Archives de catégorie : Apprentissage

Ig Nobel 2019 : prix de médecine pour les pizzas italiennes ; hommage à J Chirac, prix IgNobel de la paix en1996

J’ai visionné la remise des prix Ig Nobel à Harvard le 12 septembre 2019. C’est un plaisir, même si la vidéo dure près de 1 h 30 min. Il y a les traditionnels lancers d’avions en papier et plein d’intermèdes drôles. Ceux qui parlent trop sont coupés par une fille de 8 ans qui vient leur crier : « PLEASE STOP,… Continuer la lecture

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Responsabilité sociale en santé : Rencontres, récits d’étudiants en médecine à Lyon-Est, BRAVO

Hier, j’ai présenté le dictionnaire francophone de la responsabilité sociale en santé : ce sont des concepts importants qui doivent être enseignés. Fin août, depuis 2001 (je ne suis pas allé à tous les congrès), je participe au congrès de l’AMEE (Association for Medical Education in Europe). L’an dernier, c’était à Bâle, et cette année à Vienne (Autriche). Il y… Continuer la lecture

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Responsabilité sociale en santé : un dictionnaire bienvenu qui doit être en vue dans les bureaux des doyens

Je ne regrette pas les plus de trois heures au soleil consacrées à parcourir ce dictionnaire. Il est facile à parcourir, bien fait et utile. Il s’agit de 134 entrées et chaque contribution est de 2 à 5 pages (près de 600 pages au total). Il résulte de la collaboration de plus de 70 auteurs francophones de 17 pays (Belgique,… Continuer la lecture

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Registered reports adopté par 200 revues : un bilan (66 % ne supportent pas l’hypothèse initiale) et de bonnes réflexions

Nous avons présenté plusieurs fois le modèle de publication appelé ‘Registered Reports’ ou ‘RRs’. En 2019, les RRs sont proposés par environ 200 revues, ayant été initié dans le domaine de la psychologie en 2013. Dans Nature, en septembre 2019, Chris Chambers qui a été l’un des acteurs de ce mouvement, qui préside des comités ‘RRs’ pour plusieurs revues apportent… Continuer la lecture

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Courte synthèse sur la rédaction d’un article IMRaD : le minimum pour vos étudiants, et I AM pour répondre aux revues

Même le minimum, c’est déjà difficile : si vous connaissez IMRaD, adoptez I AM. La synthèse en 9 pages faite par des chercheurs de Nouvelle Zélande, Suède et Thaïlande est utile.. La collaboration améliore toujours les articles. Je ne connais pas cette revue de chez SAGE : The International Journal of Lower Extremity Wounds qui a mis en ligne cet… Continuer la lecture

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Biais en médecine par John Oliver !!

Vous connaissez probablement les émissions de télévision humoristiques de John Oliver. L’émission du 23 août 2019 était sur les biais en médecine. Ces émissions sont très bien documentées, avec des références à des articles scientifiques. Elles sont suivies sur YouTube (5 millions de vues en 10 jours et 15 000 commentaires). Il commence par des exemples sur les différences entre… Continuer la lecture

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Quatre croyances erronées qui font obstacle à des recherches plus fiables

C’est le titre d’un excellent article dans eLife de 11 pages (début août 2019) signé par 3 chercheurs, M Yarborough (Sacramento, Californie), R Nadon (MacGill, Montréal), et DG Carlin, chercheur indépendant basé à Marseille ! Cet article part de constats alarmants et anciens (Altman en 1994 sur le scandale de la mauvaise recherche dans le BMJ, et un livre que… Continuer la lecture

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Pourquoi participer à un comité de rédaction d’une revue scientifique ?

