Archives de catégorie : COVID-19

La moitié des preprints COVID-19 sur medRxiv ont été publiés dans des revues à comité de lecture

C’est une courte lettre très simple publiée sur JAMA Open Network en le 8 décembre 2022. Le titre Evaluation of Publication of COVID-19–Related Articles Initially Presented as Preprints, et le résultat principal est : Dans cette étude, nous avons… Continuer la lecture

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COVID-19 : dans le maquis des variants et sous-variants d’Omicron

Dans ce billet de blog, je souhaite vous faire lire un fil rédigé sur Twitter par T. Ryan Gregory, professeur en biologie de l’évolution à l’université de Guelph (Ontario, Canada). Ryan m’a donné son accord pour la traduction et l’adaptation de sa série de tweets publiés le 10 janvier 2022. À sa lecture, j’ai non …

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Publié dans Aeterna, Argus, BA.1, BA.2, BA.5, Basilic, Basilisk, BF.7, BQ.1, BQ.1.1, Centaure, Centaurus, Cerberus, Cetus, CH1.1, Chiron, coronavirus, COVID-19, Dictys, Evolution, Génétique - Biologie moléculaire, Gryphon, Hippogryph, Hydra, Kraken, Mimas, Minotaure, Omicron, Orthrus, Python, SARS-CoV-2, sous-lignages, sous-variants, Sphinx, Triton, Typhon, variants, Virologie, XBB.1.5 | Commentaires fermés sur COVID-19 : dans le maquis des variants et sous-variants d’Omicron

Pros : Prescrire, nov. 2022 : médicaments utiles et inutiles

Chaque mois, la revue indépendante Prescrire passe en revue les médicaments nouvellement commercialisés, ainsi que les nouvelles indications de médicaments déjà sur le marché. Elle en discute les mérites et démérites, par comparaison avec les autres traitements disponibles. Voici les médicaments qu’elle a examinés dans son numéro de novembre 2022. L’article qui suit est complexe, … Lire la suite Continuer la lecture

Publié dans Actualités, amfépramone, amphétamine, anémie, Antidouleur, Balance bénéfices / risques, Bénéfices, bénéfices/risques, béta-thalassémie, bimékizumab, Bimzelx, Comirnaty, COVID-19, diméthyle fumarate, diroximel fumarate, Evrenzo, excès de poids, icosapent éthyl, insuffisance rénale chronique, interféron béta, luspatercept, médiator, médicament, médicaments, Méthodes, Méthotrexate, myélodyspladie, obésité, pegcétacoplan, Prescrire, Psoriasis, Reblozyl, risques, roxadustat, sémaglutide, Spikevax, surpoids, traitement, tramadol, transfusion, triglycérides, vaccin ARN, Vaccin covid, Vazkepa, Vumerity, Wegovy | Commentaires fermés sur Pros : Prescrire, nov. 2022 : médicaments utiles et inutiles

Les 10 cas cliniques les plus lus de 2022 du blog « Réalités Biomédicales »

Depuis la création de ce blog il y a dix ans, mon désir est toujours le même : vous surprendre, toujours avec sérieux et bonne humeur, en vous racontant des histoires médicales extraordinaires. L’audience de ‘Réalités Biomédicales’ a dépassé les 41 millions de pages lues depuis sa migration sur le site web du journal Le …

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Publié dans cas clinique, coronavirus, COVID-19, Gastroentérologie, Imagerie médicale - Radiologie, médecine, Médecine de la reproduction, médecine interne, Médecine légale, monkeypox, mpox, Neurologie, Neurosciences, obstétrique, SARS-CoV-2, Urologie | Commentaires fermés sur Les 10 cas cliniques les plus lus de 2022 du blog « Réalités Biomédicales »

Altmetrics 2022 du JAMA : mesure quantitative de l’attention sur réseaux sociaux… bravo pour la France

