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Archives de catégorie : coronavirus
Covid-19 : une étude chinoise souligne l’ampleur de la charge virale à la phase précoce de l’infection par le variant Delta
Une vaste étude décrit la première chaîne de transmission du variant Delta du SARS-CoV-2 en Chine. Celle-ci date du 21 mai 2021. Au total, 167 infections ont été détectées à Guangzhou (province de Guangdong) puis rattachées au cas index à partir de données épidémiologiques ou génétiques. Les chercheurs chinois révèlent que les charges virales associées …
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États-Unis : flambée épidémique due au variant Delta dans un gymnase
L’histoire s’est déroulée sur une période de deux semaines dans une ville de l’Oklahoma (État du Midwest des États-Unis). Elle est relatée dans le bulletin épidémiologique hebdomadaire des Centres américains de contrôle et de prévention des maladies (CDC) daté du 9 juillet 2021. Tout commence par l’identification, le 15 avril 2021, d’un cas d’infection par …
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Covid-19 : Alpha, Beta, Gamma, Delta, Epsilon… l’émergence sans fin des variants
Il ne se passe plus un jour sans que l’on entende parler du variant Delta, identifié pour la première fois en Inde. Il est pourtant loin d’être la seule lignée virale à inquiéter les épidémiologistes, médecins et autorités sanitaires nationales et internationales. À ce jour, dans le monde, on dénombre une petite vingtaine de variants …
Publié dans Afrique, alpha, bêta, coronavirus, COVID-19, délétion, Delta, épidémiologie, Epsilon, fitness, gamma, insertion, Iota, Kappa, Lambd, mutations, nouveaux variants, NTD, Ouganda, protéine spike, RDB, SARS-CoV-2, séquençage génomique, susbtitution, Theta, vaccin, vaccination, variant, Variant Of Concern, Variant Of Interest, variant under monitoring, variants, variants préoccupants, Virologie, VOC, VOI, VUM
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Syndrome de Cotard et Covid-19 : lorsqu’une patiente affirme qu’elle est morte et que son cerveau se décompose
L’histoire concerne une femme turque de 41 ans, institutrice en école primaire, hospitalisée pour une perte d’odorat (anosmie), des douleurs musculaires et un mal de gorge. Le test RT-PCR réalisé sur prélèvement nasopharyngé est positif pour le variant anglais B.1.1.7, aujourd’hui dénommé Alpha. Les symptômes s’améliorent progressivement. Après dix jours, le test PCR revient négatif, mais …
Publié dans antipsychotique, B.1.1.7, coronavirus, COVID-19, délire de négation, électroconvulsivothérapie, épisode psychotique, mort, neuroleptique, Neurologie, neuropsychiatrie, Neuropsychologie, olanzapine, psychiatrie, SARS-CoV-2, sismothérapie, syndrome de Cotard, variant, variant Alpha, variant anglais
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Covid-19 : nouvelles données sur le variant Delta, dit « indien », en progression dans de nombreux pays
Identifié initialement en Inde, le variant Delta est désormais majoritaire au Royaume-Uni, où il représente environ 90 % des cas d’infection par le virus SARS-CoV-2. En date du 14 juin 2021, selon la base de données génomiques Gisaid, 61 autres pays étaient touchés par ce variant, anciennement dénommé variant indien (ou encore B.1.617.2, mais aussi …
Publié dans anticorps de sujets convalescents, anticorps monoclonaux, B.1.617.2, coronavirus, COVID-19, E484K, E484Q, EFFICACITE VACCINALE, épidémiologie, Gisaid, L425R, mutations, REACT-1, SARS-CoV-2, séquençage génomique, test PCR de criblage, Vaccinologie, VACCINS, variant, variant Alpha, variant Beta, variant brésilie, variant Delta, variant Gamma, variant indien, variant sud-africain, variants, variants of concern, variants préoccupants, Virologie, VOC, VOC-21APR-02
