Archives de l’auteur : Herve Maisonneuve

L’ordre des auteurs d’un article : pas de règles…. mais source de conflits !

Dans quel ordre lister les auteurs d’un article scientifique ? Aussi surprenant que cela paraisse, il n’y a pas de recommandations précises sur ce sujet, et les pratiques varient selon les disciplines scientifiques. Les recommandations du groupe ICMJE, les plus suivies par les revues, expliquent les critères pour être auteur, le rôle de l’auteur correspondant, les groupes collaboratifs, les contributeurs…… Continuer la lecture

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Les prix Cochrane-REWARD pour récompenser ceux qui luttent contre le gaspillage en recherche

Le gaspillage en recherche est un sport qui se porte bien… Nous avons présenté les initiatives de groupes d’experts, pour diminuer les gaspillages, et en particulier le mouvement REWARD, avec son site, ses événements, les 5 articles fondateurs du Lancet en 2014, etc… REWARD alliance s’est associé à la Collaboration Cochrane pour décerner des prix de £ 2500 aux initiatives… Continuer la lecture

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Bonne nouvelle : une journée sur l’intégrité scientifique à Nanterre le 7 décembre 2018

Le réseau des URFIST organise une journée sur l’intégrité scientifique à Nanterre. Le programme est accessible, et il faut s’inscrire, d’autant plus qu’il n’y a pas de frais de participation. Le réseau des URFIST (Unité Régionale de Formation à l’Information Scientifique et Technique) est actif et mérite d’être connu. Ils ont une bonne vision de la recherche, en étant des… Continuer la lecture

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Tempête chez Cochrane : une revue systématique sur le vaccin HPV serait mal faite, et conflits de la gouvernance..

Ce qui semble acquis, c’est que les revues systématiques de la collaboration Cochrane sont meilleures que celles qui n’ont pas respecté la méthodologie Cochrane. Chez Cochrane, les conflits d’intérêts sont mieux gérés qu’ailleurs. La plupart des chercheurs travaillant pour Cochrane sont honnêtes. Malgré cette appréciation, toutes les revues Cochrane ne sont peut-être pas toutes de bonne qualité.. difficile à évaluer…. Continuer la lecture

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Gestion des conflits d’intérêt : 15 recommandations pour mieux les gérer

C’est un article dans Intensive Care Medicine, publié début septembre 2018, et intitulé « White paper: statement on conflicts of interest ». Il y a 13 auteurs, la plupart dans la discipline Intensive care, et de 11 pays : Australia, Austria, Brazil, Canada, China, Germany, Israel, Italy, Spain, UK, USA. Il n’y avait pas de français. Voici la conclusion du résumé :… Continuer la lecture

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PRISMA Scoping review est utile car ces synthèses de littérature se développent

Ce sont les Annals qui le 4 septembre 2018 ont publié les lignes directrices PRISMA adaptées pour les Scoping Review. En mars 2016, nous avons présenté un article qui souhaitait que des recommandations pour écrire des scoping review soient préparées, c’est fait avec PRISMA-ScR. Mais avant d’écrire, il faut des recommandations pour faire ces scoping reviews, ou études de portée… Continuer la lecture

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Newsletter de l’été 2018 envoyée le 1 septembre avec le titre : « J’ai bien rigolé en vacances’

Chers Collègues, Merci car vous avez été nombreux à consulter le blog. Depuis le 1 juillet, 35 billets publiés, et j’en cite 14 dans cette newsletter. Au congrès de l’AMEE (Association for Medical Education in Europe), un australien m’a demandé comment les étudiants en médecine étaient sélectionnés en France… J’ai raconté la première année, les échecs, et il a vraiment… Continuer la lecture

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thebmj Academic edition : le retour du format papier semble un succès

J’ai découvert et lu avec intérêt les numéros mensuels du BMJ Academic edition… dont je ne connaissais pas l’existence. Les modalités d’accès aux articles étant essentiellement électroniques, nous n’avons plus la notion des revues papiers, mais ce modèle du BMJ semble avoir du succès. Si BMJ PUblishing group perdait de l’argent, ils n’auraient pas cette forme de revue. The BMJ… Continuer la lecture

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PNAS arrête d’imprimer la revue, sous prétexte d’allonger la longueur des articles !!

