Archives de catégorie : COVID-19

Les rétractations des traitements COVID-19 arrivent….264 ce jour, combien dans 5 ans ?

Ce sont deux articles rétractés en même temps (2 septembre 2022) par AJTMH (American Journal of Tropical Medicine and Hygiene). Ces articles sont de la même équipe de recherche (Egypte). Manifestement, il y a un lanceur d’alerte ! Son nom n&#8217… Continuer la lecture

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Peer-Review Congress J3 : session preprints avec les données de medRxiv !!!

Une présentation sur medRxiv par Joseph S Ross (Yale) avec les autres partenaires (Cold Spring Harbor, BMJ) medRxiv Preprint Submissions, Posts, and Key Metrics, 2019-2021. Lors du précédent Peer Review Congress, H Krumholz annonça le lancement de MadA… Continuer la lecture

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BA.2.75.2, le nouveau sous-variant d’Omicron qui inquiète les scientifiques

L’évolution continue du variant Omicron du SARS-CoV-2 continue de produire de nouveaux sous-variants porteurs de mutations additionnelles. Un de ces sous-variants émergents, dénommé BA.2.75, s’est rapidement diffusé dans certaines parties du monde, mais sans encore surpasser BA.5, le variant actuellement dominant. BA.2.75, dont la fréquence augmente en Inde, a été détecté en juillet 2022 dans …

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Publié dans anticorps, anticorps neutralisants, BA.2.75, BA.2.75.2, BA.4, BA.5, convergence évolutive, coronavirus, COVID-19, échappement immunitaire, évasion immunitaire, évolution convergente, neutralisation, Omicron, SARS-CoV-2, sous-variants, Vaccinologie, variant, variants, Virologie | Commentaires fermés sur BA.2.75.2, le nouveau sous-variant d’Omicron qui inquiète les scientifiques

Peer-review congress J1 : session ‘Pandemic Science’… intéressant

Une session a été consacrée aux publications COVID-19. Epidemiology of Scientific Output During the COVID-19 Pandemic. Anne Yang et al (Pittsburgh) ont comparé des articles avant la pandémie, puis pendant la pandémie : augmentation des lettres, brief r… Continuer la lecture

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Méta-science ou ‘recherche sur la recherche’ pour améliorer l’intégrité de la recherche

Le titre de ce billet reprend une idée d’un article de Trials sur les leçons de la pandémie COVID-19. Cet article du 17 août 2022 est le compte rendu d’une conférence de 2020 à McMaster University (Hamilton, Canada). La conférence de D Mohe… Continuer la lecture

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Un patient contracte simultanément le monkeypox, la Covid-19 et la syphilis, tandis qu’un autre présente une co-infection par monkeypox, SARS-CoV-2 et VIH

Deux études indépendantes, espagnole et italienne, rapportent, chez un homme ayant des relations avec des hommes, une co-infection par le virus monkeypox (variole du singe) et d’autres agents infectieux. L’équipe espagnole a publié le 23 août 2022, sous forme de preprint sur le site Research Square, le cas d’un individu de 56 ans ayant des …

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Publié dans coronavirus, COVID-19, Dermatologie, HIV-1, Infectiologie, monkeypox, MPXV, SARS-CoV-2, sida, syphilis, Treponema pallidum, variole du singe, vih, VIH-1, Virologie | Commentaires fermés sur Un patient contracte simultanément le monkeypox, la Covid-19 et la syphilis, tandis qu’un autre présente une co-infection par monkeypox, SARS-CoV-2 et VIH

Pandémie et intégrité des politiques publiques (EU) : corruption, conflits d’intérêts, fraude, népotisme, atteinte aux principes du système démocratique

Toutes les disciplines scientifiques ont eu leur augmentation d’articles pendant la pandémie. En consultant des articles en économie, j’ai trouvé un article qui fait très peur, mais il ne m’a pas surpris (accès libre). Nous comprenons… Continuer la lecture

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Covid-19 : une personne sur huit présente des symptômes persistants, selon une étude néerlandaise

