Archives de catégorie : COVID-19

Le top 10 des rétractations 2021 d’après Oransky/Adams dans The Scientist

C’est toujours intéressant de parcourir les rétractations de l’année écoulée, et en choisir 10 parmi les plus de 3000 est un pari. La lecture de ces 10 cas est parsemée de nombreuses références. Choix des fondateurs de RetractionWatch. Briè… Continuer la lecture

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Deux ans et une Cinquième vague

La COVID-19 est dans sa cinquième saison en France, un feuilleton avec des épisodes qui se ressemblent tous, seul le héros grec change. J’aimerai souligner à quel point cette maladie illustre la puissance de la biomédecine moderne. Il y a …… Continuer la lecture

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Que d’efforts pour faire rétracter un très mauvais article sur l’absence de preuves du confinement

C’est RetractionWatch qui le 14 décembre 2021 a raconté en détail une histoire pas banale. Les articles sont complexes avec modèles mathématiques, mais voici un résumé de l’histoire : Publication le 5 mars 2021 dans la revue Scientific Repo… Continuer la lecture

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Covid-19 : le SARS-CoV-2 peut persister dans le corps pendant des mois et se disséminer précocement dans le cerveau

Une étude américaine, reposant sur des autopsies de patients décédés de la Covid-19, a consisté à traquer la présence du coronavirus dans de très nombreux organes et tissus du corps humain. Les résultats montrent que le SARS-CoV-2 peut provoquer une infection disséminée et persister dans l’organisme pendant des mois. Le virus peut notamment largement diffuser …

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Publié dans Anatomopathologie, appareil respiratoire, ARN sous-génomiques, autopsie, cerveau, charge virale, coronavirus, Covid long, Covid longue, COVID-19, dissémination virale, hybridation in situ, immunohistochimie, organes, persistance de l'ARN viral, poumon, SARS-CoV-2, tissus, tropisme cellulaire, Virologie | Commentaires fermés sur Covid-19 : le SARS-CoV-2 peut persister dans le corps pendant des mois et se disséminer précocement dans le cerveau

Journal de bord de la pandémie 12 mars au 14 juin 2020 : merci l’Inserm et Pierre Corvol

Le numéro 3 des Cahiers du Comité pour l’Histoire de l’Inserm est un numéro collector à bien garder. Ce numéro en accès libre contient le journal de bord de Pierre Corvol pendant la pandémie à SARS-CoV-2. Entre le 12 mars et le 14 juin 2020… Continuer la lecture

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Pandémie : hausse des publications et baisse de 18 % des articles non-Covid

C’est avec joie que j’ai découvert un bon article d’une équipe française dirigée par Alexandre Loupy (Paris Translational Research Epidemiology and Biostatistics Department, Université de Paris, Hôpital Necker). Félicitons le premier auteur, Marc Rayna… Continuer la lecture

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L’AP-HP à la dérive: lettre au Président de la République,

L’assistance Publique-Hôpitaux de Paris traverse une situation particulièrement difficile, en premier lieu en raison des difficultés de recrutement des personnels non médicaux et du manque d’attractivité de l’institution. Cela entraîne des fermetures d… Continuer la lecture

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Variant Omicron : ce que l’on sait de l’activité neutralisante des anticorps, du risque de réinfection et de l’efficacité des vaccins

Initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud, le variant Omicron (B.1.1.529) est le cinquième variant préoccupant depuis le début de la pandémie Covid-19 due au SARS-CoV-2*. C’est également celui qui inquiète le plus les virologistes, immunologistes et épidémiologistes. En effet, plusieurs études in vitro indiquent que les nombreuses mutations présentes dans la protéine …

