Archives de catégorie : Apprentissage

Faut-il publier des vidéos avec, voire à la place de certains articles ? Ce sera OUI à terme car il faut abandonner YouTube

Il existe des discussions au sein des revues scientifiques pour décider de la place des vidéos. Pour des revues de chirurgie, les décisions ont été prises il y a quelques années, et les rubriques ‘vidéo’ sont régulières. Ces vidéos peuvent être revues par le comité de rédaction avant mise en ligne. Un billet sur Scholarly Kitchen apporte des arguments pour… Continuer la lecture

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La crédibilité des pré-publications est bonne, mais la transparence et l’accès aux données sont plus importants

C’est une belle étude parue en octobre 2020 dans la revue ‘Royal Society Open Science’ avec le titre : « Credibility of preprints: an interdisciplinary survey of researchers ». C’est un travail de l’équipe de B Nosek, qui dirige le centre pour l’accès ouvert à Charlottesville. En 2019, ils ont interrogé des chercheurs de toutes disciplines sur la crédibilité des pré-publications. Ils… Continuer la lecture

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Les gaspillages en recherche (conception, conduite, analyse, publications) dans le domaine dentaire : pire que pire ?

Après avoir documenté depuis 30 ans les gaspillages en recherche biomédicale, il n’est pas étonnant de constater que la recherche dentaire permet de gaspiller des ressources, avec la complaisance sociale de la plupart des experts. Cet article d’octobre 2020 dans Journal of Dental Research a été écrit par des chercheurs de Berne, Londres sous la responsabilité de l’équipe METRICS de… Continuer la lecture

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Des noms morts ! PLOS accepte les demandes des auteurs transgenres et non binaires d’articles de mettre à jour leurs noms.

Je me garderai bien de donner mon opinion sur un billet du 12 octobre du blog officiel de PLOS. Voici la traduction de ce billet : Chez PLOS, nous nous engageons à répondre aux besoins de toutes les communautés de recherche afin d’améliorer la diversité, l’équité et l’inclusion. L’une des préoccupations de certains de nos auteurs transgenres et non binaires… Continuer la lecture

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Science ouverte : une guide intéressant qui nous apprend beaucoup… l’idéal pour la reproductibilité des recherches ?

Sur le site pour la Science Ouverte, nous lisons « La science ouverte est la diffusion sans entrave des publications et des données de la recherche. Elle s’appuie sur l’opportunité que représente la mutation numérique pour développer l’accès ouvert aux publications et -autant que possible- aux données de la recherche ». Ce site du Ministère de l’Enseignement Supérieur et de la Recherche… Continuer la lecture

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COVID-19 : se tenir informé avec la newslettre de Frédéric Adnet… Les 15 premières sont excellentes

La pandémie de publications COVID-19 a rendu difficile la compréhension de la maladie pour les néophytes comme moi. Je prends plaisir à lire chaque semaine la newsletter de F Adnet. il s’agit de quelques pages analysant moins de 5 articles chaque semaine. Les choix sont vairés et bien faits. Toutes les newsletters sont ici. Par exemple dans la lettre 15… Continuer la lecture

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Nature : Comment les scientifiques peuvent arrêter de se tromper sur les statistiques ?

C’est un éditorial de une page dans Nature du 3 juillet 2020 qui revient une fois de plus sur des questions simples.Signé par Dorothy Bishop ‘an experimental psychologist at the University of Oxford, UK’. Titre « Comment les scientifiques peuvent arrêter de se tromper sur les statistiques ». Voici l’exemple dans l’air du temps : As a topical example, suppose 5% of… Continuer la lecture

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COVID-19 : des articles très cités vont booster les facteurs d’impact des revues… magouilles ?