Une vaste étude néerlandaise, conduite en population générale, rapporte qu’une personne sur huit ayant contracté la Covid-19 se plaint d’au moins un symptôme persistant. Les résultats ont été publiés le 5 août 2022 dans l’hebdomadaire britannique The Lancet. On sait qu’après avoir récupéré d’une infection aiguë par le SARS-CoV-2, certains patients continuent de présenter des …

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Grandeurs et décadences des revues scientifiques pendant la pandémie de COVID-19

Je remercie F Coulée et E Hirsch qui m’ont invité lors d’un colloque de deux jours sur les enseignements de la pandémie de COVID-19. J’ai enregistré ma communication dans une vidéo mise sur YouTube et je voudrais récapituler dans ce b… Continuer la lecture

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Des études montrent que la pandémie de Covid-19 a commencé sur un marché de Wuhan et que deux lignées virales ont été transmises à l’homme

Deux études, publiées en ligne le 26 juillet 2022 dans la revue Science, rapportent que le marché aux animaux vivants Huanan à Wuhan, en Chine, a été l’épicentre de l’émergence de la pandémie de Covid-19 et que celle-ci s’est manifestée par la transmission de l’animal à l’homme d’au moins deux lignages viraux distincts. On le …

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Merci à Joint Bone Spine pour ‘COVID-19 as a source of poor publications’

Il faut continuer à signaler les mauvaises pratiques des publications COVID-19. Je remercie à ce titre la revue Joint Bone Spine qui a publié en juin 2022 un éditorial que j’ai soumis sur ce thème. C’est difficile à écrire, et les relecteur… Continuer la lecture

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Identification d’anticorps neutralisants à large spectre, actifs sur tous les coronavirus humains

Deux équipes indépendantes rapportent, dans le numéro daté du 12 juillet 2022 de la revue Science, avoir identifié des anticorps neutralisants à large spectre, actifs contre une vaste gamme de coronavirus.  Ces anticorps humains ont la particularité de cibler une autre région de la protéine spike que celle contre laquelle sont dirigés les anticorps induits …

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Publié dans 299E, Alphacoronavirus, anticorps neutralisants à large spectre, BA.1, BA.2, BA.4, BA.5, Betacoronavirus, CCoV-HuPn-2018, coronavirus, COVID-19, Deltacoronavirus, épitope, Gammacoronavirus, HKU1, Immunologie, MERS, neutralisation, NL63, OC43, Omicron, Orthocoronavirinae, PDCoV-0081-4, peptide de fusion, protéine spike, SARS-CoV-1, SARS-CoV-2, Vaccinologie, variants, Virologie | Commentaires fermés sur Identification d’anticorps neutralisants à large spectre, actifs sur tous les coronavirus humains

Pros : Prescrire, mai 2022 : médicaments utiles et inutiles

Chaque mois, la revue indépendante Prescrire passe en revue les médicaments nouvellement commercialisés, ainsi que les nouvelles indications de médicaments déjà sur le marché. Elle en discute les mérites et démérites, par comparaison avec les autres traitements disponibles. Voici les médicaments qu’elle a examinés dans son numéro de mai 2022. POUR LES PROS :L’article qui … Lire la suite Continuer la lecture

Publié dans accident ischémique transitoire, Accidents vasculaires cérébraux, Acidose rénale tubulaire, Adalimumab, Alcaptonurie, Anidulafungine, antibiotique, anticorps, Antifongique, aspirine, AVC, AVC ischémiques, Avibactam, Balance bénéfices / risques, bénéfice, Bicarbonate de potassium, Candida, Ceftazidime, Cilgavimab, Citrate de potassium, clopidrogel, Covid, COVID-19, Dolutégravir, Ecalta, efficacité, évaluation, Evusheld, hiv, Humira, Imiquimod, immunosuppresseur, infection grave, Interféron alfa, Kératose actinique, maladie génétique, médicaments, Médicaments alcalinisants, mycose, Nitisinone, Nouveaux médicaments, Orfadin, Pédiatrie, Plavix, Ponésimod, Ponvory, Prescrire, Rectocolite hémorragique, risque, sclérose en plaques, Sibnayal, sida, soleil, Teriflunomide, Tivicav, Tixagévimab, virus du sida, Zavicetta, Zyclara | Commentaires fermés sur Pros : Prescrire, mai 2022 : médicaments utiles et inutiles

