Archives de l’auteur : Herve Maisonneuve

COVID-19 : vitesse et précipitation dans le domaine des publications ne sont pas un indicateur de qualité des publications

Notre soutien s’adresse aux professionnels de santé qui sont auprès des malades. Ils n’ont pas le temps d’écrire, voire de lire des articles scientifiques. J’ai déjà publié quelques billets sur ce tsunami de publications COVID-19 dont nous saurons plus tard quel est son intérêt. Il est probable, voire certain, que vitesse et précipitation ne soient pas amis de qualité des… Continuer la lecture

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Les relations de pouvoir : les jeunes déclarent moins que les séniors quand ils voient des fraudes ou des pratiques douteuses

C’est une belle étude publiée dans une bonne revue, SEE (Science & Engineering Ethics), en février 2020. Une étude qualitative faite dans le cadre du projet PRINTEGER financé par Horizon 2020 (2 millions €). Cette étude a été bien faite, même si le taux de réponse est très faible. Ce sont 194 personnes, plutôt chercheurs séniors, qui ont complété les… Continuer la lecture

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COVID-19 : uu lieu d’être annulés, des congrès scientifiques seront ‘virtuels’ et ils prévoient une audience plus large

Dans ce contexte de pandémie du COVID-19, de nombreux congrès ont été annulés, que ce soient des réunions nationales ou des congrès internationaux. S’il s’agit de manifestations annuelles, les reporter de 6 à 9 mois est compliqué car trop proches du prochain congrès. Les questions sont nombreuses : que faire des abstracts acceptés ? faut-il rembourser l’inscription ? faut-il payer… Continuer la lecture

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COVID 19 : les biais de convenance sociale cachent des déviances au niveau de la diffusion des recherches

Nous lisons tout sur le Coronavirus, et c’est très difficile de sélectionner les informations validées, d’autant plus qu’elles sont rares. Restons prudents et ne passons pas notre temps à dire que rien n’est bien fait… surtout gardons confiance en nos décideurs.Ils ne cachent rien.. arrêtons les fausses polémiques. Je suis confiné dans les Alpes, à 1800 mètres… avec la neige… Continuer la lecture

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Rapport annuel Frontiers : les français aiment cet éditeur (prédateur ?) avec 60 % d’acceptation des articles et des finances opaques

Frontiers, éditeur de revues scientifiques vient de publier son rapport annuel 2019, et quelques points nous surprennent. Les chiffres mis en avant : « With more than 135,000 published articles, 700 million views and downloads and 1.3 million citations, Frontiers is now the 5th most-cited publisher among the 20 largest publishers. » Mais regardons quelques points de ce rapport 2019 : les… Continuer la lecture

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La folie des publications COVID-19 ! Restons calmes car des données solides sur l’efficacité des traitements viendront

La désinformation est de mise sur le COVID-19 car des chercheurs sont attirés par le sensationnel plutôt que par produire des résultats validés qui demandent du temps. Je vous laisse vous faire votre opinion sur ce que dit le Pr D Raoult dans la Provence (21 mars 2020) : « Dans mon monde, je suis une star mondiale, je ne suis… Continuer la lecture

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COVID 19 : la bagarre pour publier vite n’est pas acceptable car de mauvais articles sont diffusés aux journalistes et patients

A qui reviendra la palme des plus mauvais articles sur COVID 19 ? Est-ce à l’équipe de D Raoult à Marseille ? Je ne sais pas ! Le 20 janvier 2020, j’ai évoqué la compétition entre les revues prestigieuses. Tout s’accélère : est-ce pour le bien de la science : à la date du 18 mars 2020, il y a… Continuer la lecture

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Les spins toujours très fréquents dans les abstracts de articles : orthopédie fait pareil que les autres disciplines

Encore une étude sur les spins des essais randomisés contrôlés (RCTs pour Randomized Controlled Trials), ces manipulations du langage dans le but d’induire le lecteur en erreur sur la véracité probable des résultats,qui peuvent distraire le lecteur et mener à une mauvaise interprétation et à une mauvaise application des résultats.. Cet article a analysé 250 abstracts de RCTs en orthopédie… Continuer la lecture

