Systémique médicale
Boules de Fourrure
Archives de catégorie : Biais
Unique invulnérabilité
Il faudrait une encyclopédie en 20 tomes pour simplement énumérer la liste des biais des études diffusées par les industries alimentaires et pharmaceutiques. Il en faudrait dix fois plus pour la liste des liens déclarés entre leurs dirigeants et les leaders d’opinion de la nutrition et de la médecine et cent fois plus pour leurs …
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39 % des résultats d’essais enregistrés dans clinicaltrials.gov ne sont pas disponibles 36 mois après leur fin
Lettre de deux pages dans le JAMA Internal Medicine (30 mars 2023) reprenant une communication du 9ème congrès du peer-review, intitulée : Comparison of Availability of Trial Results in ClinicalTrials.gov and PubMed by Data Source and Funder Type. Gasp… Continuer la lecture
Publié dans Biais, Intégrité scientifique, Public-Médias
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Les revues médicales ne devraient pas accepter de publicités de l’industrie pharmaceutique
C’est un court article du 19 février 2023 argumenté sur la pratique des publicités dans les revues médicales. Il y a des informations sur les revenus des grands éditeurs. Ceux qui proposent d’avoir de la publicité disent que les revenus son… Continuer la lecture
Publié dans Biais, Vie des revues
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Pour se faire un bon CV, rien de tel qu’être membre d’un comité de rédaction
Article de Nature du 16 janvier 2023 dont le titre est repris ci-contre (article de 15 pages en accès libre). J’ai traduit le résumé en français : Parmi les rédacteurs en chef, 8 % sont des femmes Les rédacteurs scientifiques façonnent le contenu… Continuer la lecture
Publié dans Auteurs, Biais, Rédaction des revues, Sexe et genre
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Que penser des instructions aux auteurs qui demandent de citer des articles de leur revue ?
La lecture des instructions aux auteurs des revues scientifiques est parfois surprenantes. J’ai lu celles de médecine/sciences, une bonne revue française que je défends… mais deux points me surprennent : 1) Il est demandé aux auteurs de me… Continuer la lecture
Publié dans Biais, Citations, Humour, Recommandations
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SIGAPS/MERRI : « ils gardent le pognon quand même, oui c’est dingue »
Le billet d’hier disait : Le nombre de citations et les facteurs d’impact des revues ne rendent pas compte de certains indicateurs de la qualité de la recherche en sciences du comportement et du cerveau. Je me permets de reprendre un tweet … Continuer la lecture
Publié dans Biais, Citations, évaluation, impact, Open access, recherche, Rétractation, Science Ouverte
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Formation en ligne « Dépistage du cancer du sein : informer les femmes »
Lancée au début d’Octobre rose 2022, la formation en ligne (ou MOOC) « Dépistage du cancer du sein : informer les femmes » s’adresse surtout à des soignants.Elle est conçue en quatre parties : une introduction, une partie sur l’évaluation des bénéfices du dépistage, une partie sur ses effets indésirables et une partie sur la manière de … Lire la suite Continuer la lecture
Publié dans Actualités, Aide à la décision, analphabétisme, ANDPC, Balance bénéfices / risques, Bénéfices, bénéfices/risques, Biais, CANCER DU SEIN, CANCER ROSE, Communication, Décision éclairée, décision partagée, Dépistage, Dépistage du cancer du sein, Essais comparatifs randomisés, formation, Formation en ligne, Histoire naturelle, information, MAMMOGRAPHIES, meta analyse, métaanalyse, MOOC, OAD, octobre rose, Outil d'aide à la décision, Polémique, risques, Surdiagnostic, surtraitement
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De l’erreur honnête à la fraude en passant par les pratiques discutables en recherche
Lors de conférences, j’utilise la diapo ci-dessous avec l’objectif de l’améliorer et vos commentaires seraient bienvenus. Il existe un spectre dans les mauvaises pratiques selon l’intentionnalité des chercheurs, et classer ces p… Continuer la lecture
Publié dans Auteurs, Biais, Fraude-Plagiat
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Peer-review congress J2 : Dissémination des résultats des essais cliniques… des financements publics gaspillés ?
Une présentation rassurante à partir de 240 essais cliniques présentés lors de 12 conférences en 2016. Auteurs américains et le titre Analysis of Reporting Consistency Between Clinical Trials Presented at Major Medical Conferences, Their Corresponding … Continuer la lecture
Publié dans Biais, essais cliniques, Peer review, recherche
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Peer-review congress J1 : session ‘Equity, Diversity and Inclusion’.. et des EDI editors dans les revues ?