Pros : Prescrire, mai 2022 : médicaments utiles et inutiles

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Problèmes d’auteurs : une méconduite tolérée par la communauté scientifique

Des exemples d’auteurs honoraires ou cadeaux sont quotidiens…  C’est une plaie pour la science et une injustice vis-à-vis de ceux qui veulent promouvoir une science intègre. C’est un exemple récent sur Twitter qui m’énerve… Continuer la lecture

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Le renforcement immunitaire par Omicron dépend de l’exposition antérieure au SARS-CoV-2

Une vaste étude britannique montre que la capacité d’une infection par Omicron à renforcer le système immunitaire contre le SARS-CoV-2 dépend de la souche ou du variant qui nous a déjà infecté et qu’elle n’équivaut pas, loin s’en faut, à une dose de vaccin. Dans quelle mesure une infection par Omicron stimule-t-elle l’immunité via les …

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Publié dans alpha, anticorps, anticorps neutralisants, breakthrough Infection, cellules B mémoires, cellules T, coronavirus, COVID-19, Delta, empreinte antigénique, épitopes, immune imprinting, immunité, immunité à médiation cellulaire, immunité cellulaire, immunité neutralisante, immunité neutralisante croisée, Immunologie, lymphocytes T, Omicron, protéine spike, rappel, réponse immunitaire, SARS-CoV-2, souche ancestrale, vaccination, vaccinés, Vaccinologie, variant Alpha, variant Delta, variants, variants préoccupants, Virologie, Wuhan Hu-1 | Commentaires fermés sur Le renforcement immunitaire par Omicron dépend de l’exposition antérieure au SARS-CoV-2

Covid-19 : l’ombre des variants BA.4 et BA.5 plane sur l’été

La communauté scientifique internationale est pleinement mobilisée pour évaluer les  propriétés biologiques et virologiques de BA.4 et BA.5, les deux nouveaux sous-lignages d’Omicron, identifiés pour la première fois en Afrique du Sud et qui sont devenus en mai les variants prédominants dans ce pays. Ils y ont provoqué une nouvelle vague de contaminations mais de …

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Publié dans afrique du sud, BA.1, BA.2, BA.3, BA.4, BA.5, breakthrough Infection, coronavirus, COVID-19, épidémiologie, Etats-Unis, F486V, France, Immunologie, infection post-vaccinale, L452R, mutations, nouveaux variants, Omicron, Portugal, protéine spike, SARS-CoV-2, sous-lignages, sous-lignages d’Omicron, spike, vaccin, vaccination, Vaccinologie, variants, Virologie | Commentaires fermés sur Covid-19 : l’ombre des variants BA.4 et BA.5 plane sur l’été

La lutte contre la désinformation sur les réseaux sociaux par des professionnels de santé : impossible ou immobilisme des institutions

C’est une perspective publiée dans le New England of Medicine le 18 mai 2022 qui apporte quelques réflexions sur le système nord-américain. Elle est signée par deux experts de l’ABIM (American Board of Internal Medicine). Avec d’autres organisations, l… Continuer la lecture

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Pros : Prescrire, avril 2022 : médicaments utiles et inutiles

Chaque mois, la revue indépendante Prescrire passe en revue les médicaments nouvellement commercialisés, ainsi que les nouvelles indications de médicaments déjà sur le marché. Elle en discute les mérites et démérites, par comparaison avec les autres traitements disponibles. Voici les médicaments qu’elle a examinés dans son numéro d’avril 2022. POUR LES PROS :L’article qui suit … Lire la suite Continuer la lecture

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Traitement COVID-19 : des études favorables pour des médicaments inefficaces ont été les plus citées !

C’est une analyse des articles COVID-19 ayant eu plus de 150 citations dans Scopus à la date de 23 décembre 2021. C’est un délai court car 150 citations est élevé, et parfois observé plusieurs années après la publication. Il s’agit d’un article de JPA … Continuer la lecture

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La pandémie de COVID-19 n’est pas terminée : quelle stratégie pour aujourd’hui et pour demain?

