Archives de l’auteur : Herve Maisonneuve

Les 7 péchés mortels de la science : numéro 6, l’internement ou le refus d’ouvrir les données, le refus de l’Open Access…

Excellent ouvrage (mai 2017) de Chris Chambers, professeur de neurosciences cognitives à Cardiff. Le titre : The 7 deadly sins of psychology. A manifesto for reforming the culture of science practice. Je reprend chaque vendredi un des 7 péchés, et voir ensuite le rachat proposé dans le dernier chapitre. Le péché numéro 6 peut paraître bizarre dans son intitulé :… Continuer la lecture

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Tempête dans un verre d’eau aux Annals of Surgery : rétractation d’un article utilisant le pronom masculin uniquement pour évoquer le/la chirurgien(ne)

Histoire surprenante, décrite le 24 juillet 2017 par RetractionWatch, car les problèmes sont ailleurs. L’European Surgical Association’ a un council de 14 membres dont une seule femme, et est l’une des deux sociétés responsable de la revue Annals of Surgery (avec American Surgical Association). La revue a publié la ‘Presidential Address’ d’avril 2017 faite par l’ancien président Marek Krawczyk, chirrugien… Continuer la lecture

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Félicitons les chercheurs qui savent reconnaître leurs erreurs en demandant de rétracter des articles : sont-ils nombreux ?

RetractionWatch narre une rétractation avec de nombreux détails et grâce à l’honnêteté des auteurs. Pas étonnant, ces auteurs sont Suédois, ni américains, ni français. Il s’agit d’un article impressionnant de la prestigieuse revue Cell (facteur d’impact de plus de 30 !). Il s’agit d’un article de 16 pages qui avait fait le buzz à sa parution. Les auteurs suédois du… Continuer la lecture

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La revue étudiante @-respect progresse bien en qualité : bravo

La pérennité d’un projet est toujours satisfaisante. Plusieurs fois, j’ai évoqué le projet toulousain de revue écrite par les étudiants, encadrés par des seniors du département de médecine générale. Elle s’appelle @respect pour « Revue des Etudiants en Soins Primaires Et Chercheurs Toulousains » Avec le temps les progrès sont visibles sur la qualité des textes, des références, des sujets. La régularité… Continuer la lecture

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Les jeunes chercheurs sont malmenés dans de la mauvaise science : pétition anglaise Bullied Into Bad Science

The Bullied Into Bad Science campaign is an initiative by early career researchers (ECRs) for early career researchers who aim for a fairer, more open and ethical research and publication environment. Vous pouvez signer, comme je l’ai fait. Il s’agit d’une pétition proposée par de jeunes chercheurs (ECRs pour Early Career Researchers) de Cambridge en Angleterre. Ils sont préoccupés par… Continuer la lecture

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Les 7 péchés mortels de la science : numéro 5, le péché de corruption.. Combien sont devenus profs suite à un comportement frauduleux en début de carrière ?

Excellent ouvrage (mai 2017) de Chris Chambers, professeur de neurosciences cognitives à Cardiff. Le titre : The 7 deadly sins of psychology. A manifesto for reforming the culture of science practice. Je reprend chaque vendredi un des 7 péchés, et le rachat sera proposé dans le dernier chapitre. Le chapitre 5 : The sin of corruptibility… le péché de corruption…. Continuer la lecture

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Le 8ème Peer Review congress en septembre 2017 : Supprimer l’innovation ou encourager les réplications ?

Le premier Peer Review congress était un pari risqué, en 1989 à Chicago. Nous étions deux français ! Cet événement se déroule tous les 4 ans, maintenant à Chicago, après 3 essais hors Chicago… dont celui des 14 au 16 septembre 2001 à Barcelone… salles vides car les américains avaient été bloqués dans les aéroports suite à l’attentat de New… Continuer la lecture

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Science & Pseudosciences n° 321 de juillet 2017 : luttons contre les informations non scientifiques

Vous trouverez ici le dossier de presse du numéro 321 de juillet 2017 qui est en kiosque. C’est la revue de l’AFIS (Association Française pour l’Information Scientifique). Tout est fait par des bénévoles, BRAVO. Le problème est que le public évalue les informations en fonction de valeurs, d’idées anciennes, de commentaires divers, et n’a pas un esprit critique basé sur… Continuer la lecture

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Revoir les critères de paternité d’un article car les pratiques sont préjudiciables pour la recherche : transparence SVP !!!

