Archives de l’auteur : Herve Maisonneuve

Est-ce que les rédacteurs et relecteurs sont suffisamment bons : NON et NON

Conférence inaugurale de David Moher avec une question : Custodians of high-quality science/ Are editors and peer reviewers good enough?. Il a donné sa réponse : NO and NO avant de rappeler la série des 7 articles du Lancet en janvier 2014 sur les gaspillages de la recherche. Davis a rappelé qu’un groupe collaboratif a proposé 14 « core competencies » pour… Continuer la lecture

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Comment définir Open Peer Review ? Une revue pas systématique de 122 définitions !

Les jargons dans le domaine de l’Open sont nombreux, et parmi eux Open Peer Review. Nous avons des interprétations probablement diverses, et cette revue systématique postée en avril 2017 sur F1000Research apporte des réflexions utiles. Le titre : « What is open peer review? A systematic review ». En fait, ce n’est pas une revue systématique… titre trompeur. Depuis avril, 4 reviewers… Continuer la lecture

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Encore des nouveaux Lancet : The Lancet Planetary Health et The

La famille Lancet continue de s’agrandir, avec notamment deux lancements en 2017 (est-ce fini pour 2017 ?). The Lancet Planetary Health a publié son premier numéro en avril 2017 avec un éditorial expliquant ce qu’est cette nouvelle discipline : « In The Rockefeller Foundation–Lancet Commission on Planetary Health, planetary health was defined as the health of human civilisations and the natural… Continuer la lecture

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JAMA publie sa politique de corrections des articles avec un éditorial « To err is human, to correct is divine »

Un éditorial du 5 septembre 2017 dans le JAMA est bienvenu avec un titre amusant : Correcting the medical literature: « To err is human, to correct is divine ». Ce titre fait référence à un ouvrage américain de l’année 2000 (National Academies Press) qui a marqué la développement de la qualité en santé (To err is human. Building a safer health… Continuer la lecture

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La stratégie de publication utilisée par AMEE pourrait être un modèle pour des sociétés savantes : Medical Teacher versus MedEdPublish

L’AMEE ou Association for Medical Education in Europe est la plus grande association sur la formation médicale. Son congrès annuel rassemble plus de 3 500 participants d’environ 85 pays. Innovations en formation, forums de discussions, ateliers sont nombreux et les français plutôt absents…. L’AMEE, basée à Dundee, Ecosse, publie depuis 1979 une très bonne revue indexée, Medical Teacher (Informa Healthcare),… Continuer la lecture

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Newsletter de l’été 2017 envoyée le 1 septembre avec le titre « La science est pourrie mais nos CHU excellents »

Chers Collègues, En juillet et août 2017, 37 billets sur le blog de la rédaction médicale. Plutôt que reprendre tous les billets, j’ai fait une sélection. Tous les billets de l’été sont accessibles en cliquant sur juillet ou août. Félicitons les premiers acteurs de la recherche biomédicale en France : ce sont les 32 CHU-CHR !! Excellentes analyses bibliométriques de… Continuer la lecture

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Les Registered Reports arrivent en médecine avec BMC Medicine

Nous avons exposé plusieurs fois le modèle Registered Reports développé d’abord par des revues de psychologie et neurosciences. Nous avons vu que BMC Biology était la première revue de biologie adoptant ce modèle. En médecine, la première revue adoptant les Registered Reports est BMC Medicine, par une annonce du 24 août 2017 sur le blog de BMC. Le groupe BMC… Continuer la lecture

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La littérature académique bientôt toute gratuite : le système abonnement ne tiendra pas très longtemps

Ce sont les conclusions d’une équipe américaine/allemande dans un preprint déposé dans PeerJ preprints en juillet 2017. Ces auteurs ont analysé le site pirate sci-hub. Ils précisent tout d’abord dans quelques lignes en gras une précision que je reprend à mon compte : Les lecteurs doivent noter que, dans de nombreuses juridictions, l’utilisation de Sci-Hub peut constituer une violation du… Continuer la lecture

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Congrès Peer review : intégrité de la recherche et partage des données (encore des progrès à faire)

Tous les abstracts sont sur le site. Et twitter #prc8 Une session (10 septembre 2017) sur l’intégrité de la recherche avec plusieurs communications : le contrôle des images par 7 revues de l’American Physiological Society amélioré la qualité des images soumises, et c’est une bonne chose. Une communication sur des méta-analyses de 2016 ayant inclu des articles rétractés : cela… Continuer la lecture

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Des spins (rendre favorable des résultats) dans 75 % des articles ?