La pandémie de COVID-19 semble terminée : politiques et médias n’en parlent plus. La campagne présidentielle aurait pu être l’occasion de faire un bilan. Mais pas un mot, rien ou presque, à tel point que l’on pouvait avoir le sentiment étrange que la c… Continuer la lecture

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Pros : Prescrire, mars 2022 : médicaments utiles et inutiles

Chaque mois, la revue indépendante Prescrire passe en revue les médicaments nouvellement commercialisés, ainsi que les nouvelles indications de médicaments déjà sur le marché. Elle en discute les mérites et démérites, par comparaison avec les autres traitements disponibles. Voici les médicaments qu’elle a examinés dans son numéro de mars 2022. POUR LES PROS :L’article qui … Lire la suite Continuer la lecture

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Tout savoir sur la COVID-19 : enfin un ouvrage avec des références aux données probantes

C’est un livre de qualité qui doit trouver ses lecteurs : professionnels de santé et citoyens avertis. Ce livre se veut l’encyclopédie de qualité sur la COVID-19. Tout professionnel de santé qui veut un livre documenté sera satisfait, par d… Continuer la lecture

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Hydroxychloroquine et COVID-19 : Le Figaro pas très clair… complotiste ?

Cet article a comparé les articles en ligne de quatre quotidiens grand public concernant l’utilisation de l’hydroxychloroquine dans la COVID-19. La recherche a été faite avec les termes chloroquine, hydroxychloroquine, plaquenil et raoult d… Continuer la lecture

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Un marseillais sans éthique ni intégrité : il publie dans sa revue un hommage à l’IHU de Marseille

Avertissement : La plupart de mes collègues marseillais sont de bons professionnels, mais… Je voudrais simplement attirer l’attention sur un dysfonctionnement du système des publications à propos d’un article très bizarre dans la revu… Continuer la lecture

Publié dans COVID-19, esprit critique, liens d'intérêts, Rédaction des revues | Commentaires fermés sur Un marseillais sans éthique ni intégrité : il publie dans sa revue un hommage à l’IHU de Marseille

La toux : c’est pas rien

La toux est un symptôme fréquent. Elle est le plus souvent liée à une maladie bénigne, qui guérit sans traitement. Mais chercher sa cause est parfois important. Les toux bénignes, qui guérissent sans traitement, durent souvent plus de 10 jours chez les enfants et plus de 18 jours chez les adultes. La toux est un réflexe … Lire la suite Continuer la lecture

Publié dans Acuitel°, Alteis°, antibiotique, antitumoraux, Antitussifs, Aprovel°, Aracand°, asthme, Atovaquone, Bénazépril, Briem°, Brivaness°, Bronches, Bronchite chronique, cancer des bronches, cancer du poumon, Candésartan, captopril, Cibacène°, coqueluche, corps étrangers, Cosaar°, Coversyl°, COVID-19, Embolie pulmonaire, Énalapril, Éprosartan, Fosinopril, Fozitec°, grippe, hypertension artérielle, Ibrance°, Ifirmasta°, immunodépression, Inhibiteurs de l'angiotensine, Inhibiteurs de l'angiotensine II, Inhibiteurs de l'enzyme de conversion, insuffisance cardiaque, Irbésartan, Kenzen°, Lisinopril, Lopril°, Losartan, Malarone°, médecine, Micardis°, Naltrexone, Nisis°, Noyada°, Odrick°, Olmésartan, Olmetec°, Omalizumab, palbociclib, Périndopril, pneumonie, Pritor°, Quinapril, Ramipril, Ranexa°, ranolazine, Rénitec°, Rhinite, rhino, Rhinopharyngite, sartans, Sinusite, sofosbuvir, Sovaldi°, tabac, tabagisme, Tareg°, Telmisartan, Téoula, Teveten°, Tolura°, toux, Toux aiguë, Toux chronique, Toux humide, Toux irritative, Toux productive, Toux sèche, Toux subaiguë, Trandolapril, Triatec°, tuberculose, Valsartan, Vapeurs irritantes, Vernakalant, Wellvone°, Xolair°, Zestril°, Zofénil, Zofénopril | Commentaires fermés sur La toux : c’est pas rien

Covid-19 : caractérisation du variant XD, issu d’une recombinaison entre Delta et Omicron

