Archives de l’auteur : Herve Maisonneuve

Les ‘paper mills’ ont une activité rédactionnelle pour booster des carrières avec des résultats inventés

Nous avons déjà évoqué brièvement la mise en évidence des ‘paper mills’. Une usine chinoise a publié 400 articles selon E Bik (mars 2020). Il s’agissant d’images falsifiées mises en évidence par E Bik. Remercions Dlis (Digital Librairies & Information Science)) pour avoir traduit une interview en allemand de Leonid Schneider le 4 mai 2020. Les paper mills sont des… Continuer la lecture

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COVID-19 : les fake news sur l’étude Lancet / chloroquine sont nombreuses, notamment celles de Ph Douste-Blazy

L’article du Lancet du 22 mai 2020 a attiré les FAKE NEWS… et en a attiré beaucoup. Pour les FAKE NEWS, c’est Ph Douste-Blazy parlant du Lancet ! Reconnaissons qu’il sait s’excuser de ses erreurs… Un bon point ! Il saura reconnaître les erreurs décrites ci-dessous. L’article du Lancet a consisté à analyser des données de vie réelle selon des… Continuer la lecture

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COVID-19 : les anglais (BMJ et Lancet) reviennent dans la compétition en montrant que hydroxychloroquine ne marche pas

Deux articles dans le BMJ n’ont pas montré d’efficacité de l’hydroxychloroquine… puis The Lancet… mais attendons encore des résultats d’au tres essais randomisés. Ces deux articles BMJ ont été déposés sous forme de préprints le même jour, 14 avril 2020, sur medRxiv, et publiés le même jour (14 mai). Ce sont des essais académiques. Le travail du BMJ est tout… Continuer la lecture

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COVID-19 : diminution de 50 % des délais entre soumission et publication pour des revues de spécialités

Il s’agit d’un preprint, donc non reviewé, mais dont les méthodes semblent correctes. Il a été déposé le 18 avril 2020 sur bioRxiv, et n’est pas encore publié dans une revue. Cet auteur hollandais a considéré 14 revues scientifiques et analysé les délais soumission publication des articles avant et après COVID-19. Ce sont des revues de spécialités, dont cetaines revues… Continuer la lecture

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COVID-19 : à l’AP-HP, le DG doit avoir un conseiller marseillais qui a modifié les consignes de signatures des articles

Pour la publications sur les attentats de novembre 2015, c’est Martin Hirsch, le directeur général de l’AP-HP, qui était le premier auteur dans The Lancet. Quelques remous sur cet article, mais il y a mieux. Probablement que D Raoult a conseillé le directeur général de l’AP-HP sur COVID ! Tout a changé ! Pour publier sur la COVID-19, les chercheurs… Continuer la lecture

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COVID-19 : bonne réflexion sur un protocole marseillais qui a franchi la ligne jaune… pas si simple

A propos d’un essai de l’IHU de Marseille, cet article de Médecine Sciences du 15 mai 2020 apporte des arguments pour qualifier cette recherche : protocole de soins ou protocole de recherche ? La dernière phrase de cet article : Une situation d’urgence ne saurait justifier l’abandon des règles éthiques et juridiques protégeant les personnes. Voici l’introduction qui pose bien… Continuer la lecture

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Les lignes directrices pour écrire des articles ne sont pas des outils pour évaluer la qualité des articles

Le titre de ce billet est simple, mais trop de chercheurs n’ont pas totalement compris les objectifs des lignes directrices disponibles sur le site EQUATOR. Les plus connues sont CONSORT? STARD, STROBE, etc… L’article publié dans le numéro 2 (juin) de la revue Health Science Reports explique ce qui devrait être considéré comme évident. Les auteurs viennent du centre anglais… Continuer la lecture

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COVID-19 : le site ethique-pandemie.com nous apporte de bonnes réflexions sur la COVID-19

C’est utile de suivre l’actualité et d’être réactif. C’est ce qu’a fait l’équipe du Pr Emmanuel Hirsch en lançant un site dédié aux réflexions éthiques sur la pandémie. Voici une copie de l’écran d’accueil : « Notre objectif, à la fois humble et ambitieux, est de nous comprendre mutuellement et de nous mettre d’accord sur nos désaccords. Cette médiation est plus… Continuer la lecture

