Archives de l’auteur : philippe eveillard

Helpers, apomédiaires ou experts ?

Il y a 20 ans, Tom Ferguson les appelait « Online patient-helpers ». Il y a 10 ans, Gunther Eysenbach confiait aux apomédiaires le soin de guider les internautes vers l’information médicale « crédible ». Aujourd’hui, ce sont les patient-experts qui occupent le terrain « en live ». Sont-ils de meilleurs aidants pour autant ? 1998-2000 C’est l’histoire… … de Karen Parles […] Continuer la lecture

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Sante.fr : du 1.0 pur jus

Le nouveau site officiel* d’information médicale à destination du public, lancé avant l’été, fournit une information valide, mais décalée par rapport aux besoins des patients. Faute de prendre en compte la R/evolution 2.0. C’est l’histoire… … d’une doctinaute « fidèle » ** qui, à la suite de malaises hypoglycémiques récurrents doit subir une épreuve de jeûne de […] Continuer la lecture

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« Soyez le maître à bord » n’est pas un mode d’emploi de PubMed mais une méthode d’exploration de la banque de données

La méthode « Soyez le maître à bord » part du principe que les différentes fonctionnalités de l’interface, telles qu’elles sont décrites dans les tutoriels à base de vidéos et de copies d’écran, ne servent à rien… … sauf à vous faire perdre le contrôle de votre requête. Pour conserver ce contrôle, vous devez concentrer votre attention […] Continuer la lecture

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L’érythropoïétine est sans effet sur la performance des cyclistes dans la montée du Ventoux

Après un traitement par l’érythropoïétine, les coureurs cyclistes améliorent leurs tests d’effort maximaux. En revanche, cela ne modifie en rien leur résultat aux tests sous-maximaux ni leur performance en course. L’effet sur la performance en course (montée du Ventoux) avait, en son temps (juillet 2016), fait l’objet d’une conférence de presse rapportée dans le N° […] Continuer la lecture

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PubMed : soyez le maître à bord

L’exploration de la banque de données bibliographiques PubMed est d’autant plus performante que vous restez maître de la situation tout au long de la formulation de l’équation de recherche. Pour atteindre cet objectif, vous devez éviter d’emprunter les chemins de traverse que sont les automates et les algorithmes mis à votre disposition dans l’interface. Ceux-là […] Continuer la lecture

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La veille dans PubMed : le casse-tête des opérateurs

Dans l’équation de veille, la gestion des opérateurs (OR et NOT) fournit l’occasion de revisiter quelques-uns des fondamentaux de l’interrogation de la banque de données. En théorie : trois données essentielles La première donnée Formuler une équation de veille dans PubMed consiste à interroger d’une part la partie indexée de la banque de données et d’autre […] Continuer la lecture

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La veille du médecin sur le Web – le livre

Le médecin qui fait de la veille est-il une exception ? On pourrait le croire en constatant le peu d’appétence des praticiens pour télécharger le e-book « La veille du médecin sur le Web ». Je préfère croire que le format Kindle du téléchargement est un obstacle, même si l’application Kindle, gratuite, permette de lire le format quel […] Continuer la lecture

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La veille du médecin sur le Web

Sur le Web, la veille du médecin est personnelle, confraternelle et bibliographique. Elle se démarque ainsi de celle du veilleur professionnel et de celle du chercheur. Personnelle Le médecin veille lui-même pour lui-même. C’est lui qui décide des thèmes de sa veille et des moyens à mettre en œuvre pour parvenir à ses fins. Ces […] Continuer la lecture

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PubMed raconté à un élève de CM1… et la suite

PubMed raconté à un élève de CM1 et les 2 « PubMed » qui suivent sont les 3 volets d’une formation en ligne sur la meilleure façon d’interroger la banque de données. Cette information est destinée à vous, étudiants en médecine et médecins pour vous convaincre d’interroger PubMed « dans les règles », c’est-à-dire en respectant son langage et […] Continuer la lecture

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Le sportif dopé est-il un tricheur ?