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Covid-19 : infection par le SARS-CoV-2 durant sept mois chez une patiente porteuse du VIH
L’histoire se déroule en Afrique du Sud et concerne une femme de 36 ans admise dans un hôpital de Durban en septembre 2020 pour un mal de gorge, de la toux et une gêne respiratoire. Ce cas clinique a été rapporté le 4 juin 2021 sur le site de prépublication medRxiv par l’équipe d’Axel Sigal …
Publié dans antirétroviraux, charge virale plasmatique, coronavirus, déficit immunitaire, délétions, évolution intra-hôte, évolution intra-patient, immunodépression, immunodéprimé, immunosuppression, Infectiologie, infection à VIH, mutations, NTD, patients immunodéprimés, personnes vulnérables, protéine S, protéine spike, RBD, SARS-CoV-2, séquençage génomique, sida, spicule, traitement antirétroviral, traitement immunosuppresseur, trithérapie, vaccination, vih, Virologie
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Covid-19 : comment le variant indien a débarqué au Brésil
L’histoire commence le 27 mars 2021. Le navire « MV Shanddong SA Zhi » quitte la Malaisie pour un long voyage qui doit l’amener à São Luís (État du Maranhão) au Brésil. Signalons au passage que São Luis est la seule capitale d’État du Brésil qui n’ait pas été fondée par les Portugais et dont …
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Publié dans Amérique du Sud, B.1.617.2, brésil, coronavirus, COVID-19, épidémiologie, inde, Infectiologie, lignage B.1.617.2, mutations, nouveaux variants, protéine S, protéine spike, SARS-CoV-2, spicule, variant Delta, variants, variants of concern, variants préoccupants, variats préoccupants, varient indien, Virologie, VOC
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Covid-19 : moindre sensibilité du variant indien B.1.167.2 aux vaccins et aux anticorps monoclonaux
Une étude française montre que le variant indien B.1.167.2 présente de façon significative une moindre sensibilité aux anticorps neutralisants développés par des patients Covid-19 convalescents ou produits après vaccination. L’originalité de cette étude, parue le 27 mai 2021 sur le site de prépublication bioRxiv, tient notamment au fait que les chercheurs n’ont pas utilisé de …
Publié dans Angleterre, anticorps monoclonaux, AstraZeneca, B.1.167.1, B.1.167.2, B.1.167.3, clusters, coronavirus, épidémiologie, foyers de contamination, inde, Infectiologie, mutations, NTD, Pfizer, protéine S, protéine spike, RBD, royaume uni, SARS-CoV-2, séroneutralisation, spicule, vaccin, Vaccinologie, variant, variant indien, variants indiens, variants préoccupants, Virologie, VOC
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Malaisie : un nouveau coronavirus, issu d’une recombinaison entre un virus canin et félin, isolé chez un patient hospitalisé pour pneumonie
Un nouveau coronavirus, issu d’une recombinaison entre deux coronavirus, l’un canin, l’autre félin, a été identifié chez un enfant présentant une pneumonie. Ce virus a été entièrement séquencé par une équipe de chercheurs américains, éthiopiens, chinois, malaisiens et singapouriens. Leurs résultats ont été publiés en ligne le 20 mai 2021 dans la revue Clinical Infectious …
Publié dans Alphacoronavirus, CCoV, coronavirus, coronavirus canin, coronavirus félin, FCoV, Infectiologie, PCR, Pédiatrie, Pneumologie, pneumonie, prélèvements nasopharyngés, protéine S, protéine spike, recombinaison, spike, Virologie
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Covid-19 : que sait-on du variant new-yorkais ?
