Archives de l’auteur : Herve Maisonneuve

Revues prédatrices : avertir les auteurs, car trop se font prendre…. un cas français qui se termine bien

Voici une des histoires que je rencontre périodiquement. Je voudrais surtout remercier Arnaud De La Blanchardière, praticien hospitalier, maladies infectieuses et tropicales, CHU de Caen, qui a accepté de la partager avec nous. 1) La Revue de Médecine Interne a publié en mai 2015 un cas clinique de 2 pages dans la rubrique ‘Image’ intitulé ‘Des anomalies hépatiques’ par 3… Continuer la lecture

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BMJ / PLOS Medicine : des résultats publiés sont bien reproductibles… très beau travail français !

Dans le BMJ de février 2018, une étude très originale car les auteurs ont refait les analyses sur le critère de jugement principal pour des études cliniques randomisées publiées dans deux revues. Il s’agissait de savoir si la mise à disposition des données sources permettaient de reproduire les résultats. Eh bien, malgré des difficultés, c’est possible… Très bonne nouvelle. Mais… Continuer la lecture

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Lancet Global Health : un flirt bienvenu avec la langue française ! La recherche au Niger comme exemple

The Lancet Global Health a annoncé le 12 octobre 2017 que des résumés d’articles seraient en français avec deux exemples. Cette information a été communiquée par Anne Roca, senior editor du Lancet Global Health, sur le réseau HIFA (Healthcare Information For All). HIFA est une excellente ressource. Des informations régulières en langue française (HIFA French) sont diffusées par Isabelle Wachsmuth-Huguet,… Continuer la lecture

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Les critères de jugement sont trop souvent différents entre protocoles et publications ! Ce devrait être une étape préalable aux méthodes de lecture critique

Article dans BMC Medical Research Methodology en janvier 2018 et intitulé « A systematic review of comparisons between protocols or registrations and full reports in primary biomedical research ». Bonne recherche d’auteurs canadiens. J’en ai marre de tous ces étudiants que l’on forme à l’analyse de la littérature, ou LCA (Lecture Critique d’Articles) sans les prévenir sur la qualité effroyables de certains… Continuer la lecture

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Newsletter de janvier 2018 envoyée avec le titre « SIGAPS manipulé par des CHU — Lanceur d’alerte anonyme à Montpellier ? »

Chers Collègues, Un laxisme général fait que rien ne bouge… certains comportements semblent admis ! On parle d’intégrité mais on n’examine pas les cas… En janvier 2018, 19 billets sur le blog de la rédaction médicale. Les voici : D’incroyables bricolages sont passés sous silence ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ La cour des comptes dénonce des pratiques : 950 millions € attribués à des… Continuer la lecture

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PubMedCommons jette l’éponge : le PPPR (Post Publication Peer Review) a du mal à progresser ; il faut soutenir PubPeer

Un communiqué de presse du 1 février 2018 annonce l’arrêt de PubMed Commons. Voici un extrait de ce communiqué : PubMed Commons s’est avéré une expérience précieuse pour soutenir la discussion de la littérature scientifique publiée. Le service a d’abord été lancé à titre de projet pilote à l’automne 2013 et a été revu en 2015. Malgré les faibles niveaux… Continuer la lecture

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Les liens entre rédacteurs de revues et industrie pharmaceutique : un peu plus de transparence serait souhaitable

Cette question a rarement été abordée avec des résultats objectifs. Deux articles ont apporté des données : Dans BMJ le 27 octobre 2017, avec le titre : Payments by US pharmaceutical and medical device manufacturers to US medical journal editors: retrospective observational study. Une équipe canadienne a analysé 52 revues prestigieuses américaines (deux par spécialité), et identifié les rédacteurs éligibles… Continuer la lecture

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Faut-il croire les scientifiques ? : Bon dossier grand public (averti) dans « Books »

La revue bimensuelle ‘Books’ s’intéresse à la science dans son numéro 88 de mars avril 2018. Elle est en kiosque. Ce dossier est bien fait et aborde les questions d’intégrité scientifique. J’ai découvert des infos qui m’ont intéressé. Il y a 4 articles, et presque 20 pages : Bon éditorial de Olivier Postel-Vinay qui explique que l’évaluation de la science… Continuer la lecture

