Archives de catégorie : Apprentissage

La recherche en cardiologie ouvre-t-elle la voie au partage des données, comparativement à d’autres spécialités médicales ?

Le partage des données en médecine accuse un retard par rapport à d’autres disciplines scientifiques. Le partage des données de recherche anonymisées au niveau des patients offre d’immenses possibilités à tous les intervenants qui participent à la recherche. Dans un article du JACC de fin 2017, l’équipe de cardiologie de l’École de médecine de Yale a décrit les efforts déployés… Continuer la lecture

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PLAS 21 : régularité, qualité avec des news nombreuses toujours utiles

Nous avons besoin de ce style de concision, et c’est une récréa tion de lire PLAS quand il arrive. PLAS pour Publier LA Science est une sélection de news dans le monde de la publication, des revues, etc.. avec des analyses courtes et le lien internet pour accéder à la source. Produit par la cellule d’assistance à la publication du… Continuer la lecture

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PLAS 21 : régularité, qualité avec des news nombreuses toujours utiles

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La France en retard pour les méthodes de formation médicale ? ou très en retard ? je ne sais pas

Depuis l’année 2000, j’ai assisté à la plupart des conférences annuelles de l’AMEE, Association for Medical Education in Europe, et toujours regretté la faible participation française. En 2018, la conférence se tenait à Bâle (assez proche de la France), et il y avait près de 4 000 participants provenant de 90 pays…. et combien de France ???? Vingt peut-être…. Je… Continuer la lecture

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Bonne nouvelle : une journée sur l’intégrité scientifique à Nanterre le 7 décembre 2018

Le réseau des URFIST organise une journée sur l’intégrité scientifique à Nanterre. Le programme est accessible, et il faut s’inscrire, d’autant plus qu’il n’y a pas de frais de participation. Le réseau des URFIST (Unité Régionale de Formation à l’Information Scientifique et Technique) est actif et mérite d’être connu. Ils ont une bonne vision de la recherche, en étant des… Continuer la lecture

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Bonne nouvelle : une journée sur l’intégrité scientifique à Nanterre le 7 décembre 2018

Le réseau des URFIST organise une journée sur l’intégrité scientifique à Nanterre. Le programme est accessible, et il faut s’inscrire, d’autant plus qu’il n’y a pas de frais de participation. Le réseau des URFIST (Unité Régionale de Formation à l’Infor… Continuer la lecture

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Plus de la moitié de 207 thésards allemands ont déclaré avoir utilisé des pratiques de recherche douteuses (et 3 % ont falsifié des données)

Un article de PLOS ONE du 30 août 2018 a pour titre « Questionable research practices in student final theses – Prevalence, attitudes, and the role of the supervisor’s perceived attitudes » avec deux auteurs allemands. Cette publication est intéressante car il s’agit de déclarations d’étudiants allemands en cours de thèse de science dans le domaine de la psychologie : 207 ont… Continuer la lecture

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CNIL : les formalités pour les thèses de médecine… du courage les gars !

Je remercie Raymond Vilain qui m’a transmis les réponses à des questions que j’ai souvent de la part des internes qui font leur thèse. Je ne sais jamais bien répondre, mais il existe une page du site de la CNIL (Commission Nationale de l’Informatique et des Libertés). Pour les cas les plus fréquents, voici ce que dit la CNIL :… Continuer la lecture

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La qualité de la littérature n’augmente pas d’après Richard Lehman, qui a fait une rubrique hebdomadaire pendant 20 ans

Une interview de Richard Lehman dans un blog du BMJ contient un commentaires désabusé, mais probablement exact : La plupart des articles ne traitent pas encore de questions cliniques, et la qualité de la littérature ne s’est pas vraiment améliorée malgré tous les indicateurs, les alarmes et les alertes qui ont été ajoutés, en partie grâce aux exigences des revues…. Continuer la lecture

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Les Big Data à découvert : une lecture passionnnante

Sur les conseils d’un des auteurs, j’ai acheté un ouvrage publié par Cnrs Editions, et je n’ai pas été déçu. C’est un livre pour un public averti et pour les chercheurs en général, tant il ouvre l’esprit simplement sur des domaines divers de l’application des Big Data. L’ouvrage de mars 2017 a 350 pages avec le titre « Les Big Data… Continuer la lecture

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Une initiative originale : une formation pour apprendre à faire des recherches reproductibles… pour les vieux d’abord ?