Identifié pour la première fois dans la ville de New York en novembre 2020, le variant B.1.526 a vu sa prévalence augmenter fortement depuis le début de l’année. La proportion de ce nouveau lignage viral est ainsi passée de 3 % à la mi-janvier 2021 à 34 % fin février. Au 5 avril 2021, l’analyse …
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Publié dans B.1.351, B.1.526, breakthrough Infection, coronavirus, COVID-19, épidémiologie, infection post-vaccinale, P.1, réinfection, Santé publique, SARS-CoV-2, variant, variant brésilien, variant new-yorkais, variant sud-africain, variants, variants d’intérêt, variants préoccupants, Virologie, VOC, VOI
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Covid-19 : infections post-vaccinales dues à des variants
C’est l’histoire de deux femmes qui ont contracté la Covid-19, respectivement 19 et 36 jours, après avoir reçu leur deuxième dose d’un vaccin à ARN messager. Le cas de ces patientes a été rapporté le 21 avril 2021 par des médecins et chercheurs américains dans un article en ligne du New England Journal of Medicine. …
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Publié dans breakthrough Infections, coronavirus, COVID-19, épidémiologie, Immunologie, Infectiologie, infections vaccinales, Santé publique, SARS-CoV-2, vaccin, vaccination, Vaccinologie, Virologie
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Covid-19 : transmission par aérosols ou comment le coronavirus a contaminé des passagers d’un mini-bus
C’est l’histoire de deux chauffeurs de bus américains qui ont transmis le SARS-CoV-2 à plusieurs passagers, alors que ces derniers portaient un masque et respectaient la distanciation physique. Ces deux cas sont rapportés par des médecins et des chercheurs de la faculté de médecine Case Western Reserve de Cleveland (Ohio, États-Unis) dans un article publié …
Publié dans aération, aérosols, bus, chauffeur, contact-tracing, contamination, coronavirus, COVID-19, DISTANCIATION PHYSIQUE, Divers, épidémiologie, espace clos, masque, mini-bus, passagers, SARS-CoV-2, séquençage génomique, transmission, transmission aérienne, transmission aéroportée, van, véhicule, ventilation, Virologie
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Vaccins anti-Covid-19 et cas de thrombose : données internationales de pharmacovigilance
Publiée le 16 avril 2021 dans l’European Respiratory Journal, une étude française a cherché à évaluer le risque de thrombose et a classifié les cas d’événements thrombotiques après vaccination contre la Covid-19. Pour ce faire, l’équipe du Pr David Smadja (service d’hématologie biologique, Hôpital Européen Georges Pompidou, Inserm, AP-HP), a utilisé des données internationales de …
Publié dans accident ischémique transitoire, anticorps anti-PF4?, AstraZeneca, AVC, BionTech, caillots sanguins, CIVD, coagulation, coagulation vasculaire disséminée, coronavirus, COVID-19, déclarations, effet indésirable thrombotique, effets indésirables, effets indésirables post-vaccinaux, effets secondaires, événements thrombotiques artériels, événements thrombotiques veineux, Hématologie, Moderna, notifications, PF4, Pfizer, pharmacologie, pharmacovigilance, phlebite, pseudo-TIH post-vaccination, SARS-CoV-2, thrombose des sinus veineux cérébraux, thrombose des veines splanchiques, thrombose veineuse cérébrale, thrombose veineuse cérébrale profonde, Thromboses, vaccin, vaccination, vaccine-induced immune thrombotic thrombocytopenia, Vaccinologie
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Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le variant indien
Après le B.1.1.7 anglais, le B.1.351 sud-africain, le P.1 brésilien, c’est au tour d’un autre variant du SARS-CoV-2, cette fois identifié en Inde, de faire les gros titres de la presse internationale. Depuis quelques semaines, l’Inde connaît en effet une flambée épidémique. Dès lors le rapprochement a été vite fait avec l’émergence de ce nouveau …
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Covid-19 : les écoles sont-elles prêtes pour leur réouverture ? | Atlantico.fr
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Covid-19 : quid de la production de variants chez un individu infecté et de leur transmission ?