En fin d’année, certaines revues nous informent sur l’attention des articles de l’année dans les réseaux sociaux (news, blogs, twitter, facebook, wikipedia, reddit, …). En général, ces scores Altmetric sont fugaces car en, quelq… Continuer la lecture

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Méfiez-vous des conférences prédatrices… Si elles existent, c’est qu’il y a un marché

Une fois de plus, j’ai l’immense honneur d’être invité comme orateur à une conférence virtuelle. Quel honneur… Le principal semble que je paye en tant que speaker. Que je ne connaisse rien au sujet n’est pas important ! No… Continuer la lecture

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Le journalisme scientifique change-t-il en devenant de plus en plus perméable aux manuscrits non révisés par les pairs

Je fais partie de ceux qui pensent que les bons journalistes scientifiques deviennent rares. En se rappelant les Jean-Yves Nau, Jean-Daniel Flaysakier qui ont disparu, je ne citerai pas de noms car certains m’énervent beaucoup. Cette étude de PLO… Continuer la lecture

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Covid-19 : comment Omicron a-t-il évolué depuis son émergence il y a un an ?

Il y a un an, le 26 novembre 2021, l’Organisation mondiale de la santé désignait le variant B.1.1.529 comme variant préoccupant, sous l’appellation Omicron. Par quels mécanismes moléculaires ce lignage du SARS-CoV-2 a-t-il depuis évolué ? Quelles trajectoires évolutives a-t-il suivies pour générer de nombreux sous-lignages, eux-mêmes à l’origine de multiples sous-variants ? Et quelle …

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Publié dans ACE2, anticorps neutralisants, BA.1, BA.2, BA.2.75, BA.2.75.2, BA.4, BA.5, breakpoint, co-infection, convergence évolutive, coronavirus, COVID-19, délétions, Delta, dérive antigénique, distance antigénique, domaine NTD, évolution convergente, Génétique - Biologie moléculaire, immunodéprimé, infection chronique, infection persistante, lignages, mécanisme évolutif, mutations, mutations antigéniques, mutations RBD, NTD, Omicron, point de cassure, protéine spike, RBD, récepteur cellulaire ACE2, recombinaison génétique, SARS-CoV-2, sous-lignages, sous-lignages d’Omicron, sous-variants, surveillance génomique, trajectoire évolutive, variant préoccupant, Virologie, virus recombinant, XBB | Commentaires fermés sur Covid-19 : comment Omicron a-t-il évolué depuis son émergence il y a un an ?

Des fraudeurs ne sont plus dans la liste des chercheurs les plus cités, dont un marseillaisais !

Comme chaque année, Clarivate a publié le 15 novembre 2022 sa liste de Highly Cited Researchers (HCR). Précipitons-nous sur ce message pour l’humanité, comme le dit Leonid Schneider. C’est une excellente analyse proposée sur son blog &#8216… Continuer la lecture

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Le savant flou de l’IHU de Marseille a fraudé d’après le vice président, L Schweitzer

Louis Schweitzer, haut fonctionnaire de 80 ans, ancien PDG de Renault, est vice-président du Conseil d’administration de l’IHU de Marseille et a supervisé la nomination du successeur de Didier Raoult. Il a témoigné dans une émission de Fran… Continuer la lecture

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Covid-19 : quand le séquençage du génome entier du virus guide le traitement en cas d’infection persistante

Chez de rares patients immunodéprimés, l’infection par le SARS-CoV-2 peut entraîner une infection chronique pendant plusieurs semaines ou plusieurs mois. On dispose de peu de données sur la prise en charge thérapeutique de ces patients, qui pourraient bénéficier d’associations de médicaments ou de traitements pendant une durée plus longue. Il importe alors de savoir s’il …

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Publié dans coronavirus, COVID-19, génome viral, Infectiologie, infection chronique, infection persistante, infection prolongée, infection prolongée par le SARS-CoV-2, mutations, Omicron, patients immunodéprimés, réinfection, SARS-CoV-2, séquençage génomique, séquence de génome entier, sous-lignages, sous-variants, traitement antiviral, variants, Virologie, WGS | Commentaires fermés sur Covid-19 : quand le séquençage du génome entier du virus guide le traitement en cas d’infection persistante