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Code de conduite européen pour l’intégrité en recherche : critères pour publier

All European Academies (ALLEA) est le réseau européen (40 pays) de 60 académies des sciences et humanités. En France, il y a deux membres qui participent à ALLEA : Académie des Sciences et Académies des Inscriptions et Belles-Lettres. ALLEA a mis à jour en 2017 son code de conduite pour l’intégrité scientifique et la traduction française vient d’être publiée début… Continuer la lecture

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« 10 simple rules » pour écrire un livre : les règles sont simples mais écrire n’est pas simple !

Dans l’excellente série d’articles intitulés Ten simple rules publiés par PLOS Computational Biology, vient de paraître Ten simple rules for writing a popular science book. Publier pour une large audience est difficile pour un chercheur qui a l’habitude de publier des articles scientifiques… Voici les 10 règles proposées : Développer une expérience d’écriture… En bref écrire une première version presque… Continuer la lecture

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SONG pour Standardized Outcomes in Nephrology : excellente initiative qui rejoint celles d’autres disciplines

Le mouvement est lent, trop lent.. et nous avons déjà évoqué la nécessité de disposer de critères standard pour toutes les recherches. Il est tellement difficile de comparer, compiler des résultats de recherche clinique quand les critères de jugement sont différents, voire quand ils sont identiques mais mesurés à des temps différents. La néphrologie s’y met avec SONG dont la… Continuer la lecture

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BRAVO avec la Charte éthique et déontologique des facs de médecine.. ça va souffler dans certaines facs !!!!

C’est une excellente nouvelle que la publication en fin d’année 2017 de la charte éthique et déontologique des facultés de médecine. Ce sont les doyens de médecine et odontologie qui ont signé.. C’est probablement une réponse aux différentes remarques, dont celles du Formindep. Cette charte est une excellente initiative, lisez-la… voire préparez une page de synthèse pour mettre sur les… Continuer la lecture

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Après l’Allemagne, aura-t-on en France un bras de fer entre financeurs et maisons d’édition ? Très compliqué… attention aux messages simples !

Depuis quelques semaines les bibliothèques allemandes négocient avec les maisons d’édition pour avoir un accès libre et gratuit aux contenus de toute les revues. En janvier 2018, il ne semble pas qu’un accord ait été obtenu, et des institutions n’ont pas renouvelé les abonnements… les maisons d’éditions continuant d’apporte un service.. situation difficile. Laissons les négociateurs faire de leur mieux… Continuer la lecture

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Recommandations ICMJE : revues prédatrices et partages de données ajoutés dans la version de décembre 2017

Le comité international des rédacteurs de revues médicales a, comme chaque année, actualisé ses recommandations. La version française va être postée sur le site de ICMJE dans quelques jours. Vous la trouverez ici. Quelles sont les changements par rapport à décembre 2016 ? La reprise des déclarations sur le partage des données. Maintenant, les auteurs doivent collaborer, ouvrir les données,… Continuer la lecture

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Le narcissisme et la science en quête de visibilité : je connais des narcissiques, et vous ?

Grâce à leur capacité d’adapter la bonne attitude devant leur public, les narcissiques peuvent donner l’exposé le plus convaincant sur l’importance de l’éthique dans les sciences, tout en défendant sans scrupule leurs propres intérêts. Cette phrase est dans l’article de la revue de la FEBS (Federation of European Biochemical Societies). En septembre 2016, Bruno Lemaitre avait eu l’honneur d’être interviewé… Continuer la lecture

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ESOF 2018 à Toulouse : un événement européen majeur sur la communication de la science attend vos posters

ESOF attire plus de 4000 participants de 80 pays, chercheurs,et plus de 150 journalistes et autres experts intéressés par le thème 2018 : Sharing Science: towards new horizons! European Science Open Forum (ESOF) est organisé tous les 2 ans en Europe par EuroScience, organisation basée à Strasbourg. Cette association de chercheurs attire les décideurs européens à son congrès. EuroScience mérite… Continuer la lecture

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Les chercheurs de l’industrie rapporteraient moins de malveillance que les chercheurs académiques.. hypothèse !