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Publié dans 3e dose, afrique du sud, anticorps, anticorps neutralisants, Astra Zeneca, B.1.1.529, capacité neutralisante, coronavirus, COVID-19, Delta, épidémiologie, Immunologie, infection post-vaccinale, neutralisation, Omicron, Pfizer, protéine spike, rappel, réinfection, royaume uni, S gene target failure, SARS-CoV-2, SGTF, taux d’attaque secondaire, temps de doublement, tests de neutralisation, translission, transmissibilité, troisième dose, vaccin, vaccin à ARN messager, Vaccinologie, variants, Virologie | Commentaires fermés sur Variant Omicron : ce que l’on sait de l’activité neutralisante des anticorps, du risque de réinfection et de l’efficacité des vaccins

La désinformation pendant la pandémie : un phénomène ancien qui concerne toute la science

‘People in school need to be taught that the internet is like reading graffiti on the wall‘ La pandémie nous a fait découvrir la communication de la science en général, que ce soit la communication vers les chercheurs ou vers le citoyen (av… Continuer la lecture

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Covid-19 : un collectif de médecins préconise de renforcer les mesures sanitaires dans les écoles | LCI

#Santé: JEUNESSE – Dans une tribune publiée lundi par Le Monde, un collectif de médecins et chercheurs avertit sur la nécessité d’adopter des mesures plus contraignantes pour réduire la transmission du Covid-19 à l’école. Source: Covid-19 :… Continuer la lecture

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Variant Omicron : un risque d’échappement immunitaire

Le moins qu’on puisse dire est que le nouveau variant Omicron initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud inquiète les spécialistes. Une étude, publiée sous forme de preprint sur le site medRxiv, rapporte un risque accru de réinfection associé à ce nouveau variant du SARS-CoV-2. En d’autres termes, Omicron présente une capacité accrue …

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Publié dans ACE2, afrique du sud, alpha, anticorps, bêta, breakthrough Infections, coronavirus, COVID-19, Delta, domaine de liaison au récepteur, échappement immunitaire, épidémiologie, immunité naturelle, immunité vaccinale, infections post-vaccinales, nouveau variant, NTD, Omicron, RBD, récepteur ACE2, réinfection, SARS-CoV-2, taux de reproduction effectif, transmissibilité, vaccin, vaccination, vague, variant, Virologie | Commentaires fermés sur Variant Omicron : un risque d’échappement immunitaire

Les légitimes interrogations sur les vaccins anti Covid font le jeu des complotistes et des mangeurs d’enfants.

Lorsque les premiers chiffres d’efficacité du nouveau vaccin Comirnaty ont été publiés par Pfizer, il existait des individus douteux qui se posaient des questions sur l’efficacité IRL de ces vaccins. Les ZeroCovideurs et les FaiseursdePeur les dénonçai… Continuer la lecture

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Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le nouveau variant Omicron (B.1.1.529)

Après le variant Delta (ex-variant B.1.1.7 dit britannique), le variant Beta (ex-variant sud-africain B.1.351), le variant Gamma (ex-variant P.1 dit brésilien), c’est donc au tour d’un autre variant du SARS-CoV-2, dénommé Omicron (ou variant B.1.1.519), de faire les gros titres de la presse internationale et d’occuper le devant de la scène sur les chaînes d’info …

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Publié dans Afrique australe, afrique du sud, analyse phylogénétique, B.1.1.529, Botswana, cas clinique, constellation de mutations, coronavirus, COVID-19, délétion, Divers, domaine amino-terminal, domaine de liaison au récepteur, domaine N-terminal, échappement immunitaire, épidémiologie, épitopes, évolution intra-hôte, évolution virale accélérée, gestes barrières, immunodéprimés, Immunologie, immunosuppression, infection prolongée par le SARS-CoV-2, insertion, MESURES BARRIERES, mesures non pharmaceutiques, NTD, Omicron, pateints immunodéprimés, PCR, profil mutationnel, protéine S, protéine spike, pseudovirus, RBD, SARS-CoV-2, séquençage génomique, spicule, variant, Variant Of Concern, variant préoccupant, vih, Virologie, virus du sida, VOC | Commentaires fermés sur Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le nouveau variant Omicron (B.1.1.529)