Covid-19 : le sous-variant BQ.1.1 d’Omicron progresse en France

L’évolution continue du variant Omicron, apparu fin 2021, a entraîné l’émergence de nouveaux sous-variants. Ces nouveaux venus n’en finissent pas d’éroder l’immunité acquise par la vaccination et/ou l’infection naturelle et de présenter des propriétés biologiques différentes, notamment du fait de leur capacité d’échappement immunitaire et de changements fonctionnels de leur protéine spike. Comme BA.4.6 et …

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Publié dans anticorps neutralisants, BA.4.6, BA.5, BF.7, BQ.1, BQ.1.1, breakthrough Infection, coronavirus, COVID-19, échappement immunitaire, épidémiologie, Immunologie, mutations, Omicron, protéine spike, RBD, SARS-CoV-2, sous-lignage, sous-lignages d’Omicron, sous-variant, sous-variants, test de neutralisation, vaccination, Virologie | Commentaires fermés sur Covid-19 : le sous-variant BQ.1.1 d’Omicron progresse en France

Covid-19 : le variant Omicron aurait émergé chez la souris, selon une étude

Le variant Omicron apparaît mieux équipé pour reconnaître le récepteur cellulaire ACE2 de la souris que celui de l’homme, rapportent des chercheurs américains dans une étude publiée le 18 octobre 2022 dans les Comptes rendus de l’Académie américaine des sciences (PNAS). On rappelle que le coronavirus SARS-CoV-2 se fixe par l’intermédiaire de la région RBD …

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Publié dans Animal, animal de compagnie, coronavirus, COVID-19, médecine vétérinaire, nouveaux variants, Omicron, one health, protéine spike, rat, RBD, RBM, récepteur ACE2, receptor binding domain, receptor binding motif, réservoir animal, rongeur, rongeurs, rongeurs domestiques, SARS-CoV-2, souris, variant, Virologie | Commentaires fermés sur Covid-19 : le variant Omicron aurait émergé chez la souris, selon une étude

Pros : Prescrire, août 2022 : médicaments utiles et inutiles

Chaque mois, la revue indépendante Prescrire passe en revue les médicaments nouvellement commercialisés, ainsi que les nouvelles indications de médicaments déjà sur le marché. Elle en discute les mérites et démérites, par comparaison avec les autres traitements disponibles. Voici les médicaments qu’elle a examinés dans son numéro d’août 2022. POUR LES PROS :L’article qui suit … Lire la suite Continuer la lecture

Publié dans Actiskénan, Actualités, angiœdème héréditaire, anxiété, atidarsagène autotemcel, azacitidine, Balance bénéfices / risques, béclométasone, Bénéfices, bénéfices/risques, bérotrastat, Buprénorphine, cancer, cannabidiol, céféine, cholangiocarcinome, COVID-19, crises d'épilepxie, Dalféine, dépendance aux opiacés, Douleur, douleur des enfants, Dropizal, Durée de vie, Epidyolex, fiévre, Formotérol, glycopyrroniium, implant, insomnie, leucémie myéloïde chronique, leucodystrophie métachromatique, Libmeldy, médicament, morphine, Onureg, opium, Orladeyo, Pemazyre, pémigatinib, placebo, Prescrire, risques, Roactemra, Sclérose tubéreuse de Bourneville, Sixmo, teinture d'opium, tiotropium, tocilizumab, Trimbow, Tumeurs bénigners, voies biliaires | Commentaires fermés sur Pros : Prescrire, août 2022 : médicaments utiles et inutiles

Covid-19 : des rats domestiques contaminés par leur propriétaire infecté par le SARS-CoV-2

