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Covid-19 : ces variants préoccupants anglais, sud-africain et brésilien qui circulent en Europe
Réalisée entre juin 2020 et février 2021 sous l’égide du Centre européen de prévention et de contrôle des maladies (ECDC, Stockholm, Suède), une étude a analysé les données des cas Covid-19 liés à des « variants préoccupants » (Variants Of Concern ou VOC), en l’occurrence aux variants anglais B.1.1.7, sud-africain B.1.351 et brésilien P.1. Il …
Publié dans B.1.1.7, B.1.351, épidémiologie, Europe, hospitalisation, mutation E484K, non-VOC, P.1, pays européens, réanimation, séquençage génomique, variant, variant anglais, variant anglais B.1.1.7, variant brésilien P.1, variant sud-africain, variant sud-africain B.1.351, variants, variants of concern, Virologie, VOC
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Covid-19 : que sait-on du variant new-yorkais ?
Identifié pour la première fois dans la ville de New York en novembre 2020, le variant B.1.526 a vu sa prévalence augmenter fortement depuis le début de l’année. La proportion de ce nouveau lignage viral est ainsi passée de 3 % à la mi-janvier 2021 à 34 % fin février. Au 5 avril 2021, l’analyse …
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Publié dans B.1.351, B.1.526, breakthrough Infection, coronavirus, COVID-19, épidémiologie, infection post-vaccinale, P.1, réinfection, Santé publique, SARS-CoV-2, variant, variant brésilien, variant new-yorkais, variant sud-africain, variants, variants d’intérêt, variants préoccupants, Virologie, VOC, VOI
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Covid-19 : infections post-vaccinales dues à des variants
C’est l’histoire de deux femmes qui ont contracté la Covid-19, respectivement 19 et 36 jours, après avoir reçu leur deuxième dose d’un vaccin à ARN messager. Le cas de ces patientes a été rapporté le 21 avril 2021 par des médecins et chercheurs américains dans un article en ligne du New England Journal of Medicine. …
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Covid-19 : transmission par aérosols ou comment le coronavirus a contaminé des passagers d’un mini-bus
C’est l’histoire de deux chauffeurs de bus américains qui ont transmis le SARS-CoV-2 à plusieurs passagers, alors que ces derniers portaient un masque et respectaient la distanciation physique. Ces deux cas sont rapportés par des médecins et des chercheurs de la faculté de médecine Case Western Reserve de Cleveland (Ohio, États-Unis) dans un article publié …
Publié dans aération, aérosols, bus, chauffeur, contact-tracing, contamination, coronavirus, COVID-19, DISTANCIATION PHYSIQUE, Divers, épidémiologie, espace clos, masque, mini-bus, passagers, SARS-CoV-2, séquençage génomique, transmission, transmission aérienne, transmission aéroportée, van, véhicule, ventilation, Virologie
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Vaccins anti-Covid-19 et cas de thrombose : données internationales de pharmacovigilance
Publiée le 16 avril 2021 dans l’European Respiratory Journal, une étude française a cherché à évaluer le risque de thrombose et a classifié les cas d’événements thrombotiques après vaccination contre la Covid-19. Pour ce faire, l’équipe du Pr David Smadja (service d’hématologie biologique, Hôpital Européen Georges Pompidou, Inserm, AP-HP), a utilisé des données internationales de …
Publié dans accident ischémique transitoire, anticorps anti-PF4?, AstraZeneca, AVC, BionTech, caillots sanguins, CIVD, coagulation, coagulation vasculaire disséminée, coronavirus, COVID-19, déclarations, effet indésirable thrombotique, effets indésirables, effets indésirables post-vaccinaux, effets secondaires, événements thrombotiques artériels, événements thrombotiques veineux, Hématologie, Moderna, notifications, PF4, Pfizer, pharmacologie, pharmacovigilance, phlebite, pseudo-TIH post-vaccination, SARS-CoV-2, thrombose des sinus veineux cérébraux, thrombose des veines splanchiques, thrombose veineuse cérébrale, thrombose veineuse cérébrale profonde, Thromboses, vaccin, vaccination, vaccine-induced immune thrombotic thrombocytopenia, Vaccinologie
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Covid-19 : ce qu’on sait et ce qu’on ignore sur le variant indien
Après le B.1.1.7 anglais, le B.1.351 sud-africain, le P.1 brésilien, c’est au tour d’un autre variant du SARS-CoV-2, cette fois identifié en Inde, de faire les gros titres de la presse internationale. Depuis quelques semaines, l’Inde connaît en effet une flambée épidémique. Dès lors le rapprochement a été vite fait avec l’émergence de ce nouveau …
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Publié dans B.1.1.7, B.1.351, coronavirus, COVID-19, délétion, échappement immunitaire, épidémiologie, Gènétique, génomique, inde, Infectiologie, mutation, P.1, protéine S, protéine spike, royaume uni, SARS-CoV-2, séquençage génomique, spicule, transmissibilité, variant à suivre, variant anglais, variant B.1.1.617, variant brésilien, variant britannique, variant indien, Variant Of Concern, Variant Of Interest, variant préoccupant, variant under investigation, Virologie, virus, VOC, VOI, VUI
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Covid-19 : quid de la production de variants chez un individu infecté et de leur transmission ?