Deux présentations sur les spins (présentation ou interprétation biaisées pour rendre les résultats plus favorables) au Peer Review congress : Identification and classification of spin in clinical studies evaluating biomarkers in ovarian cancers: a systematic review. Un bon travail qui a sélectionné 200 articles sur un seul thème. Surprenant : 32 % des articles n’avaient pas de spin !!!! L’analyse… Continuer la lecture

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Jeux Olympiques de la recherche sur les publications : Est-ce que nous évaluons les bonnes questions ?

Ivan Oransky a qualifié le Peer Review Congress de ‘Jeux Olympiques’ car il est organisé tous les 4 ans à Chicago. La salle plénière était comble pour l’ouverture par Drummond Rennie avec un honneur pour Eugene Garfield, inventeur du facteur d’impact, disparu en février 2017. Ce congrès a reçu 260 abstracts, et le programme avec abstracts (120 Pages) contient 45… Continuer la lecture

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Peer Review Week 2017 : une semaine chargée avec plein d’événements

La semaine du 11 au 17 septembre 2017 est dédiée au Peer Review avec deux manifestations concomitantes : La Peer Review Week est un événement virtuel annuel ; vous trouverez plein de webinars et autres conférences listées sur le site dédié ; ceci est organisé par 28 partenaires ; il y aura beaucoup de posts sur twitter #PeerRevWk17 et #TransparencyInReview… Continuer la lecture

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Deux sociétés savantes demandent de rétracter une revue Cochrane dont les conclusions ne leur plaisent pas (cas des antiviraux de l’hépatite C)

Le 6 juin 2017, une revue systématique Cochrane intitulée « Direct-acting antivirals for chronic hepatitis C » a créé une surprise, et n’a pas plus à de nombreux experts. Le travail semble bien fait, et ils ont inclu 138 essais randomisés (25 232 participants). La conclusion n’a pas plu dans un environnement pharmaceutique poussant au traitement de tous les porteurs du virus… Continuer la lecture

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De nouvelles listes de revues prédatrices pour remplacer la liste de J Beall : ‘Stop Predatory Journals’

Les revues prédatrices prospèrent et les chercheurs pris au piège sont nombreux. Les revues prédatrices sont faites par des escrocs qui veulent de l’argent en faisant croire qu’ils font des revues scientifiques. L’excellente liste de J Beall a été arrêtée sans rpéavis en janvier 2017, et l’on sait que J Beall avait trop de menaces et de pressions… Il a… Continuer la lecture

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Le grand public est alerté sur les mauvaises pratiques scientifiques : exemples dans Slate… et la science ne change pas ses pratiques

En août 2017, Slate a publié deux articles sur la science et ces articles ont beaucoup d’impact. Est-ce que c’est dommageable pour les scientifiques ? Probablement. Le 2 août, un article explique que le seuil de 0,05 pour la p-value n’est pas bon. Il faudrait privilégier un seuil de 0,005 : « Will lowering p-value thresholds help fix science? » Il s’agissait… Continuer la lecture

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Des revues prédatrices indexées par PubMed…. plus fréquent que vous l’imaginez

Cela est clair, mais pas toujours admis par certains experts. Une lettre dans The Lancet le 19 août 2017 reprend et actualise des données sur la présence d’article de revues prédatrices dans la base PubMed. En avril 2017, les revues prédatrices indexées représenteraient des 23,7 % des revues prédatrices en rééducation, 16,1 % en neurosciences, et 24,7 % en neurologie…. Continuer la lecture

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Est-ce qu’un rédacteur médical professionnel améliore la qualité des articles concernant des essais randomisés ?