Une étude dirigée par des chercheurs de l’Institut Pasteur de Paris rapporte les premières données épidémiologiques, virologiques et biologiques concernant le variant XD du SARS-CoV-2, issu de la recombinaison entre les variants Delta et Omicron. Ces travaux, supervisés par Étienne Simon-Lorière, responsable du groupe ‘Génomique évolutive des virus à ARN’ à l’Institut Pasteur, ont été …

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Publié dans anticorps, anticorps monoclonaux, anticorps neutralisants, AY.4, BA.1, BA.2, biologiqe moléculaire, breakpoints, coronavirus, COVID-19, Delta, échappement immunitaire, Gènétique, Génétique - Biologie moléculaire, génome viral, Immunologie, neutralisation, Omicron, points de cassure, protéine spike, RBD, recombinaison génétique, SARS-CoV-2, sous-lignage, spike, template switching, vaccin, vaccination, variant XD, variants, Virologie, virus recombinant | Commentaires fermés sur Covid-19 : caractérisation du variant XD, issu d’une recombinaison entre Delta et Omicron

Les corrections de la littérature sont insuffisantes et surviennent tardivement

Je suis bien d’accord avec cette perspective publiée dans PLOS Biology  début mars 2022 : Correction of scientific literature: Too little, too late!. Les auteurs (L Besançon, E Bik, J Heathers, G Meyerowitz-Katz) proposent 8 idées pour améliorer … Continuer la lecture

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Deux messages du Lancet Regional Health – Americas : oubliez l’HCQ pour la COVID-19 et publiez des essais négatifs

Ce billet est en miroir de celui d’hier sur la non-efficacité de l’ ivermectine dans la COVID-19. Il s’agit d’un article brésilien dans une revue presque prestigieuse, Lancet Regional Health – Americas. Comme hier, c&#8217… Continuer la lecture

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Deux messages du NEJM : oubliez l’ivermectine pour la COVID-19 et publiez des essais négatifs

Le 30 mars 2022, le New England Journal of Medicine a publié un essai randomisé, double aveugle, versus placebo pour évaluer l’intérêt de l’ivermectine dans la COVID-19 pour prévenir les hospitalisations. Essai fait au Brésil avec 3515 mala… Continuer la lecture

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Infection par Omicron : quelle réponse contre d’autres variants chez les vaccinés et non-vaccinés ?

Une étude sud-africaine a évalué, chez des individus vaccinés et non vaccinés, la capacité des anticorps produits après une infection par le variant Omicron à combattre d’autres variants du SARS-CoV-2. Les résultats ont été publiés le 22 mars 2022 dans la revue Cell Host and Microbe. Conduite par Simon Richardson, Penny Moore et leurs collègues …

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Publié dans ADCC, ADCP, alpha, anticorps neutralisants, BA.1, bêta, breakthrough Infection, breakthrough Infections, coronavirus, COVID-19, cytotoxicité cellulaire, D614G, Delta, gamma, immunité, immunité neutralisante, immunité neutralisante croisée, Immunologie, infection post-vaccinale, non-vaccinés, Omicron, phagocytose dépendante des anticorps, rappel, SARS-CoV-2, troisième dose, vaccination, vaccinés, Vaccinologie, variant, Virologie | Commentaires fermés sur Infection par Omicron : quelle réponse contre d’autres variants chez les vaccinés et non-vaccinés ?

Une rétractation pas très claire pour des auteurs français : méconduite administrative ?

C’est RetractionWatch qui nous a appris qu’un article d’auteurs français avait été rétracté à la demande des auteurs. Je ne comprends pas le motif de la rétractation, car un erratum était probablement suffisant. J’aurai besoin d… Continuer la lecture

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L’index de fragilité des résultats statistiquement significatifs des essais COVID-19 : oublions vite ce seuil de 0.05

Je ne connaissais pas cette notion, et cet article du 18 mars 2022 (JAMA Open Network) m’a intéressé. Son titre : ‘The Fragility of Statistically Significant Results in Randomized Clinical Trials for COVID-19‘. Je ne sais pas quelle e… Continuer la lecture

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Mauvais résumés des preprints COVID-19 : une convenance sociale pour survendre des recherches

