Archives de l’auteur : Herve Maisonneuve

COVID-19 : mise en évidence des problèmes de la communication scientifique

C’est un billet intéressant de V Larivière et collègues sur le blog de la LSE (London School of Economics) daté du 5 mars 2020 avec le titre : The Coronavirus (COVID-19) outbreak highlights serious deficiencies in scholarly communication. Nous nous réjouissons de la mise en accès libre, début 2020, des milliers d’articles sur le virus SARS-CoV-2, sans considérer que la… Continuer la lecture

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COVID-19 : devinette.. qui a écrit au Lancet sans déclarer ses liens d’intérêts… c’est… c’est… c’est…

Une correspondance publiée dans The Lancet le 7 avril 2020 avait pour titre « The French response to COVID-19: intrinsic difficulties at the interface of science, public health, and policy ». Le contenu de cette lettre pourrait faire supposer qu’elle a été écrite par D Raoult… mais astucieux car il a trouvé une girouette pas très loin…… C’est un expert reconnu qui… Continuer la lecture

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COVID-19 : le salon des articles refusés de D Raoult et coll avec le bulletin paroissial ‘New Microbes and New Infection’

Un article de Médiapart (7 avril 2020) « Chloroquine : pourquoi le passé de Didier Raoult joue contre lui » ne m’a pas étonné du tout. Il y a trois ans, j’avais été longuement contacté par un journaliste enquêtant sur l’IHU de Marseille, car il voulait comprendre le fonctionnement des revues et SIGAPS. Cet article de Médiapart conforte l’article de 2012 dans… Continuer la lecture

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Essais randomisés et revues systématiques ne sont pas les articles les plus cités parmi le top 50 des citations classiques en pédiatrie

Cet article amène plein de réflexions quant à la diffusion et la citation des articles… j’ai aimé. Il a été publié en mars 2020 dans BMC Research Methodology par une équipe croate. Les 50 articles les plus cités en pédiatrie (entre 1966 et 2012, pour une recherche faite en décembre 2017) avaient en moyenne une densité de citation de 120… Continuer la lecture

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COVID-19 : analyse de la littérature, accès aux données sources, reproductibilité sont ignorées par les girouettes scientifiques

La littérature est mise à mal par des experts, parfois anciens ministres, voire anciens directeurs d’agences de santé. La tribune dans le Figaro du 5 avril 2020 signée par 3 experts compétents fait très peur. Ils font du tort à leurs successeurs et ne les respectent pas. Le titre de la tribune : « Chloroquine: l’appel de trois grands noms de… Continuer la lecture

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COVID-19 : recyclage des mêmes malades pour publier dans différentes revues…

Parmi les standards éthiques de la publication médicale, il est recommandé de ne pas publier plusieurs fois le même cas clinique dans plusieurs revues. Les rédacteurs du JAMA ont signalé, sans citer leurs sources, que des cas de malades ayant la COVID-19 ont été soumis plusieurs fois. Dans un éditorial du 16 mars 2020, à propos des nombreux manuscrits soumis,… Continuer la lecture

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COVID-19 : Comment rétracter l’article « Hydroxychloroquine and azithromycin as a treatment of… (Gautret P et al) » ?

L’article « Hydroxychloroquine and azithromycin as a treatment of COVID-19: results of an open-label non-randomized clinical trial (Gautret P et al. PMID 32205204) » a créé des conflits incroyables… et les réserves de ISAC (International Society of Antimicrobial Chemotherapy). Il semble que personne n’a vu les données sources, ni les avis des relecteurs ? Ce serait assez simple…. L’article a déjà été… Continuer la lecture

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COVID-19 : les manuscrits du rédacteur en chef de Intern J Antimicrobial Agents sont soumis au peer review, très bien !