Dysfonctionnement des revues scientifiques pendant la pandémie à SARS-CoV-2

Je remercie la Société Française de Santé Publique pour son aimable invitation lors de son congrès d’octobre 2021 à Poitiers. Deux interventions m’ont été proposées : quels sont les enjeux des publications en général ? Quels étaient les enjeux liées à … Continuer la lecture

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IVG médicamenteuses à domicile : jusqu’à 7 semaines

Un certain nombre de médecins et sage-femmes peuvent pratiquer des IVG médicamenteuses à domicile jusqu’à la fin de la 5e semaine de grossesse. En raison de la pandémie de covid-19, ce délai a été allongé jusqu’à la fin de la 7e semaine de grossesse, au moins jusqu’au 31 juillet 2022. En France, les interruptions volontaires … Lire la suite Continuer la lecture

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Un publiant comme les aiment les institutions qui ferment les yeux : 284 publications COVID-19

Tant que les institutions, les jurys, etc… demanderont aux chercheurs de beaucoup publier, nous auront des Fangio de l’article. Je remercie Nicolas Kluger qui, dans un tweet du 21 novembre 2021, nous signale qu’un auteur a publié 284 … Continuer la lecture

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Un Covid long peut également survenir chez des personnes vaccinées atteintes de Covid-19

On le sait, une infection par le SARS-CoV-2 peut entraîner des troubles prolongés, ce que l’on appelle la Covid-longue. Le terme « Covid-long » a, tout d’abord, été utilisé par les patients puis repris dans la littérature médicale anglo-saxonne (long Covid) pour qualifier ces symptômes séquellaires post-Covid. Mais qu’en est-il lorsque la Covid-19 se déclare chez une …

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La présentation des données est un sport incertain : à propos du port du masque en milieu communautaire (53 % d’efficacité).

Avertissement : selon la bonne vieille formule stalinienne « Il vaut mieux avoir tort avec ses amis que raison avec ses ennemis » et son équivalent sartrien et apocryphe (voir LA) « Il ne faut pas désespérer Billancourt », jamais je n’aurais dû écrire ce b… Continuer la lecture

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États-Unis : diffusion massive du SARS-CoV-2 parmi les cerfs, potentiels réservoirs du coronavirus

Une étude américaine rapporte que plus de 80 % des cerfs, testés entre décembre 2020 et janvier 2021 dans plusieurs régions de l’État d’Iowa, sont positifs au SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19. Le cervidé en question est appelé « cerf de Virginie » (Odocoileus virginianus). Cette espèce est sensible à l’infection par le SARS-CoV-2. Il a été …

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Publié dans Animal, animaux, cerf de Virginie, cervidés, coronavirus, COVID-19, débordements, encéphalopathie des cervidés, faune sauvage, ganglions lymphatiques, Iowa, maladie débilitante chronique, médecine vétérinaire, Odocoileus virginianus, one health, réservoir animal, SARS-CoV-2, spillback, spillover, transmission sylvatique, tuberculose bovine, Virologie, virus, visons, zoologie, zoonose inverse | Commentaires fermés sur États-Unis : diffusion massive du SARS-CoV-2 parmi les cerfs, potentiels réservoirs du coronavirus

L’IHU n’oublie pas de publier dans des revues douteuses (2), voire prédatrices ?

Nous connaissons la frénésie de publier de l’IHU de Marseille. Les records de volume de publication font-ils avancer la science ? S’agit-il de publications de qualité ? Il semble que les revues prestigieuses ne soient pas très friandes d&#8… Continuer la lecture

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Covid-19 : nouvelles données de l’effet de la vaccination sur la transmission du variant Delta

Il est établi que l’administration du vaccin contre la Covid-19 réduit considérablement le risque d’être hospitalisé pour une forme grave de la maladie et de décéder. La vaccination réduit également le risque d’être infecté par le variant Delta, plus transmissible que le variant Alpha (ex-variant anglais). Pour autant, lorsqu’une infection par SARS-CoV-2 survient malgré tout …