Durant la pandémie de Covid-19, le séquençage du génome viral est utilisé pour suivre la diffusion de nouveaux variants porteurs de mutations spécifiques. On le sait, de nouvelles mutations, ou associations de mutations, peuvent conférer un avantage sélectif au virus, qui peut devenir plus transmissible ou échapper au système immunitaire. Il a ainsi été montré …
Publié dans cluster, coronavirus, COVID-19, diversité intra-hôte, diversité intra-patient, évolution intra-patient, foyer épidémique, Gènétique, génome viral, goulot d'étranglement, mutations, protéine S, protéine spike, SARS-CoV-2, sélection purificatrice, séquençage génomique, spicule, transmission, variant dominant, variant minoritaire, Variant Of Concern, variants, variants préoccupants, Virologie, virus, VOC
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Covid-19 : ce qu’il faut savoir sur le variant brésilien P.1
Au Brésil, l’épidémie de Covid-19 est aujourd’hui dominée par plusieurs lignées virales SARS-CoV-2 qui ont toutes en commun de posséder la mutation E484K dans la protéine S (spike ou spicule), qui permet au virus de se fixer sur les cellules qu’ils infectent. Cette mutation est problématique dans la mesure où elle peut contribuer à un …
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Publié dans ACE2, activité neutralisante, Amazonas, analyse phylogénétique, anticorps, anticorps monoclonaux, anticorps neutralisants, B.1.1.7, B.1.351, brésil, contagiosité, coronavirus, COVID-19, D614G, domaine NTD, domaine RBD, domaine RBM, E484K, écepteur ACE2, échappement immunitaire, épidémiologie, Immunologie, Infectiologie, K417N/T, létalité, Manaus, mutations, N.10, N.9, N501Y, neutralisation, P.2, pathogénicité, pouvoir neutralisant, protéine S, protéine spike, RBD, RBM, SARS-CoV-2, séquençage génomique, spicule, transmissibilité, vaccin, vaccination, variant anglais, variant brésilien, variant britannique, Variant Of Concern, variant P.1, variant sud-africain, variants d’intérêt, Variants Of Interest, variants préoccupants, Virologie, virus, VOC, VOI
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Quand l’appendice se décroche sous l’effet d’un traumatisme
C’est l’histoire d’un enfant de 11 ans admis aux urgences d’un centre de traumatologie à New Delhi (Inde). Voilà deux jours qu’il ressent de sévères douleurs abdominales après être tombé de vélo. Il n’a pas présenté de nausées, de vomissements, de fièvre et de distension abdominale. À l’examen clinique, l’enfant est conscient et respire normalement. …
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Publié dans amputation appendiculaire, amputation de l'appendice, appendice, appendicite, appendicite traumatique, cavité abdominale, cavité péritonéale, chirurgie, colon, Gastroentérologie, intestin grêle, péritoine, péritonite, région iléo-cæcale, transsection appendiculaire
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Covid-19 : retour sur les premiers cas de variant sud-africain en France et les premières chaînes de contamination
Une enquête épidémiologique détaille l’origine des premiers cas notifiés en France d’infection par le variant dit sud-africain du SARS-Cov-2*. Également dénommé B.1.351, ce dernier comporte plusieurs mutations dans le gène codant la protéine S (spicule ou spike en anglais), notamment les mutations N501Y et E484K, respectivement associées à une plus grande transmissibilité et à un …
Publié dans afrique du sud, agrégats de cas, B.1.351, cas d'importation, cas importés, chaînes de contamination, cluster, cluster familial, coronavirus, COVID-19, enquête épidémiologique, épidémiologie, foyer épidémique, foyers d’infection, foyers familiaux, Infectiologie, Mozambique, SARS-CoV-2, transmission, variant, variant sud-africain, Virologie, virus
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Un cas clinique unique : un nourrisson avec trois pénis
C’est l’histoire d’un nourrisson de trois mois résidant à Duhok, ville du Kurdistan irakien. Conduit par ses parents à l’hôpital, il présente une grosse bourse du côté gauche et deux excroissances cutanées sur le périnée, l’une mesurant deux centimètres de long avec un gland et l’autre un centimètre, implantée à la base du pénis. La …
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Publié dans anomalie congénitale, chirurgie, diphallia, duplication, enfant, malformation congénitale, nourisson, Pédiatrie, Pénis, triphallia, Urologie
