Archives de catégorie : coronavirus

BA.2.75.2, le nouveau sous-variant d’Omicron qui inquiète les scientifiques

L’évolution continue du variant Omicron du SARS-CoV-2 continue de produire de nouveaux sous-variants porteurs de mutations additionnelles. Un de ces sous-variants émergents, dénommé BA.2.75, s’est rapidement diffusé dans certaines parties du monde, mais sans encore surpasser BA.5, le variant actuellement dominant. BA.2.75, dont la fréquence augmente en Inde, a été détecté en juillet 2022 dans …

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Un patient contracte simultanément le monkeypox, la Covid-19 et la syphilis, tandis qu’un autre présente une co-infection par monkeypox, SARS-CoV-2 et VIH

Deux études indépendantes, espagnole et italienne, rapportent, chez un homme ayant des relations avec des hommes, une co-infection par le virus monkeypox (variole du singe) et d’autres agents infectieux. L’équipe espagnole a publié le 23 août 2022, sous forme de preprint sur le site Research Square, le cas d’un individu de 56 ans ayant des …

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Covid-19 : une personne sur huit présente des symptômes persistants, selon une étude néerlandaise

Une vaste étude néerlandaise, conduite en population générale, rapporte qu’une personne sur huit ayant contracté la Covid-19 se plaint d’au moins un symptôme persistant. Les résultats ont été publiés le 5 août 2022 dans l’hebdomadaire britannique The Lancet. On sait qu’après avoir récupéré d’une infection aiguë par le SARS-CoV-2, certains patients continuent de présenter des …

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Des études montrent que la pandémie de Covid-19 a commencé sur un marché de Wuhan et que deux lignées virales ont été transmises à l’homme

Deux études, publiées en ligne le 26 juillet 2022 dans la revue Science, rapportent que le marché aux animaux vivants Huanan à Wuhan, en Chine, a été l’épicentre de l’émergence de la pandémie de Covid-19 et que celle-ci s’est manifestée par la transmission de l’animal à l’homme d’au moins deux lignages viraux distincts. On le …

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Identification d’anticorps neutralisants à large spectre, actifs sur tous les coronavirus humains

Deux équipes indépendantes rapportent, dans le numéro daté du 12 juillet 2022 de la revue Science, avoir identifié des anticorps neutralisants à large spectre, actifs contre une vaste gamme de coronavirus.  Ces anticorps humains ont la particularité de cibler une autre région de la protéine spike que celle contre laquelle sont dirigés les anticorps induits …

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Publié dans 299E, Alphacoronavirus, anticorps neutralisants à large spectre, BA.1, BA.2, BA.4, BA.5, Betacoronavirus, CCoV-HuPn-2018, coronavirus, COVID-19, Deltacoronavirus, épitope, Gammacoronavirus, HKU1, Immunologie, MERS, neutralisation, NL63, OC43, Omicron, Orthocoronavirinae, PDCoV-0081-4, peptide de fusion, protéine spike, SARS-CoV-1, SARS-CoV-2, Vaccinologie, variants, Virologie | Commentaires fermés sur Identification d’anticorps neutralisants à large spectre, actifs sur tous les coronavirus humains

Covid-19 : premier cas documenté de transmission du SARS-CoV-2 du chat à l’homme

C’est l’histoire d’une vétérinaire thaïlandaise de 32 ans qui se présente le 15 août 2021 à l’hôpital universitaire de Songkhla, ville située au sud du pays. Elle présente depuis deux jours de la fièvre, un écoulement nasal clair et une toux productive. Elle déclare aux médecins qu’elle et deux de ses collègues ont examiné un …

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Le renforcement immunitaire par Omicron dépend de l’exposition antérieure au SARS-CoV-2

Une vaste étude britannique montre que la capacité d’une infection par Omicron à renforcer le système immunitaire contre le SARS-CoV-2 dépend de la souche ou du variant qui nous a déjà infecté et qu’elle n’équivaut pas, loin s’en faut, à une dose de vaccin. Dans quelle mesure une infection par Omicron stimule-t-elle l’immunité via les …

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Covid-19 : l’ombre des variants BA.4 et BA.5 plane sur l’été

La communauté scientifique internationale est pleinement mobilisée pour évaluer les  propriétés biologiques et virologiques de BA.4 et BA.5, les deux nouveaux sous-lignages d’Omicron, identifiés pour la première fois en Afrique du Sud et qui sont devenus en mai les variants prédominants dans ce pays. Ils y ont provoqué une nouvelle vague de contaminations mais de …

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La pandémie de COVID-19 n’est pas terminée : quelle stratégie pour aujourd’hui et pour demain?