Propos court dans Nature (career column) le 7 août 2019 sur les bénéfices d’être membre d’un comité de rédaction. Le titre est clair : Why you should join a journal’s editorial board. L’auteur est une mathématicienne qui donne des conseils à un jeune chercheur. Ces conseils s’appliquent probablement à toutes les disciplines : Identifier une ou deux revues qui vous… Continuer la lecture

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Le processus d’examen par les pairs est sans aucun doute l’élément vital de l’édition scientifique : formons les jeunes chercheurs

J’ai, comme titre de ce billet, traduit la première phrase d’ un article paru fin juillet 2019 dans Cardiovascular research. L’objectif de l’article est de donner quelques conseils pour que les jeunes chercheurs puissent relire et critiquer des manuscrits soumis à des revues scientifiques. Quelques soient les très nombreuses critiques du peer-review, nous n’avons pas de meilleure méthode ! Des… Continuer la lecture

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Bravo CAEN pour le Code & Comité de déontovigilance UFR Santé / Université / CHU

Il me semble que c’est une initiative unique et innovante à Caen : Un code et comité de déontovigilance avec 3 parties (UFR santé, Université, CHU). Dans le cadre du développement de l’intégrité scientifique en France, certains chercheurs n’ont aucune instance à laquelle se référer en cas de méconduite, de manquements divers aux pratiques professionnelles. Par exemple les personnels des… Continuer la lecture

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La citation de seconde main compromet fortement la qualité des articles… notamment par la non recherche des sources originales

Cet article a essayé d’analyser les comportements des auteurs quand ils sélectionnent les références à citer dans leurs articles. Ce travail(accès libre) a été fait par des chercheurs hollandais, et publié début 2019. Ils ont exploré un sujet difficile, à savoir comment les auteurs choisissent les articles cités en références dans les manuscrits qu »ils écrivent… Difficile. Ils ont fait un… Continuer la lecture

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Bonnes pratiques pour les abstract de congrès (posters et communications orales)

En mars 2018, j’ai présenté un preprint sur les abstracts de congrès. Le preprint était du 19 octobre 2017 sur PeerJ, et des commentaires ont été faits. Le preprint était une première version ouverte aux commentaires. Un lien a été ajouté au niveau du preprint de PeerJ pour citer l’article publié. Un article a été publié le 5 juin 2019… Continuer la lecture

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Bonnes pratiques pour les abstract de congrès (posters et communications orales)

En mars 2018, j’ai présenté un preprint sur les abstracts de congrès. Le preprint était du 19 octobre 2017 sur PeerJ, et des commentaires ont été faits. Le preprint était une première version ouverte aux commentaires. Un lien a été ajouté au niveau du preprint de PeerJ pour citer l’article publié. Un article a été publié le 5 juin 2019… Continuer la lecture

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Commencer

Je ne sais pas par où commencer. Je veux simplement l’écrire, coucher ces impressions multiples en un simple récit, pour ne pas oublier. Pour relire un jour, à tête reposée, à cœur écœuré ou l’humeur triste et blasée, ces premiers … Lire la suite… Continuer la lecture

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Livre blanc de SpringerNature sur le partage des données : cinq recommandations simples

Ce rapport de 24 pages a été préparé par cinq collaborateurs du groupe SpringerNature (accès libre). Ils sont basés en Angleterre, et ont une connaissance d’autres pratiques que celle des revues du groupe (F1000, BMC avant son rachat par Springer). Ils ont différentes positions dans le groupe. Ils ont repris des enquêtes auprès d’environ 11 000 chercheurs, y compris une… Continuer la lecture

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SANRA : un outil simple pour évaluer les revues narratives de la littérature

La première mise en évidence de la piètre qualité des revues de la littérature a été l’article de C Mulrow publié par les Annals of Internal Medicine : The medical review article : state of the science. Cet article de 1987 est toujours d’actualité et mérite d’être lu. Elle montrait que les méthodes pour faire une revue de la littérature… Continuer la lecture

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La règle des cinq pour un CV : 5 articles des 5 dernières années que les jurys lisent (lire est mieux que compter des haricots)