Deux rats domestiques ont été contaminés par le variant Omicron du SARS-CoV-2 à partir d’une personne infectée, rapportent des chercheurs français dans un article paru le 13 octobre 2022 sur le site de prépublication bioRxiv. L’un des rongeurs a développé des symptômes sévères. Ces résultats sont présentés par Xavier Montagutelli, Bérénice Decaudin, Étienne Simon-Lorière et …

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Covid-19 : panorama des symptômes neurologiques à l’admission à l’hôpital, pendant l’hospitalisation et à long terme

Parmi les patients atteints de Covid-19, les adultes et les enfants présentent différentes manifestations neurologiques associées à l’infection par le SARS-CoV-2 lors de l’admission à l’hôpital et pendant l’hospitalisation. Le risque d’accident vasculaire cérébral (AVC) augmente avec l’âge, alors que le risque de survenue d’une infection du système nerveux central (SNC) ou d’épilepsie diminue avec …

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Les rétractations des traitements COVID-19 arrivent….264 ce jour, combien dans 5 ans ?

Ce sont deux articles rétractés en même temps (2 septembre 2022) par AJTMH (American Journal of Tropical Medicine and Hygiene). Ces articles sont de la même équipe de recherche (Egypte). Manifestement, il y a un lanceur d’alerte ! Son nom n&#8217… Continuer la lecture

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Peer-Review Congress J3 : session preprints avec les données de medRxiv !!!

Une présentation sur medRxiv par Joseph S Ross (Yale) avec les autres partenaires (Cold Spring Harbor, BMJ) medRxiv Preprint Submissions, Posts, and Key Metrics, 2019-2021. Lors du précédent Peer Review Congress, H Krumholz annonça le lancement de MadA… Continuer la lecture

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Peer-review congress J1 : session ‘Pandemic Science’… intéressant

Une session a été consacrée aux publications COVID-19. Epidemiology of Scientific Output During the COVID-19 Pandemic. Anne Yang et al (Pittsburgh) ont comparé des articles avant la pandémie, puis pendant la pandémie : augmentation des lettres, brief r… Continuer la lecture

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Méta-science ou ‘recherche sur la recherche’ pour améliorer l’intégrité de la recherche

Le titre de ce billet reprend une idée d’un article de Trials sur les leçons de la pandémie COVID-19. Cet article du 17 août 2022 est le compte rendu d’une conférence de 2020 à McMaster University (Hamilton, Canada). La conférence de D Mohe… Continuer la lecture

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Pandémie et intégrité des politiques publiques (EU) : corruption, conflits d’intérêts, fraude, népotisme, atteinte aux principes du système démocratique

Toutes les disciplines scientifiques ont eu leur augmentation d’articles pendant la pandémie. En consultant des articles en économie, j’ai trouvé un article qui fait très peur, mais il ne m’a pas surpris (accès libre). Nous comprenons… Continuer la lecture

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Grandeurs et décadences des revues scientifiques pendant la pandémie de COVID-19

Je remercie F Coulée et E Hirsch qui m’ont invité lors d’un colloque de deux jours sur les enseignements de la pandémie de COVID-19. J’ai enregistré ma communication dans une vidéo mise sur YouTube et je voudrais récapituler dans ce b… Continuer la lecture

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Merci à Joint Bone Spine pour ‘COVID-19 as a source of poor publications’

Il faut continuer à signaler les mauvaises pratiques des publications COVID-19. Je remercie à ce titre la revue Joint Bone Spine qui a publié en juin 2022 un éditorial que j’ai soumis sur ce thème. C’est difficile à écrire, et les relecteur… Continuer la lecture

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Pros : Prescrire, mai 2022 : médicaments utiles et inutiles

Chaque mois, la revue indépendante Prescrire passe en revue les médicaments nouvellement commercialisés, ainsi que les nouvelles indications de médicaments déjà sur le marché. Elle en discute les mérites et démérites, par comparaison avec les autres traitements disponibles. Voici les médicaments qu’elle a examinés dans son numéro de mai 2022. POUR LES PROS :L’article qui … Lire la suite Continuer la lecture