Il s’agit d’un preprint déposé en mai 2017 sur BioRxiv par un groupe de 14 rédacteurs éminents. Que nous dit le résumé de ce preprint qu’il faudra discuter lors des congrès de rédacteurs ? J’ai adapté une traduction de ce résumé : Conformément au mouvement croissant dans la publication scientifique en vue de la transparence des données et des méthodes,… Continuer la lecture

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Une autorisation du malade pour toute iconographie publiée est indispensable, même s’il n’est pas possible de reconnaître le malade… mais les enfants du malade peuvent changer d’avis !

Les rétractations de cas cliniques pour absence de consentement du patient, ou changement d’avis du patient seraient-elles en augmentation ? Je ne sais pas, mais la liste de ces cas sur RetractionWatch augmente. Le cas qui vient d’être rapporté est celui d’un changement d’avis des enfants, alors que la mère de 77 ans avait donné son consentement ! Ce seraient… Continuer la lecture

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Newsletter de juin 2017 envoyée le 30 juin avec le titre « 7 péchés mortels et 5 maladies affectent la science »

En juin 2017, 22 billets sur le blog de la rédaction médicale. En cliquant sur les liens, vous avez accès aux billets du blog. Partage des données des essais cliniques obligatoire : difficile ? ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ Après une longue concertation, l’ICMJE a publié une position majeure pour les articles soumis à des revues biomédicales ; voici les suggestions : les manuscrits… Continuer la lecture

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Proposition pour rejoindre un comité de rédaction fantôme : ceux qui se font prendre ne peuvent plus enlever leur photo

Les vrais escrocs sont de bons professionnels. j’ai encore reçu une sollicitation pour être sur le board d’une revue en cours de construction. Ce qui est fabuleux, c’est que ces escrocs terminent leur email en m’alertant sur les escrocs ! En post-scriptum ils osent écrire « This is not a spam email. » Je connais des experts français dont les noms, et… Continuer la lecture

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Quatre prix Nobel suggèrent de publier de la bonne science plutôt que courir après le facteur d’impact

Cette vidéo est courte, avec un anglais facile et des sous-titres. Le message est convaincant, et je vous suggère d’écouter quatre vieux chercheurs ayant eu un prix Nobel (1 min 32 sec) ? Qui sont les 4 orateurs : Peter Doherty, Bruce Beutler, Joseph Goldstein et Paul Nurse. Quels sont les messages : la recherche compte, pas le journal ;… Continuer la lecture

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Peut-on améliorer la connaissance du public et des médecins dans le domaine des bénéfices et risques liés aux médicaments ?

L’Académie des Sciences Médicales du Royaume-Uni a publié un rapport sur la communication des bénéfices et risques liés aux médicaments, pour les professionnels et le public. Un éditorial du 4 juin 2017 dans le BMJ a extrait une information inquiétante : “Only one in three members of the public trusts the result of research. More than one fifths of general… Continuer la lecture

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Republier un article avec ses corrections : une bonne pratique qu’adoptent des revues de spécialités

C’est un éditorial de la revue Neurology, le 4 juillet 2017, qui explique en détail le cas d’un article ayant des erreurs. Cet article a été corrigé puis republié. Nous avons expliqué cette bonne pratique qui est devenue facile pour les familles des revues JAMA et Lancet, et quelques autres revues prestigieuses. L’éditorial de Neurology en juillet 2017 est intitulé… Continuer la lecture

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Les 7 péchés mortels de la science : numéro 4, accumulation de données… je pourrais arrêter de travailler et publier uniquement

Excellent ouvrage (mai 2017) de Chris Chambers, professeur de neurosciences cognitives à Cardiff. Le titre : The 7 deadly sins of psychology. A manifesto for reforming the culture of science practice. Je reprend chaque vendredi un des 7 péchés, et le rachat sera proposé dans le dernier chapitre. Le chapitre 4 : « The sin of data hoarding ». L’accumulation de données… Continuer la lecture