La réponse n’est pas évidente, mais l’article intitulé « Professional medical writing support and the reporting quality of randomized controlled trial abstracts among high-impact general medical journals » et déposé le 16 août 2017 sur F1000Research est bien fait et passionnant. Les commentaires des 2 reviewers sont justes. En pratique, c’est une analyse ancillaire d’un article de BMJ Open en 2016 analysant… Continuer la lecture

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Choisir une revue pour soumettre un article : de bons outils sur le web

Comment choisir la revue pour soumettre votre article : sujet très souvent discuté lors des formations qui montre clairement que très rares sont les experts capables de répondre. Je mets hors sujet les membres de comité de rédaction qui soumettent à leur revue.. ils n’ont pas à choisir et n’imaginent pas un refus ! Je suis toujours étonné du manque… Continuer la lecture

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Mettre des articles de revues prédatrices dans un CV devrait avoir un impact négatif..

Je vois, en France, des CVs contenant des articles publiés dans des revues prédatrices : les CNU (Conseil National des Universités) devrait s’en apercevoir… mais certains de leurs membres ne connaissent pas les revues prédatrices, voire sont sur des comités de rédaction de ces revues… Pubier une revue prédatrice est une fraude, voire un crime ! Ne devrait donc pas… Continuer la lecture

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Les archives ouvertes de preprints se développent rapidement et deviennent thématiques

Nous avons vu que les preprints se développaient, avec par exemple les explications sur AsapBio, avec des règles simples proposées pour comprendre ce phénomène. Il s’agit d’un article qui n’a pas encore été publié dans une revue, et les résultats deviennent publics. Doit-on traduire par pré-impression, ou pré-publication, ou garder le terme preprint, voire préprint… Qu’en pensent nos amis Québécois… Continuer la lecture

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L’affaire Séralini versus Monsanto continue : tous menteurs dans une affaire qui nuit à la science… sans faits établis sur de bonnes méthodes, les croyances s’opposent

Tout est regrettable dans cette histoire compliquée à propos d’un premier article qui n’aurait pas dû être publié, qui n’aurait pas dû être rétracté sur des arguments faibles, qui n’aurait pas dû être republié avec d’autres complices, etc…. Mais jamais personne n’arrivera à s’entendre pour faire une très bonne étude collaborative qui pourrait apporter des arguments de réponse : il… Continuer la lecture

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Les revues d’anesthésie ne veulent plus publier d’articles frauduleux… mais la détection est délicate et les controverses nombreuses

La discipline d’anesthésie a été marquée par des fraudes importantes, que ce soient Y Fuji, J Boldt, Y Saitoh, S Reuben et quelques autres. Au total, ce sont plus de 300 articles qui ont été ou doivent encore être rétractés. Les rédacteurs de ces revues sont très attentifs, mais 2017 est encore une grande année dans ce domaine avec des… Continuer la lecture

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La liste des 17 patients opérés par le fraudeur P Macchiarini pour des greffes de trachée est en ligne

Nous avons relaté les fraudes de P Macchiarini qui a publié sur des greffes de trachées artificielles recouvertes de cellules souches, Il a travaillé dans plusieurs institution dont le Karolinska Institute (Suède). Il a été licencié de cet institut dans des conditions compliquées. Il a quelques articles rétractés pour fraude. Il estétonnant de constater que Leonid Schneider a publié sur… Continuer la lecture

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The JAMA a un nouveau modèle de correction pour les éditoriaux/lettres basés sur des articles rétractés, et publiés avant la rétractation

Début août 2017, une correction inhabituelle dans le JAMA. En 2016, le JAMA a rétracté trois articles de Y Sato, un japonais ayant au total 14 articles rétractés. Ces articles ont été rétractés pour diverses raisons dont palgiat, fraude. Ces articles avaient donné lieu à publication d’éditoriaux ou lettres avant que les fraudes et rétractations n’aient été mises en évidence…. Continuer la lecture

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Mieux décrire les interventions dans les revues systématiques.. 8 recommandations majeures

Bravo au groupe de travail réuni en juin 2016, dont les recommandations ont été publiées dans le BMJ (20 juillet 2017) en accès ouvert, dans la rubrique Research Methods and Reporting. Il s’agit de recommandations pour améliorer les revues systématiques. Nous avons vu tous les biais des revues systématiques, dont l’épidémie est inutile, trompeuse, voire dangereuse ! Diffusons ces recommandations… Continuer la lecture