C »est un tweet de PNASnews (5 septembre 2018) qui nous apprend l’arrêt en janvier 2019 de la version imprimée des Proceedings of the National Academy of Science of the United States of America : On 7/1/19, PNAS will eliminate the strict page limits and the Plus article category. The preferred length of articles will remain at 6 pgs; flexible length… Continuer la lecture

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Mesurer la Science : traduction française d’un livre excellent

Je remercie Bernard Paquito qui m’a transmis l’information : l’excellent livre Measuring Research — What Everyone Needs to Know de Cassidy Sugimoto et Vincent Larivière a été traduit en français. J’en ai fait la publicité en avril 2018. Son titre est Mesurer la Science, sans sous-titre et les auteurs ont été inversés : Vincent Larivière et Cassidy Sugimoto. Il a… Continuer la lecture

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Disparition des ‘paywall’ pour 2020 : un voeux pieux ou une prédiction réaliste

Début septembre 2018, Science Europe, la Commission européenne et 11 organisations nationales de financement de la recherche ont lancé le Plan S avec une recommandation principale “By 2020 scientific publications that result from research funded by public grants provided by participating national and European research councils and funding bodies, must be published in compliant Open Access Journals or on compliant… Continuer la lecture

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Plus de la moitié de 207 thésards allemands ont déclaré avoir utilisé des pratiques de recherche douteuses (et 3 % ont falsifié des données)

Un article de PLOS ONE du 30 août 2018 a pour titre « Questionable research practices in student final theses – Prevalence, attitudes, and the role of the supervisor’s perceived attitudes » avec deux auteurs allemands. Cette publication est intéressante car il s’agit de déclarations d’étudiants allemands en cours de thèse de science dans le domaine de la psychologie : 207 ont… Continuer la lecture

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La démission du comité de rédaction de Nutrients va faciliter la publication d’articles médiocres… évitons MDPI

J’ai fait un billet le 20 juin 2018 sur MDPI, une ancienne maison d’édition qui a profité de l’Open Access pour améliorer ses revenus. MDPI a été considéré comme produisant des revues prédatrices, mais certaines des revues de cette maison d’édition semblent de bonne qualité. Pour certains MDPI n’est pas une maison d’édition prédatrice. Dix rédacteurs séniors de la revue… Continuer la lecture

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CNIL : les formalités pour les thèses de médecine… du courage les gars !

Je remercie Raymond Vilain qui m’a transmis les réponses à des questions que j’ai souvent de la part des internes qui font leur thèse. Je ne sais jamais bien répondre, mais il existe une page du site de la CNIL (Commission Nationale de l’Informatique et des Libertés). Pour les cas les plus fréquents, voici ce que dit la CNIL :… Continuer la lecture

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Si vous obtenez de l’argent pour faire une recherche dans le domaine de la nutrition, c’est que vous connaissez bien les membres du jury ….

Nous avons commenté une conférence de JPA Ioannidis du 14 juin 2018 expliquant que dans le domaine de la nutrition, il n’existait pas de données établissant des liens de causalité entre des comportements et des risques…. Son point de vue a été publié le 23 août 2018 dans le JAMA, et cet article contient toutes les bonnes références sur cette… Continuer la lecture

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Peer Review Week 2018 : 4ème édition pour permettre des contacts, etc… mais la France est aux abonnés absents ?

