Archives de catégorie : analyse phylogénétique

Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le nouveau variant Omicron (B.1.1.529)

Après le variant Delta (ex-variant B.1.1.7 dit britannique), le variant Beta (ex-variant sud-africain B.1.351), le variant Gamma (ex-variant P.1 dit brésilien), c’est donc au tour d’un autre variant du SARS-CoV-2, dénommé Omicron (ou variant B.1.1.519), de faire les gros titres de la presse internationale et d’occuper le devant de la scène sur les chaînes d’info …

Continuer la lecture

Publié dans Afrique australe, afrique du sud, analyse phylogénétique, B.1.1.529, Botswana, cas clinique, constellation de mutations, coronavirus, COVID-19, délétion, Divers, domaine amino-terminal, domaine de liaison au récepteur, domaine N-terminal, échappement immunitaire, épidémiologie, épitopes, évolution intra-hôte, évolution virale accélérée, gestes barrières, immunodéprimés, Immunologie, immunosuppression, infection prolongée par le SARS-CoV-2, insertion, MESURES BARRIERES, mesures non pharmaceutiques, NTD, Omicron, pateints immunodéprimés, PCR, profil mutationnel, protéine S, protéine spike, pseudovirus, RBD, SARS-CoV-2, séquençage génomique, spicule, variant, Variant Of Concern, variant préoccupant, vih, Virologie, virus du sida, VOC | Commentaires fermés sur Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le nouveau variant Omicron (B.1.1.529)

Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1

Au Brésil, l’épidémie de Covid-19 est aujourd’hui dominée par plusieurs lignées virales SARS-CoV-2 qui ont toutes en commun de posséder la mutation E484K dans la protéine S (spike ou spicule), qui permet au virus de se fixer sur les cellules qu’ils infectent. Cette mutation est problématique dans la mesure où elle peut contribuer à un …

Continuer la lecture de « Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1 »

Continuer la lecture

Publié dans ACE2, activité neutralisante, Amazonas, analyse phylogénétique, anticorps, anticorps monoclonaux, anticorps neutralisants, B.1.1.7, B.1.351, brésil, contagiosité, coronavirus, COVID-19, D614G, domaine NTD, domaine RBD, domaine RBM, E484K, écepteur ACE2, échappement immunitaire, épidémiologie, Immunologie, Infectiologie, K417N/T, létalité, Manaus, mutations, N.10, N.9, N501Y, neutralisation, P.2, pathogénicité, pouvoir neutralisant, protéine S, protéine spike, RBD, RBM, SARS-CoV-2, séquençage génomique, spicule, transmissibilité, vaccin, vaccination, variant anglais, variant brésilien, variant britannique, Variant Of Concern, variant P.1, variant sud-africain, variants d’intérêt, Variants Of Interest, variants préoccupants, Virologie, virus, VOC, VOI | Commentaires fermés sur Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1

New York : le coronavirus circulait plus d’un mois avant l’identification du premier cas de Covid-19

Des chercheurs américains rapportent que le SARS-CoV-2 était présent dans la ville de New York six à huit semaines avant l’identification du premier cas de Covid-19. Telle est la conclusion d’une étude postée sur le site de prépublication medXriv le 11 février 2021. On rappelle que le premier cas d’infection par le SARS-CoV-2 à New …

Continuer la lecture de « New York : le coronavirus circulait plus d’un mois avant l’identification du premier cas de Covid-19 »

Continuer la lecture

Publié dans analyse phylogénétique, ARN viral, Biologie moléculaire, coronavirus, COVID-19, épidémiologie, Etats-Unis, Gènétique, génome, Infectiologie, lignage, new york, PCR, poolage, pooling, RT-PCR, Santé publique, SARS-CoV-2, séquençage, séquençage génomique, séquence génétique, sérologie, tests groupés, Virologie, virus | Commentaires fermés sur New York : le coronavirus circulait plus d’un mois avant l’identification du premier cas de Covid-19