Il s’agit d’un article de 25 pages très complet avec des analyses complexes publié le 25 juin 2020. Je n’ai pas pu suivre toutes les équations, mais des tableaux faciles à comprendre sont intéressants. Cet article a été publié par une nouvelle revue QSS (Quantitative Science Studies), publiée par MIT Press Journals. Les deux premiers numéros sont très bons. Des… Continuer la lecture

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Journal de bord en pédiatrie : semaine 4 – « Espoir »

Garde cataclysmique. Nager dans le grand bain avec les requins. La bouée de sauvetage est fourbe : visible, semblant à portée de bras, et pourtant, quand on s’en approche, elle s’éloigne, comme emportée par un courant sournois. Nage tout seul dans &#82… Continuer la lecture

Publié dans année, apprendre, Apprentissage, bébé, enfant, Ethique, études, étudiant, Initiation, internat, interne, Litthérapeute, Litthérapie, médecin, médecine, MEDECINE GENERALE, Méthode, mort, OBSERVATION, parent, patient, Pédiatrie, psychiatrie, Santé, soins, Stage, vie, Vocation | Commentaires fermés sur Journal de bord en pédiatrie : semaine 4 – « Espoir »

COVID-19 : la science après la pandémie… excellente série ‘collector’ de 8 articles dans Nature, car rien ne sera pareil

La revue Nature a publié une série de 8 articles sur l’après pandémie (gratuits et j’ai tout imprimé !) : Universities will never be the same after the coronavirus crisis le 1 juin. Les cours en ligne ont changé les pratiques. Certaines universités avaient déjà des offres en ligne importantes, d’autres ont dû tout faire. Est-ce que les étudiants étrangers… Continuer la lecture

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Comprendre les manipulations d’images et le travail d’E Bik qui a conduit à 172 rétractations

Le blog d’Elisabeth Bik est le meilleur pour nous aider à comprendre les manipulations d’images dans les articles scientifiques. Très didactique, vous apprendrez les différents types de western blots (nous avons vu pourquoi ce nom de western dans un billet du mars 2020); E Bik a utilisé des images de palmiers pour bien décrire les 3 types de manipulations. Elle… Continuer la lecture

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En temps de crise : Est-il acceptable de réduire les standards éditoriaux et les contrôles qualité des revues ?

Ce vendredi 12 juin 2020, date initiale du congrès de EASE (European Association of Science Editors) à Valence (Espagne), nous organisons une session virtuelle (avec Zoom) de 10 h à 14 h 30, heures françaises. Il y a déjà environ 150 inscrits, et c’est gratuit. Il y a 3 sessions plénières et le programme est ici : The realities of… Continuer la lecture

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Est-ce que les jeunes chercheurs seront les précurseurs du changement ? Oui, mais beaucoup de nuances

Il s’agit d’un projet international de 3 ans dont j’ai présenté une des publications hier le 4 juin 2020. La France était bien représentée dans ce projet avec Cherifa Boukacem-Zeghmouri parmi l’équipe de 9 chercheurs de pays différents (D Nicolas, Head project UK, et autres pays Chine, Israël, Espagne, Malaysie, Pologne). Le site internet est très riche et vous consulterez… Continuer la lecture

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Poster : faire simple avec un seul message de 15 mots compris en quelques secondes, et au milieu

Je fais régulièrement des formations sur comment faire un abstract et un poster pour un congrès scientifique. Il faut une bonne demi- journée pour discuter avec un groupe de chercheurs ayant déjà participé à un congrès. les discussions sont nombreuses et je suis souvent surpris par les mauvais posters. Les messages principaux sont nombreux : un abstract/poster sans article publié… Continuer la lecture

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Intégrité de la recherche : le rapport MLE (Mutual Learning Exercise) est une bonne base pour développer des initiatives

L’intégrité scientifique progresse en France, c’est vrai. J’ai appris que vitesse et précipitation étaient sources d’erreurs en lisant les périgrinations de l’amiral Corniloff. Il était allé consulter la comtesse, sa voisine, avant de prendre femme, car la comtesse avait trois filles. Il s’agit d’une vieille histoire de salle de garde….. Notre propos est le développement de l’intégrité scientifique en France…. Continuer la lecture

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COVID-19, une inconnue pour les revues scientifiques… que font les auteurs et rédacteurs pendant l’épidémie ?