Durant la pandémie de Covid-19, le séquençage du génome viral est utilisé pour suivre la diffusion de nouveaux variants porteurs de mutations spécifiques. On le sait, de nouvelles mutations, ou associations de mutations, peuvent conférer un avantage sélectif au virus, qui peut devenir plus transmissible ou échapper au système immunitaire. Il a ainsi été montré …
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Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1
Au Brésil, l’épidémie de Covid-19 est aujourd’hui dominée par plusieurs lignées virales SARS-CoV-2 qui ont toutes en commun de posséder la mutation E484K dans la protéine S (spike ou spicule), qui permet au virus de se fixer sur les cellules qu’ils infectent. Cette mutation est problématique dans la mesure où elle peut contribuer à un …
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Covid-19 : retour sur les premiers cas de variant sud-africain en France et les premières chaînes de contamination
Une enquête épidémiologique détaille l’origine des premiers cas notifiés en France d’infection par le variant dit sud-africain du SARS-Cov-2*. Également dénommé B.1.351, ce dernier comporte plusieurs mutations dans le gène codant la protéine S (spicule ou spike en anglais), notamment les mutations N501Y et E484K, respectivement associées à une plus grande transmissibilité et à un …
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Covid-19 : malgré la quarantaine, des passagers d’un vol international à l’origine de multiples chaînes de contamination
L’histoire se déroule en Nouvelle-Zélande, pays qui pratique une stratégie d’isolement et de mise en quatorzaine à ses frontières dans le but d’éliminer le coronavirus SARS-CoV-2. Le 18 septembre 2020, un cas de Covid-19 est identifié. Le patient est un des passagers d’un vol international en provenance d’Inde. À sa descente d’avion, cet homme (G) …
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Polyarthrite après infection par le SARS-CoV-2
C’est l’histoire d’un homme de 67 ans qui se présente le 20 février 2020 pour un bilan de santé dans un hôpital de Chimkent (sud du Kazakhstan). Il ne se plaint alors ni de douleur, ni de gonflement articulaire. Dans le cadre des examens biologiques de routine effectués dans ce centre spécialisé en rhumatologie, on …
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Surdité brusque et SARS-CoV-2 : une infection peut en cacher une autre
C’est l’histoire d’un homme de 29 ans, sans antécédent médical, qui se présente dans le service d’ORL du CHU de Dijon pour une surdité brusque bilatérale apparue depuis dix jours. Il n’existe pas d’autre signe à l’examen clinique. La femme du patient présente une anosmie et une agueusie. Cette perte d’odorat et du goût incite …
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Covid-19 et chirurgie : mieux vaut se faire opérer au moins sept semaines après un test PCR positif
Les patients opérés dans les six semaines suivant le diagnostic d’infection à SARS-CoV-2 ont un risque accru de décès et de complications pulmonaires dans les 30 jours post-chirurgie. La chirurgie des patients atteints de Covid-19 devrait donc, lorsque cela est possible, être retardée d’au moins sept semaines pour réduire ces risques. Telle est la conclusion …
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L’autre épidémie : panorama des nombreuses séquelles médicales du Covid-19 | Atlantico.fr
Grande fatigue, essoufflement, douleurs, palpitations, troubles de la concentration et de la mémoire, perte de l’odorat et du goût, sont souvent rapportés, y compris chez les patients ayant connu une évolution initiale bénigne de la maladie. “Dès… Continuer la lecture
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Covid-19 : probables réinfections chez des résidents d’une maison de retraite
C’est l’histoire de résidents d’un centre de soins infirmiers spécialisés pour personnes âgées dans le Kentucky (États-Unis). En juillet 2020, cet établissement informe les autorités sanitaires locales d’un cas de Covid-19. Des tests RT-PCR sont effectués afin de détecter d’autres cas possibles parmi les résidents et les employés. Le cas index est un membre du …