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Publié dans breakthrough Infection, cas contacts, cas index, charge virale, cinétique de la charge virale, cohorte, contact-tracing, contagiosité, contamination, contexte familial, coronavirus, COVID-19, dynamique virale, épidémiologie, foyer, foyer familial, foyers familiaux, gestes barrières, Infectiologie, infection post-vaccinale, interventions non pharmaceutiques, MESURES BARRIERES, non-vaccinés, Santé publique, SARS-CoV-2, sujets contacts, traçage de cas, transmission, vaccin, vaccination, vaccinés, variant Alpha, variant anglais, variant Delta, variant indien, Virologie | Commentaires fermés sur Covid-19 : nouvelles données de l’effet de la vaccination sur la transmission du variant Delta

Quand la vaccination vient à bout d’une infection Covid-19 persistante chez un patient immunodéprimé

C’est l’histoire d’un homme de 37 ans atteint du syndrome de Wiskott-Aldrich, un déficit immunitaire héréditaire associée à une anomalie présente sur le chromosome X. L’incidence de cette pathologie est estimée entre 1 à 5 enfants atteints pour un million de naissances. Elle est caractérisée par l’association de trois symptômes. Cette triade comporte un eczéma, …

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Publié dans anticorps monoclonaux, charge virale, clearance virale, coronavirus, COVID-19, déficit immunitaire, émergence de nouveaux variants, évolution intra-hôte accélérée, évolution intra-patient, évolution virale accélérée, immunodéficience, immunodépression, immunodéprimé, Immunologie, Infectiologie, infection persistante, infection persistante par le SARS-CoV-2, mutations, nouveaux variants, Oncologie, patients immunodéprimés, plasma de sujets Covid-19 convalescents, protéine spike, raitement immunosuppresseur, RT-PCR, SARS-CoV-2, syndrome de Wiskott-Aldrich, vaccin, vaccination, vaccination thérapeutique, Vaccinologie, variants, Virologie, Wiskott-Aldrich | Commentaires fermés sur Quand la vaccination vient à bout d’une infection Covid-19 persistante chez un patient immunodéprimé

Manuscrits soumis à 2329 revues : la première vague de la pandémie a créé des avantages potentiellement cumulatifs pour les hommes

Cet article de PLOS ONE (octobre 2021) est un énorme travail, parfois difficile à comprendre, proposé par 6 auteurs européens, et grâce à la participation de Elsevier. Le titre : Gender gap in journal submissions and peer review during the first wave o… Continuer la lecture

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Le Comité d’éthique du Cnrs nous fait plaisir : BRAVO, c’est une bonne surprise

Comme d’autres j’ai apprécié un avis très courageux du Comité d’éthique du Cnrs (COMETS), car sans langue de bois. L’avis n°2021-42 a été approuvé en séance plénière le 25 juin 2021 et publié le 21 septembre. Il faut lire les 26 pages car c&#8217… Continuer la lecture

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Vaccins COVID-19 : à quand l’accès aux données sources des essais ?

Toute la communauté scientifique évoque sans cesse la mise à disposition des données sources avec les publications. La pandémie était une fantastique occasion pour mettre en pratique cette initiative des plans pour la science ouverte….   Nous sav… Continuer la lecture

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Covid-19 : nouvelles données sur les hospitalisations d’enfants et d’adolescents aux États-Unis

Deux études apportent de nouvelles données sur l’évolution du nombre de cas de Covid-19 pédiatrique aux États-Unis, sur le taux d’admission aux urgences parmi les enfants infectés par le SARS-CoV-2 ainsi que sur le taux d’hospitalisations parmi les enfants et adolescents de 0 à 17 ans. Ces résultats ont été publiés en ligne le 3 …

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Publié dans admission aux urgences, adolescents, charge virale, consultations aux urgences, coronavirus, COVID-19, DISTANCIATION PHYSIQUE, école, enfants, enfants symptomatiques, entans asymptomatiques, épidémiologie, gestes barrières, Hôpital, hospitalisation, masque, maternelle, MESURES BARRIERES, mesures non pharmaceutiques, Pédiatrie, PORT DU MASQUE, réanimation, Santé publique, SARS-CoV-2, secondaire, séjour hospitalier, soins intensifs, taux de couverture vaccinale, vaccin, vaccination, ventilation mécanique invasive, Virologie | Commentaires fermés sur Covid-19 : nouvelles données sur les hospitalisations d’enfants et d’adolescents aux États-Unis