L’article sur l’hydroxychloriquine (Gautret et al) dans International Journal of Antimicrobial Agents ne correspond pas aux standards de la société savante propriétaire du journal : ISAC pour International Society of Antimicrobial Chemotherapy. L’ISAC a publié le 3 avril 2020 un communiqué de presse que je reprends ci-dessous. Est-ce qu’un membre du comité de rédaction peut refuser un manuscrit soumis par… Continuer la lecture

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Poster : faire simple avec un seul message de 15 mots compris en quelques secondes, et au milieu

Je fais régulièrement des formations sur comment faire un abstract et un poster pour un congrès scientifique. Il faut une bonne demi- journée pour discuter avec un groupe de chercheurs ayant déjà participé à un congrès. les discussions sont nombreuses et je suis souvent surpris par les mauvais posters. Les messages principaux sont nombreux : un abstract/poster sans article publié… Continuer la lecture

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Intégrité de la recherche : le rapport MLE (Mutual Learning Exercise) est une bonne base pour développer des initiatives

L’intégrité scientifique progresse en France, c’est vrai. J’ai appris que vitesse et précipitation étaient sources d’erreurs en lisant les périgrinations de l’amiral Corniloff. Il était allé consulter la comtesse, sa voisine, avant de prendre femme, car la comtesse avait trois filles. Il s’agit d’une vieille histoire de salle de garde….. Notre propos est le développement de l’intégrité scientifique en France…. Continuer la lecture

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COVID-19, une inconnue pour les revues scientifiques… que font les auteurs et rédacteurs pendant l’épidémie ?

Toutes mes pensées aux professionnels de santé qui nous aident à lutter contre cette maladie, COVID-19. Et aussi, évitons les querelles politiciennes nuisibles au combat : il faut faire confiance à nos gouvernants… que feraient à leur place ceux qui gueulent ? Sur les réseaux sociaux, il y a des questionnements quant aux publications : est-ce que les manuscrits soumis… Continuer la lecture

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COVID-19 : la promotion du Médiator marseillais semble fondée sur des croyances, mais qui aura raison ? Le sage peut-être !

Mes pensées vont à tous les professionnels, soignants et non soignants, qui nous aident à mener cette guerre contre le SARS-CoV-2. Dans le même temps, je m’aperçois que je gamberge pendant mon confinement : toute communication hors des urgences du moment a peu d’impact sur moi ! Je constate que des journalistes non scientifiques ne savent pas différencier les preuves… Continuer la lecture

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COVID-19 : un article scientifique commenté dans les journaux grand public sera plus cité ! Bingo pour Intern J ANtimicrobiol Agents

L’actualité COVID-19 a permis de discuter d’un article très critiqué par les scientifiques (effet de l’hydroxychloroquine). Cet article, publié par la revue International Journal of Antimicrobiol Agents (facteur d’impact de 4,6), quelle que soit sa qualité devrait être cité. Ceci augmentera le facteur d’impact de la revue. Il sera d’abord cité par tous les auteurs qui voudront expliquer les nombreux… Continuer la lecture

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Les relations de pouvoir : les jeunes déclarent moins que les séniors quand ils voient des fraudes ou des pratiques douteuses

C’est une belle étude publiée dans une bonne revue, SEE (Science & Engineering Ethics), en février 2020. Une étude qualitative faite dans le cadre du projet PRINTEGER financé par Horizon 2020 (2 millions €). Cette étude a été bien faite, même si le taux de réponse est très faible. Ce sont 194 personnes, plutôt chercheurs séniors, qui ont complété les… Continuer la lecture

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COVID-19 : vitesse et précipitation dans le domaine des publications ne sont pas un indicateur de qualité des publications

Notre soutien s’adresse aux professionnels de santé qui sont auprès des malades. Ils n’ont pas le temps d’écrire, voire de lire des articles scientifiques. J’ai déjà publié quelques billets sur ce tsunami de publications COVID-19 dont nous saurons plus tard quel est son intérêt. Il est probable, voire certain, que vitesse et précipitation ne soient pas amis de qualité des… Continuer la lecture

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COVID-19 : uu lieu d’être annulés, des congrès scientifiques seront ‘virtuels’ et ils prévoient une audience plus large