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TheMetaNews : bon projet avec deux newsletter hebdomadaires pour les jeunes chercheurs

J’ai découvert une lettre périodique à l’attention des chercheurs, et je n’ai pas pour habitude de faire de promotion pour ce genre de média, mais EXCEPTION, SVP. Je trouve que l’équipe rédactionnelle jeune est bien pondérée. Ils sont trois avec des compétences complémentaires. Les news sont objectives et nombreuses. TheMetaNews envoie deux newsletters par semaine sur la vie de la… Continuer la lecture

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L’intégrité des essais randomisés contrôlés : la partie émergée d’un iceberg… enregistrement des protocoles, CONSORT ne suffisent pas

Est-ce que la moitié des publications seraient fausses comme l’a suggéré R Horton, rédacteur en chef du Lancet, en 2015 ? Qu’en est-il des meilleurs méthodologies, à savoir les essais randomisés contrôlés ? Bon article d’auteurs australiens et hollandais dans Fertility and Sterility en mai 2020, avec des exemples en gynécologie, et plein d’interrogations. Article difficile à synthétiser, et j’ai… Continuer la lecture

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Les fraudes de Mart Bax, anthropologue hollandais, découvertes 18 ans après les premiers soupçons et 10 ans après sa retraite

Le cas de Mart Bax est exemplaire de la lenteur pour mettre en évidence les fraudes de certains chercheurs. Mart Bax, encore vivant, a pris sa retraite en 2002 et ses fraudes ont été décrites après sa retraite, bien que des soupçons majeurs aient été identifiés dès 1995. Neuf de ses articles ont été rétractés, dont 7 récemment, et la… Continuer la lecture

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COVID-19 : la bonne règle d’Ingelfinger est obsolète ! Il fut un temps où les revues scientifiques ne considéraient pas les manuscrits dont les données avaient été communiquées au public

Je reprends quelques éléments d’un billet que j’ai publié sur Univadis le 4 mai 2020 sous le titre « COVID-19 : Des données non validées par des revues scientifiques sont diffusées par les médias ». Avec les réseaux sociaux, les préprints, et l’accélération liée volume de publications COVID-19, la diffusion des preuves scientifiques a changé : est-ce un progrès ? Je vous… Continuer la lecture

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COVID-19 : les serveurs de préprints semblent avoir été vigilants, ayant même refusé des preprints !

Une news de Nature du 7 mai 2020 revient sur le fonctionnement des serveurs de préprints pandant la pandémie du virus SARS-CoV-2. L’article commence par une anecdote : le serveur bioRxiv aurait refusé de mettre en ligne un préprint, ca qui n’est normalement jamais fait par ces serveurs. Un serveur peut refuser de déposer un préprint si l’article n’est pas… Continuer la lecture

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COVID-19 : quel bordel avec tous ces auteurs qui ne montrent pas leurs données ! Les débats auraient été pacifiés sur la chloroquine

A l’époque de l’ouverture de tout : open access, open data, etc… Quelle erreur de n’avoir pas eu les données sources de tous ces essais de médicaments soit disant efficaces ! A commencer par tous ceux qui vous disent que l’hydroxychloroquine est efficace ! Il y a encore des essais dont les résultats sont des communiqués de presse ou des… Continuer la lecture

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COVID-19 : le concept des mains sales s’applique dans les pratiques d’auteurs (IHU Marseille) !

Est-ce que toutes les situations d’auteurs de courtoisie sont semblables ? Dans certains cas, la prise en otage, c’est plus difficile à accepter. Cela s’appelle la pratiques des mains sales ! Ce concept de mains sales existe en politique, dans des domaines juridiques. C’est expliqué sur wikipedia anglais ‘dirty hands’. De nombreuses explications pour des situations rencontrées en politique quand… Continuer la lecture

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COVID-19 : une méta-analyse de l’IHU de Marseille considère que des chercheurs parisiens ont de mauvaises conduites