Lire est très impopulaire quand on dispose d’indicateurs permettant de comparer… sauf que ces indicateurs n’ont jamais été conçus pour comparer des candidats ou allouer des ressources. Il y a des groupes vertueux qui commencent à changer les comportements des chercheurs, mais cela semble difficile. L’objectif est de remplacer la quantité par la qualité ! Dans Nature du 21 février… Continuer la lecture

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La revue ‘Written Communication’ a un numéro spécial ‘Writing and Science’

Le groupe SAGE publie une revue qui s’appelle Written Communication (WC). Elle a un facteur d’impact de 1,3. En décembre 2018, WC a publié un numéro spécial « Writing and Science » avec un éditorial et 6 articles. L’éditorial présente les 6 articles ; il est signé par le rédacteur en chef. Voici les 6 articles originaux (recherches qualitatives), et chaque article… Continuer la lecture

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800 chercheurs ont signé une déclaration sur la signification statistique qui ne sert à rien : intervalle de compatibilité doit remplacer intervalle de confiance.. le débat est ouvert

Il n’ s’agit pas de bannir les valeurs de P des articles, mais de devenir un peu plus raisonnable. Il faut abandonner cette frontière de 0,05. En quelques jours 800 chercheurs de 50 pays ont signé une sorte de ‘pétition’, dont des chercheurs français (vous l’annexe de l’article). Nous avons souvent abordé la problématique des très mauvaises statistiques dans les… Continuer la lecture

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10 règles simples pour éviter les conflits entre collègues

La plupart des interactions et communications entre collègues sont cordiales et se passent très bien. Dans quelques cas existent des conflits qui peuvent pourrir tout un laboratoire / département /service… Il s’agit de vues différentes, d’interprétations divergentes, voire d’un mauvais jour. Des conflits peuvent durer des années ! Dans la série « 10 simple rules » de PLOS computational biology (18 janvier… Continuer la lecture

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Vous n’écrivez pas un article scientifique pour des lecteurs : écrivez pour les reviewers et le rédacteur en chef

Dans le livre sur la publication pour les revues de psychologie analysé le 14 février 2019, le chapitre « Writing for your referees », par RS Sternberg, est bien fait. Il reprend un message que je répète toujours lors des formations : pour qui écrivez-vous ? La plupart des chercheurs répondent pour des collègues, pour d’autres chercheurs qui connaissent mal… Continuer la lecture

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Gérer les demandes des auteurs d’article nécessite prudence et tact : quand ne pas publier un article accepté ?

Voici une demande récente reçue par une revue scientifique aux USA : “I have an urgent request regarding a forthcoming publication. I have to take my affiliation off the paper. The paper is in the process of being published. Unfortunately, last week, I learned that my employer [private consulting firm] wants me to remove my affiliation information from the paper…. Continuer la lecture

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Médecin de passage, le témoignage d’un gilet jaune de la recherche biomédicale : salut l’artiste Ménard

J’ai lu avec plaisir un livre écrit par Joël Ménard « Médecin de passage ». Connaissant l’auteur, j’ai apprécié certains chapitres, et j’ai découvert une grande érudition littéraire et cinématographique, avec des dialogues imaginés avec deux auteurs : Archibald Cronin (médecin écossais) et David Lodge (écrivain anglais). L’auteur se demande s’il ne s’agit pas de Archibald Ménard ou Joël Cronin. C’est un… Continuer la lecture

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La rédaction des articles en psychologie.. différente de la biomédecine, mais plein de messages utiles

J’ai l’habitude de lire des livres de rédaction dans des disciplines qui ont des règles différentes. Si nos articles biomédicaux sont standardisés, avec 3 500 mots, 30 références, une introduction courte, les articles en psychologie ont des règles différentes. Le deuxième édition, datée 2019, de l’ouvrage ci-contre est intéressante. C’est un livre multi-auteurs, avec des auteurs prestigieux, et il est… Continuer la lecture

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La communication scientifique dans une société de post-vérité : vous devez avoir des stratégies pour lutter contre les campagnes de désinformation

Je propose ci-dessous la traduction d’un résumé de l’article intitulé : « Scientific communication in a post-truth society » Cet article a été publié dans PNAS en octobre 2018, et il mérite réflexion. Cet article reprend une des communications lors du colloque Arthur M. Sackler de la National Academy of Sciences, “The Science of Science Communication III,” en Novembre 2017, à Washington,… Continuer la lecture

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Pour augmenter l’impact de vos publications, écrivez mieux ! Est-ce vrai ?