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Les conférences prédatrices sont nombreuses… un business qui marche comme celui des revues

Il existe plusieurs sociétés qui organisent ces conférences très particulières : elles sont annoncées dans des villes et lieux prestigieux, avec des orateurs prestigieux… Quelques personnes s’inscrivent et la conférence est déplacée au denier moment dans un hôtel de seconde zone. J’ai assisté à une conférence de ce type à Paris, que j’avais décrite, mais j’ai eu une lettre sévère… Continuer la lecture

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COVID 19 : pour ceux qui restent chez eux, écrivez des manuscrits… les revues seront-elles impactées et comment

Nous nous interrogeons sur l’impact du COVID 19 sur les publications. Les revues prestigieuses mettent en accès libre les articles sur le sujet, voire ont un site dédié pour ces articles (les éditeurs peuvent regrouper sur un site les articles des revues de leur portefeuille). Des sociétés proposent des services gratuits pour éditer des articles, pour traduire probablement…. profitez-en vite… Continuer la lecture

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Pourquoi Western blot ? Le blog d’Elisabeth Bik nous explique Northern, Southern mais pas Eastern

J’ai emprunté cette copie d’écran à un billet de l’excellent blog d’E Bik, détective d’images fraudées dans les articles scientifiques. Ce billet explique comment détecter les images de Western blots qui ont été bricolées. Elle explique pourquoi ‘Western’. Lisez tout le billet qui est très didactique. Voici l’extrait : Continuer la lecture

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Quantitative Science Studies arrive.. attendons les premiers articles…. car J of Informetrics n’est pas mort

En mars 2019, j’avais expliqué les raisons de la démission en janvier 2019 du comité de rédaction de J of Informetrics pour créer une nouvelle QSS au sein de MIT Press Journals. Le 20 février 2020, un premier éditorial annonce l’arrivée de QSS (Quantitative Science Studies). Titre de l’éditorial : Opening science: The rebirth of a scholarly journal Cet éditorial… Continuer la lecture

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La reproductibilité serait améliorée si les données brutes des articles étaient publiques, mais les auteurs ne veulent pas !

J’ai choisi de traduire le résumé d’un article étonnant dans la revue Molecular Brain le 21 février 2020 : « No raw data, no science: another possible source of the reproducibility crisis ». Simple, mais le rédacteur en chef a exigé des données brutes de manuscrits avant de les oumettre à peer-review. La raison pour les demander est que l’article était trop… Continuer la lecture

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Une seule  » usine à articles  » semble avoir produit au moins 400 articles avec images fraudées… c’est la Chine !

Elisabeth Bik, basée à San Francisco, est devenue une détective excellente pour identifier les images fraudées des articles en biologie. C’est une microbiologiste hollandaise basée aux USA. En février 2020, la revue Science a annoncé qu’Elisabeth Bik avait mis en évidence un article qui a été à l’origine de 400 articles dans différentes spécialités avec les mêmes images. Ce sont… Continuer la lecture

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Synhtèse excellente d’une formation pour écrire un article de recherche : tout est dit en quelques mots

Cet éditorial est concis et très utile. Il apporte les éléments principaux à connaître pour écrire un article de recherche. Il a été publié dans International Journal of Radiation Oncology en mars 2020. Quelques bonnes idées : commencez votre projet de rédaction 6 mois avant… chosissez 6 illustrations au plus vite et travaillez pour les rendre très lisibles Ce n’est… Continuer la lecture

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Belles bagnoles pour les cardiologues, amendes pour les psychiatres, vitesse chez les orthopédistes

Les psychiatres sont les plus susceptibles de recevoir une amende pour un excès de vitesse extrême, et les cardiologues sont les plus susceptibles de conduire des voitures de luxe lorsqu’ils reçoivent des amendes, selon une étude publiée dans le numéro de Noël 2019 de la revue BMJ. Cet article intitulé « The need for speed: observational study of physician driving behaviors »… Continuer la lecture

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La belle endormie s’est réveillée : félicitons le Bulletin de l’Académie Nationale de Médecine

La lecture de l’éditorial du rédacteur en chef, JN Fiessinger, du Bulletin de l’Académie nationale de médecine nous fait plaisir. Cet éditorial du numéro de février était disponible sur internet le 13 janvier 2020. Je cite un paragraphe : « Dans le cadre de la célébration du bicentenaire de notre Académie, le Bulletin a effectué en 2019 une évolution majeure. Confié… Continuer la lecture

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Ouvrir le peer review !