Toutes mes pensées aux professionnels de santé qui nous aident à lutter contre cette maladie, COVID-19. Et aussi, évitons les querelles politiciennes nuisibles au combat : il faut faire confiance à nos gouvernants… que feraient à leur place ceux qui gueulent ? Sur les réseaux sociaux, il y a des questionnements quant aux publications : est-ce que les manuscrits soumis… Continuer la lecture

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COVID 19 : pour ceux qui restent chez eux, écrivez des manuscrits… les revues seront-elles impactées et comment

Nous nous interrogeons sur l’impact du COVID 19 sur les publications. Les revues prestigieuses mettent en accès libre les articles sur le sujet, voire ont un site dédié pour ces articles (les éditeurs peuvent regrouper sur un site les articles des revues de leur portefeuille). Des sociétés proposent des services gratuits pour éditer des articles, pour traduire probablement…. profitez-en vite… Continuer la lecture

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Pourquoi Western blot ? Le blog d’Elisabeth Bik nous explique Northern, Southern mais pas Eastern

J’ai emprunté cette copie d’écran à un billet de l’excellent blog d’E Bik, détective d’images fraudées dans les articles scientifiques. Ce billet explique comment détecter les images de Western blots qui ont été bricolées. Elle explique pourquoi ‘Western’. Lisez tout le billet qui est très didactique. Voici l’extrait : Continuer la lecture

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Synhtèse excellente d’une formation pour écrire un article de recherche : tout est dit en quelques mots

Cet éditorial est concis et très utile. Il apporte les éléments principaux à connaître pour écrire un article de recherche. Il a été publié dans International Journal of Radiation Oncology en mars 2020. Quelques bonnes idées : commencez votre projet de rédaction 6 mois avant… chosissez 6 illustrations au plus vite et travaillez pour les rendre très lisibles Ce n’est… Continuer la lecture

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Pas d’hésitation, écrivez toujours en anglais avant de vous faire relire par un anglophone pour l’editing

Trop souvent je rencontre des internes qui écrivent leur article (thèse..) en français pour ensuite faire traduire… Comme la plupart des rédacteurs, je suggère d’écrire en anglais immédiatement et de faire corriger par un anglophone. C’est la meilleure façon d’apprendre et de progresser. Il y a des arguments pour cela : regardez cette vidéo de 4 minutes 28 secondes et… Continuer la lecture

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Les critiques des jeunes chercheurs, sources de progrès, sont souvent délétères pour leurs carrières

Voici le dernier paragraphe d’une opinion publiée dans Nature le 2 janvier 2020. Ce paragraphe résume bien une situation commune, à savoir que la critique, souvent salvatrice, des étudiants et jeunes chercheurs est dangereuse pour leur carrière ! Le texte tient sur une page, est facile à lire. Vous pouvez l’afficher dans une salle de staff. Il est temps d’être… Continuer la lecture

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Bonne année avec le vrai cycle de Krebs

Image volée sur le net, mais qui rappelle des souvenirs de faculté : bonne année
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Study 329 : pire que ce que je pensais pour la paroxétine (Paxil/Seroxat) chez l’enfant avec des manipulations GSK et FDA

Bravo pour cette excellente conférence par David Healy à Lyon (octobre 2015) sur le scandale des études cliniques de la paroxétine chez l’enfant. Je viens de visualiser la vidéo (une heure) qui est bien sous-titrée en français. L’anglais est agréable et facile à comprendre. Incroyable : manipulations de GSK (Smith Kline Beecham au moment des faits) avec les trois essais… Continuer la lecture

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Rigidité cadavérique (10/10) : une solution en développant la recherche sur la recherce est urgent