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Lire PLAS est un régal car le partage transversal entre disciplines scientifiques est utile : les revues ont les mêmes problématiques

Le numéro 16 de Publier LA Science (juin 2017), newsletter gratuite de la cellule de l’Inra (Institut national de la recherche agronomique) fait 14 pages. Cette newsletter est préparée par la cellule d’assistance à la publication scientifique du département Environnement et Agronomie. Il contient 40 courtes analyses d’articles et de sites dans le domaine des publications. Les thématiques sur l’Open… Continuer la lecture

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Après The Wellcome Trust, la revue scientifique de la Bill Gates Foundation sera créée sur le modèle de F1000Research

Le paysage des revues scientifiques pourrait changer si les institutions adoptent les politiques du Wellcome Trust et bientôt de la Bill & Melinda Gates Foundation. L’an dernier a été lancé Wellcome Open Research, une revue en Open access dédiée aux recherches supportées par le Wellcome Trust (UK). En moins d’un an, il y a 81 articles (4 juillet 2017), dont… Continuer la lecture

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Les revues sont de plus en plus exigeantes sur le respect de l’éthique de la recherche, et vous devez être en conformité avec la CNIL

Le site de la CNIL (Commission Nationale de l’Informatique et des Libertés) a été actualisé avec des explications très utiles pour les chercheurs en santé. Je vous suggère de prendre connaissance des recommandations pour les recherches dans le domaine de la santé. Je suis peut être le seul, mais ces déclarations m’énervent…. Le titre ci-dessus n’est pas clair pour moi… Continuer la lecture

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Est-ce qu’un rédacteur médical peut soumettre un article par délégation de l’auteur correspondant ? OUI, pour moi

Le numéro de Juin 2017 de Medical Writing, revue de EMWA, est sur les Medical Devices. De nombreux articles sur ce thème, ainsi que d’autres articles des rubriques régulières. Bonne réflexion de Philip Leventhal sur une question qui se pose parfois : Can a medical writer submit a manuscript on behalf of a corresponding author?. Il m’est arrivé de soumettre… Continuer la lecture

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Les 7 péchés mortels de la science : numéro 3, le péché du manque de fiabilité car la reproductibilité est un mot tabou !

Excellent ouvrage (mai 2017) de Chris Chambers, professeur de neurosciences cognitives à Cardiff. Le titre : The 7 deadly sins of psychology. A manifesto for reforming the culture of science practice. Je reprend chaque vendredi un des 7 péchés, et ensuite le rachat sera proposé dans le dernier chapitre. Le chapitre 3 : « The sin of unreliability ». Le péché du… Continuer la lecture

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Ecrire votre premier article : Conseils pour les étudiants en formation médicale

L’AMEE (Association for Medical Education in Europe) publie des revues de qualité. Medical Teacher est la revue de recherche en éducation médicale. Une revue en Open access, MedEdPublish, est destinée aux étudiants. AMEE MedEdPublish is a highly visible, open access, specialist practitioner e-journal that enables academics, teachers, clinicians, researchers and students to publish their experiences, views and research findings relating… Continuer la lecture

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Elsevier a gagné son procès contre Sci-Hub : 15 millions de dollars à payer par Alexandra Elbakyan!

Le 21 juin 2017, un tribunal de New York a condamné le site pirate Sci-Hub à payer 15 millions de dollars pour non respect du copyright. Sci-Hub est ce site qui donne accès illégalement à plus de 62 millions d’articles scientifiques.Ce site a été créé en 2011 par une chercheuse en neurosciences basée au Kazakhstan, Alexandra Elbakyan. Il n’y avait… Continuer la lecture

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J Beall nous livre son expérience des revues prédatrices : ‘on’ lui a demandé de se taire !

Depuis la fermeture de son blog sur les revues prédatrices, Jeffrey Beall a un peu disparu de la scène. Il n’est pas venu au congrès mondial sur l’intégrité. Il vient de publier une opinion dans Biochemia Medica avec le titre « What I learned form predatory publishers ». Son blog ‘Scholarly Open Access’ a été lancé en janvier 2012 et fermé en… Continuer la lecture

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60 % des essais non publiés (79 % des malades inclus) dans le domaine de la prévention de la douleur post-opératoire (prégabaline), et pas d’efficacité !