La pandémie de COVID-19 semble terminée : politiques et médias n’en parlent plus. La campagne présidentielle aurait pu être l’occasion de faire un bilan. Mais pas un mot, rien ou presque, à tel point que l’on pouvait avoir le sentiment étrange que la c… Continuer la lecture

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Covid-19 : caractérisation du variant XD, issu d’une recombinaison entre Delta et Omicron

Une étude dirigée par des chercheurs de l’Institut Pasteur de Paris rapporte les premières données épidémiologiques, virologiques et biologiques concernant le variant XD du SARS-CoV-2, issu de la recombinaison entre les variants Delta et Omicron. Ces travaux, supervisés par Étienne Simon-Lorière, responsable du groupe ‘Génomique évolutive des virus à ARN’ à l’Institut Pasteur, ont été …

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Infection par Omicron : quelle réponse contre d’autres variants chez les vaccinés et non-vaccinés ?

Une étude sud-africaine a évalué, chez des individus vaccinés et non vaccinés, la capacité des anticorps produits après une infection par le variant Omicron à combattre d’autres variants du SARS-CoV-2. Les résultats ont été publiés le 22 mars 2022 dans la revue Cell Host and Microbe. Conduite par Simon Richardson, Penny Moore et leurs collègues …

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Dans le sillage d’Omicron, les singularités de BA.2

L’ascension du variant Omicron (B.1.1.529) a été fulgurante dans de nombreux pays. Initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud en novembre 2021, ce nouveau variant du SARS-CoV-2 est aujourd’hui présent dans au moins 67 pays. Ce variant préoccupant est composé de trois sous-lignages désignés BA.1 (majoritaire), BA.2 et BA.3 (très peu détecté). Un …

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Omicron : une biologie et une dynamique virale différentes de celles observées chez les précédents variants

Dans ce billet de blog, je vous invite, à travers les données issues d’articles publiés ces dernières semaines, à comprendre les moyens utilisés par la recherche pour explorer les propriétés biologiques et virologiques d’Omicron. Celles-ci révèlent en quoi ce nouveau variant du SARS-CoV-2 est atypique. L’objectif des chercheurs est de comprendre comment les multiples mutations …

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Publié dans ACE2, anticorps, anticorps neutralisants, Biologie humaine, biologie structurale, bronche, cathepsine, cellule, charge virale, conformation, coronavirus, cryo-EM, cryomicroscopie électronique, délétion, Delta, domaine amino-terminal, domaine de liaison au récepteur, durée d'excrétion, dynamique virale, échappement immunitaire, ectodomaine, effet épistatique, épistasie, épithélium nasal, épitopes, évasion immunitaire, excrétion virale, fusion membranaire, IFITM, Immunologie, mutation, Omicron, particules virales, PCR, peptide de fusion, poumon, protéine spike, protomère, pseudovirus, RBD, récepteur ACE2, réplication, réplication virale, RT-PCR, SARS-CoV-2, séquence génomique, sites antigéniques, sous-unité S1, sous-unité S2, spike, TMPRSS2, transmissibilité, trimère, variant, variants, Virologie, virus, voie endosomale | Commentaires fermés sur Omicron : une biologie et une dynamique virale différentes de celles observées chez les précédents variants

Des lapins de compagnie naturellement infectés par le SARS-CoV-2 en France

Des chercheurs vétérinaires français ont, pour la première fois, mis en évidence une infection naturelle par le SARS-CoV-2 chez des lapins de compagnie. Cette étude, dirigée par des chercheurs de l’université de Montpellier, a été publiée le 27 janvier 2022 dans la revue Veterinary Sciences. Elle visait à déterminer la séroprévalence de l’infection par le …