Suite au billet du 19 août 2019 « Quatre croyances erronées qui font obstacle à des recherches plus fiables », j’ai proposé d’analyser ce livre de Richard Harris, journaliste scientifique qui vit à Washington. Dans le livre de Chris Chambers, la rédemption était aussi dans le dernier chapitre. C Chambers a proposé des solutions pour chacun des 7 péchés décrits. Les solutions… Continuer la lecture

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Médiator : un peu de hauteur pour réfléchir sur la causalité et le nombre de morts

Je vous encourage à lire un livre qui vient d’être publié (octobre 2019) avec le titre « Médiator® – Et si ce n’était qu’une question de poids ? » (L’Harmattan 2019). Il permet de discuter la notion de causalité. Ce livre détaillé demande de la concentration et un peu de temps… mais il apporte des arguments, contrairement à tous ces… Continuer la lecture

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Les PhD en biomédecine connaissent des formes graves d’inconduite scientifique de la part de leurs établissements de recherche

C’est une enquête à laquelle 72 PhD de l’université d’Oslo ont répondu en 2016. L’article a été publié le 14 octobre 2019 dans Research Ethics (il faut 3 ans pour analyser 72 questionnaires ! merveilleux). Voici une partie du résumé : Dans l’ensemble, 13 % des PhDs en biomédecine récemment diplômés ont déclaré connaître des personnes dans leur environnement immédiat… Continuer la lecture

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Ig Nobel 2019 : prix de médecine pour les pizzas italiennes ; hommage à J Chirac, prix IgNobel de la paix en1996

J’ai visionné la remise des prix Ig Nobel à Harvard le 12 septembre 2019. C’est un plaisir, même si la vidéo dure près de 1 h 30 min. Il y a les traditionnels lancers d’avions en papier et plein d’intermèdes drôles. Ceux qui parlent trop sont coupés par une fille de 8 ans qui vient leur crier : « PLEASE STOP,… Continuer la lecture

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Responsabilité sociale en santé : Rencontres, récits d’étudiants en médecine à Lyon-Est, BRAVO

Hier, j’ai présenté le dictionnaire francophone de la responsabilité sociale en santé : ce sont des concepts importants qui doivent être enseignés. Fin août, depuis 2001 (je ne suis pas allé à tous les congrès), je participe au congrès de l’AMEE (Association for Medical Education in Europe). L’an dernier, c’était à Bâle, et cette année à Vienne (Autriche). Il y… Continuer la lecture

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Responsabilité sociale en santé : un dictionnaire bienvenu qui doit être en vue dans les bureaux des doyens

Je ne regrette pas les plus de trois heures au soleil consacrées à parcourir ce dictionnaire. Il est facile à parcourir, bien fait et utile. Il s’agit de 134 entrées et chaque contribution est de 2 à 5 pages (près de 600 pages au total). Il résulte de la collaboration de plus de 70 auteurs francophones de 17 pays (Belgique,… Continuer la lecture

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Registered reports adopté par 200 revues : un bilan (66 % ne supportent pas l’hypothèse initiale) et de bonnes réflexions

Nous avons présenté plusieurs fois le modèle de publication appelé ‘Registered Reports’ ou ‘RRs’. En 2019, les RRs sont proposés par environ 200 revues, ayant été initié dans le domaine de la psychologie en 2013. Dans Nature, en septembre 2019, Chris Chambers qui a été l’un des acteurs de ce mouvement, qui préside des comités ‘RRs’ pour plusieurs revues apportent… Continuer la lecture

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Courte synthèse sur la rédaction d’un article IMRaD : le minimum pour vos étudiants, et I AM pour répondre aux revues

Même le minimum, c’est déjà difficile : si vous connaissez IMRaD, adoptez I AM. La synthèse en 9 pages faite par des chercheurs de Nouvelle Zélande, Suède et Thaïlande est utile.. La collaboration améliore toujours les articles. Je ne connais pas cette revue de chez SAGE : The International Journal of Lower Extremity Wounds qui a mis en ligne cet… Continuer la lecture

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Biais en médecine par John Oliver !!