La semaine du peer review en est à sa quatrième année, et les archives 2016 et 2017 sont sur le site dédié à cette semaine. Les annonces et communiqués de presse sont en anglais, allemand, portugais, chinois, japonais, coréen… mais pas en français ! L’objectif est d’organiser des événements sur le peer review, et la plupart sont en live sur… Continuer la lecture

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La publication des avis des reviewers se généralise…. le peer-review ouvert est éthique, intègre et transparent

Avec la signature de V Kiermer, groupe PLOS, ce sont 7 revues qui rejoignent les revues ayant décidé de mettre en ligne les avis des reviewers avec l’article. Le groupe PLOS, notamment PLOS ONE, publie 23 000 articles de recherches par an dans de nombreux domaines scientifiques, et le volume d’articles est important. Le groupe PLOS va mettre en oeuvre… Continuer la lecture

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La qualité de la littérature n’augmente pas d’après Richard Lehman, qui a fait une rubrique hebdomadaire pendant 20 ans

Une interview de Richard Lehman dans un blog du BMJ contient un commentaires désabusé, mais probablement exact : La plupart des articles ne traitent pas encore de questions cliniques, et la qualité de la littérature ne s’est pas vraiment améliorée malgré tous les indicateurs, les alarmes et les alertes qui ont été ajoutés, en partie grâce aux exigences des revues…. Continuer la lecture

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Toujours les controverses autour du PACE trial publié par The Lancet : un appel pour le rétracter est commenté par le BMJ

The Lancet est silencieux depuis longtemps, alors que les controverses sont nombreuses autour de cet essai qui n’a pas été reproduit. J’ai évoqué cette non reproductibilité en juin 2018 : l’essai PACE, publié en 2011, a évalué 641 patients ayant un syndrome de fatigue chronique. Les critères de jugement ont été changé en cours d’essai. Il n’a pas été reproduit…. Continuer la lecture

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60 % des médecins américains (chirurgie et medical device) ne déclarent pas les liens d’intérêts dans les articles : et en France ?

Avec toutes ces recommandations et informations diverses, trop d’auteurs ne déclarent pas les liens d’intérêts dans les articles… C’est toujours le cas. C’est une publication dans JAMA Surgery du 15 août 2018 qui nous rapporte de nouvelles données de 2016 aux USA. La méthode consiste à comparer les déclarations dans les articles et les données de la base publique des… Continuer la lecture

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Les Big Data à découvert : une lecture passionnnante

Sur les conseils d’un des auteurs, j’ai acheté un ouvrage publié par Cnrs Editions, et je n’ai pas été déçu. C’est un livre pour un public averti et pour les chercheurs en général, tant il ouvre l’esprit simplement sur des domaines divers de l’application des Big Data. L’ouvrage de mars 2017 a 350 pages avec le titre « Les Big Data… Continuer la lecture

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Relire Peters & Ceci : une des premières recherches sur le peer review en 1982.. suivie de polémiques et accusations

J’ai encore dans un dossier la copie d’un article de 1982 qui faisait 70 pages car les commentaires et controverses avaient été publiés après la recherche de Peters & Ceci. Cet article a été très cité et reste un modèle du genre, bien que ce genre d’étude ne soit plus possible. Je viens de voir que l’article avait été numérisé… Continuer la lecture

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Bon rapport « Science Open by Design » avec des recommandations qui pourraient paraître évidentes et de bon sens

Comment traduire ‘Open Science by Design’ : La science ouverte par conception. Pas facile. La science ouverte change rapidement et profondément nos pratiques. Ce rapport publié par NAP (National Academies Press), accessible gratuitement, a été le fruit d’un travail financé par la Fondation John Arnold. Il fait 232 pages, mais le résumé est très clair (13 pages). Quels sont les… Continuer la lecture

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Newsletter envoyée le 1 août 2018 avec le titre : « Faîtes de beaux rêves en vacances »

Chers Collègues, En été, vous restez nombreux à consulter le blog, et je vous en remercie. Brève newsletter pour respecter votre repos, en rappelant quelques faits qui m’ont surpris depuis le début de 2018 : Le billet sur le rapport de la cour des comptes a été très consulté… car il décoiffe sur SIGAPS…. profitez de vos moments de détente… Continuer la lecture

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Sci-Hub donne toujours un accès gratuit à la plupart des articles scientifiques payants