Une vraie recherche sur l’évaluation par les pairs est nécessaire. C’est un commentaire de Nature le 25 février 2020 qui attire notre attention. Le peer review est considéré important ou très important par 98 % des chercheurs (enquête 2018 avec 11 000 chercheurs), et pourtant il est mal connu. Les modalités du peer review sont très variables entre les revues…… Continuer la lecture

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Quand je lis mon CV, je regrette d’avoir publié certains articles : et vous ? Limitons le nombre d’article par auteur ?

L’article intitulé « Fast lane to slow science » paru en janvier 2020 dans Trends in Cognitive Sciences m’a étonné. L’auteure, Uta Frith, travaille à University College of London (UCL), UK. Elle est d’origine allemande, a 78 ans, et est connue pour ses travaux et livres dans l’autisme et la dyslexie. L’auteur est honnête en avouant qu’elle a eu son premier poste… Continuer la lecture

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La science rapide : tous les records battus avec le Coronavirus COVID-19

C’est une épidémie de publications avec ce Coronavirus. Nous avons vu que les revues prestigieuses se battaient et mettaient en ligne le plus vite possible des articles d’accès libre ! La guerre est rude, gagnée par des chinois et quelques revues. De nombreuses données émergent sur ce phénomène de publications. Il est très clair que beaucoup de ces articles ne… Continuer la lecture

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Affaire Peyroche : clap de fin ? Le temps est indispenable pour éviter des prises de positions rapides, et analyser les preuves

Plutôt que de ré-écrire sur ce sujet, j’ai copié le titre : Je vous propose de lire tranquillement l’excellent billet de Sylvestre Huet sur son blog. Rien à ajouter, c’est bien dit. Il y a tout. Un article du 13 février par Hervé Morin dans Le Monde fait aussi un état clair de la situation avec pour titre « Deux semaines… Continuer la lecture

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Revues et Covid-19 : ‘hot papers’, peer-review simplifié, articles gratuits, altmetric en hausse et compétition sévère

Suivre l’épidémie de Coronavirus à travers les revues scientifiques est possible, mais la surinformation tue l’information. Que se passe-t-il ? Les revues doivent suivre l’actualité, s’adresser au lectorat chinois, attirer les articles à tout prix, etc.. Nous avons décrit la compétition NEJM / Lancet sur la clinique, les risques du NEJM avec des cas trompeurs, mais toute bonne revue a… Continuer la lecture

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Vérifier les articles avec l’objectif de rechercher les manques d’intégrité : une checklist utile et testée

A première vue, je n’étais pas convaincu… mais à la relecture, je pense que cette initiative est intéressante, d’autant plus que ce sont de bons auteurs. Ils ont développé une checklist appelée REAPPRAISED avec l’objectif d’aider lecteurs, rédacteurs de revue et tous ceux qui évaluent des articles afin de détecter des signes de manque d’intégrité. La checklist tient sur une… Continuer la lecture

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L’évaluation des chercheurs : les 5 principes de Hong Kong peuvent être mis en oeuvre avec succès

J’ai déjà présenté ces principes de Hong Kong en octobre 2019. La version 2 de ce preprint est du 23 novembre 2019. L’intéressant, ce sont les exemples de mise en oeuvre. Cela valide ces principes car ils sont adapté à la pratique. Les 5 principes ont été repris sur un poster BRAVO. Voici ces 5 principes résumés, et les exemples… Continuer la lecture

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Un candidat pour rentrer dans le club fermé des 100 rétractations ! Il n’en a que 17 pour l’instant

L’histoire semble affolante pour ce chercheur dont 150 études sont sous investigation de son université. Les détails sont dans The Scientist du 10 février 2020 et dans Nature du 7 février 2020. Il s’agit de la recherche dans le domaine de l’écologie, portant sur les araignées. Cela a commencé à l’université Hamilton au Canada, et le chercheur s’appelle Jonathan Pruitt…. Continuer la lecture

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Small versus big data : pas mieux ! Le cheery-picking toujours la norme ?