Covid-19 : un enseignant non vacciné à l’origine d’une flambée épidémique au variant Delta dans une école primaire américaine

L’histoire se déroule aux États-Unis dans une école primaire. Elle commence lorsqu’un enseignant apprend qu’il est positif pour le SARS-CoV-2, le coronavirus responsable de la Covid-19. Nous sommes le 23 mai 2021. Deux jours plus tôt, cette personne, non vaccinée, a présenté des symptômes mais a continué à travailler le demain et le surlendemain avant …

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Covid-19 : vers quels saints se tournent les Chrétiens ?

Quel saint catholique invoqueraient les membres de la communauté chrétienne européenne dans l’éventualité de la survenue de la maladie Covid-19 ? Telle est la question que se sont posé trois chercheurs italiens et français. Les résultats, issus d’une enquête en ligne auquel ont répondu plus d’un millier de personnes, sont publiés dans la revue Ethics, …

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Publié dans catholicisme, catholiques, chrétiens, communauté chrétienne, coronavirus, Covid, COVID-19, Facebook, Psychologie, religion, réseaux sociaux, Rita de Cascia, saint, saint catholique, Saint Jean-Gabriel Perboyre, saint Roch, saint Sébastian, Sainte Rita, saints, saints guérisseurs, Santé publique, SARS-CoV-2, twitter | Commentaires fermés sur Covid-19 : vers quels saints se tournent les Chrétiens ?

Supplique contre le masque à l’école

Intuitivement, le masque est utile en cas d’épidémie de virose respiratoire. Confirmer cette intuition nécessiterait des études que personne ne se risquera à faire pour deux raisons : la dramaturgie politique qui entoure ce sujet, et l’impossibilité de définir le critère « port du masque ». Les rares études sérieuses ont été faites en milieu hospitalier où le …

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Troublant : un article COVID rétracté par NEJM a été cité 652 fois en ne mentionnant la rétractation que 115 fois (18 %)

Bonne idée que celle de l’étude des citations d’un article rétracté par le NEJM, dans une lettre de JAMA Internal Medicine. Il s’agit de l’article rétracté en même temps que l’article controversé du Lancet sur l’inef… Continuer la lecture

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Covid-19 : caractéristiques cliniques, virologiques et sérologiques des infections post-vaccinales dues au variant Delta

Une étude, conduite par des chercheurs singapouriens, rapporte pour la première fois des données virologiques et sérologiques concernant des infections post-vaccinales associées au variant Delta. Leurs résultats ont été publiés le 31 juillet 2021 sur le site de prépublication medRxiv. Il ressort notamment que la vaccination s’accompagne d’un déclin plus rapide de la charge virale …

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Taïwan : cluster dans un hôpital associé à un événement super-contaminateur

C’est l’histoire d’un foyer de transmission de Covid-19 associé à la propagation du virus SARS-CoV-2 à la faveur d’un événement de super-contamination survenu dans un grand hôpital de Taïwan. Elle est relatée dans un article paru le 21 juillet 2021 dans le Journal of Microbiology, Immunology and Infection. Il est très rare de trouver dans …

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Covid-19 : rares infections post-vaccinales chez les soignants du plus grand hôpital israélien

Malgré la grande efficacité du vaccin Pfizer à ARN messager contre la Covid-19, des infections post-vaccinales ont été récemment rapportées dans la littérature médicale internationale, notamment parmi le personnel de santé. Des épidémiologistes et immunologistes israéliens ont cherché à caractériser ces infections parmi les employés du Sheba Medical Center (Ramat Gan), le plus important établissement …

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Covid-19 : quand le variant Delta infecte des touristes américains complètement vaccinés