Article très bien fait publié dans Pain (en accès libre), avec un titre informatif contenant le résultat et un verbe conjugué (tout ce que j’aime) : « Perioperative pregabalin administration does not prevent chronic postoperative pain: systematic review with a meta-analysis of randomized trials ». Félicitations pour Valeria Martinez, hôpital Raymond Poincaré. Une vidéo résume le travail… à voir. Si le résultat… Continuer la lecture

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Les 7 péchés mortels de la science : numéro 2, le péché de la flexibilité cachée ou comment jouer avec le p-harking et le p-HACKing

Excellent ouvrage (mai 2017) de Chris Chambers, professeur de neurosciences cognitives à Cardiff. Le titre : The 7 deadly sins of psychology. A manifesto for reforming the culture of science practice. Je reprend chaque vendredi un des 7 péchés, et voir ensuite le rachat proposé dans le dernier chapitre. Le chapitre 2 : « The sin of hidden flexibility ». La flexibilité… Continuer la lecture

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Le partage des données progresse assez vite : 65 000 articles de PLOS ONE précisent comment accéder aux donnéee

Billet sur le blog de PLOS en mai 2017 pour faire le point sur le partage des données sources. Cette politique est devenue obligatoire pour PLOS ONE en mars 2014. Le bilan semble plutôt positif car 65 000 articles ont une mention sur l’accès aux données sources. Chaque article d’une revue du groupe PLOS doit décrire où sont archivées les… Continuer la lecture

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Tout article scientifique devrait avoir un résumé pour le grand public : les revues progressent !

La communication scientifique change vite. Nous savons que les revues scientifiques sont, en volume, surtout consultées par le grand public. Par exemple, un article du JAMA est à 75 % tweetté par des non scientifiques. Par ailleurs, l’open access est une réponse aux demandes du public, de la fondation Georges Soros, et autres lobbies. Le raisonnement est imparable : »Moi, citoyen,… Continuer la lecture

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Les preprints : 10 règles simples pour comprendre une anomalie, car les preprints ne sont jamais imprimés !

Dans la série d’articles de PLOS Computational Biology, vient de sortir en mai 2017 : « Ten simple rules to consider regarding preprint submission ». Très utile pour bien comprendre un phénomène ancien en physique (1991) mais tout nouveau en biologie (2016). La définition est simple : c’est un article qui n’a pas encore été publié dans une revue scientifique. Le contenu… Continuer la lecture

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Dans quel ordre écrire les sections du manuscrit de mon article de recherche ?

Cette question m’est souvent posée, et la réponse varie selon les cas montrés par les étudiants. Un article de recherche pour une revue internationale à comité de lecture, en biomédecine, a 3 000 à 4 000 mots, environ 30 à 40 références. Je ne réponds à la question que si deux points sont résolus : 1) pour quelle(s) revue(s) biomédicales… Continuer la lecture

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Newsletter de mai 2017 avec le titre « Fac de médecine : zéro pour 28 (sur 37) pour les conflits d’intérêts »

En mai 2017, 21 billets sur le blog de la rédaction médicale. En cliquant sur les liens, vous avez accès aux billets du blog. Deux infos merveilleuses (voir plus loin) : conflits d’intérêts : zéro pointé pour les facs de médecine françaises…. Etienne Klein (plagieur) démissionné !!! Fin des fonctions d’un plagieur : E KLein n’est plus président du conseil… Continuer la lecture

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Les 7 péchés mortels de la science : numéro 1, les biais, conséquence du ‘publie autant d’articles que possible avec des résultats positifs et nouveaux’

Excellent ouvrage (mai 2017) de Chris Chambers, professeur de neurosciences cognitives à Cardiff, et que j’ai rencontré, à propos des Registered Reports. Le titre : The 7 deadly sins of psychology. A manifesto for reforming the culture of science practice. Je vais reprendre chaque vendredi les 7 péchés, et voir ensuite le rechat proposé dans le dernier chapitre. Le chapitre… Continuer la lecture