Lors de la conférence de JPA Ioannidis à l’Académie nationale de médecine (Projet MIROR, décembre 2019), il a utilisé deux diapos reproduites ci dessous, à méditer… Son message est qu’après des années de publication d’études avec de petits échantillons (diapo 10), nous pensons avoir une solution avec les big data (diapo 12)… mais nous entrons dans une ère qui n’apportera… Continuer la lecture

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Nouveau formulaire ICMJE pour déclarer les conflits d’intérêts potentiels ! Utiliser Convey ?

Les recommandations de l’ICMJE (International Committee of Medical Journal Editors), anciennenment groupe de Vancouver ont été actualisées en décembre 2019. Une modification majeure a été le remplacement de l’expression conflits d’intérêts par relations et activtés parmi les déclarations à faire par un auteur/reviewer/rédacteur. Le conflit d’intérêts existe toujours, mais c’est au lecteur d’interpréter les déclarations des relations et activités. Logiquement… Continuer la lecture

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Deuxième entrée dans le club fermé des Top 100 rétractations, club réservé aux hommes !

C’est RetractionWatch qui nous informe le 14 janvier 2020 de l’arrivée de J Boldt dans ce club où Fujii était le seul. Ils sont deux à avoir plus de 100 rétractations ! Mais de vieux fraudeurs, avant l’ère électronique, auraient pu les rejoindre… Vous lirez tous les détails sur cet anesthésiste-réanimateur qui a publié des articles frauduleux sur des solutés… Continuer la lecture

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Le facteur TOP devrait remplacer le facteur d’impact, mais ce n’est pas gagné.. aux revues de le mettre en oeuvre

Le mouvement initié à Charlottesville par les équipes de Brian Nosek a décrit les recommandations TOP décrites depuis plus de 5 ans. TOP pour Transparency Openess Promotion est basé sur 8 critères décrits dans des revues dont Science en juin 2015. Ce sont les critères recomandés par Chris Chambers dans le dernier chapitre de son ouvrage sur les 7 péchés… Continuer la lecture

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Les 150 ans de Nature : nombreuses ressources sur le site anniversaire

En août 2018, j’avais analysé un livre consacré à la revue Nature qui a eu 7 rédacteurs en chef depuis 1869. L’année 2019 étant celle du 150ème anniversaire, le site a présenté des évènements tout au long de l’année. La consultation du site apporte de nombreuses informations avec des vidéos. Vous pouvez télécharger le numéro un du 4 novembre 1869… Continuer la lecture

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Une rétractation vertueuse : l’adresse de Mme Vidal, ministre, n’est plus connue et ses co-auteurs ne l’ont pas !

Plusieurs fois, j’ai eu des remarques sur ce cas très simple. Je reprends des informations connues et très bien décrites par le blog de S Huet. Cette situation est révélatrice d’un laxisme français étonnant. La rétractation montrée dans l’image ci-dessous a été demandée par quatre des auteurs de l’article. Les quatre autres n’ont pas d’adresse ! Lisez la notice de… Continuer la lecture

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Les rétractations d’articles augmentent en oncologie : bonne ou mauvaise nouvelle ?