Dans ce contexte de pandémie du COVID-19, de nombreux congrès ont été annulés, que ce soient des réunions nationales ou des congrès internationaux. S’il s’agit de manifestations annuelles, les reporter de 6 à 9 mois est compliqué car trop proches du prochain congrès. Les questions sont nombreuses : que faire des abstracts acceptés ? faut-il rembourser l’inscription ? faut-il payer… Continuer la lecture

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COVID 19 : les biais de convenance sociale cachent des déviances au niveau de la diffusion des recherches

Nous lisons tout sur le Coronavirus, et c’est très difficile de sélectionner les informations validées, d’autant plus qu’elles sont rares. Restons prudents et ne passons pas notre temps à dire que rien n’est bien fait… surtout gardons confiance en nos décideurs.Ils ne cachent rien.. arrêtons les fausses polémiques. Je suis confiné dans les Alpes, à 1800 mètres… avec la neige… Continuer la lecture

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Rapport annuel Frontiers : les français aiment cet éditeur (prédateur ?) avec 60 % d’acceptation des articles et des finances opaques

Frontiers, éditeur de revues scientifiques vient de publier son rapport annuel 2019, et quelques points nous surprennent. Les chiffres mis en avant : « With more than 135,000 published articles, 700 million views and downloads and 1.3 million citations, Frontiers is now the 5th most-cited publisher among the 20 largest publishers. » Mais regardons quelques points de ce rapport 2019 : les… Continuer la lecture

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La folie des publications COVID-19 ! Restons calmes car des données solides sur l’efficacité des traitements viendront

La désinformation est de mise sur le COVID-19 car des chercheurs sont attirés par le sensationnel plutôt que par produire des résultats validés qui demandent du temps. Je vous laisse vous faire votre opinion sur ce que dit le Pr D Raoult dans la Provence (21 mars 2020) : « Dans mon monde, je suis une star mondiale, je ne suis… Continuer la lecture

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COVID 19 : la bagarre pour publier vite n’est pas acceptable car de mauvais articles sont diffusés aux journalistes et patients

A qui reviendra la palme des plus mauvais articles sur COVID 19 ? Est-ce à l’équipe de D Raoult à Marseille ? Je ne sais pas ! Le 20 janvier 2020, j’ai évoqué la compétition entre les revues prestigieuses. Tout s’accélère : est-ce pour le bien de la science : à la date du 18 mars 2020, il y a… Continuer la lecture

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Les spins toujours très fréquents dans les abstracts de articles : orthopédie fait pareil que les autres disciplines

Encore une étude sur les spins des essais randomisés contrôlés (RCTs pour Randomized Controlled Trials), ces manipulations du langage dans le but d’induire le lecteur en erreur sur la véracité probable des résultats,qui peuvent distraire le lecteur et mener à une mauvaise interprétation et à une mauvaise application des résultats.. Cet article a analysé 250 abstracts de RCTs en orthopédie… Continuer la lecture

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Les conférences prédatrices sont nombreuses… un business qui marche comme celui des revues

Il existe plusieurs sociétés qui organisent ces conférences très particulières : elles sont annoncées dans des villes et lieux prestigieux, avec des orateurs prestigieux… Quelques personnes s’inscrivent et la conférence est déplacée au denier moment dans un hôtel de seconde zone. J’ai assisté à une conférence de ce type à Paris, que j’avais décrite, mais j’ai eu une lettre sévère… Continuer la lecture

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COVID 19 : pour ceux qui restent chez eux, écrivez des manuscrits… les revues seront-elles impactées et comment

Nous nous interrogeons sur l’impact du COVID 19 sur les publications. Les revues prestigieuses mettent en accès libre les articles sur le sujet, voire ont un site dédié pour ces articles (les éditeurs peuvent regrouper sur un site les articles des revues de leur portefeuille). Des sociétés proposent des services gratuits pour éditer des articles, pour traduire probablement…. profitez-en vite… Continuer la lecture

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Pourquoi Western blot ? Le blog d’Elisabeth Bik nous explique Northern, Southern mais pas Eastern

J’ai emprunté cette copie d’écran à un billet de l’excellent blog d’E Bik, détective d’images fraudées dans les articles scientifiques. Ce billet explique comment détecter les images de Western blots qui ont été bricolées. Elle explique pourquoi ‘Western’. Lisez tout le billet qui est très didactique. Voici l’extrait : Continuer la lecture