Présentation de Ana-Catarina Pinho-Gomes (The George Institute for Global Health, Imperial College London, London), sur la proportion de femmes parmi les reviewers (et rédateurs) de revues médicales… Vous imaginez les observations…. avec … Continuer la lecture
Publié dans Biais, Rédaction des revues
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Peer-review congress à Chicago : bravo Isabelle Boutron, keynote speaker
Jeudi 8 septembre 2022, début du 9ème Peer-Review congress à Chicago à l’heure précise… Qualité des présentations, qualité du son excellente avec Zoom. La première conférence a permis un survol sur ‘Bias, spin, and problems with tran… Continuer la lecture
Publié dans Biais, essais cliniques, Peer review, Spin
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Le scandale des gros publiants : la vit D n’est pas recommandée pour prévenir ou traiter la COVID-19
Les gros publiants saisissent toutes les opportunités pour caser des études et articles : la COVID-19 a été une opportunité. Pirouette-Cacahuète, je vous fais croire que tout marche ! Excellent s’il ne s’agissait pas de malades… Bien … Continuer la lecture
Publié dans Biais
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Les articles rétractés sont cités sans mentionner la rétractation, et parfois des recommandations sont influencées négativement
C’est Science qui, le 1er juillet 2022, a commenté un excellent article sur les citations des articles rétractés de Yoshihiro Sato. Ce nutritionniste japonais (décédé) est connu pour ses fraudes, et il a 143 occurences dans RetractionWatch databa… Continuer la lecture
Publié dans Biais, Rétractation
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Les articles d’essais dits ‘positifs’ sont cités trois fois plus que les ‘négatifs’ ; de même pour les essais influençant la pratique clinique !
Rien de neuf, mais des données supplémentaires pour étayer cette affirmation. Il s’agit d’une lettre de 4 pages du JAMA Network Open du 30 juin 2022, à partir d’essais cliniques randomisés dans le domaine du cancer. Comme d’habi… Continuer la lecture
Traitement COVID-19 : des études favorables pour des médicaments inefficaces ont été les plus citées !
C’est une analyse des articles COVID-19 ayant eu plus de 150 citations dans Scopus à la date de 23 décembre 2021. C’est un délai court car 150 citations est élevé, et parfois observé plusieurs années après la publication. Il s’agit d’un article de JPA … Continuer la lecture
Toute analyse statistique unique cache un iceberg d’incertitude. L’analyse multi-équipes peut le révéler
C’est le message principal d’un commentaire publié dans Nature le 17 mai 2022. En effet, la plupart (tous ?) des articles de recherche sont basés sur une seule analyse statistique, faite par une équipe de statisticiens. Les messages de l… Continuer la lecture
Publié dans Biais, statistiques
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Hydroxychloroquine et COVID-19 : Le Figaro pas très clair… complotiste ?
Cet article a comparé les articles en ligne de quatre quotidiens grand public concernant l’utilisation de l’hydroxychloroquine dans la COVID-19. La recherche a été faite avec les termes chloroquine, hydroxychloroquine, plaquenil et raoult d… Continuer la lecture
Publié dans Biais, Complotisme, COVID-19, Public-Médias
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Les essais en homéopathie aussi mauvais que les essais des principaux domaines médicamenteux
Nous avons vu la plupart des biais des essais en général. La littérature est importante, avec par exemple environ 40 publications montrant que pour au moins 50 % des critères de jugement, il y a des différences entre protocoles et publications. Les lan… Continuer la lecture
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L’index de fragilité des résultats statistiquement significatifs des essais COVID-19 : oublions vite ce seuil de 0.05
Je ne connaissais pas cette notion, et cet article du 18 mars 2022 (JAMA Open Network) m’a intéressé. Son titre : ‘The Fragility of Statistically Significant Results in Randomized Clinical Trials for COVID-19‘. Je ne sais pas quelle e… Continuer la lecture
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Mauvais résumés des preprints COVID-19 : une convenance sociale pour survendre des recherches
