouveaux variants SARS-CoV-2, on sait désormais que ce coronavirus, dont le génome était considéré jusqu’à présent relativement stable, peut muter. Cette variabilité génétique repose sur l’apparition de mutations consistant en la substitution d’un nucléotide par un autre, autrement dit d’une « lettre » par une autre dans l’ARN viral. Comme pour tout …

Continuer la lecture de « Covid-19 : quand le SARS-CoV-2 se déleste de petits fragments de son matériel génétique pour échapper aux anticorps »

Continuer la lecture

Publié dans activité neutralisante, anticorps, anticorps neutralisants, ARN, ARN viral, coronavirus, COVID-19, délétion, délétions, émergence de nouveaux variants, épitopes, évolution virale, Gènétique, génome, génome viral, Immunologie, immunosuppression, Infectiologie, mutations, neutralisation, nouveaux variants, patient immuodéprimé, phylogénétique, SARS-CoV-2, système immunitaire, variants, Virologie, virus | Commentaires fermés sur Covid-19 : quand le SARS-CoV-2 se déleste de petits fragments de son matériel génétique pour échapper aux anticorps

Covid-19 : vaccins et nouveaux variants, quel impact ?

Des chercheurs sud-africains rapportent 19 janvier 2021 sur le site de prépublication bioXriv des résultats indiquant que les mutations présentes dans le variant sud-africain 501Y.V2 lui confèrent la possibilité d’échapper à l’activité neutralisante des anticorps produits lors d’une infection naturelle, voire post-vaccination. Rappel : la protéine S (spike, spicule) de surface du coronavirus SARS-CoV-2 se …

Continuer la lecture de « Covid-19 : vaccins et nouveaux variants, quel impact ? »

Continuer la lecture

Publié dans 501.V3, 501Y.V.2, 501Y.V1, activité neutralisante, afrique du sud, anticorps monoclonaux, anticorps polyclonaux, B.1.1.7, B1.1.28, brésil, coronavirus, délétion, domaine N-terminal, E484K, émergence de nouveaux variants, Gènétique, immunité, Immunologie, Infectiologie, K417N/T, mutations, N501Y, nouveau variant, nouveaux variants, NTD, plasma, protéine S, protéine spike, pseudovirus, RBD, receptor binding domain, royaume uni, SARS-CoV-2, sérum, système immunitaire, Vaccinologie, variant anglais, variant brésilien, variant britannique, Virologie, VOC 202012/01 | Commentaires fermés sur Covid-19 : vaccins et nouveaux variants, quel impact ?

Royaume-Uni : un variant du coronavirus SARS-CoV-2 porteur de nombreuses mutations

Le gouvernement britannique a annoncé que des chercheurs ont identifié un nouveau variant du coronavirus SARS-CoV-2. Celui-ci renferme un nombre de mutations plus important que la plupart des autres variants, raison pour laquelle il est pris « particulièrement au sérieux », a indiqué Chris Whittie, le Chief medical officer for England. « Le groupe consultatif sur les …

Continuer la lecture de « Royaume-Uni : un variant du coronavirus SARS-CoV-2 porteur de nombreuses mutations »

Continuer la lecture

Publié dans ARN, coronavirus, COVID-19, délétion, délétions, épidémiologie, génome, génome viral, immunosuppresion, lignage, mutation, mutations, nouveau variant, nouvelle variante, PCR, SARS-CoV-2, séquence génétique, vaccin, Vaccinologie, VACCINS, variant, Virologie, virus, VUI-202012/01 | Commentaires fermés sur Royaume-Uni : un variant du coronavirus SARS-CoV-2 porteur de nombreuses mutations

Visons, furets, chats : les animaux infectés par le SARS-CoV-2 représentent-ils un risque pour l’être humain ?

Au Danemark, des visons d’élevage ont été infectés par le SARS-CoV-2, le coronavirus responsable de la Covid-19. Le risque de propagation du SARS-CoV-2 dans ces fermes, de même que la crainte d’une extension des contaminations humaines à partir de ces animaux, a incité le gouvernement danois à décider de l’abattage immédiat de tous les visons …

Continuer la lecture de « Visons, furets, chats : les animaux infectés par le SARS-CoV-2 représentent-ils un risque pour l’être humain ? »

Continuer la lecture

Publié dans Animal, animal de compagnie, animal domestique, animaux, barrière d'espèce, chat, chien, coronavirus, COVID-19, débordement, délétion, épidémiologie, faune sauvage, félin, félins, Furet, Infectiologie, lion, médecine vétérinaire, mustélidés, mutation, one health, primates non humains, recombinaison génétique, Santé publique, SARS-CoV-2, singes, spillback, spillover, tigre, une seule santé, vison, visons d'élevage | Commentaires fermés sur Visons, furets, chats : les animaux infectés par le SARS-CoV-2 représentent-ils un risque pour l’être humain ?