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Des palpitations cardiaques qui s’atténuent quand la patiente va à la selle
C’est l’histoire d’une femme de 54 ans qui consulte aux urgences pour des palpitations. Selon elle, cette perception pénible des battements cardiaques est soulagée lorsqu’elle évacue des gaz intestinaux ou va à la selle. Ce cas clinique surprenant a été rapporté le 1er avril 2021 dans la rubrique « Images in Clinical Medicine » de …
Publié dans brèche diaphragmatique, cas clinique, cavité péricardique, chirurgie, coeur, côlon intrapéricardique, côlon transverse, diaphragme, hernie diaphragmatique, hernie diaphragmatique intrapéricardique, hernie diaphragmatique péritonéopéricardique, hernie intrapéricardique, Imagerie médicale, intestin grêle, palpitations, péricarde, péricardite constrictive, scanner
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Quand une arête de poisson provoque d’intenses douleurs anales
En ce 1er avril, je vous raconte une histoire de poisson. Mais n’allez pas imaginer en lisant le titre de ce billet de blog que je relate ici une histoire médicale où il serait question de l’introduction d’un long corps étranger par voie intrarectale à des fins masturbatoires. Rien de tel dans ce cas clinique …
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Publié dans abcès anal, abcès périnatal, anus, arête de poisson, canal anal, chirurgie, corps étranger, douleur anale auguë, fesse, fistule périanale, Gastroentérologie, poisson, proctologie, rectum
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Covid-19 : malgré la quarantaine, des passagers d’un vol international à l’origine de multiples chaînes de contamination
L’histoire se déroule en Nouvelle-Zélande, pays qui pratique une stratégie d’isolement et de mise en quatorzaine à ses frontières dans le but d’éliminer le coronavirus SARS-CoV-2. Le 18 septembre 2020, un cas de Covid-19 est identifié. Le patient est un des passagers d’un vol international en provenance d’Inde. À sa descente d’avion, cet homme (G) …
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Polyarthrite après infection par le SARS-CoV-2
C’est l’histoire d’un homme de 67 ans qui se présente le 20 février 2020 pour un bilan de santé dans un hôpital de Chimkent (sud du Kazakhstan). Il ne se plaint alors ni de douleur, ni de gonflement articulaire. Dans le cadre des examens biologiques de routine effectués dans ce centre spécialisé en rhumatologie, on …
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Infecté il y a cinq ans, un survivant d’Ebola serait à l’origine d’une nouvelle épidémie en Guinée
Un survivant de l’épidémie d’Ebola de grande ampleur ayant sévi en Afrique de l’Ouest en 2013-2016 serait à l’origine de la flambée épidémique qui frappe actuellement la Guinée. Telle est la surprenante conclusion de trois rapports indépendants publiés le 12 mars 2021 sur le site virological.org. La nouvelle épidémie d’Ebola en Guinée n’aurait donc pas …
Publié dans Afrique de l’Ouest, Ebola, épidémie, filovirus, génome, Guinée, Infectiologie, latence virale, Libéria, persistance virale, quiescence virale, République démocratique du Congo, séquençage génétique, Sierra Leone, sperme, survivant d’Ebola, taux de mutation, testicule, transmission sexuelle, Virologie, virus, virus à ARN
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Infecté il y a cinq ans, un survivant d’Ebola serait à l’origine d’une nouvelle épidémie en Guinée
Un survivant de l’épidémie d’Ebola de grande ampleur ayant sévi en Afrique de l’Ouest en 2013-2016 serait à l’origine de la flambée épidémique qui frappe actuellement la Guinée. Telle est la surprenante conclusion de trois rapports indépendants publiés le 12 mars 2021 sur le site virological.org. La nouvelle épidémie d’Ebola en Guinée n’aurait donc pas …
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Surdité brusque et SARS-CoV-2 : une infection peut en cacher une autre
C’est l’histoire d’un homme de 29 ans, sans antécédent médical, qui se présente dans le service d’ORL du CHU de Dijon pour une surdité brusque bilatérale apparue depuis dix jours. Il n’existe pas d’autre signe à l’examen clinique. La femme du patient présente une anosmie et une agueusie. Cette perte d’odorat et du goût incite …