Dans Science il y a quelques jours, des chercheurs ont expliqué que les crises n’étaient pas une excuse pour diminuer les standards de la recherche. Ils ont raison. Mais Science ne doit pas être lu à l’IHU de Marseille. Une méta-analyse sur les données de la chloroquine pour traiter la COVID-19 a été mise en ligne sur le site de… Continuer la lecture

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Médecine d’urgence : 44 % des résumés d’essais randomisés ont des spin ! Conforme aux autres spécialités

C’est heureux d’avoir de nouvelles données sur la prévalence des spins dans les articles scientifiques. Cette étude a été faite à partir d’essais randomisés en médecine d’urgence, et les auteurs sont américains. Leurs résultats sont conformes à la littérature. Rappelons que les spins sont ces manipulations du langage pour embellir des données et tromper le lecteur. Quelques informations reprises du… Continuer la lecture

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La famille Lancet grandit encore avec « The Lancet Microbe » et les 6 « The Lancet Regional Health »

Ce sont 20 déclinaisons dans la famille The Lancet ! Chaque année des lancements, et obligatoirement en open access, ce qui est très agréable. Mais les APCs (Article Processing Charges) élevés quand il s’agit de publier dans une revue sans facteur d’impact : les mentalités évoluent car l’absence de facteur d’impact au début ne semble pas un obstacle. En avril… Continuer la lecture

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COVID-19 : la productivité en recherche des femmes diminuerait pour certains… données contradictoires

Deux revues ont expliqué recevoir beaucoup plus de manuscrits pendant cette période de confinement, mais que la proportion de femmes parmi les auteurs avait beaucoup diminué. Il y a beaucoup de spéculations sur les travail à domicile, avec les femmes prenant en charge les enfants.. et n’ayant plus de temps pour écrire des articles. Ces deux revues (British Journal for… Continuer la lecture

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COVID-19 : les crises ne sont pas une excuse pour diminuer les standards de la recherche

En situation d’urgence, quel est le bon équilibre entre la préservation de méthodes rigoureuses et l’attente de résultats pour traiter la maladie ? Il n’est pas toujours possible de réaliser des essais randomisés comparatifs de qualité… mais comment faire ? Les données précliniques, et les études avec de petits effectifs apportent des arguments, mais jamais de preuve d’une efficacité avec… Continuer la lecture

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Les revues scientifiques publient les études négatives : les vieilles croyances résistent

J’entends toujours fréquemment des collègues soutenir en public l’idée que les revues scientifiques ne publient que des études positives, c’est à dire des études montrant un résultat ‘statistiquement significatif’. C’est en 2013 que j’ai observé les premières données présentées par un vieil ami hollandais lors d’un congrès du peer review à Chicago. Les résultats ont ensuite été publiés dans PLOS… Continuer la lecture

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COVID-19 : AFIS et Science & Pseudo-sciences ont une chronique actualisée pour le public averti

L’Association Française pour l’Information Scientifique (AFIS) a mis en lignes des informations pour informer le public sur le SARS-CoV-2. Une rubrique Coronavirus – Comment s’informer ? liste des ressources publiques par ordre chronologique pour suivre les informations principales. Tout va plutôt un peu trop vite. Il y a aussi 7 billets thématiques en ligne à la date du 27 avril… Continuer la lecture

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COVID-19 : appel pour trouver des reviewers d’articles rendant des avis en 5 jours

Nous avons souvent évoqué ces publications très rapides par de nombreuses revues, parfois 48 heures après la soumission. Comment faire un peer-review, demander aux auteurs de réviser leur article aussi vite ! Le summum étant les publications de complaisance du Dr D Raoult… avec son salon de ses articles refusés. Sous l’égide de l’Open Access Scholarly Publishers Association (OASPA), un… Continuer la lecture

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COVID-19 : Claude Bernard s’adresse aux bobologues de tous bords, aux druides de Marseille, à des politiques et à D Trump

J’ai deux exemplaires de la Médecine expérimentale de Claude Bernard, et cette introduction mérite toujours d’être relue, bien que des passages soient parfois un peu verbeux. Voici un extrait qui est d’actualité : « Un médecin qui essaye un traitement et qui guérit ses malades est porté à croire que la guérison est due à son traitement. Souvent des médecins se… Continuer la lecture