Sci-Hub a pris une place parmi les outils pour accéder gratuitement aux articles scientifiques, et des donations permettent à sa fondatrice, Alexandra Elbakyan de poursuivre son projet. Sci-Hub a été analysé en détail par une équipe de chercheurs américains, australiens et allemands, avec une publication dans eLife (open access journal) en février 2018 : « Research: Sci-Hub provides access to nearly… Continuer la lecture

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Les 150 ans de la revue  »Nature » avec ses combats, ses triomphes : une bonne lecture de vacances

La lecture de l’histoire de la revue Nature est un réel plaisir en vacances. Cet ouvrage est un travail d’historien avec des citations, des lettres d’archives pour illustrer ce qu’est la revue Nature. Est-ce une institution anglaise ? Dès le début, trois villes, Londres, Cambridge et Oxford ont influencé les rivalités entre les chercheurs. Nature a été au début le… Continuer la lecture

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Un congrès sur les Altmetrics : probablement utile ! Mais impossible de mesurer la qualité de la recherche avec ces indicateurs

C’est la 5ème année que le congrès sur les Altmetrics va être organisé à Londres (fin septembre 2018). Par Altmetrics, il faut entendre tous ces nouveaux indicateurs de bibliométrie, basé sur les articles et non plus sur la notoriété des revues, comme l’est le Dieu Facteur d’Impact… Dieu pour certains car il vaut mieux le qualifier de diable… le h-index… Continuer la lecture

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INQUIRE pour diminuer le gaspillage de la recherche : des suggestions pour les universitaires et les institutions

Depuis janvier 2014, nous avons évoqué plusieurs fois les initiatives REWARD, surtout poussés par des articles du Lancet. Il s’agit de décrire puis de lutter contre le gaspillage de la recherche. Plusieurs articles ont fait le point sur les propositions. Dans PLOS Medicine, en juin 2018, un article intitulé « Academic response to improving value and reducing waste: A comprehensive framework… Continuer la lecture

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La reproductibilité en biologie : le projet du Center for Open Science est plus difficile que prévu… résultats ‘mixtes’

Nous avons évoqué les problématiques de reproductibilité, et en sciences sociales, en neurosciences, un certain nombre de projets ont été menés à bien. Mais dans le domaine de la biologie du cancer, c’est très difficile : en janvier 2017, j’avais listé les 5 premières publications dans eLife du projet prévoyant de refaire les expérimentations correspondant à 50 publications. Projet ambitieux… Continuer la lecture

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Les notices de rétractations s’améliorent, mais la politique des ‘withdrawals’ devrait être abandonnée

Je remercie E Decullier pour son travail sur les rétractations. Nous avons analysé avec 8 ans d’écart un échantillon de notices de rétractations d’articles biomédicaux, et montré que les raisons pour rétracter étaient maintenant précisées dans toutes les notices. C’est un progrès intéressant, et nos données ont été détaillées dans un article publié en juillet 2018 dans BMC Research Notes…. Continuer la lecture

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Une initiative originale : une formation pour apprendre à faire des recherches reproductibles… pour les vieux d’abord ?

Cet article, avec deus auteurs allemands, a été publié par PlOS Biology le 26 juillet 2018 avec le titre : « Digital open science—Teaching digital tools for reproducible and transparent research ». J’ai traduit le résumé pour nous inciter à mieux former les étudiants (et les vieux aussi) dans le domaine de la reproductibilité des données : Une caractéristique importante de la… Continuer la lecture

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Publier des études négatives, OUI… mais ne plus mettre en oeuvre des pratiques semble très difficile..

C’est un excellent éditorial de JAMA Pediatrics (23 juillet 2018) pour accompagner trois études négatives publiées dans le même numéro. L’éditorial présente les 3 études, et surtout pose la question de la « desimplementation » des pratiques. Publier les études négatives ou stériles devient plus commun.. mais ces publications des 3 essais randomisés contrôlés devraient permettre de changer des pratiques de sur… Continuer la lecture

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Rétractation à l’Université de Clermont-Ferrand : manipulation de données ? Le rapport est caché, mais la CADA veille….