C’est le message d’un article moyen de la prestigieuse revue PNAS (8 janvier 2019), avec pour titre : How we can boost the impact of publications? Try better writing. La qualité méthodologique du travail ne permet pas d’être convaincu par cet article… des facteurs de confusion peuvent exister. Donc prudence. Auteurs australiens. Déjà 1268 tweets le 29 janvier pour un… Continuer la lecture

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POLETHIS : Conseil pour l’éthique de la recherche et l’intégrité scientifique de l’Université Paris-Saclay

L’Université Paris-Saclay vient de diffuser le numéro 1 de Poléthis, et vous pouvez télécharger ce document de 36 pages ici. Je remercie Emmanuel Hirsch qui m’a autorisé d’héberger ce document sur le blog. C’est bien fait, et je en sais pas si d’autres universités ont un si bon document pour sensibiliser les personnels sur l’éthique et l’intégrité. Le sommaire est… Continuer la lecture

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Les leaders d’opinions n’aiment pas reconnaître qu’un essai a foiré : ils ont des critiques stéréotypées montrant que la conception était erronée

Cet article du BMJ de Noël 2018 est d’un humour grinçant. Voici un paragraphe du début : ‘Lorsqu’on demande aux principaux leaders d’opinion de commenter les résultats décevants d’un essai clinique dans des reportages ou lors de conférences, nous avons observé qu’ils semblent curieusement incapables de reconnaître que le traitement ne fonctionne pas. Ils préfèrent soutenir que la conception de… Continuer la lecture

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Faut-il utiliser des emoji dans les articles biomédicaux ?

Un article du BMJ de Noël 2018 appelle les scientifiques à illustrer leurs articles avec des emoji (pas de s au pluriel semble-t-il). Emoji (ou pictogramme) est un terme d’origine japonaise et les auteurs le définisse ainsi : « Emoji are single character images conveying stylised facial expressions, objects, animals, flags/signs, weather patterns, and activities. » Il en existe près de 2000… Continuer la lecture

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Pratiques du golf aux USA : les chirurgiens vasculaire, thoracique et orthopédique sont les meilleurs

Nous avons présenté le numéro de Noël du BMJ le 28 décembre 2018 avec 6 sections très documentées. Un des articles de ce numéro a pour titre « Golf habits among physicians and surgeons: observational cohort study’. C’est une étude venant de Boston sur les caractéristiques de près de 42 000 médecins golfeurs américains. Voici le résumé de l’article : « Parmi… Continuer la lecture

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Le numéro de Noël du BMJ : un régal en vacances avec de l’humour et du sérieux

Le numéro de Noël du BMJ est toujours un plaisir et je vous suggère de prendre connaissance du sommaire (14 December 2018; vol 363, issue 8180). Des articles ont été commentés sur les réseaux sociaux (Twitter, Facebook), mais je ne crois pas qu’ils aient été réellement lus… C’est une succession d’articles divers, dont certains se veulent humoristiques, et d’autres un… Continuer la lecture

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L’intégrité scientifique va mal (5/6) en France avec les cas Jessus, Peyroche : pourquoi 503 zozos défendent des pratiques douteuses ? Passions, intérêts ?

C’est le 5ème billet expliquant que l’intégrité scientifique est malmenée en France. Je reviens sur le cas de C Jessus qui est consternant car le premier rapport d’un comité d’investigation était du niveau de l’école maternelle… Je ne détaille pas tous les aspects de ce cas ayant même conduit la communauté scientifique à mal se comporter vis-à-vis de bons journalistes… Continuer la lecture

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L’intégrité scientifique va mal (4/6) : en France avec les cas Jessus, Peyroche : pourquoi des zozos tirent sur les ambulances ?