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COVID-19 : la pérennité de l’archive ouverte medRxiv est assurée.. mais la moitié de ces préprints seront ultérieurement publiés par des revues à comité de lecture

Avec la COVID-19, nous avons découvert l’acceptation des préprints par la communauté médicale. Le serveur medRxiv devient une référence, mais combien de préprints ont été déposés depuis janvier, et donneront-ils lieu à publication, et dans quelles revues ? Amis documentalistes, vous en savez beaucoup plus que moi : vos commentaires SVP !! MERCI COMBIEN de préprints ‘COVID-19 et SARS-CoV-2’ ?… Continuer la lecture

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COVID-19 : STROBE et CONSORT sont des lignes directrices inconnues à l’IHU de Marseille

Une petite musique monte enfin pour attirer l’attention sur les méconnaissances méthodologiques des chercheurs de l’IHU de Marseille (D Raoult et ses colonels). Nombreux sont les articles qui analysent la littérature hydroxychloroquine / COVID-19 pour montrer les gaspillages de ressources pour conduire des études avec de mauvaises méthodologies. J’en retiens deux assez simples, parmi les nombreux que vous pourrez consulter… Continuer la lecture

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COVID-19 : Luc Montagnier fait la promotion des revues prédatrices… et les médias le suivent !!! Piteux

Le pire n’est peut-être pas encore venu avec la COVID-19 ! Des découvertes piteuses sont propagées par les médias… Par exemple dans le Point du 18 avril 2020, il y a un article « Le virus du Sars-CoV-2 a-t-il été créé par l’homme ? Tous les éléments pour en juger. VIDÉO. L’accusation du professeur Montagnier et du mathématicien Perez est trop… Continuer la lecture

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Les relations de pouvoir : les jeunes déclarent moins que les séniors quand ils voient des fraudes ou des pratiques douteuses

C’est une belle étude publiée dans une bonne revue, SEE (Science & Engineering Ethics), en février 2020. Une étude qualitative faite dans le cadre du projet PRINTEGER financé par Horizon 2020 (2 millions €). Cette étude a été bien faite, même si le taux de réponse est très faible. Ce sont 194 personnes, plutôt chercheurs séniors, qui ont complété les… Continuer la lecture

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COVID-19 : les ‘hot paper’ n’honorent pas les revues, dont le NEJM qui est un bras armé de l’industrie

Le Parisien a publié des données scandaleuses sur l’efficacité de la chloroquine (sondage IFOP) et le NEJM (New England Journal of Medicine) voudrait nous faire croire que le remdevisir guérit la COVID-19…. Doit-on s’attendre à voir pire lors de cette pandémie d’articles scientifiques ? L’article du 10 avril 2020 « Compassionate use of remdesivir for patients with severe COVID-19 » est ce… Continuer la lecture

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COVID-19 : la Chine contrôlerait les articles scientifiques avant publication (la France devrait réfléchir)

Imaginez que les articles de l’IHU de Marseille aient besoin d’un accord d’une agence de l’état, voire du ministère de la santé avant d’être publiés sur YouTube ou dans une revue de complaisance ? Le respect des règles d’éthique et d’intégrité serait un préalable à toute publication ! Tout serait plus facile et nous éviterait des débats inutiles basés sur… Continuer la lecture

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COVID-19 : les préprints ont envahi la médecine… avec un départ fulgurant…c’est bien, mais les médias n’ont rien compris

Le « manuscrit auteur » est la version initiale du compte rendu de recherche, avant soumission à une revue. Cette version qui précède l’évaluation par un comité de rédaction est appelée « prépublication, préprint ou preprint ». Elle ne comprend ni les modifications que fera l’auteur après le peer-review, ni les corrections et la mise en page de l’éditeur. En décembre 2107, j’ai évoqué… Continuer la lecture

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H-index moyens élevés en médecine.. son inventeur, J Hirsch, dit que son index contribue à employer les mauvaises personnes !

