Systémique médicale
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Archives de catégorie : Animal
Covid-19 : le variant Omicron aurait émergé chez la souris, selon une étude
Le variant Omicron apparaît mieux équipé pour reconnaître le récepteur cellulaire ACE2 de la souris que celui de l’homme, rapportent des chercheurs américains dans une étude publiée le 18 octobre 2022 dans les Comptes rendus de l’Académie américaine des sciences (PNAS). On rappelle que le coronavirus SARS-CoV-2 se fixe par l’intermédiaire de la région RBD …
Publié dans Animal, animal de compagnie, coronavirus, COVID-19, médecine vétérinaire, nouveaux variants, Omicron, one health, protéine spike, rat, RBD, RBM, récepteur ACE2, receptor binding domain, receptor binding motif, réservoir animal, rongeur, rongeurs, rongeurs domestiques, SARS-CoV-2, souris, variant, Virologie
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Covid-19 : des rats domestiques contaminés par leur propriétaire infecté par le SARS-CoV-2
Deux rats domestiques ont été contaminés par le variant Omicron du SARS-CoV-2 à partir d’une personne infectée, rapportent des chercheurs français dans un article paru le 13 octobre 2022 sur le site de prépublication bioRxiv. L’un des rongeurs a développé des symptômes sévères. Ces résultats sont présentés par Xavier Montagutelli, Bérénice Decaudin, Étienne Simon-Lorière et …
Publié dans Animal, animal de compagnie, coronavirus, COVID-19, eaux usées, lignages cryptiques, médecine vétérinaire, nouveaux variants, Omicron, one health, rat, rat domestique, réservoir secondaire, rongeur, rongeurs domestiques, SARS-CoV-2, souris, spectre d’hôte, variant, Virologie, zoologie
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10 % d’erreurs de citations dans 1200 articles de revues chirurgicales prestigieuses
Il s’agit d’une lettre de 2 pages dans JAMA Surgery d’août 2021 (mise en ligne en mai), mais d’un travail énorme et de qualité. Les auteurs (Stanford, Californie) rappellent, avec de bonnes citations, qu’il est admis que d… Continuer la lecture
L’éthique des recherches animales bafouée dans certaines publications : propositions des NIH
Le blog Science Intergity Digest (E Bik) présente des exemples de ce qu’il ne faut pas faire aux animaux, à partir de publications. Le billet du 7 mai est consacré aux grandes tumeurs des souris. C’est un billet très détaillé avec des liste… Continuer la lecture
Publié dans Animal, Méthodologies, recherche, Recommandations
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Rigidité cadavérique (4/10) : trompés par des souris
Suite au billet du 19 août 2019 « Quatre croyances erronées qui font obstacle à des recherches plus fiables », j’ai proposé d’analyser ce livre de Richard Harris, journaliste scientifique qui vit à Washington. Ce livre revient sur des histoires connues, en ajoutant la touche du journaliste d’investigation qui raconte les coulisses de certaines publications. Le chapitre 4 continue avec des tromperies… Continuer la lecture
Publié dans Animal, Gaspillage, Grand public, Histoire, livres
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Leptospirose : la maladie
La leptospirose se contracte au contact d’eau ou de boues souillées par des urines d’animaux domestiques ou sauvages affectés par la maladie. On en dénombre environ 600 cas par an en France. Un tiers des cas de leptospirose touche des profe… Continuer la lecture
Publié dans Animal, bactérie, boeuf, cheval, conjonctives, contact, contamination, daignostic, foie, homme, indemnisable, interrogans, leptospira, Leptospire, leptospirose, maladie, nez, peau, professionnelle, reins, Risques infectieux, rongeurs, sérologie, spirochètes, tableau, urine
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50 $ par article cité pour augmenter le facteur d’impact d’une revue : business chinois ou mondial ?