Ce n’est pas un article fabuleux, mais quelques informations. Pas fabuleux car les illustrations sont mal faites, un peu trop marketing avec des camemberts inutiles ! Dans le domaine de l’oncologie, 1512 rétractations entre 2000 et 2018 ont été analysées, soit près de 80 par an. Elles ont concerné 543 revues. En moyenne, 3,5 ans séparaient la publication de la… Continuer la lecture

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Sur-citation des articles des hommes versus sous-citation des articles des femmes ! ETONNANT ! NON

Ce preprint a été déposé le 11 janvier 2020 sur bioRxiv. Il attend vos commentaires ! Cet article a été pas mal tweeté, notamment par bioRxiv, et le pdf téléchargé 240 fois. Il n’a pas encore été publié à la date du 10 février 2020. Le titre ne réflète pas le résultat principal : « The extent and drivers of gender… Continuer la lecture

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Les rétractations sur France culture ‘La méthode scientifique’

J’ai eu l’honneur avec Pierre Corvol d’avoir été invité par Nicolas Martin pour l’émission ‘La méthode scientifique’ du 6 février 2020. Le podcast peut être écouté sur le site de France Culture. Cette émission a été initiée suite à la rétractation de Frances Arnold, prix Nobel de chimie. Sujet difficile à vulgariser, mais nous avons fait de notre mieux pour… Continuer la lecture

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Le meilleur modèle pour publier des études ‘négatives’ : les ‘Registered reports’ ont gagné sur les modèles classiques.

Ce preprint du 5 février 2020 sera vite publié car il apporte des données convaincantes. Il a été déposé sur PsyArXiv, une des plateformes de OSF. Le protocole a été enregistré correctement sur le registre du COS (Charlottesville, USA). Le titre « An excess of positive results: Comparing the standard Psychology literature with Registered Reports ». Les méthodes sont très bien décrites… Continuer la lecture

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Communication des résultats des essais cliniques : l’industrie bien meilleure que les universitaires

Cette comparaison n’est pas nouvelle, mais l’illustration est claire ! Il s’agit d’un article dans Science le 13 janvier 2020 qui accuse la FDA et les NIH de laxisme car ils laissent les sponsors ne pas respecter les lois ! Le titre est clair : FDA and NIH let clinical trial sponsors keep results secret and break the law Aux… Continuer la lecture

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Actualisation des recos de Vancouver… ‘relations et activités’ remplace ‘conflits d’intérêts’, et d’autres idées nouvelles

En décembre, l’ICMJE ou International Committee of Medical Journal Editors met à jour le document intitulé “Recommendations for the Conduct, Reporting, Editing, and Publication of Scholarly Work in Medical Journals”. Encore appelé recommandations de Vancouver. Les changements ont été publiés début janvier 2020 (www.icmje.org). Le nombre de changements est limité, mais significatif. La version originale a sa traduction en français… Continuer la lecture

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Coronavirus : quand le NEJM fait une erreur, personne n’est informé.. Auteurs et revues se battent pour être les premiers !.

Les revues sont dans une compétition majeure pour publier des articles sur le Coronavirus. La compétition est plus compliquée car, en 2020, les auteurs sont chinois pour les cas observés en Chine. Ce n’était pas le cas il y a 10 ou 20 ans car des auteurs américains publiaient avec les chinois. Le NEJM a publié un article le 30… Continuer la lecture

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La fin des mégarevues ? Des anomalies, un modèle qui n’a pas convaincu…

J’ai accueilli l’arrivée des mégarevues, comme PLOS ONE en 2006, avec de l’espoir car le modèle semblait répondre à des attentes. Mais après une dizaine d’année, ce modèle s’essoufle.. Un article de 22 pages a fait une analyse très détaillée des ces méga-revues… beaucoup de données…. Incroyable travail dans Journal of Informetrics en 2019 par un auteur américain. Le titre… Continuer la lecture

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Guide LERU pour développer une culture de l’intégrité de la recherche dans les Universités

LERU (League of European Research Universities) est un réseau de 23 universités en Europe, dont 3 universités françaises. Ce réseau a publié en janvier 2020 un très bon Advice paper intitulé « Towards a Research Integrity Culture at Universities: From Recommendations to Implementation ». Nous disposons de beaucoup de guides, documents, recommandations… sur le développement de l’intégrité de la recherche. Je trouve… Continuer la lecture

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