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Quantitative Science Studies arrive.. attendons les premiers articles…. car J of Informetrics n’est pas mort

En mars 2019, j’avais expliqué les raisons de la démission en janvier 2019 du comité de rédaction de J of Informetrics pour créer une nouvelle QSS au sein de MIT Press Journals. Le 20 février 2020, un premier éditorial annonce l’arrivée de QSS (Quantitative Science Studies). Titre de l’éditorial : Opening science: The rebirth of a scholarly journal Cet éditorial… Continuer la lecture

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La reproductibilité serait améliorée si les données brutes des articles étaient publiques, mais les auteurs ne veulent pas !

J’ai choisi de traduire le résumé d’un article étonnant dans la revue Molecular Brain le 21 février 2020 : « No raw data, no science: another possible source of the reproducibility crisis ». Simple, mais le rédacteur en chef a exigé des données brutes de manuscrits avant de les oumettre à peer-review. La raison pour les demander est que l’article était trop… Continuer la lecture

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Une seule  » usine à articles  » semble avoir produit au moins 400 articles avec images fraudées… c’est la Chine !

Elisabeth Bik, basée à San Francisco, est devenue une détective excellente pour identifier les images fraudées des articles en biologie. C’est une microbiologiste hollandaise basée aux USA. En février 2020, la revue Science a annoncé qu’Elisabeth Bik avait mis en évidence un article qui a été à l’origine de 400 articles dans différentes spécialités avec les mêmes images. Ce sont… Continuer la lecture

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Synhtèse excellente d’une formation pour écrire un article de recherche : tout est dit en quelques mots

Cet éditorial est concis et très utile. Il apporte les éléments principaux à connaître pour écrire un article de recherche. Il a été publié dans International Journal of Radiation Oncology en mars 2020. Quelques bonnes idées : commencez votre projet de rédaction 6 mois avant… chosissez 6 illustrations au plus vite et travaillez pour les rendre très lisibles Ce n’est… Continuer la lecture

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Belles bagnoles pour les cardiologues, amendes pour les psychiatres, vitesse chez les orthopédistes

Les psychiatres sont les plus susceptibles de recevoir une amende pour un excès de vitesse extrême, et les cardiologues sont les plus susceptibles de conduire des voitures de luxe lorsqu’ils reçoivent des amendes, selon une étude publiée dans le numéro de Noël 2019 de la revue BMJ. Cet article intitulé « The need for speed: observational study of physician driving behaviors »… Continuer la lecture

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La belle endormie s’est réveillée : félicitons le Bulletin de l’Académie Nationale de Médecine

La lecture de l’éditorial du rédacteur en chef, JN Fiessinger, du Bulletin de l’Académie nationale de médecine nous fait plaisir. Cet éditorial du numéro de février était disponible sur internet le 13 janvier 2020. Je cite un paragraphe : « Dans le cadre de la célébration du bicentenaire de notre Académie, le Bulletin a effectué en 2019 une évolution majeure. Confié… Continuer la lecture

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Ouvrir le peer review !

Une vraie recherche sur l’évaluation par les pairs est nécessaire. C’est un commentaire de Nature le 25 février 2020 qui attire notre attention. Le peer review est considéré important ou très important par 98 % des chercheurs (enquête 2018 avec 11 000 chercheurs), et pourtant il est mal connu. Les modalités du peer review sont très variables entre les revues…… Continuer la lecture

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Quand je lis mon CV, je regrette d’avoir publié certains articles : et vous ? Limitons le nombre d’article par auteur ?