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Hong Kong : transmission du SARS-CoV-2 de hamsters de compagnie à l’homme, suivie d’une diffusion interhumaine

Tout commence, à Hong Kong, le 11 janvier 2022. Une employée de 23 ans travaillant dans une animalerie, qui vend des hamsters, des lapins et des chinchillas,  présente un mal de gorge et de la toux. Elle est doublement vaccinée contre la Covid-19, la deuxième dose lui ayant été administrée le 16 septembre 2021. Elle …

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En Inde, un léopard contaminé par le SARS-CoV-2. Des pumas et des lions infectés dans un zoo en Afrique du Sud

Un léopard vivant en liberté a été contaminé par le SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19, indiquent des chercheurs de l’Institut indien de recherche vétérinaire à Bareli (Uttar Pradesh, État de l’Inde du Nord) dans un preprint publié le 12 janvier 2022 sur le site bioRxiv. En 2021, trois cas d’infection naturelle par le SARS-CoV-2 chez des …

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Comment le SARS-CoV-2 peut évoluer en variant préoccupant chez un individu immunodéprimé

C’est l’histoire d’une femme sud-africaine d’une trentaine d’années, atteinte du sida. Elle est admise en septembre 2020 dans un hôpital de Durban pour des symptômes qui ont débuté douze jours auparavant. Cette patiente présente une gêne respiratoire, un mal de gorge, de la toux. Le test RT-PCR pour le SARS-CoV-2 effectué sur le prélèvement nasopharyngé …

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Covid-19 : la vaccination a-t-elle un impact sur la durée du cycle menstruel ainsi que sur la durée et l’intensité des saignements ?

Une étude américaine indique qu’une femme peut présenter un léger allongement, en moyenne de 0,91 jour, de son cycle menstruel suite à la vaccination contre la Covid-19. Cette augmentation, inférieure à un jour, est certes significative sur le plan statistique, mais n’a pas de conséquence sur le plan clinique. Cette étude a cherché à déterminer …

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Covid-19 : ce que l’on sait de la sévérité de l’infection à Omicron

Quel impact le variant Omicron a-t-il sur le taux des admissions et des hospitalisations ? Ce nouveau variant, initialement identifié au Botswana et en Afrique du Sud en novembre 2021, est-il aussi dangereux que le précédent variant Delta ? Plusieurs études, en provenance d’Afrique du Sud et du Royaume-Uni, ont été publiées. L’occasion de faire …

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Les 10 billets les plus lus de 2021 sur le blog « Réalités biomédicales »

Depuis la création de ce blog il y a huit ans, mon désir est toujours le même : vous surprendre, toujours avec sérieux et bonne humeur en vous racontant des histoires médicales extraordinaires. Vous êtes toujours de plus en plus nombreux à lire ce blog, le seul à vous raconter des cas cliniques insolites, déroutants, …

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États-Unis : le SARS-CoV-2, détecté chez une proportion importante de cerfs en liberté, est capable de se diffuser entre cervidés

Le SARS-CoV-2 a été détecté, entre janvier et mars 2021, chez plus d’un tiers des cerfs vivant en liberté dans le nord-est de l’Ohio (État du Midwest des États-Unis), rapporte une étude mise en ligne le 23 décembre 2021 sur le site de la revue Nature. L’espèce de cervidé en question est appelé « cerf …

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Covid-19 : le SARS-CoV-2 peut persister dans le corps pendant des mois et se disséminer précocement dans le cerveau

Une étude américaine, reposant sur des autopsies de patients décédés de la Covid-19, a consisté à traquer la présence du coronavirus dans de très nombreux organes et tissus du corps humain. Les résultats montrent que le SARS-CoV-2 peut provoquer une infection disséminée et persister dans l’organisme pendant des mois. Le virus peut notamment largement diffuser …

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Variant Omicron : ce que l’on sait de l’activité neutralisante des anticorps, du risque de réinfection et de l’efficacité des vaccins

Initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud, le variant Omicron (B.1.1.529) est le cinquième variant préoccupant depuis le début de la pandémie Covid-19 due au SARS-CoV-2*. C’est également celui qui inquiète le plus les virologistes, immunologistes et épidémiologistes. En effet, plusieurs études in vitro indiquent que les nombreuses mutations présentes dans la protéine …

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Covid-19 : un collectif de médecins préconise de renforcer les mesures sanitaires dans les écoles | LCI

#Santé: JEUNESSE – Dans une tribune publiée lundi par Le Monde, un collectif de médecins et chercheurs avertit sur la nécessité d’adopter des mesures plus contraignantes pour réduire la transmission du Covid-19 à l’école. Source: Covid-19 :… Continuer la lecture

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Variant Omicron : un risque d’échappement immunitaire

Le moins qu’on puisse dire est que le nouveau variant Omicron initialement détecté au Botswana et en Afrique du Sud inquiète les spécialistes. Une étude, publiée sous forme de preprint sur le site medRxiv, rapporte un risque accru de réinfection associé à ce nouveau variant du SARS-CoV-2. En d’autres termes, Omicron présente une capacité accrue …

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Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le nouveau variant Omicron (B.1.1.529)

Après le variant Delta (ex-variant B.1.1.7 dit britannique), le variant Beta (ex-variant sud-africain B.1.351), le variant Gamma (ex-variant P.1 dit brésilien), c’est donc au tour d’un autre variant du SARS-CoV-2, dénommé Omicron (ou variant B.1.1.519), de faire les gros titres de la presse internationale et d’occuper le devant de la scène sur les chaînes d’info …

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États-Unis : diffusion massive du SARS-CoV-2 parmi les cerfs, potentiels réservoirs du coronavirus

Une étude américaine rapporte que plus de 80 % des cerfs, testés entre décembre 2020 et janvier 2021 dans plusieurs régions de l’État d’Iowa, sont positifs au SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19. Le cervidé en question est appelé « cerf de Virginie » (Odocoileus virginianus). Cette espèce est sensible à l’infection par le SARS-CoV-2. Il a été …

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Covid-19 : nouvelles données de l’effet de la vaccination sur la transmission du variant Delta

Il est établi que l’administration du vaccin contre la Covid-19 réduit considérablement le risque d’être hospitalisé pour une forme grave de la maladie et de décéder. La vaccination réduit également le risque d’être infecté par le variant Delta, plus transmissible que le variant Alpha (ex-variant anglais). Pour autant, lorsqu’une infection par SARS-CoV-2 survient malgré tout …

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Quand la vaccination vient à bout d’une infection Covid-19 persistante chez un patient immunodéprimé

C’est l’histoire d’un homme de 37 ans atteint du syndrome de Wiskott-Aldrich, un déficit immunitaire héréditaire associée à une anomalie présente sur le chromosome X. L’incidence de cette pathologie est estimée entre 1 à 5 enfants atteints pour un million de naissances. Elle est caractérisée par l’association de trois symptômes. Cette triade comporte un eczéma, …

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Des coronavirus de chauves-souris très proches du SARS-CoV-2 identifiés au Laos

Des chercheurs de l’Institut Pasteur rapportent avoir identifié, au nord du Laos, des coronavirus de chauves-souris dont il apparaît qu’ils représentent à ce jour les ancêtres les plus proches du SARS-CoV-2, responsable de la Covid-19. Cette étude est un élément possiblement très important dans la quête du réservoir naturel de l’agent viral responsable de la …

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Covid-19 : nouvelles données sur les hospitalisations d’enfants et d’adolescents aux États-Unis

Deux études apportent de nouvelles données sur l’évolution du nombre de cas de Covid-19 pédiatrique aux États-Unis, sur le taux d’admission aux urgences parmi les enfants infectés par le SARS-CoV-2 ainsi que sur le taux d’hospitalisations parmi les enfants et adolescents de 0 à 17 ans. Ces résultats ont été publiés en ligne le 3 …

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Covid-19 : un enseignant non vacciné à l’origine d’une flambée épidémique au variant Delta dans une école primaire américaine

L’histoire se déroule aux États-Unis dans une école primaire. Elle commence lorsqu’un enseignant apprend qu’il est positif pour le SARS-CoV-2, le coronavirus responsable de la Covid-19. Nous sommes le 23 mai 2021. Deux jours plus tôt, cette personne, non vaccinée, a présenté des symptômes mais a continué à travailler le demain et le surlendemain avant …

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Covid-19 : vers quels saints se tournent les Chrétiens ?