Cet article, avec deus auteurs allemands, a été publié par PlOS Biology le 26 juillet 2018 avec le titre : « Digital open science—Teaching digital tools for reproducible and transparent research ». J’ai traduit le résumé pour nous inciter à mieux former les étudiants (et les vieux aussi) dans le domaine de la reproductibilité des données : Une caractéristique importante de la… Continuer la lecture

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Publier des études négatives, OUI… mais ne plus mettre en oeuvre des pratiques semble très difficile..

C’est un excellent éditorial de JAMA Pediatrics (23 juillet 2018) pour accompagner trois études négatives publiées dans le même numéro. L’éditorial présente les 3 études, et surtout pose la question de la « desimplementation » des pratiques. Publier les études négatives ou stériles devient plus commun.. mais ces publications des 3 essais randomisés contrôlés devraient permettre de changer des pratiques de sur… Continuer la lecture

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www.goodreports.org : un nouveau site pour aider les auteurs d’articles biomédicaux à remplir une ligne directrice

C’est un travail dérivé du site EQUATOR qui contient toutes les lignes directrices pour écrire des articles. Ce site d’accès gratuit s’appelle GoodReports et c’est une bonne idée. Il s’agit d’aider les auteurs pour choisir la bonne ligne directrice et ensuite de la remplir en ligne. Il ne reste plus qu’à télécharger le pdf à joindre à la soumission de… Continuer la lecture

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La plupart des recherches dans le domaine de la nutrition sont biaisées… voire fausses….

L’institut Swiss Re (compagnie d’assurance) et le BMJ ont organisé une conférence de 2 jours : Food for thought. The science and politics of nutrition. Excellente réunion et le programme était intéressant (je n’y étais pas). Les diapos et vidéos sont déjà en ligne et téléchageables. Il s’agit d’une bonne présentation de John Ioannidis faites par visioconférence le 14 juin… Continuer la lecture

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Trump a tué la NGC, National Guideline Clearinghouse. Le site US des recommandations en santé ferme le 16 juillet

Dans le domaine de la santé, nous avons l’habitude de rechercher des recommandations, et l’AHRQ (Agency for Healthcare Research and Quality) est l’agence d’évaluation américaine. En France, la HAS a des activités similaires à l’AHRQ, bien que les agences ne soient pas comparables. La AHRQ a publié de très nombreuses recommandations qui sont accessibles sur le site NGC. C’est STAT… Continuer la lecture

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Les fake news prennent l’ascenseur, les vérités l’escalier ! Félicitations au COMETS

Le comité d’éthique du Cnrs (COMETS) a publié un bon avis (2018-37, 12/04/18) intitulé « Quelles nouvelles responsabilités pour les chercheurs à l’heure des débats sur la post-vérité ? » Faut-il dire « informations fallacieuses » ou « infox « ? Il faut lire ce rapport 2 ou 3 fois pour bien intégrer nos responsabilités car nous devons nous engager pour La marche des… Continuer la lecture

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La santé des labos ! Les pratiques s’améliorent quand les référents intégrité ont le temps de faire de la prévention.. mais c’est encore rare

Bonne nouvelle qui nous vient d’Ecosse, et publiée dans Nature (16 mai 2018) : un témoignage d’une chercheuse employée depuis 2012 pour diffuser les bonnes pratiques de recherche. Il s’agit de l’un des 6 articles d’une série d’articles sur le thème « La Santé des labos ». « Cinq ans plus tard, nous n’avons pas eu de rétractation ou de problèmes sérieux avec… Continuer la lecture

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La lettre des orthopédistes (le BOF) consacrée à la rédaction médicale : bravo

En Avril 2018, le BOF (Bulletin des Orthopédistes Francophones), la lettre régulière adressée aux membres de la SOFCOT (Société Française de Chirurgie Orthopédique et Traumatologique) contenait un dossier sur la rédaction médicale. Merci pour m’avoir autorisé de le diffuser sur le blog. La lettre entière est consultable sur le site de la SOFCOT et aussi téléchargeable ici. La SOFCOT a… Continuer la lecture

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10 règles simples pour structurer vos articles :

Dans l’excellente série de PLOS Computational Biology, des américains ont proposé 10 règles dans un article intitulé « Ten simple rules for structuring papers ». Attention, il s’agit du formatage d’articles scientifiques en général, et tout ne colle pas avec le format IMRaD de la biomédecine. Les principes généraux : Concentrez votre article sur une contribution centrale, que vous communiquez dans le… Continuer la lecture

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Un bon poster pour une communication efficace : trop de posters mal faits… le premier poster date de 1969 !

Je fais régulièrement des formations sur comment soumettre un abstract pour un congrès et comment préparer votre poster : le manque de formation dans ce domaine fait que trop, beaucoup trop, de posters sont mal faits ! The FEBS Journal vient de publier (12 avril 2018) un article utile « How to design an aoutstanding poster ». Cet article est amusant, avec… Continuer la lecture

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Mieux évaluer les chercheurs en tuant le facteur d’impact et en orientant la recherche vers les attentes de la société ?