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Publié dans audition, cochlée, cochléite, coronavirus, COVID-19, hypoacousie neurosensorielle, Infectiologie, infection sexuellement transmissble, IST, labyrinthe, maladie sexuellement transmissible, méningite lymphocytaire, mst, neurosyphilis, oreille, oreille interne, ORL, Oto-rhino-laryngologie, otosyphilis, PCR, perte d'audition, RT-PCR, SARS-CoV-2, sérologie syphilitique, surdité, surdité brisque, surdité de perception, syphilis, syphilis tardive, syphilis tertiaire, test PCR, Virologie
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Covid-19 et chirurgie : mieux vaut se faire opérer au moins sept semaines après un test PCR positif
Les patients opérés dans les six semaines suivant le diagnostic d’infection à SARS-CoV-2 ont un risque accru de décès et de complications pulmonaires dans les 30 jours post-chirurgie. La chirurgie des patients atteints de Covid-19 devrait donc, lorsque cela est possible, être retardée d’au moins sept semaines pour réduire ces risques. Telle est la conclusion …
Publié dans anesthésie, Anesthésiologie, chirurgie, complications pulmonaires postopératoires, coronavirus, COVID-19, Infectiologie, intervention chirurgicale, mortalité psotopératoire, opération chirurgicale, SARS-CoV-2
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Incapable de reconnaître les sons, cette patiente n’a pas conscience de son trouble
C’est l’histoire d’une femme médecin de 66 ans, jusqu’à présent en bonne santé, qui est amenée à l’hôpital par ses enfants qui s’inquiètent pour elle. La patiente déclare pourtant ne se plaindre de rien. Sa fille déclare à l’équipe soignante que sa mère présente un comportement bizarre depuis quelque temps. Deux jours avant d’être admise …
Publié dans Accident vasculaire cérébral, agnosie auditive, Anosognosie, audition, AVC, cas clinique, langage écrit, langage parlé, musique, Neurologie, Neurosciences, sons, sons non verbaux, sons verbaux, surdité corticale, surdité verbale
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Covid-19 : probables réinfections chez des résidents d’une maison de retraite
C’est l’histoire de résidents d’un centre de soins infirmiers spécialisés pour personnes âgées dans le Kentucky (États-Unis). En juillet 2020, cet établissement informe les autorités sanitaires locales d’un cas de Covid-19. Des tests RT-PCR sont effectués afin de détecter d’autres cas possibles parmi les résidents et les employés. Le cas index est un membre du …
Publié dans centre de soins infirmiers spécialisés pour personnes âgées, cluster, coronavirus, COVID-19, EHPAD, épidémiologie, établissement d’hébergement pour personnes âgées, flambée épidémique, foyer épidémique, Infectiologie, Maison de retraite, Personnes âgées, réinfection, réinfections, RT-PCR, SARS-CoV-2, test PCR
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Quand les urines sont vertes…
Un cas intrigant de coloration anormale des urines a été rapporté en décembre 2020 par des médecins internistes portugais dans la revue médicale en ligne Curēus. Ces urines vertes ont immanquablement fait penser à ce que pourraient être les urines de l’incroyable Hulk, le super-héros. En effet, non sans humour, les médecins qui décrivent ce …
Publié dans coloration anormale, coloration verte des urines, Néphrologie, urine, urines, Urologie
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Transplantation pulmonaire : un cas tragique de transmission du SARS-CoV-2 d’une donneuse à une receveuse
Des chirurgiens et médecins américains rapportent, dans un article publié en ligne le 10 février 2021 dans l’American Journal of Transplantation, un cas documenté de transmission du SARS-CoV-2 entre donneuse et receveuse dans le cadre d’une greffe bi-pulmonaire. La donneuse avait pourtant été testé négative pour le coronavirus au test RT-PCR réalisé sur prélèvement nasopharyngé. …
Publié dans coronavirus, COVID-19, greffe, greffe bi-pulmonaire, Infectiologie, liquide de lavage broncho-alvéolaire, poumon, poumons, RT-PCR, SARS-CoV-2, transplantation, transplantation bi-pulmonaire, transplantation pulmonaire, Virologie
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Forme sévère de Covid-19 : des anomalies du globe oculaire détectées à l’IRM