Vous connaissez probablement les émissions de télévision humoristiques de John Oliver. L’émission du 23 août 2019 était sur les biais en médecine. Ces émissions sont très bien documentées, avec des références à des articles scientifiques. Elles sont suivies sur YouTube (5 millions de vues en 10 jours et 15 000 commentaires). Il commence par des exemples sur les différences entre… Continuer la lecture

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Quatre croyances erronées qui font obstacle à des recherches plus fiables

C’est le titre d’un excellent article dans eLife de 11 pages (début août 2019) signé par 3 chercheurs, M Yarborough (Sacramento, Californie), R Nadon (MacGill, Montréal), et DG Carlin, chercheur indépendant basé à Marseille ! Cet article part de constats alarmants et anciens (Altman en 1994 sur le scandale de la mauvaise recherche dans le BMJ, et un livre que… Continuer la lecture

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Pourquoi participer à un comité de rédaction d’une revue scientifique ?

Propos court dans Nature (career column) le 7 août 2019 sur les bénéfices d’être membre d’un comité de rédaction. Le titre est clair : Why you should join a journal’s editorial board. L’auteur est une mathématicienne qui donne des conseils à un jeune chercheur. Ces conseils s’appliquent probablement à toutes les disciplines : Identifier une ou deux revues qui vous… Continuer la lecture

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Le processus d’examen par les pairs est sans aucun doute l’élément vital de l’édition scientifique : formons les jeunes chercheurs

J’ai, comme titre de ce billet, traduit la première phrase d’ un article paru fin juillet 2019 dans Cardiovascular research. L’objectif de l’article est de donner quelques conseils pour que les jeunes chercheurs puissent relire et critiquer des manuscrits soumis à des revues scientifiques. Quelques soient les très nombreuses critiques du peer-review, nous n’avons pas de meilleure méthode ! Des… Continuer la lecture

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Bravo CAEN pour le Code & Comité de déontovigilance UFR Santé / Université / CHU

Il me semble que c’est une initiative unique et innovante à Caen : Un code et comité de déontovigilance avec 3 parties (UFR santé, Université, CHU). Dans le cadre du développement de l’intégrité scientifique en France, certains chercheurs n’ont aucune instance à laquelle se référer en cas de méconduite, de manquements divers aux pratiques professionnelles. Par exemple les personnels des… Continuer la lecture

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La citation de seconde main compromet fortement la qualité des articles… notamment par la non recherche des sources originales

Cet article a essayé d’analyser les comportements des auteurs quand ils sélectionnent les références à citer dans leurs articles. Ce travail(accès libre) a été fait par des chercheurs hollandais, et publié début 2019. Ils ont exploré un sujet difficile, à savoir comment les auteurs choisissent les articles cités en références dans les manuscrits qu »ils écrivent… Difficile. Ils ont fait un… Continuer la lecture

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Bonnes pratiques pour les abstract de congrès (posters et communications orales)

En mars 2018, j’ai présenté un preprint sur les abstracts de congrès. Le preprint était du 19 octobre 2017 sur PeerJ, et des commentaires ont été faits. Le preprint était une première version ouverte aux commentaires. Un lien a été ajouté au niveau du preprint de PeerJ pour citer l’article publié. Un article a été publié le 5 juin 2019… Continuer la lecture

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Bonnes pratiques pour les abstract de congrès (posters et communications orales)

En mars 2018, j’ai présenté un preprint sur les abstracts de congrès. Le preprint était du 19 octobre 2017 sur PeerJ, et des commentaires ont été faits. Le preprint était une première version ouverte aux commentaires. Un lien a été ajouté au niveau du preprint de PeerJ pour citer l’article publié. Un article a été publié le 5 juin 2019… Continuer la lecture

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Commencer

Je ne sais pas par où commencer. Je veux simplement l’écrire, coucher ces impressions multiples en un simple récit, pour ne pas oublier. Pour relire un jour, à tête reposée, à cœur écœuré ou l’humeur triste et blasée, ces premiers … Lire la suite… Continuer la lecture

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