Sur Nature Index, le 24 mars 2020, une interview de l’inventeur du H-index, Jorge Hirsch : What’s wrong with the H-index, according to its inventor “Severe unintended negative consequences”. J Hirsch, physicien à l’Université de Californie a hésité en 2005 avant de publier son index, et il ne s’attendait pas à ce succès. L’article a repris des données de 2012… Continuer la lecture

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COVID-19 : mise en évidence des problèmes de la communication scientifique

C’est un billet intéressant de V Larivière et collègues sur le blog de la LSE (London School of Economics) daté du 5 mars 2020 avec le titre : The Coronavirus (COVID-19) outbreak highlights serious deficiencies in scholarly communication. Nous nous réjouissons de la mise en accès libre, début 2020, des milliers d’articles sur le virus SARS-CoV-2, sans considérer que la… Continuer la lecture

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COVID-19 : devinette.. qui a écrit au Lancet sans déclarer ses liens d’intérêts… c’est… c’est… c’est…

Une correspondance publiée dans The Lancet le 7 avril 2020 avait pour titre « The French response to COVID-19: intrinsic difficulties at the interface of science, public health, and policy ». Le contenu de cette lettre pourrait faire supposer qu’elle a été écrite par D Raoult… mais astucieux car il a trouvé une girouette pas très loin…… C’est un expert reconnu qui… Continuer la lecture

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COVID-19 : le salon des articles refusés de D Raoult et coll avec le bulletin paroissial ‘New Microbes and New Infection’

Un article de Médiapart (7 avril 2020) « Chloroquine : pourquoi le passé de Didier Raoult joue contre lui » ne m’a pas étonné du tout. Il y a trois ans, j’avais été longuement contacté par un journaliste enquêtant sur l’IHU de Marseille, car il voulait comprendre le fonctionnement des revues et SIGAPS. Cet article de Médiapart conforte l’article de 2012 dans… Continuer la lecture

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Essais randomisés et revues systématiques ne sont pas les articles les plus cités parmi le top 50 des citations classiques en pédiatrie

Cet article amène plein de réflexions quant à la diffusion et la citation des articles… j’ai aimé. Il a été publié en mars 2020 dans BMC Research Methodology par une équipe croate. Les 50 articles les plus cités en pédiatrie (entre 1966 et 2012, pour une recherche faite en décembre 2017) avaient en moyenne une densité de citation de 120… Continuer la lecture

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COVID-19 : analyse de la littérature, accès aux données sources, reproductibilité sont ignorées par les girouettes scientifiques

La littérature est mise à mal par des experts, parfois anciens ministres, voire anciens directeurs d’agences de santé. La tribune dans le Figaro du 5 avril 2020 signée par 3 experts compétents fait très peur. Ils font du tort à leurs successeurs et ne les respectent pas. Le titre de la tribune : « Chloroquine: l’appel de trois grands noms de… Continuer la lecture

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COVID-19 : recyclage des mêmes malades pour publier dans différentes revues…

Parmi les standards éthiques de la publication médicale, il est recommandé de ne pas publier plusieurs fois le même cas clinique dans plusieurs revues. Les rédacteurs du JAMA ont signalé, sans citer leurs sources, que des cas de malades ayant la COVID-19 ont été soumis plusieurs fois. Dans un éditorial du 16 mars 2020, à propos des nombreux manuscrits soumis,… Continuer la lecture

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COVID-19 : Comment rétracter l’article « Hydroxychloroquine and azithromycin as a treatment of… (Gautret P et al) » ?

L’article « Hydroxychloroquine and azithromycin as a treatment of COVID-19: results of an open-label non-randomized clinical trial (Gautret P et al. PMID 32205204) » a créé des conflits incroyables… et les réserves de ISAC (International Society of Antimicrobial Chemotherapy). Il semble que personne n’a vu les données sources, ni les avis des relecteurs ? Ce serait assez simple…. L’article a déjà été… Continuer la lecture

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COVID-19 : les manuscrits du rédacteur en chef de Intern J Antimicrobial Agents sont soumis au peer review, très bien !

L’article sur l’hydroxychloriquine (Gautret et al) dans International Journal of Antimicrobial Agents ne correspond pas aux standards de la société savante propriétaire du journal : ISAC pour International Society of Antimicrobial Chemotherapy. L’ISAC a publié le 3 avril 2020 un communiqué de presse que je reprends ci-dessous. Est-ce qu’un membre du comité de rédaction peut refuser un manuscrit soumis par… Continuer la lecture

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