Quand je fais des cours, je surprends souvent en expliquant que pour faire un résumé fidèle à l’article, le plus simple est de copier / coller des phrases de l’article. Mais des auteurs écrivent des résumés sans relire leur manuscrit, voire… Continuer la lecture

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L’absence de politique de rétractation des preprints déposés sur des archives va engendrer des conflits

Un long billet de RetractionWatch (4 février 2022) explique en détail une rétractation d’un preprint déposé sur la bonne archive SocArXiv (Open Science Framework). Le preprint faisait état d’une efficacité de l’ivermectine dans la COV… Continuer la lecture

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Dans le sillage d’Omicron, les singularités de BA.2

L’ascension du variant Omicron (B.1.1.529) a été fulgurante dans de nombreux pays. Initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud en novembre 2021, ce nouveau variant du SARS-CoV-2 est aujourd’hui présent dans au moins 67 pays. Ce variant préoccupant est composé de trois sous-lignages désignés BA.1 (majoritaire), BA.2 et BA.3 (très peu détecté). Un …

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Publié dans ACE2, anticorps, anticorps neutralisants, biologie, Biologie humaine, bronche, cellule, charge virale, coronavirus, COVID-19, délétion, Delta, domaine de liaison au récepteur, dynamique virale, échappement immunitaire, épidémiologie, épithélium nasal, évasion immunitaire, fusion membranaire, Immunologie, modèle animal, mutation, Omicron, pathogénicité, PCR, poumon, protéine spike, pseudovirus, RBD, récepteur ACE2, réplication virale, RT-PCR, SARS-CoV-2, séquence génomique, spike, TMPRSS2, transmissibilité, Vaccinologie, variant, variants, Virologie, virus | Commentaires fermés sur Dans le sillage d’Omicron, les singularités de BA.2

L’intégrité de la recherche pendant la pandémie à SARS-CoV-2 a surtout concerné les publications

Nombreuses sont les recherches en cours sur les éventuelles inconduites pendant la pandémie, et les publications vont arriver sur ce thème. Nous avons aimé l’article intitulé : Research Integrity During the COVID-19 Pandemic: Perspectives of Heal… Continuer la lecture

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La revue Prescrire et les vaccins Covid – première partie

Un internaute m’a posé une série questions vraiment importantes. Les résultats des essais sur les vaccins Covid sont-ils publics ? Est-il normal qu’ils soient réalisés par les laboratoires pharmaceutiques ? Comment la revue Prescrire se forge-t-elle un avis ? Comment sont décidés les prix des médicaments ? Les industriels du médicament se rendent-ils coupables de … Lire la suite Continuer la lecture

Publié dans Actualités, Agence du médicament, AMM, Autorisation de mise sur le marché, Covid, COVID-19, Données agrégées, Données brutes, Données non publiées, Données source, EMA, essais cliniques, European Medicines Agency, FDA, Federal Drug Agency, Financement des essais, Firmes pharmaceutiques, Mise sur le marché d'un médicament, Registre des essais, Résultats des essais cliniques, REVUE PRESCRIRE, Revues internationales, vaccin contre la covid-19, Vaccin covid | Commentaires fermés sur La revue Prescrire et les vaccins Covid – première partie

Des lapins de compagnie naturellement infectés par le SARS-CoV-2 en France

Des chercheurs vétérinaires français ont, pour la première fois, mis en évidence une infection naturelle par le SARS-CoV-2 chez des lapins de compagnie. Cette étude, dirigée par des chercheurs de l’université de Montpellier, a été publiée le 27 janvier 2022 dans la revue Veterinary Sciences. Elle visait à déterminer la séroprévalence de l’infection par le …

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Publié dans Animal, animal de compagnie, animaux, coronavirus, COVID-19, infection naturelle, Lapin, médecine vétérinaire, réservoir animal, SARS-CoV-2, Virologie | Commentaires fermés sur Des lapins de compagnie naturellement infectés par le SARS-CoV-2 en France

Les revues systématiques actualisées devraient être développées et financées dans tous les domaines

Bonnes explications dans un commentaire de Nature en décembre 2021 avec pour titre ‘Decision makers need constantly updated evidence synthesis‘. J’ai repris l’illustration de Nature ci-dessus… elle est bien faite. Nous rej… Continuer la lecture

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