Publié dans accident ischémique transitoire, Accidents vasculaires cérébraux, Acidose rénale tubulaire, Adalimumab, Alcaptonurie, Anidulafungine, antibiotique, anticorps, Antifongique, aspirine, AVC, AVC ischémiques, Avibactam, Balance bénéfices / risques, bénéfice, Bicarbonate de potassium, Candida, Ceftazidime, Cilgavimab, Citrate de potassium, clopidrogel, Covid, COVID-19, Dolutégravir, Ecalta, efficacité, évaluation, Evusheld, hiv, Humira, Imiquimod, immunosuppresseur, infection grave, Interféron alfa, Kératose actinique, maladie génétique, médicaments, Médicaments alcalinisants, mycose, Nitisinone, Nouveaux médicaments, Orfadin, Pédiatrie, Plavix, Ponésimod, Ponvory, Prescrire, Rectocolite hémorragique, risque, sclérose en plaques, Sibnayal, sida, soleil, Teriflunomide, Tivicav, Tixagévimab, virus du sida, Zavicetta, Zyclara | Commentaires fermés sur Pros : Prescrire, mai 2022 : médicaments utiles et inutiles

Pros : Prescrire, mai 2022 : médicaments utiles et inutiles

Chaque mois, la revue indépendante Prescrire passe en revue les médicaments nouvellement commercialisés, ainsi que les nouvelles indications de médicaments déjà sur le marché. Elle en discute les mérites et démérites, par comparaison avec les autres traitements disponibles. Voici les médicaments qu’elle a examinés dans son numéro de mai 2022. POUR LES PROS :L’article qui … Lire la suite Continuer la lecture

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Problèmes d’auteurs : une méconduite tolérée par la communauté scientifique

Des exemples d’auteurs honoraires ou cadeaux sont quotidiens…  C’est une plaie pour la science et une injustice vis-à-vis de ceux qui veulent promouvoir une science intègre. C’est un exemple récent sur Twitter qui m’énerve… Continuer la lecture

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La lutte contre la désinformation sur les réseaux sociaux par des professionnels de santé : impossible ou immobilisme des institutions

C’est une perspective publiée dans le New England of Medicine le 18 mai 2022 qui apporte quelques réflexions sur le système nord-américain. Elle est signée par deux experts de l’ABIM (American Board of Internal Medicine). Avec d’autres organisations, l… Continuer la lecture

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Pros : Prescrire, avril 2022 : médicaments utiles et inutiles

Chaque mois, la revue indépendante Prescrire passe en revue les médicaments nouvellement commercialisés, ainsi que les nouvelles indications de médicaments déjà sur le marché. Elle en discute les mérites et démérites, par comparaison avec les autres traitements disponibles. Voici les médicaments qu’elle a examinés dans son numéro d’avril 2022. POUR LES PROS :L’article qui suit … Lire la suite Continuer la lecture

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Traitement COVID-19 : des études favorables pour des médicaments inefficaces ont été les plus citées !

C’est une analyse des articles COVID-19 ayant eu plus de 150 citations dans Scopus à la date de 23 décembre 2021. C’est un délai court car 150 citations est élevé, et parfois observé plusieurs années après la publication. Il s’agit d’un article de JPA … Continuer la lecture

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La pandémie de COVID-19 n’est pas terminée : quelle stratégie pour aujourd’hui et pour demain?