Tout est possible dans le domaine des manipulations du facteur d’impact, mais je n’avais pas imaginé l’exemple ci-dessous. Je dois remercier particulièrement Mme Isabelle Ortigues-Marty, rédactrice en chef de la revue Animal, pour la transmission de l’email copié ci-dessous. Lisez tranquillement, c’est édifiant : en Chine, le business ‘Citing for Money’ est simple : payer des auteurs (50 $) pour… Continuer la lecture
Publié dans Animal, Citations, Facteur d'impact
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EASE 2018 : SAGER pas assez connus des rédacteurs de revues, sexe et genre devraient toujours être précisés dans la recherche
Ces recommandations ont été initiées par European Association of Science Editors (EASE) en2012, publiées en mai 2016, et je les ai présentées en septembre 2106. Nous avons commenté un article du JAMA utilisant correctement ces concepts. Le site de EASE a une section dédiée avec toutes les informations utiles (image). Devinez : leur mise en oeuvre n’est pas satisfaisante. La… Continuer la lecture
Publié dans Animal, Ethique, Méthodologie de recherche
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89 % des études animales citées dans des brochures investigateurs pour les essais chez l’homme ne sont jamais publiées !
Si vous pensez que la recherche clinique a des problèmes, regardez la recherche animale ! Cet article de PLOS Biology (5 avril 2018), intitulé « Preclinical efficacy studies in investigator brochures: Do they enable risk–benefit assessment? » ne nous étonne pas… mais devrait nous inquiéter. La plupart des essais cliniques chez l’homme seraient basés sur des recherches animales insuffisantes (non publiés, omission… Continuer la lecture
Publié dans Animal, Biais, Gaspillage, Méthodologie de recherche
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Nouveau site pour New England J Medicine : bravo… Nous lirons bientôt les articles avec les oreilles sur un smartphone
La compétition des revues est aussi technologique et, après d’autres, le New England Journal of Medicine a lancé un site internet avec une navigation plus fluide. A première vue, c’est pas mal… Le NEJM utilise une plateforme, Atypon, qui a été adoptée par d’autres revues… comme celles de ACS (American Chemical Society), de l’ATS (American Thoracic Society), des groupes Elsevier… Continuer la lecture
Publié dans Animal
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La recherche animale doit s’améliorer : la recherche préclinique se trompe encore, et des malades sont inclus dans des essais !
Le numéro du 11 janvier 2018 du BMJ contient 4 articles sur la recherche animale. Très longue histoire qui mérite de lire tous les articles. Il s’agit d’un domaine compliqué, le développement d’un vaccin pour la tuberculose. Un éditorial de F Godlee, basé sur les autres articles du numéro : ‘Nous avons besoin d’une meilleure recherche animale, mieux décrite’ ;… Continuer la lecture
Publié dans Animal, Gaspillage, Méthodologie de recherche, Reproductibilité, Résultats négatifs
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Après 35 ans, une revue corrige un article écrit sous le pseudonyme d’un chat… des co-auteurs animaux existent dans la littérature
C’est une histoire révélée par RetractionWatch le 1 août 2017. En 1982, un auteur, David Lewis, a publEnregistrerié une lettre à propos d’un article qu’il avait écrit. Mais cette lettre (Australasian Journal of Philosophy) était signée Bruce Le Catt… La correction a été publiée le 24 juillet 2017 : « The Australasian Association of Philosophy would like to clarify that ‘Bruce… Continuer la lecture
Après 35 ans, une revue corrige un article écrit sous le pseudonyme d’un chat… des co-auteurs animaux existent dans la littérature
C’est une histoire révélée par RetractionWatch le 1 août 2017. En 1982, un auteur, David Lewis, a publEnregistrerié une lettre à propos d’un article qu’il avait écrit. Mais cette lettre (Australasian Journal of Philosophy) était signée Bruce Le Catt… La correction a été publiée le 24 juillet 2017 : « The Australasian Association of Philosophy would like to clarify that ‘Bruce… Continuer la lecture
DOAB : comme le DOAJ mais pour les livres en Open Access
Je ne connaissais pas le DOAB pour Directory of Open Access Books. Est-ce utile ? Oui si les livres prédateurs ne sont pas listés dans ce registre…. Il y a des infos en français sur le site pour expliquer le projet : L’objectif principal du DOAB est d’accroître la visibilité des livres en libre accès. Les éditeurs de livres universitaires… Continuer la lecture