Quand je fais des cours, je surprends souvent en expliquant que pour faire un résumé fidèle à l’article, le plus simple est de copier / coller des phrases de l’article. Mais des auteurs écrivent des résumés sans relire leur manuscrit, voire… Continuer la lecture
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Les manipulations de langage sont fréquentes pour embellir les essais non significatifs
C’est un travail énorme fait par une équipe hollandaise et publié le 18 février 2022 dans PLOS Biology. Le titre est attirant : ‘Analysis of 567,758 randomized controlled trials published over 30 years reveals trends in phrases used to discuss re… Continuer la lecture
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Amélioration des publications des essais cliniques d’antidépresseurs, mais situation toujours déprimante
Le travail d’Erik Turner sur la publication (ou plutôt la non-publication) des essais cliniques d’antidépresseurs a commencé il y a plus de 40 ans. Son article de 2008 dans le NEJM a apporté des données probantes pour confirmer ce que tous les chercheu… Continuer la lecture
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COVID19 : Essais ivermectine pires que les essais hydroxychloroquine ? Peut-être
Le système déraille vraiment à la lecture d’un article du 17 janvier 2022 dans Open Forum Infectious Diseases par des chercheurs anglais. Ils regrettent d’avoir été abusés par des publications sur l’ivermectine, et ils n’ont pas… Continuer la lecture
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Vaccins covid : dénombrer des effets indésirables
L’étude des effets indésirables des vaccins covid est complexe. Les affirmations simplistes et non étayées ont toutes chances d’être fausses. Sur internet, on trouve des textes relayés des dizaines de fois, qui affirment connaître le nombre de morts ou le nombre d’effets indésirables dus aux vaccins covid. Selon certains, la base de données européenne EudraVigilance … Lire la suite Continuer la lecture
Publié dans Actualités, AstraZeneca, Biais, BionTech, Cominarty, effets indésirables, EudraVigilance, évaluation, Guillain-Barré, Janssen, médicaments, Moderna, Mortaltié, morts, Péricardite, Pfizer, Pharmaco-épidémiologie, pharmacovigilance, Spikevax, Vaccin anti-covid, vaccin contre la covid-19, Vaccin covid, Vaccins covid, Vaxzevria
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Des auteurs manipulent les revues pour beaucoup publier : des faits probants pour une pratique connue
Félicitons nos collègues de Rennes, et leurs co-auteurs, pour un bel article innovant dans PLOS Biology le 23 novembre 2021. C’est un gros travail bien fait, bien décrit avec beaucoup de détails : ‘A survey of biomedical journals to detect … Continuer la lecture
Est-il encore utile de montrer le gaspillage en recherche clinique tant il est majeur ? Cas des ECRs
Depuis la série de 5 articles du Lancet en 2014, le constat est clair et ancien : une partie importante de la recherche clinique ne sert à rien. Ancien car en 1994, Doug Altman décrivait ce scandale, et des estimations de 85 % de gaspillage en recherch… Continuer la lecture
Publié dans Biais, Méthodologies
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Les financeurs peuvent influencer la publication des résultats de recherche en santé publique
Cet article de PLOS ONE (18 août 2021) a été remarqué par Nature Briefing qui a publié l’iconographie reprise ci-dessous (à partir de l’article de PLOS ONE). Le titre de l’article traduit en français : « C’est celui qui paie le … Continuer la lecture
Publié dans Biais, liens d'intérêts
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Torturer les phrases : un sport commun très préjudiciable pour la science, mais toléré
Parmi les pratiques discutables en recherche, le massage ou torture des données est commun… Avec habileté, omettre des valeurs, changer un test statistique, etc… permettent d’obtenir un résultat convaincant même si la réalité est diff… Continuer la lecture
10 % d’erreurs de citations dans 1200 articles de revues chirurgicales prestigieuses
Il s’agit d’une lettre de 2 pages dans JAMA Surgery d’août 2021 (mise en ligne en mai), mais d’un travail énorme et de qualité. Les auteurs (Stanford, Californie) rappellent, avec de bonnes citations, qu’il est admis que d… Continuer la lecture
Chirurgie bariatrique : les spins trop fréquents dans les essais randomisés (essais foireux ?)