C’est une hypothèse plausible et comment l’expliquer ? Est-ce qu’il y aurait moins de bricolages de données dans l’industrie ? Sans occulter l’observation principale : plus de 80 % des chercheurs ont commis ou observé des pratiques préjudiciables à la recherche… L’article a été publié dans SEE avec le titre « Scientists Still Behaving Badly? A Survey Within Industry and Universities »…. Continuer la lecture

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La recherche animale doit s’améliorer : la recherche préclinique se trompe encore, et des malades sont inclus dans des essais !

Le numéro du 11 janvier 2018 du BMJ contient 4 articles sur la recherche animale. Très longue histoire qui mérite de lire tous les articles. Il s’agit d’un domaine compliqué, le développement d’un vaccin pour la tuberculose. Un éditorial de F Godlee, basé sur les autres articles du numéro : ‘Nous avons besoin d’une meilleure recherche animale, mieux décrite’ ;… Continuer la lecture

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Un catalogue des biais en construction… proposez vos idées pour le compléter

Un site assez simple a pour objectif de présenter un catalogue des biais dans le domaine des sciences biomédicales. Cette idée a été évoquée par David Sackett avant l’existence de l’internet. dans un article de 1979 : Bias in Analytical Research. Chron Dis 1979;32:51-63. Il listait 35 biais dans l’échantillonage et les mesures des essais cliniques, et 56 biais affectant… Continuer la lecture

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Récompenser ceux qui reproduisent des résultats de recherche : un rapport de l’Académie des sciences de Hollande

La Hollande a encore le souvenir du scandale D Stapel qui a fait progresser les mentalités. L’Académie des sciences basée à Amsterdam vient de publier un rapport attendu sur la reproductibilité des résultats de recherche. Je ne prends pas le risque de la nommer en Hollandais.. Ce rapport peut vous servir si vous devez préparer un exposé sur le sujet…. Continuer la lecture

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Rétractation d’un article à Montpellier… avez-vous des infos ? Les auteurs ne répondent pas…. et le lanceur d’alerte ?

Des rétractations d’articles signés uniquement par des auteurs français sont rares… Pourquoi ? RetractionWatch a rapporté (incomplètement ?) fin 2017 un cas de rétractation d’un cas publié fin 2016 dans la prestigieuse revue Neurology. Tous les auteurs sont des experts français de Montpellier et Besançon. L’article intitulé « Mystery Case: CSF-1R mutation is a cause of intracranial cerebral calcifications, cysts, and… Continuer la lecture

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Les mégarevues en accès libre représentent 3 % des articles : pas de concentration, et Scientific Reports a dépassé PLOS One

Quand je rencontre des chercheurs, tous connaissent PLOS One, mais bien peu connaissent Scientific Reports, voire PeerJ, eLife et quelques autres… Un billet (10 janvier 2018) de la cuisine des chefs (Scholarly Kitchen) de Ph Davis commente l’évolution des mégarevues. La prédiction était que toute la science allait se concentrer dans 100 mégarevues, mais ce n’est pas le cas. La… Continuer la lecture

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Faut-il lutter contre la culture de la vitesse dans le milieu académique ? The Slow Professor propose des stratégies

Il faut effectivement lire deux fois ce court livre (90 pages) pour le goûter et prendre du plaisir. Le livre « The Slow Professor — Challenging the culture of speed in the Academy » est un grand succès en Amérique du Nord, avec un retirage et deux auteures surbookées… Maggie Berg est dans le département ‘English language and literature’ de la Queens… Continuer la lecture

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SIGAPS : 950 millions d’euros alloués de façon variable selon les établissements, avec de petits arrangements discrets….