L’histoire se situe dans le sud-est de l’État du Massachusetts, sur la presqu’île de Cape Cod, célèbre pour ses plages immaculées. Elle s’est déroulée entre le 3 et 17 juillet 2021 dans une station balnéaire du comté de Barnstable à l’occasion de plusieurs événements estivaux et de grands rassemblements publics. Tout commence le 10 juillet …

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COVID : le bal masqué… un bon livre complémentaire des précédents

Les livres rapportant des expériences liées à la COVID-19 sont bienvenus. Celui d’Antoine Flahaut n’est pas redondant avec les livres que nous avons analysés. Antoine Flahaut apporte sa vision internationale de la pandémie, avec de nombreuses citations… Continuer la lecture

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Covid-19 : première description d’une importante diffusion communautaire du variant Delta au Brésil

Alors que le Brésil commence à récupérer d’une seconde vague de Covid-19, les premiers cas d’infection par le variant Delta, hautement transmissible, sont en train d’émerger. Le premier cas d’infection par ce variant préoccupant date du 26 avril 2021. Depuis, plusieurs cas isolés ou d’importation ont été signalés dans cinq États du Brésil. Une équipe …

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États-Unis : flambée épidémique due au variant Delta dans un gymnase

L’histoire s’est déroulée sur une période de deux semaines dans une ville de l’Oklahoma (État du Midwest des États-Unis). Elle est relatée dans le bulletin épidémiologique hebdomadaire des Centres américains de contrôle et de prévention des maladies (CDC) daté du 9 juillet 2021. Tout commence par l’identification, le 15 avril 2021, d’un cas d’infection par …

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Covid-19 : Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon… l’émergence sans fin des variants

Il ne se passe plus un jour sans que l’on entende parler du variant Delta, identifié pour la première fois en Inde. Il est pourtant loin d’être la seule lignée virale à inquiéter les épidémiologistes, médecins et autorités sanitaires nationales et internationales. À ce jour, dans le monde, on dénombre une petite vingtaine de variants …

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Des lions infectés par le variant Delta dans un zoo en Inde

Des vétérinaires et virologistes indiens rapportent plusieurs cas d’infection naturelle par le variant Delta du SARS-CoV-2 chez des lions d’Asie (Panthera leo persica, encore appelé lion persan). Leurs travaux sont parus le 2 juillet 2021 sur le site de prépublication bioRxiv. Le séquençage génomique du virus détecté chez ces félins maintenus en captivité dans un …

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Publié dans Animal, animal de compagnie, animal domestique, animaux, B.1.167.2, barrière d'espèce, chat, chien, coronavirus, COVID-19, épidémiologie, faune sauvage, félin, félins, Furet, inde, lion, médecine vétérinaire, mustélidés, one health, parc zoologique, Santé publique, SARS-CoV-2, singes, spillback, spillover, tigre, une seule santé, variant, variant Delta, variant indien, Virologie, vison, visons d'élevage, zoo | Commentaires fermés sur Des lions infectés par le variant Delta dans un zoo en Inde

Syndrome de Cotard et Covid-19 : lorsqu’une patiente affirme qu’elle est morte et que son cerveau se décompose

L’histoire concerne une femme turque de 41 ans, institutrice en école primaire, hospitalisée pour une perte d’odorat (anosmie), des douleurs musculaires et  un mal de gorge. Le test RT-PCR réalisé sur prélèvement nasopharyngé est positif pour le variant anglais B.1.1.7, aujourd’hui dénommé Alpha. Les symptômes s’améliorent progressivement. Après dix jours, le test PCR revient négatif, mais …

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Publié dans antipsychotique, B.1.1.7, coronavirus, COVID-19, délire de négation, électroconvulsivothérapie, épisode psychotique, mort, neuroleptique, Neurologie, neuropsychiatrie, Neuropsychologie, olanzapine, psychiatrie, SARS-CoV-2, sismothérapie, syndrome de Cotard, variant, variant Alpha, variant anglais | Commentaires fermés sur Syndrome de Cotard et Covid-19 : lorsqu’une patiente affirme qu’elle est morte et que son cerveau se décompose