Gardons espoir après la lecture d’un superbe article de PLOS Biology de fin mars 2018. Je ne sais pas quelles seront les réponses aux 2 questions de mon titre… Le OUI n’est pas certain de gagner ! Le titre de cet article : « Assessing scientists for hiring, promotion, and tenure ». Les 6 auteurs sont prestigieux et d’origine diverses. Félicitons Florian… Continuer la lecture

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Bonnes pratiques pour les abstracts et présentation orales lors de congrès ou GP – CAP ! Abandonnez les ‘encore abstracts’

Bonne initiative d’un groupe qui propose des bonnes pratiques pour les abstracts de congrès et les présentations orales. Rien n’existe, et force est de constater que les pratiques des congrès ne sont pas homogènes. Il s’agit d’un preprint d’octobre 2017 sur PeerJ qui définit quelques termes avant d’aborder thèmes Les auteurs.. car c’est un peu la pagaille. D’abord, les congrès… Continuer la lecture

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Evaluation des impacts des formations de 2 jours à la rédaction scientifique : auto-satisfaction des formateurs !

C’est un article intéressant mais dont les critères de jugement ne sont pas les bons. Ces auteurs espagnols rapportent leur expérience d’enseignement de la rédaction médicale sur 10 ans, avec 27 formations de 2 jours pour plus de 700 chercheurs (médecine, pharmacie, biologie). Ils donnent le programme de l’atelier sur 2 jours : classique en focalisant sur l’article original et… Continuer la lecture

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Trois bons cas pour discuter avec les étudiants sur des problématiques d’auteurs, de conflits d’intérêts

Je remercie Valéry Ridde, Santé Publique, Montréal et IRD, France, qui m’a transmis ces trois courts articles de la Revue Canadienne de Bioéthique et publiés début 2018. C’est intéressant car ce sont 3 cas dans un cadre de recherche internationale avec des pays en voie de développement (mais c’est pareil entre 2 universités françaises). Les cas, anonymisés, ont été réécrits… Continuer la lecture

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Revues prédatrices : avertir les auteurs en proposant que toutes les spécialités s’engagent

Nous avons décrit hier un cas d’un article dans une revue prédatrice, avec surtout des collègues qui acceptent de témoigner. D’autres restent très discrets, voire ne veulent pas expliquer qu’ils se sont fait prendre, voire utilisent ces revues pour augmenter leur CV (ce n’est pas une hypothèse, car des chercheurs m’ont expliqué que cela permettait de faire vire en faisant… Continuer la lecture

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« 10 simple rules » pour écrire un livre : les règles sont simples mais écrire n’est pas simple !

Dans l’excellente série d’articles intitulés Ten simple rules publiés par PLOS Computational Biology, vient de paraître Ten simple rules for writing a popular science book. Publier pour une large audience est difficile pour un chercheur qui a l’habitude de publier des articles scientifiques… Voici les 10 règles proposées : Développer une expérience d’écriture… En bref écrire une première version presque… Continuer la lecture

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BRAVO avec la Charte éthique et déontologique des facs de médecine.. ça va souffler dans certaines facs !!!!

C’est une excellente nouvelle que la publication en fin d’année 2017 de la charte éthique et déontologique des facultés de médecine. Ce sont les doyens de médecine et odontologie qui ont signé.. C’est probablement une réponse aux différentes remarques, dont celles du Formindep. Cette charte est une excellente initiative, lisez-la… voire préparez une page de synthèse pour mettre sur les… Continuer la lecture

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Faut-il lutter contre la culture de la vitesse dans le milieu académique ? The Slow Professor propose des stratégies

Il faut effectivement lire deux fois ce court livre (90 pages) pour le goûter et prendre du plaisir. Le livre « The Slow Professor — Challenging the culture of speed in the Academy » est un grand succès en Amérique du Nord, avec un retirage et deux auteures surbookées… Maggie Berg est dans le département ‘English language and literature’ de la Queens… Continuer la lecture

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EQUATOR évolue bien : lignes directrices et un EQUATOR dédié à l’oncologie

EQUATOR est une excellent réseau avec un site très utile pour écrire des articles. Ce site est très méconnu parmi les participants aux formation à la rédaction. Le site compile 389 lignes directrices pour vous aider à écrire des articles. Sur la page de garde du site, il y a 11 lignes directrices mises en valeur car ce sont celles… Continuer la lecture