La France est l’un des rares pays qui alloue directement de l’argent en fonction des publications… c’est plutôt rare. En général l’argent est alloué pour des projets de recherche (à ceux qui publient..). La cour des comptes, soucieuse de l’utilisation de l’argent public, a publié le 18 janvier 2018 un rapport de 246 pages (avec annexes) intitulé : « Le rôle… Continuer la lecture

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« Science et médias : Une relation sous influence » : 7 articles dans Science & Pseudo-Sciences

Le numéro 323, janvier-mars 2018, de Science & Pseudo-Sciences est en kiosque (pas dans tous, il faut insister). Revue de l’AFIS (Association Française pour l’Information Scientifique). Outre quelques bons articles sur des sujets polémiques (Glyphosate, Lévothyrox, Lyme..), il contient un bon dossier sur Science et Médias avec 7 articles. Le sommaire est en ligne, avec possibilité d’acheter les numéros (voire… Continuer la lecture

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Newsletter de décembre 2017 envoyée le 2 janvier 2018 avec le titre : « P < 0,005 doit remplacer P < 0,05 — Gagadémie »

Avec tous mes voeux pour 2018, en espérant continuer mes billets sur ce blog. La communication est difficile car si j’évoque de bonnes pratiques, la consultation du blog baisse… Il faut du miel pour attirer les mouches, et j’en ai fait l’expérience : le 16 octobre 2015, j’ai publié un billet sur le Bulletin de l’Académie de Médecine, regrettant sa… Continuer la lecture

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L’archive de preprints en langue française a été créée : il faudrait la soutenir et assurer son avenir

Je remercie Bernard Paquito pour son tweet du 18 janvier 2017 nous informant de la création d’un nouveau registre pour des preprints en langue française. Idée géniale ou projet mal barré ? J’aimerai que ce soit une idée géniale et que le succès suive. Le nom Frenxiv, avec un drapeau français ne représentant pas la francophonie, faut-il un logo plus… Continuer la lecture

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Les critères de jugement sont trop souvent différents entre protocoles et publications ! Ce devrait être une étape préalable aux méthodes de lecture critique

Article dans BMC Medical Research Methodology en janvier 2018 et intitulé « A systematic review of comparisons between protocols or registrations and full reports in primary biomedical research ». Bonne recherche d’auteurs canadiens. J’en ai marre de tous ces étudiants que l’on forme à l’analyse de la littérature, ou LCA (Lecture Critique d’Articles) sans les prévenir sur la qualité effroyables de certains… Continuer la lecture

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Pourquoi vous ne devriez pas croire ce que vous lisez dans les revues biomédicales : F Godlee, rédactrice du BMJ

C’est le tire d’une bonne conférence (novembre 2017) à la Liverpool School of Tropical Medicine, faite par Fiona Godlee, rédactrice en chef du BMJ ; vous pouvez ré-écoutez la vidéo en regardant les bonnes diapos. Il vous faut une heure tranquille, ce que j’ai fait un dimanche matin, pour avoir uns liste de cas de malveillances ou fraudes en médecine,… Continuer la lecture

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De bonnes recommandations pour le contenu des plans d’analyse statistique dans les essais cliniques

C’est un point faible qui pourrait être amélioré par des recommandations proposées par des statisticiens et publiées dans le JAMA le 19 décembre 2017 (accès libre), avec un éditorial d’explication (avec paywall). Le titre « Guidelines for the content of statistical analysis plans in clinical trials » pour combler un vide en proposant d’avoir des plans d’analyse favorisant la transparence et le… Continuer la lecture

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Les critères pour être auteurs d’un article de recherche évoluent-ils avec une science collaborative ? Oui

Ce sont 5 pages du JAMA qui ont été consacrées à un éditorial des rédacteurs sur le thème « Authorship and team science » (décembre 2017). Leur constat est que les équipes de recherches collaborent de plus en plus, et c’est souvent poussé par les financeurs : cela a des répercutions sur les auteurs des articles de recherche. Il ne s’agit pas… Continuer la lecture

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La Revue Prescrire a raison : les guides de la Haute autorité de santé ont une très très grande marge d’amélioration….