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Transplantation pulmonaire : un cas tragique de transmission du SARS-CoV-2 d’une donneuse à une receveuse
Des chirurgiens et médecins américains rapportent, dans un article publié en ligne le 10 février 2021 dans l’American Journal of Transplantation, un cas documenté de transmission du SARS-CoV-2 entre donneuse et receveuse dans le cadre d’une greffe bi-pulmonaire. La donneuse avait pourtant été testé négative pour le coronavirus au test RT-PCR réalisé sur prélèvement nasopharyngé. …
Publié dans coronavirus, COVID-19, greffe, greffe bi-pulmonaire, Infectiologie, liquide de lavage broncho-alvéolaire, poumon, poumons, RT-PCR, SARS-CoV-2, transplantation, transplantation bi-pulmonaire, transplantation pulmonaire, Virologie
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New York : le coronavirus circulait plus d’un mois avant l’identification du premier cas de Covid-19
Des chercheurs américains rapportent que le SARS-CoV-2 était présent dans la ville de New York six à huit semaines avant l’identification du premier cas de Covid-19. Telle est la conclusion d’une étude postée sur le site de prépublication medXriv le 11 février 2021. On rappelle que le premier cas d’infection par le SARS-CoV-2 à New …
Publié dans analyse phylogénétique, ARN viral, Biologie moléculaire, coronavirus, COVID-19, épidémiologie, Etats-Unis, Gènétique, génome, Infectiologie, lignage, new york, PCR, poolage, pooling, RT-PCR, Santé publique, SARS-CoV-2, séquençage, séquençage génomique, séquence génétique, sérologie, tests groupés, Virologie, virus
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Covid-19 : des personnels de santé israéliens contaminés par le coronavirus après la première dose de vaccin
Des médecins israéliens rapportent des cas de contamination par le coronavirus SARS-CoV-2 parmi le personnel du plus grand hôpital du pays après administration de la première dose de vaccin anti-Covid-19. Publié le 1er février 2021 dans la revue en ligne Emerging Infectious Diseases, ce rapport concerne vingt-deux cas de contamination post-vaccinale. Ceux-ci sont survenus lors …
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Pneumonie Covid-19 : une inflammation qui tourne en boucle
Le coronavirus SARS-CoV-2 peut provoquer une réaction inflammatoire pouvant aboutir, dans sa forme la plus grave, à un syndrome de détresse respiratoire aiguë. Une minorité de patients Covid-19 développent une pneumonie nécessitant le recours à la ventilation mécanique. La mortalité de ces patients est élevée (20 % à 40 %). Les déterminants de cette gravité …
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Covid-19 : quand le SARS-CoV-2 se déleste de petits fragments de son matériel génétique pour échapper aux anticorps
Avec l’apparition de nouveaux variants SARS-CoV-2, on sait désormais que ce coronavirus, dont le génome était considéré jusqu’à présent relativement stable, peut muter. Cette variabilité génétique repose sur l’apparition de mutations consistant en la substitution d’un nucléotide par un autre, autrement dit d’une « lettre » par une autre dans l’ARN viral. Comme pour tout …
Publié dans activité neutralisante, anticorps, anticorps neutralisants, ARN, ARN viral, coronavirus, COVID-19, délétion, délétions, émergence de nouveaux variants, épitopes, évolution virale, Gènétique, génome, génome viral, Immunologie, immunosuppression, Infectiologie, mutations, neutralisation, nouveaux variants, patient immuodéprimé, phylogénétique, SARS-CoV-2, système immunitaire, variants, Virologie, virus
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Manaus, Brésil : de nouveaux variants du SARS-CoV-2 se jouent-ils de l’immunité collective ?
Que se passe-t-il à Manaus dans l’État d’Amazonas ? En octobre 2020, cet état du nord-ouest du Brésil avait été durement touché par l’épidémie de Covid-19. Publiée en octobre 2020 dans la revue Science, une étude conduite auprès des donneurs de sang indiquait que plus des trois quarts (76 %) des habitants de la plus …
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