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« Prise en charge défectueuse d’une lésionnelles » : droit de réponse de l’avocat qui conseille le rédacteur en chef ayant accepté un article d’une auteure proche

Le 2 octobre 2017 sur ce blog, j’ai publié un billet commentant un article de la revue Déontologie, Droit & Soin ayant pour titre « Prise en charge défectueuse d’une lésionnelles ». Je me suis permis de penser qu’il s’agissait d’un article de complaisance, et je vous laisse juger. L’auteure est Mme Khady Badiane Devers. Un bon commentaire avait été justement ajouté… Continuer la lecture

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Que recommandent des statisticiens influents pour sortir de la crise des statistiques ? Pas seulement de changer le seuil de la valeur de P

Nature de fin novembre 2017 a demandé les avis de 5 statisticiens sur le bon emploi des stats dans les articles : « Five ways to fix statistics » avec un sous-titre « Alors que le débat gronde sur la question de savoir comment et dans quelle mesure les mauvaises statistiques sont responsables d’une mauvaise reproductibilité, Nature a demandé aux statisticiens influents de… Continuer la lecture

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Des conseils excellents pour mieux écrire vos articles de recherche par des experts renommés

Presque simultanément deux articles ont été publiés par de bons rédacteurs pour donner des conseils de rédaction aux auteurs : l’un dans Anesthesia & Analgesia par l’ancien rédacteur en chef, et l’autre dans Journal of Public Health and Emergency par un statisticien reconnu parmi les medical writers; Writing Research Reports par D Sessler et S Shafer dans Anesthesia & Analgesia… Continuer la lecture

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Des conseils excellents pour mieux écrire vos articles de recherche par des experts renommés

Presque simultanément deux articles ont été publiés par de bons rédacteurs pour donner des conseils de rédaction aux auteurs : l’un dans Anesthesia & Analgesia par l’ancien rédacteur en chef, et l’autre dans Journal of Public Health and Emergency par un statisticien reconnu parmi les medical writers; Writing Research Reports par D Sessler et S Shafer dans Anesthesia & Analgesia… Continuer la lecture

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Peer-review à l’heure de la science ouverte : venez en discuter à Bordeaux le mardi 27 mars 2018

Félicitons l’URFIST de Bordeaux pour l’organisation d’une journée d’échanges sur un sujet mal exploré. Le programme est en ligne sur le site de l’URFIST. URFIST veux dire Unité Régionale de Formation à l’Information Scientifique et Technique. La carte ci-dessous localise les URFIST en France. Pensez-vous que le peer-review soit utile ? Il est accusé de tous les maux, mais aucun… Continuer la lecture

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Améliorer le peer review : conseils pour auteurs, relecteurs et rédacteurs dans AJHP

The American Journal of Hospital Pharmacy (AJHP) a publié 3 articles (accès libre) et un éditorial bien documentés. Les auteurs ont une bonne expérience. Je vais les utiliser pour des présentations sur le peer review. Les références citées sont bien choisies (ce qui devient rare). L’éditorial signé par Guy R. Hasegawa qui a été rédacteur de AJHP pendant 3 décennies… Continuer la lecture

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Merveilleux : les preprints doivent être listés sur vos CV… Ce sont une forme reconnue de publication

C’est une déclaration qui me plait, qui est innovante, mais qui cache probablement des résistances au changement de nos dirigeants…. Si toutes les institutions signataires, et tous leurs chercheurs suivaient ce mouvement, la France serait proche des bonnes pratiques internationales. Nous avons déjà expliqué ce que sont les preprints… avec la déclaration de ASAPBio. En résumé, vous déposez sur un… Continuer la lecture

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Bravo pour l’enquête française sur « Difficultés des Auteurs à la Publication d’Articles Médicaux »

J’ai été heureux de lire dans BMC Medical Research Methodology en juillet 2017 une enquête ayant eu 1191 réponses sur 7766 praticiens contactés par email à l’AP-HP. Vous aurez dans l’article toutes les caractéristiques des répondeurs. J’ai essayé de traduire une partie des résultats du résumé : 94 % des répondeurs avaient publié au moins un article au cours des… Continuer la lecture

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14 compétences indispensables pour être rédacteur ont été proposées par un panel de rédacteurs

Nous avons évoqué la préparation d’une liste des compétences des rédacteurs, avec notamment un meeting lors du congrès de EASE à Strasbourg en juin 2017. L’article vient d’être publié dans BMC Medicine (11 septembre 2017) avec le titre : « Core competencies for scientific editors of biomedical journals: consensus statement ». Il y a 30 auteurs, et toutes les sociétés savantes de… Continuer la lecture

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