Dans son numéro de janvier 2018 (page 71), La Revue Prescrire donne des informations sur son activité d’évaluation des guides élaborés par la Haute autorité de santé. Leur évaluation est plutôt bien faite, et ils ont des données objectives pour confirmer ce qui semble assez évident quand on discute avec ceux qui savent utiliser et évaluer la littérature (ils sont… Continuer la lecture

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PEERJ : un modèle original de revue qui donne satisfaction aux auteurs

La newsletter de PeerJ du 4 décembre 2017 nous apprend que 4000 articles ont été publiés depuis 2013. PeerJ est une revue électronique pour la biologie, la médecine et les sciences de l’environnement. Cette revue me est peu connue parmi les experts que je croise, alors qu’il semble que cette revue fonctionne bien. Elle publie des articles après peer-review et… Continuer la lecture

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EQUATOR évolue bien : lignes directrices et un EQUATOR dédié à l’oncologie

EQUATOR est une excellent réseau avec un site très utile pour écrire des articles. Ce site est très méconnu parmi les participants aux formation à la rédaction. Le site compile 389 lignes directrices pour vous aider à écrire des articles. Sur la page de garde du site, il y a 11 lignes directrices mises en valeur car ce sont celles… Continuer la lecture

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Trop souvent les résumés ne sont pas exactement représentatifs des articles…..

Il y a eu beaucoup de recherches comparant le contenu des résumés avec le contenu des articles. Dans BMC Medical Research Methodology, une équipe essentiellement canadienne a publié fin 2017 une étude de portée (scoping review) pour rechercher les études sur ces comparaisons. Le titre « A scoping review of comparisons between abstracts and full reports in primary biomedical research ». Ils… Continuer la lecture

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Environ 50 % des publications scientifiques, voire plus selon les disciplines, sont en accès libre

Il s’agit d’un preprint déposé le 2 août 2017 sur PeerJ Preprints avec le titre : « The State of OA: A large-scale analysis of the prevalence and impact of Open Access articles ». Les auteurs sont américains, canadiens, allemands,… Avec comme premiers auteurs deux experts de ImpactStory. Cet article est détaillé, avec beaucoup d’informations. 1u 2 janvier 2018, c’est toujours sous… Continuer la lecture

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Citez au moins 3 collègues de votre université dans vos articles : un moyen d’améliorer la visibilité de l’Université dans les indicateurs de notoriété

Comme expliqué par Chris Chambers dans son livre (péché n° 7), les universités aiment bien compter des haricots, modèle d’astrologie moderne pour évaluer la recherche. Le site RetractionWatch (RW) nous montre un exemple extraordinaire, car c’est une note écrite par le doyen de ‘University of Malaysia’ pour inciter ses chercheurs à citer des collègues. La note, traduite sur le site… Continuer la lecture

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« Prise en charge défectueuse d’une lésionnelles » : droit de réponse de l’avocat qui conseille le rédacteur en chef ayant accepté un article d’une auteure proche

Le 2 octobre 2017 sur ce blog, j’ai publié un billet commentant un article de la revue Déontologie, Droit & Soin ayant pour titre « Prise en charge défectueuse d’une lésionnelles ». Je me suis permis de penser qu’il s’agissait d’un article de complaisance, et je vous laisse juger. L’auteure est Mme Khady Badiane Devers. Un bon commentaire avait été justement ajouté… Continuer la lecture

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Fazlul Sarkar devrait avoir au moins 42 articles rétractés… mais tout ceci est long, car seuls 19 ont été rétractés

C’est une fraude énorme aux USA qui a nécessité une enquête importante dont le rapport a été rendu public en novembre 2016. Le document de 360 pages vaut d’être survolé car il est très très détaillé… le comité d’investigation a analysé 140 allégations, la plupart anonymes, contre le Dr Fazlul Sarkar, anatomopathologiste dans le domaine du cancer, et employé de… Continuer la lecture

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Peut-on accepter la promotion de chercheurs ayant publié dans des revues prédatrices ou illégitimes ?

C’est une situation que des CNU ont probablement rencontrée lorsqu’il s’agit de nommer des chercheurs à des positions académiques. J’ai entendu quelques discussions à ce propos ! Volontairement ou accidentellement, des chercheurs publient dans ces 10 000 revues dites prédatrices ou illégitimes… et ils mettent bien sûr les citations de ces articles dans leur CV. Un cas est expliqué dans… Continuer la lecture

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