Trois publications récentes ont modifié le regard qu’on pouvait porter sur le dopage des sportifs. A ma connaissance, personne ne s’en est fait l’écho. Une bonne raison pour en faire un billet de blog et un e-book d’une quarantaine de pages (disponible sur Amazon). Les 2 premières publications en date (avril et mai 2016) ont […] Continuer la lecture

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MEDLINE fête ses 45 ans ; PubMed ses 20 ans

L’occasion de faire la différence entre les deux. MEDLINE, c’est la banque de données des références indexées. PubMed, c’est la banque de données des références indexées (= MEDLINE) accompagnées de celles en attente d’indexation (as supplied by publisher) et de celles en cours d’indexation (in process). Pour être complet, il faut ajouter les références des périodiques […] Continuer la lecture

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Petite mise au point sur le dopage des sportifs

Les propriétés ergogéniques des médicaments ne pouvant être démontrées scientifiquement (selon les « bonnes pratiques » des essais cliniques contrôlés), le dopage sportif ne peut être défini directement comme étant la prise d’un médicament capable d’améliorer la performance sportive. Il faut donc prendre un chemin de traverse et, pour cela, définir le sportif dopé et le produit […] Continuer la lecture

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Améliorez vos présentations !

« 95% des présentations sont nulles » écrivait en 2008 Guy Kawasaki dans la préface de « Presentation Zen » (Garr Reynolds). Dix après, malgré les « bons conseils » diffusés régulièrement sur le Web, rien n’a changé : 95% des présentations sont les « guide-ânes » des présentateurs, le degré zéro de la pédagogie. Entre 2007 et 2015 j’ai présenté « en live » des […] Continuer la lecture

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J.O : Michael Phelps a perdu une bonne occasion de se taire

Le 9 aout 2016, le nageur nord-américain qui truste les médailles depuis 4 olympiades a déclaré : « c’est triste que de nos jours il y ait des gens contrôlés positifs, même deux fois pour certains, qui ont quand même l’occasion de nager aux Jeux Olympiques ». Dans le collimateur de Phelps : la nageuse Yuliya Efimova, contrôlée positive à […] Continuer la lecture

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Dopage : la liste des substances interdites mérite un sérieux « coup de balai »

A l’heure où les JO de Rio débutent, des voix se font entendre pour remettre en cause la politique de l’Agence mondiale antidopage (AMA), notamment en ce qui concerne la liste des substances dopantes. Deux articles récents jettent le doute sur la cohérence de la liste :  les substances mentionnées sont-elles toutes susceptibles d’améliorer les performances […] Continuer la lecture

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Trois exemples d’équation dans PubMed

Parmi les 30 équations de recherche « commentées » de l’anti-manuel de PubMed, j’en ai choisi trois. Elles ne sont pas plus exemplaires que les autres mais elles montrent l’éventail des situations prises en compte : de la plus simple à la plus compliquée. L’équation simple croise deux affiliations descripteur/qualificatif. Elle est exemplaire par la relation entre les […] Continuer la lecture

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L’anti-manuel de PubMed valorise l’affiliation descripteur/qualificatif

Sur chaque référence indexée est accrochée une étiquette Sur cette étiquette sont listés les termes caractérisant le contenu de l’article. Cette étiquette, c’est l’index. Les termes de l’index appartiennent à un thesaurus, un vocabulaire dans lequel les termes (ou descripteurs) ont, entre eux, des relations hiérarchiques. C’est le langage de PubMed. Un descripteur peut se […] Continuer la lecture

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L’anti-manuel de PubMed est sur Amazon

L’anti-manuel, le retour Il y a un an, l’anti-manuel de PubMed était au programme du blog sous la forme de 4 billets d’anthologie. Aujourd’hui, j’en rajoute une couche. C’est une couche plus épaisse (88 pages), en ligne sur Amazon et téléchargeable en échange d’une place de cinéma, d’un paquet de gauloises ou d’un café au […] Continuer la lecture

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Ce que révèle l’interrogation de PubMed sur le dopage de Maria S.