Quel saint catholique invoqueraient les membres de la communauté chrétienne européenne dans l’éventualité de la survenue de la maladie Covid-19 ? Telle est la question que se sont posé trois chercheurs italiens et français. Les résultats, issus d’une enquête en ligne auquel ont répondu plus d’un millier de personnes, sont publiés dans la revue Ethics, …

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Covid-19 : caractéristiques cliniques, virologiques et sérologiques des infections post-vaccinales dues au variant Delta

Une étude, conduite par des chercheurs singapouriens, rapporte pour la première fois des données virologiques et sérologiques concernant des infections post-vaccinales associées au variant Delta. Leurs résultats ont été publiés le 31 juillet 2021 sur le site de prépublication medRxiv. Il ressort notamment que la vaccination s’accompagne d’un déclin plus rapide de la charge virale …

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Taïwan : cluster dans un hôpital associé à un événement super-contaminateur

C’est l’histoire d’un foyer de transmission de Covid-19 associé à la propagation du virus SARS-CoV-2 à la faveur d’un événement de super-contamination survenu dans un grand hôpital de Taïwan. Elle est relatée dans un article paru le 21 juillet 2021 dans le Journal of Microbiology, Immunology and Infection. Il est très rare de trouver dans …

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Covid-19 : rares infections post-vaccinales chez les soignants du plus grand hôpital israélien

Malgré la grande efficacité du vaccin Pfizer à ARN messager contre la Covid-19, des infections post-vaccinales ont été récemment rapportées dans la littérature médicale internationale, notamment parmi le personnel de santé. Des épidémiologistes et immunologistes israéliens ont cherché à caractériser ces infections parmi les employés du Sheba Medical Center (Ramat Gan), le plus important établissement …

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Covid-19 : quand le variant Delta infecte des touristes américains complètement vaccinés

L’histoire se situe dans le sud-est de l’État du Massachusetts, sur la presqu’île de Cape Cod, célèbre pour ses plages immaculées. Elle s’est déroulée entre le 3 et 17 juillet 2021 dans une station balnéaire du comté de Barnstable à l’occasion de plusieurs événements estivaux et de grands rassemblements publics. Tout commence le 10 juillet …

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Covid-19 : une étude chinoise souligne l’ampleur de la charge virale à la phase précoce de l’infection par le variant Delta

Une vaste étude décrit la première chaîne de transmission du variant Delta du SARS-CoV-2 en Chine. Celle-ci date du 21 mai 2021. Au total, 167 infections ont été détectées à Guangzhou (province de Guangdong) puis rattachées au cas index à partir de données épidémiologiques ou génétiques. Les chercheurs chinois révèlent que les charges virales associées …

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États-Unis : flambée épidémique due au variant Delta dans un gymnase

L’histoire s’est déroulée sur une période de deux semaines dans une ville de l’Oklahoma (État du Midwest des États-Unis). Elle est relatée dans le bulletin épidémiologique hebdomadaire des Centres américains de contrôle et de prévention des maladies (CDC) daté du 9 juillet 2021. Tout commence par l’identification, le 15 avril 2021, d’un cas d’infection par …

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Covid-19 : Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon… l’émergence sans fin des variants

Il ne se passe plus un jour sans que l’on entende parler du variant Delta, identifié pour la première fois en Inde. Il est pourtant loin d’être la seule lignée virale à inquiéter les épidémiologistes, médecins et autorités sanitaires nationales et internationales. À ce jour, dans le monde, on dénombre une petite vingtaine de variants …

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