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Les Centres hospitaliers universitaires sont les premiers acteurs de la recherche biomédicale en France

Je suis toujours satisfait quand la bibliométrie est utilisée à bon escient. Je vous recommande de consulter le site du CNCR (Centre national de Coordination de la recherche) : créé en 2005, le CNCR est l’organe de représentation des Etablissements Publics de Santé et a pour objectif le développement de leurs activités spécifiques en recherche et innovation en santé. En… Continuer la lecture

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Comme en France, les chercheurs chinois reçoivent de l’argent quand ils publient dans des revues prestigieuses : ce qui est bon pour les chercheurs serait-il bon pour la science ?

C’est un éditorial anonyme de Nature (13 juillet 2017) qui revient sur une situation chinoise connue mais inquiétante…. Le titre de l’édito ‘Paper Money’, ‘Don’t pay prizes for published science ». C’est comme en France qui alloues des ressources par SIGAPS. Donc, avant d’accuser les chinois, prudence ! Voici le début de cet édito : With great fanfare, Sichuan Agricultural University… Continuer la lecture

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Newsletter de juillet 2017 envoyée le 1 août avec le titre « Péché de corruption : combien se font une carrière sur des méconduites ? »

En juillet 2017, 20 billets sur le blog de la rédaction médicale. Plutôt que résumer le mois de juillet, j’ai choisi de reprendre un billet à lire en ce week-en de mi-août un apéritif en vacances……. J’ai analysé les 8 chapitres d’un excellent ouvrage (mai 2017) de Chris Chambers, professeur de neurosciences cognitives à Cardiff : The 7 deadly sins… Continuer la lecture

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Les 7 péchés mortels de la science : le rachat (redemption).. avec Registered reports, recommandations TOP, et une évaluation correcte de la recherche

Excellent ouvrage (mai 2017) de Chris Chambers, professeur de neurosciences cognitives à Cardiff. Le titre : The 7 deadly sins of psychology. A manifesto for reforming the culture of science practice. Je reprend chaque vendredi un des 7 péchés, et voir ensuite le rachat proposé dans le dernier chapitre. Le dernier chapitre commence par se demander si ces dérives décrites… Continuer la lecture

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Fraude massive en Chine par environ 500 chercheurs (107 rétractations) ayant conduit à des sanctions majeures….

C’est un article du 28 juillet 2017 dans une revue chinoise, XINHUANET, et cité par RetractionWatch qui explique que près de 500 chercheurs chinois ont été accusés de fraude scientifique. L’article : « China Focus: China announces result of academic fraud investigation. » J’ai résumé quelques points de l’article. Le ministère de la Science et de la Technologie (MST) a annoncé le… Continuer la lecture

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Les systèmes de mesure académique nuisent à la science : des chercheurs hollandais militent pour une science en transition

Un média privé américain (Washington), Insider Higher Ed, écrit par des journalistes scientifiques, publie une série d’articles sur la reproductibilité en science « Rethinking Research ». Il s’agit d’une reprise d’articles écrits pour Footnote. Le 4ème article de la série s’intitule « Do our measures of academic success hurt science? », et il est écrit par des chercheurs hollandais (Utrecht). L’article montre quelques points… Continuer la lecture

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Les 7 péchés mortels de la science : numéro 7, le péché du comptage de haricots ou l’astrologie moderne pour évaluer les chercheurs et la recherche

Excellent ouvrage (mai 2017) de Chris Chambers, professeur de neurosciences cognitives à Cardiff. Le titre : The 7 deadly sins of psychology. A manifesto for reforming the culture of science practice. Je reprend chaque vendredi un des 7 péchés, et voir ensuite le rachat proposé dans le dernier chapitre. Le 7ème et dernier péché est The sin of bean counting…. Continuer la lecture

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Après 35 ans, une revue corrige un article écrit sous le pseudonyme d’un chat… des co-auteurs animaux existent dans la littérature