L’article intitulé « Fast lane to slow science » paru en janvier 2020 dans Trends in Cognitive Sciences m’a étonné. L’auteure, Uta Frith, travaille à University College of London (UCL), UK. Elle est d’origine allemande, a 78 ans, et est connue pour ses travaux et livres dans l’autisme et la dyslexie. L’auteur est honnête en avouant qu’elle a eu son premier poste… Continuer la lecture

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La science rapide : tous les records battus avec le Coronavirus COVID-19

C’est une épidémie de publications avec ce Coronavirus. Nous avons vu que les revues prestigieuses se battaient et mettaient en ligne le plus vite possible des articles d’accès libre ! La guerre est rude, gagnée par des chinois et quelques revues. De nombreuses données émergent sur ce phénomène de publications. Il est très clair que beaucoup de ces articles ne… Continuer la lecture

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Affaire Peyroche : clap de fin ? Le temps est indispenable pour éviter des prises de positions rapides, et analyser les preuves

Plutôt que de ré-écrire sur ce sujet, j’ai copié le titre : Je vous propose de lire tranquillement l’excellent billet de Sylvestre Huet sur son blog. Rien à ajouter, c’est bien dit. Il y a tout. Un article du 13 février par Hervé Morin dans Le Monde fait aussi un état clair de la situation avec pour titre « Deux semaines… Continuer la lecture

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Revues et Covid-19 : ‘hot papers’, peer-review simplifié, articles gratuits, altmetric en hausse et compétition sévère

Suivre l’épidémie de Coronavirus à travers les revues scientifiques est possible, mais la surinformation tue l’information. Que se passe-t-il ? Les revues doivent suivre l’actualité, s’adresser au lectorat chinois, attirer les articles à tout prix, etc.. Nous avons décrit la compétition NEJM / Lancet sur la clinique, les risques du NEJM avec des cas trompeurs, mais toute bonne revue a… Continuer la lecture

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Vérifier les articles avec l’objectif de rechercher les manques d’intégrité : une checklist utile et testée

A première vue, je n’étais pas convaincu… mais à la relecture, je pense que cette initiative est intéressante, d’autant plus que ce sont de bons auteurs. Ils ont développé une checklist appelée REAPPRAISED avec l’objectif d’aider lecteurs, rédacteurs de revue et tous ceux qui évaluent des articles afin de détecter des signes de manque d’intégrité. La checklist tient sur une… Continuer la lecture

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L’évaluation des chercheurs : les 5 principes de Hong Kong peuvent être mis en oeuvre avec succès

J’ai déjà présenté ces principes de Hong Kong en octobre 2019. La version 2 de ce preprint est du 23 novembre 2019. L’intéressant, ce sont les exemples de mise en oeuvre. Cela valide ces principes car ils sont adapté à la pratique. Les 5 principes ont été repris sur un poster BRAVO. Voici ces 5 principes résumés, et les exemples… Continuer la lecture

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Un candidat pour rentrer dans le club fermé des 100 rétractations ! Il n’en a que 17 pour l’instant

L’histoire semble affolante pour ce chercheur dont 150 études sont sous investigation de son université. Les détails sont dans The Scientist du 10 février 2020 et dans Nature du 7 février 2020. Il s’agit de la recherche dans le domaine de l’écologie, portant sur les araignées. Cela a commencé à l’université Hamilton au Canada, et le chercheur s’appelle Jonathan Pruitt…. Continuer la lecture

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Small versus big data : pas mieux ! Le cheery-picking toujours la norme ?

Lors de la conférence de JPA Ioannidis à l’Académie nationale de médecine (Projet MIROR, décembre 2019), il a utilisé deux diapos reproduites ci dessous, à méditer… Son message est qu’après des années de publication d’études avec de petits échantillons (diapo 10), nous pensons avoir une solution avec les big data (diapo 12)… mais nous entrons dans une ère qui n’apportera… Continuer la lecture

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Nouveau formulaire ICMJE pour déclarer les conflits d’intérêts potentiels ! Utiliser Convey ?

Les recommandations de l’ICMJE (International Committee of Medical Journal Editors), anciennenment groupe de Vancouver ont été actualisées en décembre 2019. Une modification majeure a été le remplacement de l’expression conflits d’intérêts par relations et activtés parmi les déclarations à faire par un auteur/reviewer/rédacteur. Le conflit d’intérêts existe toujours, mais c’est au lecteur d’interpréter les déclarations des relations et activités. Logiquement… Continuer la lecture

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