Le cas de C Jessus a été évoqué sur ce blog, dans un billet du 28 mai 2018. Sur la base de RetractionWatch, il y a 6 items (12 décembre 2018). Il a montré l’incompétence d’une pseudo-commission d’enquête, et des réactions inadmissibles d’un groupe de St Just de la Science. Je vous suggère de relire le premier rapport d’enquête et… Continuer la lecture

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Les oies dorées de la HAS ne connaissent pas les bonnes pratiques de publication : disparition des recos ‘Dyslipidémies’ ! Les Archives des Maladies du Coeur devraient rétracter leur article

Assez inhabituel de la part de la HAS, mais BRAVO : les recommandations sur les dyslipidémies ont été abrogées selon un communiqué de presse du 22 novembre 2018. Cette décision a été poussée par un recours devant le Conseil d’État de l’association Formindep. Des conflits d’intérêts n’ont pas été gérés correctement. La HAS n’a semble-t-il pas pris la peine de… Continuer la lecture

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Savoir écrire une question de recherche, et vous pourrez l’apprendre à votre directeur de thèse !

Je suis souvent surpris par la méconnaissance des thésards quant à la rédaction de leur questions de recherche. Je suis encore plus surpris quand le thésard de médecine me dit qu’après 3 rendez-vous avec son directeur de thèse, la question de recherche n’est pas décidée !! Les thésards ayant eu une formation d’analyse de la littérature (que certains appellent LCA)… Continuer la lecture

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La recherche dite ‘hélicoptère’ ne peut pas durer.. mais comment faire ?

C’est un rapport américain, des National Academies of Sciences, Engineering, Medicine, qui m’a fait découvrir cette problématique. Pour moi, la recherche ‘hélicoptère’ se limitait à ces médecins allant en Afrique prendre des données pour les publier dans de bonnes revues sans les noms des travailleurs de terrain, etc… Eh bien, c’est plus large d’après ce rapport de 335 pages, dont… Continuer la lecture

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La recherche dite ‘hélicoptère’ ne peut pas durer.. mais comment faire ?

C’est un rapport américain, des National Academies of Sciences, Engineering, Medicine, qui m’a fait découvrir cette problématique. Pour moi, la recherche ‘hélicoptère’ se limitait à ces médecins allant en Afrique prendre des données pour les publier dans de bonnes revues sans les noms des travailleurs de terrain, etc… Eh bien, c’est plus large d’après ce rapport de 335 pages, dont… Continuer la lecture

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Conseils pour écrire un article original selon le plan IMRaD… sans confondre style scientifique et littéraire

Il s’agit de deux articles simples et courts, le premier pour aider à rédiger un article original. Le second article est sur le style en rédaction scientifique. Il ont été écrits par des urologues de Barcelone dans la revue Actas Urológicas Españolas (English Edition) et ont été publiés en octobre 2018. Ils sont en espagnol et en anglais. Le fin… Continuer la lecture

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Conseils pour écrire un article original selon le plan IMRaD… sans confondre style scientifique et littéraire

Il s’agit de deux articles simples et courts, le premier pour aider à rédiger un article original. Le second article est sur le style en rédaction scientifique. Il ont été écrits par des urologues de Barcelone dans la revue Actas Urológicas Españolas (English Edition) et ont été publiés en octobre 2018. Ils sont en espagnol et en anglais. Le fin… Continuer la lecture

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La recherche en cardiologie ouvre-t-elle la voie au partage des données, comparativement à d’autres spécialités médicales ?

Le partage des données en médecine accuse un retard par rapport à d’autres disciplines scientifiques. Le partage des données de recherche anonymisées au niveau des patients offre d’immenses possibilités à tous les intervenants qui participent à la recherche. Dans un article du JACC de fin 2017, l’équipe de cardiologie de l’École de médecine de Yale a décrit les efforts déployés… Continuer la lecture

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