C’est une histoire révélée par RetractionWatch le 1 août 2017. En 1982, un auteur, David Lewis, a publEnregistrerié une lettre à propos d’un article qu’il avait écrit. Mais cette lettre (Australasian Journal of Philosophy) était signée Bruce Le Catt… La correction a été publiée le 24 juillet 2017 : « The Australasian Association of Philosophy would like to clarify that ‘Bruce… Continuer la lecture

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Après 35 ans, une revue corrige un article écrit sous le pseudonyme d’un chat… des co-auteurs animaux existent dans la littérature

C’est une histoire révélée par RetractionWatch le 1 août 2017. En 1982, un auteur, David Lewis, a publEnregistrerié une lettre à propos d’un article qu’il avait écrit. Mais cette lettre (Australasian Journal of Philosophy) était signée Bruce Le Catt… La correction a été publiée le 24 juillet 2017 : « The Australasian Association of Philosophy would like to clarify that ‘Bruce… Continuer la lecture

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Que penser de ces livres Open Access pour lesquels les auteurs payent… oui les auteurs payent.. les lisez-vous ?

Je suis dubitatif. Comme la plupart d’entre vous, je reçois des sollicitations pour écrire des chapitres de livres. L’email est flatteur, bien écrit mais n’explique pas que j’aurais à payer lors de l’acceptation du chapitre (il doit être toujours accepté). Suite à une de ces sollicitations, je me suis inscrit sur Intech pour proposer mes services ! J’ai été accepté… Continuer la lecture

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Les allemands veulent résilier les abonnements aux revues scientifiques de Elsevier ! Est-ce que le modèle économique des revues est approprié ?

Les conflits entre institutions et maisons d’éditions sont anciens; en Allemagne, ils sont violents. C’est The Scientist de juillet 2017 qui a publié une bonne description des phénomènes, sous le titre « Major German Universities cancel Elsevier contracts ». Le début de l’article du Scientist : « In Germany, the fight for open access and favorable pricing for journals is getting heated. At… Continuer la lecture

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Les 7 péchés mortels de la science : numéro 6, l’internement ou le refus d’ouvrir les données, le refus de l’Open Access…

Excellent ouvrage (mai 2017) de Chris Chambers, professeur de neurosciences cognitives à Cardiff. Le titre : The 7 deadly sins of psychology. A manifesto for reforming the culture of science practice. Je reprend chaque vendredi un des 7 péchés, et voir ensuite le rachat proposé dans le dernier chapitre. Le péché numéro 6 peut paraître bizarre dans son intitulé :… Continuer la lecture

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Tempête dans un verre d’eau aux Annals of Surgery : rétractation d’un article utilisant le pronom masculin uniquement pour évoquer le/la chirurgien(ne)

Histoire surprenante, décrite le 24 juillet 2017 par RetractionWatch, car les problèmes sont ailleurs. L’European Surgical Association’ a un council de 14 membres dont une seule femme, et est l’une des deux sociétés responsable de la revue Annals of Surgery (avec American Surgical Association). La revue a publié la ‘Presidential Address’ d’avril 2017 faite par l’ancien président Marek Krawczyk, chirrugien… Continuer la lecture

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Félicitons les chercheurs qui savent reconnaître leurs erreurs en demandant de rétracter des articles : sont-ils nombreux ?

RetractionWatch narre une rétractation avec de nombreux détails et grâce à l’honnêteté des auteurs. Pas étonnant, ces auteurs sont Suédois, ni américains, ni français. Il s’agit d’un article impressionnant de la prestigieuse revue Cell (facteur d’impact de plus de 30 !). Il s’agit d’un article de 16 pages qui avait fait le buzz à sa parution. Les auteurs suédois du… Continuer la lecture

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La revue étudiante @-respect progresse bien en qualité : bravo

La pérennité d’un projet est toujours satisfaisante. Plusieurs fois, j’ai évoqué le projet toulousain de revue écrite par les étudiants, encadrés par des seniors du département de médecine générale. Elle s’appelle @respect pour « Revue des Etudiants en Soins Primaires Et Chercheurs Toulousains » Avec le temps les progrès sont visibles sur la qualité des textes, des références, des sujets. La régularité… Continuer la lecture

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