Dans Nature Communications, un article publié le 5 septembre 2017 a été rétracté par les auteurs le 4 juillet 2018. Ci-joint dans l’image, titre et noms des auteurs. La note de rétractation ne détaille pas l’incident ! Un très bon point pour les auteurs, car reconnaître des erreurs, des fautes est une conduite très vertueuse, pas facile et qui montre… Continuer la lecture

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Les revues prédatrices nous harcèlent encore et encore.. avec des fantômes

Nous recevons de nombreuses sollicitations, et je viens d’en recevoir des Annals of Short Reports ! Beau titre du groupe Remedy Publications basé en Inde, avec adresse en Californie. Ils demandent 1 800 $ comme APC (Article Processing Charge). J’ai regardé, et c’est l’horreur.. Ils ont quelques articles très mauvais… et surtout un editorial board avec des experts fantômes (voir… Continuer la lecture

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USA : 61 % des pédiatres sont de femmes, et pourtant 41 % des premiers auteurs des revues de pédiatrie sont des femmes

Rien d’étonnant quand nous prenons connaissance d’un article de JAMA Network Open de juillet 2018 intitulé « Assessment of Women Physicians Among Authors of Perspective-Type Articles Published in High-Impact Pediatric Journals ». Aux USA, les femmes représentent ‘61.9% of pediatricians and 53.0% of full-time physician pediatric faculty’. Les auteurs ont sélectionné 435 articles qualifiés d’articles de type perspective ou opinion (pas de… Continuer la lecture

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Intégrité de la recherche : mauvaise note pour les universités anglais (Rapport de la House of Commons, Londres, juin 2018)

Ce nouveau rapport de la chambre des communes sur l’intégrité de la recherche a été publié le 28 juin 2018. Il a 82 pages avec 21 recommandations en pages 52 à 56. Tout d’abord quelques remarques sur le ministre des sciences qui n’était pas assez impliqué dans l’intégrité scientifique. Compte tenu des investissements dans la recherche, le gouvernement veut être… Continuer la lecture

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La fausse science se développe (en France !) : bravo aux médias, dont Le Monde, qui enquêtent sur des pratiques douteuses

Plusieurs article du Monde, 19 juillet 2018, alertent le grand public sur des pratiques scientifiques douteuses Un éditorial : Fausse science : il faut une prise de conscience mondiale « « Le Monde », aux côtés d’une vingtaine de médias, a enquêté sur 10 000 revues dites « prédatrices » qui contribuent à tromper les administrations et le public.  » Les… Continuer la lecture

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Le Plan national pour la science ouverte : les résultats de la recherche scientifique ouverts à tous, sans entrave, sans délai, sans paiement

Je vous recommande de télécharger et bien lire le plan national pour la science ouverte présenté le 4 juillet 2018 par Frédérique Vidal, ministre de l’Enseignement supérieur, de la Recherche et de l’Innovation. Son discours est accessible : Je voudrais conclure en vous disant qu’on parle de science ouverte depuis trop longtemps. Il est temps de passer à l’action. Ce… Continuer la lecture

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68 compétences utiles pour pratiquer l’Evidence-Based-Practice ! Certains n’ont pas compris !

Bon article paru dans JAMA Network Open le 22 juin 2018 avec le titre « Core Competencies in Evidence-Based Practice for Health ProfessionalsConsensus Statement Based on a Systematic Review and Delphi Survey ». Déjà 16 000 téléchargements en moins d’un mois ! Evidence-best-pratice (EBP) est préférable à Evidence-Based-medicine. Il s’agit d’un énorme travail et les méthodes ont été bien décrites (image à… Continuer la lecture

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Le business des publications scientifiques dans la VRS, avec la notion de bibliodiversité

VRS, ou la Vie de la Recherche Scientifique, est une publication du Syndicat national des chercheurs scientifiques (FSU) au sein du Cnrs. Le numéro 412 du printemps 2018 (15 mai) contenait un dossier au business des publications. Le dossier de 34 pages a abordé la plupart des interrogations sur l’avenir du système des publications face à l’inflation des articles et… Continuer la lecture

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