Publié dans Animal, livres, Open access, Recherche documentaire
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Des registres d’études animales devraient être créés : pourquoi ? comment ? Il faut totalement revoir la recherche animale
Les registres de protocoles (avec dépôt ultérieur des résultats) en médecine clinique sont devenus obligatoires pour publier une recherche. Ces registres sont utilisés dans d’autres domaines, par exemple pour les revues systématiques. Le dépôt d’un protocole avant la recherche est une mesure pour s’assurer de l’intégrité de la recherche. Si des analyses non prévues au protocole sont faites à posteriori,… Continuer la lecture
Publié dans Animal, Méthodologie de recherche
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PCR (Publish, Cite, Reward) : une société propose de 100 à 3000 $ (selon facteur d’impact) si vous citez ses produits dans vos articles
C’est le blog Retraction Watch (14 août 2015) qui nous a informé d’une stratégie nouvelle par une société américaine Cyagen. Cyagen est une société basée en Californie et en Chine, fondée en 2005 avec 200 employés en 2015, et qui fournit des animaux, des cellules, des vecteurs DNA, des milieux de culture et autres produits de laboratoire. Cette société a… Continuer la lecture
Publié dans Animal, Biais, conflits d'intérêts
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Fulgurance baudelairienne
Certaines personnes adorent/idolâtrent leur animal de compagnie. Elles en viennent à préférer la compagnie du chien ou du chat à celle de leurs congénères. Cette passion de l’animal, contrairement au lieu commun qui voudrait que l’amoureux de la bête soit … Continuer la lecture → Continuer la lecture
Publié dans Animal, baudelaire, enfant, littérature, veuves
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Enfin, des standards pour s’assurer de la reproductibilité de la recherche préclinique
La non reproductibilité est un domaine pour lequel il existe des données factuelles en recherche fondamentale et recherche animale. Nous avons vu que la recherche animale faite sur 10 souris dont 3 se sont échappées donnait lieu à des communiqués de presse divers… qui ont déjà guéri le cancer, l’Alzheimer et autres maladies… il ne reste plus qu’à ….! Le… Continuer la lecture
Publié dans Animal, Méthodologie de recherche
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Affaire OGM Séralini : la revue Food and Chemical Toxicology n’est pas claire… mais publie une bonne défense de Séralini
Nous avons évoqué cet article rétracté par FCT (Food and Chemical Toxicology) sur des arguments discutables pour une rétractation. Il s’agit des études sur la toxicologie des OGM. Rendons hommage à la revue FCT et à G Séralini pour la publication d’une lettre à la rédaction en juillet 2014, et en Open access. La revue accepte de publier les arguments… Continuer la lecture
Publié dans Animal, Rétractation
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Une chienne nommée Galadriel Mirkwood a publié un article dans une revue scientifique prestigieuse
Etrange histoire que je ne connaissais pas ! Je félicite Thierry Schaeverbeke (Bordeaux) pour avoir simplement décrit la carrière scientifique de Polly Matzinger, immunologiste américaine ayant une personnalité atypique. Tout est bien décrit dans le numéro de novembre 2012 de la revue Rhumatos. Un des articles de P Matzinger (née en France) a été publié dans Journal of Experimental Medicine… Continuer la lecture
Publié dans Animal, Critères d'auteurs, Histoire, Humour
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Séralini / OGM : pauvre science ! Revues bafouées pour défendre des egos ? La reproductibilité de la science inutile ?
Nous n’avons jamais vu ce type de manipulation digne de salles de garde ! Le titre « Republished study ». Nous avions évoqué ces lobbies anti-OGM en décembre 2013 et la rétractation troublante, avec les nombreux conflits d’intérêts… En fait l’équipe Séralini, au lieu de défendre la bonne science, en répliquant CORRECTEMENT une expérimentation, a préféré trouver une revue complaisante qui a… Continuer la lecture
Publié dans Animal, Mauvais articles, Rétractation
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