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Le mauvais emploi des verbes dans les articles scientifiques favorise les spins

Editorial plaisant, d’autant plus que le premier des deux auteurs, Abe Fingerhut, est un collègue américain qui a longtemps exercé la chirurgie en France. Cet éditorial dans la prestigieuse revue Surgery est intitulé ‘Strength of verbs in medical writing should correspond to the level of evidence (or degree of causality): a plea for accuracy’. Trop souvent les auteurs (reviewers et… Continuer la lecture

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Les journalistes couvrent de façon préférentielle les résultats initiaux, bien qu’ils soient souvent contredits par des méta-analyses et informent rarement le public lorsqu’ils ne sont pas confirmés.

C’est un travail de l’équipe de Bordeaux qui a été remarqué lors du congrès mondial sur l’intégrité de la recherche : bonne communication orale de Estelle Dumas-Mallet dans un anglais parfait, salle comble sans le moindre trac. La première question a ensuite été posée par Brian Nosek, chercheur responsable du Center for Open Science à Charlottesville, USA. Bravo à l’équipe… Continuer la lecture

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Le peer-review, c’est jouer au loto…. tous les gagnants ont tenté leur chance

La communauté scientifique est plutôt passive… Je vois tant de choses monstrueuses que beaucoup ne les croient pas ! Les jeunes souffrent et ne peuvent rien dire en constatant les pratiques des seniors… J’ai relu un éditorial qui sommeillait sur une étagère… Il y en a beaucoup… Il s’agit d’un éditorial intitulé « Who is afraid of reviewers’ comments? Or why… Continuer la lecture

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Le partage des données des essais cliniques va devenir obligatoire selon l’ICMJE

C’est un sujet débattu, mais la déclaration de l’ICMJE (International Committee of Medical Journal Editors) vient conclure 18 mois de consultations. Que dit cet éditorial publié conjointement par les plus grandes revues (JAMA, BMJ, Lancet, NEJM, Annals Intern Med, et d’autres) ? les manuscrits soumis à des revues suivant l’ICMJE devront contenir une déclaration sur le partage des données sources… Continuer la lecture

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ICTRP à ne pas confondre avec ISRCTN ! En pratique, il faudrait enregistrer tous les protocoles cliniques… et tous les protocoles de méthodes en biologie!

L’enregistrement des protocoles des expérimentations a été demandé dans les années 2004 par les rédacteurs des revues. L’histoire du refecoxib a marqué les esprits : les rédacteurs du NEJM ont découverts que des données connues des auteurs n’étaient pas dans l’article, et que la publication n »était pas totalement conforme au protocole de l’essai. Depuis, une dizaine d’études ont montré des… Continuer la lecture

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Les scientifiques peuvent ‘se faire pirater’ leurs données en les mettant en libre accès….

Lors de la conférence mondiale de l’intégrité scientifique (fin mai 2017), Stephan Lewandowsky, Université de Bristol, a fait une présentation remarquée. Je n’ai pas encore les diapos. Il a beaucoup travaillé sur la désinformation, dans de nombreux domaines. Il a déjà été cité dans RetractionWatch pour d’autres publications. Ses réflexions sont importantes : des scientifiques mal intentionnés peuvent prendre des… Continuer la lecture

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Mourir pour un tatouage : aucun respect des médias pour diffuser les images du patient

Plusieurs fois, j’ai attiré l’attention sur les images ou cas de patients qui étaient découverts par le grand public, voire la famille. Les revues sont de plus en plus ouverte, accessibles sans codes, et c’est le grand public, en volume, qui accède le plus aux articles scientifiques ! Le grand public vous lit ! Je vous recommande de lire un… Continuer la lecture

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Significosis, Neophilia, Theorrhea, Arigorum, Disjunctivitis : 5 maladies de la recherche d’après Leadership Quarterly

Voici un extrait de l’abstract : However, five serious “diseases” stifle the production of useful research. These diseases include: significosis, an inordinate focus on statistically significant results; neophilia, an excessive appreciation for novelty; theorrhea, a mania for new theory; arigorium, a deficiency of rigor in theoretical and empirical work; and finally, disjunctivitis, a proclivity to produce large quantities of redundant,… Continuer la lecture

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