Des anomalies du globe oculaire ont été détectées à l’IRM chez des patients atteints d’une forme sévère de Covid-19, rapportent des neuroradiologues français dans une étude publiée le 16 février 2021 dans la revue Radiology. On sait que la Covid-19 peut être associée dans ses formes sévères à des lésions ophtalmologiques, telles qu’une conjonctivite, une …
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New York : le coronavirus circulait plus d’un mois avant l’identification du premier cas de Covid-19
Des chercheurs américains rapportent que le SARS-CoV-2 était présent dans la ville de New York six à huit semaines avant l’identification du premier cas de Covid-19. Telle est la conclusion d’une étude postée sur le site de prépublication medXriv le 11 février 2021. On rappelle que le premier cas d’infection par le SARS-CoV-2 à New …
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Covid-19 : des personnels de santé israéliens contaminés par le coronavirus après la première dose de vaccin
Des médecins israéliens rapportent des cas de contamination par le coronavirus SARS-CoV-2 parmi le personnel du plus grand hôpital du pays après administration de la première dose de vaccin anti-Covid-19. Publié le 1er février 2021 dans la revue en ligne Emerging Infectious Diseases, ce rapport concerne vingt-deux cas de contamination post-vaccinale. Ceux-ci sont survenus lors …
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Pneumonie Covid-19 : une inflammation qui tourne en boucle
Le coronavirus SARS-CoV-2 peut provoquer une réaction inflammatoire pouvant aboutir, dans sa forme la plus grave, à un syndrome de détresse respiratoire aiguë. Une minorité de patients Covid-19 développent une pneumonie nécessitant le recours à la ventilation mécanique. La mortalité de ces patients est élevée (20 % à 40 %). Les déterminants de cette gravité …
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Covid-19 : quand le SARS-CoV-2 se déleste de petits fragments de son matériel génétique pour échapper aux anticorps
Avec l’apparition de nouveaux variants SARS-CoV-2, on sait désormais que ce coronavirus, dont le génome était considéré jusqu’à présent relativement stable, peut muter. Cette variabilité génétique repose sur l’apparition de mutations consistant en la substitution d’un nucléotide par un autre, autrement dit d’une « lettre » par une autre dans l’ARN viral. Comme pour tout …
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Quand des jumeaux n’ont pas le même père
C’est l’histoire de deux jumeaux. Elle est relatée dans un article publié en décembre 2020 dans Biomedica, revue de l’Institut national de la santé colombien. Tout commence par la demande d’un test de paternité concernant des jumeaux de sexe masculin. Il s’agit de déterminer, en utilisant toute une série de marqueurs ADN, s’ils ont le …
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Quand la masturbation provoque une hémorragie méningée
C’est l’histoire d’un quinquagénaire japonais admis aux urgences pour un sévère mal de tête. Il a subitement ressenti une douleur au niveau de la région frontale gauche alors qu’il cherchait à se procurer du plaisir. Célibataire, il a en effet l’habitude de se masturber plusieurs fois par jour. La céphalée a atteint son intensité maximale …
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Manaus, Brésil : de nouveaux variants du SARS-CoV-2 se jouent-ils de l’immunité collective ?
Que se passe-t-il à Manaus dans l’État d’Amazonas ? En octobre 2020, cet état du nord-ouest du Brésil avait été durement touché par l’épidémie de Covid-19. Publiée en octobre 2020 dans la revue Science, une étude conduite auprès des donneurs de sang indiquait que plus des trois quarts (76 %) des habitants de la plus …
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Covid-19 : vaccins et nouveaux variants, quel impact ?
Des chercheurs sud-africains rapportent 19 janvier 2021 sur le site de prépublication bioXriv des résultats indiquant que les mutations présentes dans le variant sud-africain 501Y.V2 lui confèrent la possibilité d’échapper à l’activité neutralisante des anticorps produits lors d’une infection naturelle, voire post-vaccination. Rappel : la protéine S (spike, spicule) de surface du coronavirus SARS-CoV-2 se …
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