La pandémie de COVID-19 semble terminée : politiques et médias n’en parlent plus. La campagne présidentielle aurait pu être l’occasion de faire un bilan. Mais pas un mot, rien ou presque, à tel point que l’on pouvait avoir le sentiment étrange que la c… Continuer la lecture

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Pros : Prescrire, mars 2022 : médicaments utiles et inutiles

Chaque mois, la revue indépendante Prescrire passe en revue les médicaments nouvellement commercialisés, ainsi que les nouvelles indications de médicaments déjà sur le marché. Elle en discute les mérites et démérites, par comparaison avec les autres traitements disponibles. Voici les médicaments qu’elle a examinés dans son numéro de mars 2022. POUR LES PROS :L’article qui … Lire la suite Continuer la lecture

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Tout savoir sur la COVID-19 : enfin un ouvrage avec des références aux données probantes

C’est un livre de qualité qui doit trouver ses lecteurs : professionnels de santé et citoyens avertis. Ce livre se veut l’encyclopédie de qualité sur la COVID-19. Tout professionnel de santé qui veut un livre documenté sera satisfait, par d… Continuer la lecture

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Hydroxychloroquine et COVID-19 : Le Figaro pas très clair… complotiste ?

Cet article a comparé les articles en ligne de quatre quotidiens grand public concernant l’utilisation de l’hydroxychloroquine dans la COVID-19. La recherche a été faite avec les termes chloroquine, hydroxychloroquine, plaquenil et raoult d… Continuer la lecture

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Un marseillais sans éthique ni intégrité : il publie dans sa revue un hommage à l’IHU de Marseille

Avertissement : La plupart de mes collègues marseillais sont de bons professionnels, mais… Je voudrais simplement attirer l’attention sur un dysfonctionnement du système des publications à propos d’un article très bizarre dans la revu… Continuer la lecture

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La toux : c’est pas rien

La toux est un symptôme fréquent. Elle est le plus souvent liée à une maladie bénigne, qui guérit sans traitement. Mais chercher sa cause est parfois important. Les toux bénignes, qui guérissent sans traitement, durent souvent plus de 10 jours chez les enfants et plus de 18 jours chez les adultes. La toux est un réflexe … Lire la suite Continuer la lecture

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Les corrections de la littérature sont insuffisantes et surviennent tardivement

Je suis bien d’accord avec cette perspective publiée dans PLOS Biology  début mars 2022 : Correction of scientific literature: Too little, too late!. Les auteurs (L Besançon, E Bik, J Heathers, G Meyerowitz-Katz) proposent 8 idées pour améliorer … Continuer la lecture

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Deux messages du Lancet Regional Health – Americas : oubliez l’HCQ pour la COVID-19 et publiez des essais négatifs

Ce billet est en miroir de celui d’hier sur la non-efficacité de l’ ivermectine dans la COVID-19. Il s’agit d’un article brésilien dans une revue presque prestigieuse, Lancet Regional Health – Americas. Comme hier, c&#8217… Continuer la lecture

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Deux messages du NEJM : oubliez l’ivermectine pour la COVID-19 et publiez des essais négatifs

Le 30 mars 2022, le New England Journal of Medicine a publié un essai randomisé, double aveugle, versus placebo pour évaluer l’intérêt de l’ivermectine dans la COVID-19 pour prévenir les hospitalisations. Essai fait au Brésil avec 3515 mala… Continuer la lecture

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Une rétractation pas très claire pour des auteurs français : méconduite administrative ?

C’est RetractionWatch qui nous a appris qu’un article d’auteurs français avait été rétracté à la demande des auteurs. Je ne comprends pas le motif de la rétractation, car un erratum était probablement suffisant. J’aurai besoin d… Continuer la lecture

Publié dans COVID-19, Ethique, liens d'intérêts, Rétractation, Sociétés savantes | Commentaires fermés sur Une rétractation pas très claire pour des auteurs français : méconduite administrative ?

L’index de fragilité des résultats statistiquement significatifs des essais COVID-19 : oublions vite ce seuil de 0.05

Je ne connaissais pas cette notion, et cet article du 18 mars 2022 (JAMA Open Network) m’a intéressé. Son titre : ‘The Fragility of Statistically Significant Results in Randomized Clinical Trials for COVID-19‘. Je ne sais pas quelle e… Continuer la lecture

Publié dans Biais, COVID-19, statistiques | Commentaires fermés sur L’index de fragilité des résultats statistiquement significatifs des essais COVID-19 : oublions vite ce seuil de 0.05