Félicitons une équipe française de chercheurs pour une bonne revue systématique dans Journal of Clinical Epidemiology : ‘Spin occurs in bariatric surgery randomized controlled trials with a statistically nonsignificant primary outcome: A Systemat… Continuer la lecture
Peut-on survivre au désordre de l’information médicale ? Cette course à la publi est délétère
Nous pensons que tous les professionnels de santé impliqués dans la prise de décision médicale devraient posséder des compétences de base en matière d’évaluation critique et savoir quelles sources d’information sont susceptibles d’êtr… Continuer la lecture
Publié dans Biais, esprit critique, surmédicalisation
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Auteurs suspects
Pasteur avait qualifié le vin de boisson saine et hygiénique. Nul n’oserait suspecter Pasteur de conflit d’intérêts au prétexte qu’il possédait une vigne. Dans les années 1980, une baisse de la consommation du vin a conduit à diverses publications dont la plus connue est le fameux « french paradox » : les français, malgré la bonne chère et …
Publié dans Biais, cigarettes, conflit d'intérêts, médecine, vin
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La réplication des recherches en économie : un bilan qui devrait être fait dans d’autres disciplines
Un blog est dédié à la réplication en économie (The Replication Network ou TRN), et il est animé par deux chercheurs, anglais et néo-zélandais. Beaucoup de ressources sur ce blog, et 3 billets de début 2021 reprennent les principales informations dans … Continuer la lecture
Publié dans Biais, Reproductibilité
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La réplication des recherches en économie : un bilan qui devrait être fait dans d’autres disciplines
Un blog est dédié à la réplication en économie (The Replication Network ou TRN), et il est animé par deux chercheurs, anglais et néo-zélandais. Beaucoup de ressources sur ce blog, et 3 billets de début 2021 reprennent les principales informations dans … Continuer la lecture
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COVID-19 : la qualité des publications n’était pas au rendez-vous
Des équipes de chercheurs français, essentiellement hôpital Necker, avec des collaborations (19 auteurs quand même) ont publié un travail de bonne qualité début janvier 2021 dans BMC Medical Research Methodology. Ils ont analysé des publications entre … Continuer la lecture
Publié dans Biais
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En 20 ans, très légère amélioration de la qualité des articles d’essais cliniques dans les revues prestigieuses, mais encore mauvais
Cette lettre de JAMA Internal Medicine le 23 novembre 2020 représente un énorme travail pour un message terrifiant. En 1998, moins de 5 % des articles rapportant des résultats d’essais cliniques, mentionnaient les NNT, NNH et AAR. Les lignes directrices CONSORT recommandent de présenter ces paramètres indispensables pour comprendre le niveau d’efficacité d’un médicament. Trop de publications se contentent de… Continuer la lecture
Publié dans Biais, Méthodologie de recherche
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En 20 ans, très légère amélioration de la qualité des articles d’essais cliniques dans les revues prestigieuses, mais encore mauvais
Cette lettre de JAMA Internal Medicine le 23 novembre 2020 représente un énorme travail pour un message terrifiant. En 1998, moins de 5 % des articles rapportant des résultats d’essais cliniques, mentionnaient les NNT, NNH et AAR. Les lignes directrices CONSORT recommandent de présenter ces paramètres indispensables pour comprendre le niveau d’efficacité d’un médicament. Trop […] Continuer la lecture
Nature : Comment les scientifiques peuvent arrêter de se tromper sur les statistiques ?
C’est un éditorial de une page dans Nature du 3 juillet 2020 qui revient une fois de plus sur des questions simples.Signé par Dorothy Bishop ‘an experimental psychologist at the University of Oxford, UK’. Titre « Comment les scientifiques peuvent arrêter de se tromper sur les statistiques ». Voici l’exemple dans l’air du temps : As a topical example, suppose 5% of… Continuer la lecture
Publié dans Apprentissage, Biais, statistiques
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Les revues scientifiques publient les études négatives : les vieilles croyances résistent
J’entends toujours fréquemment des collègues soutenir en public l’idée que les revues scientifiques ne publient que des études positives, c’est à dire des études montrant un résultat ‘statistiquement significatif’. C’est en 2013 que j’ai observé les premières données présentées par un vieil ami hollandais lors d’un congrès du peer review à Chicago. Les résultats ont ensuite été publiés dans PLOS… Continuer la lecture
Publié dans Biais, Résultats négatifs
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Small versus big data : pas mieux ! Le cheery-picking toujours la norme ?
Lors de la conférence de JPA Ioannidis à l’Académie nationale de médecine (Projet MIROR, décembre 2019), il a utilisé deux diapos reproduites ci dessous, à méditer… Son message est qu’après des années de publication d’études avec de petits échantillons (diapo 10), nous pensons avoir une solution avec les big data (diapo 12)… mais nous entrons dans une ère qui n’apportera… Continuer la lecture
Publié dans Biais, Méthodologie de recherche
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