Ergogénique en théorie, sans efficacité réelle probablement, mais certainement placée sans raison valable sur la liste des produits dopants. Tel peut être caractérisé le meldonium après être passé dans la « moulinette » de PubMed et de la littérature médicale récente. L’histoire A l’Open d’Australie (janvier 2016), la joueuse de tennis russe Maria Sharapova est contrôlée positive […] Continuer la lecture

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L’interrogation de PubMed n’est pas uberisable

Le 3 janvier 2016, Philippe Ameline a tweeté : « Tss, tss, je pense que vous serez étonné du nombre de non-médecins plus à l’aise avec PubMed que les praticiens ». Plus à l’aise ? Pourquoi pas. Plus performant ? J’en doute. Explication L’interrogation de PubMed se déroule en 4 étapes : – choix des mots clés […] Continuer la lecture

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Fuyez les « pass navigo » de PubMed

Les tutoriels qui fournissent des indications sur la façon de naviguer dans PubMed peuvent être assimilés aux « pass navigo » qui donnent accès au métro (et à la circulation dans ses couloirs…). Ces tutoriels indiquent vers quoi diriger le pointeur de votre souris et comment cheminer dans l’interface. Mais, cela ne sert à rien de cheminer […] Continuer la lecture

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On ne plante pas un clou avec une clé de 8

Vous vous retrouvez au petit matin devant les résultats PubMed de votre recherche « sodomie et mycose vaginale » (Jaddo  Petit traité imaginaire de médecine réelle 2 juin 2015) Merci à Jaddo d’avoir fait allusion à PubMed en ces termes dans son dernier billet. Cela me donne l’occasion de revenir sur l’aberration qui consiste à entrer 2 […] Continuer la lecture

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L’anti-manuel (suite et fin)

My NCBI a oublié de prévenir ses « fidèles » qu’une équation de veille ne se formulait pas comme une équation de recherche. Un oubli qui montre à quel point ce service mérite d’être… oublié. Comprendre Dans PubMed, certains articles sont indexés et d’autres (moins nombreux) ne le sont pas. Les articles indexés constituent la banque de […] Continuer la lecture

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L’anti-manuel (4)

Il n’y a qu’une seule bonne façon de formuler la première équation, mais il faudra toujours la reformuler*. C’est écrit nulle part, mais ça tombe sous le sens. Une seule bonne façon… Pour formuler la première équation selon le langage et la grammaire de PubMed, il n’y a pas 36 façons de faire. Aucun mot-clé […] Continuer la lecture

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L’anti-manuel (3)

Vanter les performances de PubMed dans la recherche d’une solution à un problème clinique est manifestement outrancier. Pourtant, certains ne se sont pas privés de le faire. En France, c’est là* ; aux Etats-Unis, c’est là. Rappel : la vocation première d’une banque de données bibliographiques est de référencer un article scientifique ou une thèse […] Continuer la lecture

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L’anti-manuel (2)

« PubMed n’est pas Google ». La National Library of Médicine (NLM) souhaite vous persuader du contraire. Grâce à l’Automatic Term Mapping* (ATM), vous pouvez interroger PubMed sans rien connaître du langage (hermétique) ni de la grammaire (originale) de l’outil de recherche. L’ATM interprète votre requête (en général formulée à la Google) d’une façon déplorable et bruyante. Déplorable car […] Continuer la lecture

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L’anti-manuel (1)

La grosse artillerie est sortie : les vidéos de doctolib et les copies d’écran « made in NLM ou in BU » sont à la disposition des étudiants et des médecins pour qu’ils deviennent « maîtres es PubMed »… … sauf que naviguer avec aisance dans l’interface* et en connaître tous les recoins ne sert pas à grand chose et […] Continuer la lecture

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Lecture pour tous

Deux slidedocs, l’un relatif à l’information sur les maladies, l’autre à celle sur les médicaments sont en ligne sur Slideshare. Ils sont destinés aux patients et aux professionnels de santé et peuvent être téléchargés sur des tablettes. Ces 2 slidedocs explorent exclusivement CISMeF et la BDBfr. Ils ont été rédigés pour que la recherche et […] Continuer la lecture

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Fin de la première série sur la documentation du médecin

Après PubMed (en aout) et Zotero (en septembre), la mise en ligne du slidedoc sur la liste de références (en octobre) marque la fin de la première série sur la documentation du médecin. Les 3 slidedocs sont étroitement liés car la sollicitation des 3 est nécessaire pour publier un article ou rédiger une thèse. Cette […] Continuer la lecture

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Comment établir la liste de références (improprement appelée bibliographie) d’une thèse de médecine ?

Ça ne s’invente pas, mais ça n’intéresse personne et vous ne trouverez nulle part un mode d’emploi. C’est pourtant simple. Il suffit de demander de l’aide aux bibliothécaires de votre B.U. (quand vous ne savez pas quelle base interroger), aux confrères qui publient (remontée des filières) ou à ceux qui partagent (social bookmarking) et aux […] Continuer la lecture

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Comment référencer une thèse de médecine ?

Qui s’intéresse à la liste de références d’une thèse de médecine ? Où trouver au moins 3 feuillets sur le sujet dans la presse médicale ou dans les rayons des librairies spécialisées ? Dans une thèse, la liste de références n’est pas ce qui impressionne le jury. Elle est volontiers laissée à l’abandon comme en […] Continuer la lecture

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La sensibilité dans PubMed

Le précédent billet posait une question : pourquoi une équation de recherche formulée dans le Constructeur de requêtes bibliographiques médicales affiche-t-il un plus grand nombre de références que la même équation formulée dans PubMed ? La réponse Le champ d’exploration n’est pas le même. Il est beaucoup plus large dans le Constructeur de requêtes, même […] Continuer la lecture

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PubMed : de la requête à l’équation

Reprise du précédent billet Il était question de l’obstacle dont personne ne parle : le passage de la requête à l’équation de recherche dans PubMed. Un exemple était proposé à la sagacité du lecteur : comment formuler l’équation de recherche portant sur l’impact des corticoïdes inhalés sur la croissance de l’enfant asthmatique ? Rappel Contrairement […] Continuer la lecture

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« Cuisine » MeSH pour tous

La mise au point d’un robot-mixeur des mots clés français est-elle la solution radicale pour faire tomber les barrières de l’interrogation de PubMed/MEDLINE ?  Pas sûr ! Le 17 septembre 2014, un tweet de Gaëtan Kerdelhué et un mail de Badisse Dahamna ont informé les internautes de la mise à leur disposition d’un outil d’interrogation […] Continuer la lecture

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Zotero pour tous

Les listes de références (improprement appelées bibliographies) des thèses de médecine sont rarement correctement rédigées, faute d’avoir été secourues par un gestionnaire de références. La raison en est que ces gestionnaires sont tous, peu ou prou, des usines à gaz dont la multitude de fonctions et le nombre de manettes pour les activer ne satisfont que les […] Continuer la lecture

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Se former sur PubMed avec un smartphone

Sous réserve d’utiliser de gros caractères (corps 24 ou 28) un slidedoc est lisible sur un écran de smartphone (4 à 4,5″). La preuve avec le slidedoc « se former sur PubMed… » (en accès libre et gratuit sur Slideshare). Faire passer le message sur la formulation dans PubMed n’est pas une mince affaire, surtout si l’on […] Continuer la lecture

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Des tutoriels pour la recherche bibliographique sur les médicaments dans PubMed

Le dernier NLM Technical Bulletin (6 août 2014) renferme une mine d’information sur la façon de mieux rechercher les références relatives aux médicaments et substances chimiques dans PubMed. Une dizaine de tutoriels sont proposés à la curiosité du fan-club de PubMed. Même si vous maitrisez « tout PubMed », il y a des chances pour que ces tutoriels […] Continuer la lecture

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Slidedoc : la présentation « à lire »

Alors que les présentations PowerPoint sont destinées à être vues, Nancy Duarte lance les Slidedocs, des présentations « à lire ». Dean Giustini, le bibliothécaire de l’université de Colombie britannique avait déjà mis en ligne des présentations à lire. Elles sont sur Slideshare, là, et là. Giustini se contente de remplir des pages de texte et de les […] Continuer la lecture

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Pourquoi un livre numérique sur PubMed ?

Pour faire mieux que les copies d’écran Les brochures-modes d’emploi, diapositives et autres vidéos bourrées de copie d’écran n’ont plus lieu d’être. Deux raisons à cela. Les (trop) fréquentes évolutions de l’interface rendent obsolètes ces copies d’écran au bout de quelques mois. Surtout, la partie « électro-ménagère » de PubMed (navigation et fonctions), maitrisée par un enfant […] Continuer la lecture

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La méthode pour ne plus haïr PubMed (4) : synthèse

Dans PubMed, la difficulté ne vient ni du concept d’affiliation descripteur/qualificatif, ni de la technicité de la navigation dans l’interface, mais : – de la tendance à la googlisation systématique de toutes les requêtes quelque soit l’outil de recherche, – et du refus des internautes « d’approcher » les fondamentaux (le B.A-BA) des techniques documentaires. Dans PubMed, […] Continuer la lecture

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